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58 Publikationen

2019 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2936939
Sharifi-Noghabi, H., Zolotareva, O., Collins, C.C. & Ester, M. (2019). MOLI: multi-omics late integration with deep neural networks for drug response prediction (Bioinformatics), 35(14), I501-I509. Gehalten auf der Biennial Joint Meeting of the 27th Annual Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB) / 18th European Conference on Computational Biology (ECCB), Oxford: Oxford Univ Press. doi:10.1093/bioinformatics/btz318.
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2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2935584
Theorell, A., Seiffarth, J., Grünberger, A. & Noeh, K. (2019). When a single lineage is not enough: Uncertainty-Aware Tracking for spatio-temporal live-cell image analysis. BIOINFORMATICS, 35(7), 1221-1228. Oxford Univ Press. doi:10.1093/bioinformatics/bty776.
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2917896
Lux, M., Brinkman, R.R., Chauve, C., Laing, A., Lorenc, A., Abeler-Dörner, L. & Hammer, B. (2018). flowLearn: Fast and precise identification and quality checking of cell populations in flow cytometry. Bioinformatics. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/bioinformatics/bty082.
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933892
Dirmeier, S., Fuchs, C., Mueller, N.S. & Theis, F.J. (2017). netReg: network-regularized linear models for biological association studies. Bioinformatics, 34(5), 896-898. Oxford University Press. doi:10.1093/bioinformatics/btx677.
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | PUB-ID: 2918897
Thijssen, B., Dijkstra, T.M.H., Heskes, T. & Wessels, L.F.A. (2017). Bayesian data integration for quantifying the contribution of diverse measurements to parameter estimates. Bioinformatics, 34(5), 803-811. Oxford University Press ({OUP}). doi:10.1093/bioinformatics/btx666.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2912555
Helfrich, S., Azzouzi, C.E., Probst, C., Seiffarth, J., Grünberger, A., Wiechert, W., Kohlheyer, D. & Nöh, K. (2015). Vizardous: interactive analysis of microbial populations with single cell resolution. Bioinformatics, 31(23), 3875-3877. Oxford Univ. Press. doi:10.1093/bioinformatics/btv468.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2674387
Hilker, R., Stadermann, K.B., Doppmeier, D., Kalinowski, J., Stoye, J., Straube, J., Winnebald, J. & Goesmann, A. (2014). ReadXplorer - Visualization and Analysis of Mapped Sequences. Bioinformatics, 30(16), 2247-2254. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/bioinformatics/btu205.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2643941
Hoffmann, N., Wilhelm, M., Doebbe, A., Niehaus, K. & Stoye, J. (2014). BiPACE 2D – Graph-based multiple alignment for comprehensive two-dimensional gas chromatography–mass spectrometry. Bioinformatics, 30(7), 988-995. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/bioinformatics/btt738.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2700599
Janssen, S. & Giegerich, R. (2014). The RNA shapes studio. Bioinformatics, 31(3), 423-425. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/bioinformatics/btu649.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2551798
Sauthoff, G., Mohl, M., Janssen, S. & Giegerich, R. (2013). Bellman's GAP -- a Language and Compiler for Dynamic Programming in Sequence Analysis. Bioinformatics, 29(5), 551-560. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/bioinformatics/btt022.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2610129
Kessler, N., Bonte, A., Langenkämper, G., Niehaus, K., Goesmann, A. & Nattkemper, T.W. (2013). MeltDB 2.0 - Advances of the metabolomics software system. Bioinformatics, 29(19), 2452-2459. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/bioinformatics/btt414.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2510984
Hilker, R., Sickinger, C., Pedersen, C.N.S. & Stoye, J. (2012). UniMoG - A unifying framework for genomic distance calculation and sorting based on DCJ. Bioinformatics, 28(19), 2509-2511. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/bioinformatics/bts440.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2496829
Cox, A.J., Bauer, M.J., Jakobi, T. & Rosone, G. (2012). Large-scale compression of genomic sequence databases with the Burrows-Wheeler transform. Bioinformatics, 28(11), 1415-1419. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/bioinformatics/bts173.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2481783 OA
Kölling, J., Langenkämper, D., Sylvie, A., Michale, K. & Nattkemper, T.W. (2012). WHIDE - A web tool for visual data mining colocation patterns in multivariate bioimages. Bioinformatics, 28(8), 1143-1150. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/bioinformatics/bts104.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2401665
Hazelhurst, S. & Lipták, Z. (2011). KABOOM! A new suffix-array based algorithm for clustering expression data. Bioinformatics, 27(24), 3348-3355. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/bioinformatics/btr560.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408590
Huang, D., Huang, Y., Bai, Y., Chen, D., Hofestädt, R., Klukas, C. & Chen, M. (2011). MyBioNet: interactively visualize, edit and merge biological networks on the Web. Bioinformatics, 27(23), 3321-3322. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/bioinformatics/btr557.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2289952
Blom, J., Jakobi, T., Doppmeier, D., Jaenicke, S., Kalinowski, J., Stoye, J. & Goesmann, A. (2011). Exact and complete short-read alignment to microbial genomes using Graphics Processing Unit programming. Bioinformatics, 27(10), 1351-1358. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/bioinformatics/btr151.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2307115
Dutilh, B.E., Jurgelenaite, R., Szklarczyk, R., van Hijum, S.A.F.T., Harhangi, H.R., Schmid, M., de Wild, B., Francoijs, K.-J., Stunnenberg, H.G., Strous, M., Jetten, M.S.M., Op den Camp, H.J.M. & Huynen, M.A. (2011). FACIL: Fast and Accurate Genetic Code Inference and Logo. Bioinformatics, 27(14), 1929-1933. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/bioinformatics/btr316.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2094556
Schleif, F.-M., Riemer, T., Boerner, U., Schnapka-Hille, L. & Cross, M. (2011). Genetic algorithm for shift-uncertainty correction in 1-D NMR-based metabolite identifications and quantifications. Bioinformatics, 27(4), 524-533. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/bioinformatics/btq661.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2093578
Linke, B., Giegerich, R. & Goesmann, A. (2011). Conveyor: a workflow engine for bioinformatic analyses. Bioinformatics, 27(7), 903-911. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/bioinformatics/btr040.
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