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67 Publikationen

2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941754
Baaijens, J. A., Van der Roest, B., Köster, J., Stougie, L., & Schönhuth, A. (2019). Full-length de novo viral quasispecies assembly through variation graph construction. Bioinformatics, 35(24), 5086-5094. doi:10.1093/bioinformatics/btz443
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941756
Yin, B., Balvert, M., van der Spek, R. A. A., Dutilh, B. E., Bohté, S., Veldink, J., & Schönhuth, A. (2019). Using the structure of genome data in the design of deep neural networks for predicting amyotrophic lateral sclerosis from genotype. Bioinformatics, 35(14), i538-i547. doi:10.1093/bioinformatics/btz369
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941761
Baaijens, J. A., & Schönhuth, A. (2019). Overlap graph-based generation of haplotigs for diploids and polyploids. Bioinformatics, 35(21), 4281-4289. doi:10.1093/bioinformatics/btz255
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2019 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2936939
Sharifi-Noghabi, H., Zolotareva, O., Collins, C. C., & Ester, M. (2019). MOLI: multi-omics late integration with deep neural networks for drug response prediction. Bioinformatics, 35(14), I501-I509. doi:10.1093/bioinformatics/btz318
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2935584
Theorell, A., Seiffarth, J., Grünberger, A., & Noeh, K. (2019). When a single lineage is not enough: Uncertainty-Aware Tracking for spatio-temporal live-cell image analysis. BIOINFORMATICS, 35(7), 1221-1228. doi:10.1093/bioinformatics/bty776
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2018 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2917896 OA
Lux, M., Brinkman, R. R., Chauve, C., Laing, A., Lorenc, A., Abeler-Dörner, L., & Hammer, B. (2018). flowLearn: Fast and precise identification and quality checking of cell populations in flow cytometry. Bioinformatics, 34(13), 2245-2253. doi:10.1093/bioinformatics/bty082
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941786
Ebler, J., Schönhuth, A., & Marschall, T. (2017). Genotyping inversions and tandem duplications. Bioinformatics, 33(24), 4015-4023. doi:10.1093/bioinformatics/btx020
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | PUB-ID: 2918897
Thijssen, B., Dijkstra, T. M. H., Heskes, T., & Wessels, L. F. A. (2017). Bayesian data integration for quantifying the contribution of diverse measurements to parameter estimates. Bioinformatics, 34(5), 803-811. doi:10.1093/bioinformatics/btx666
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933892
Dirmeier, S., Fuchs, C., Mueller, N. S., & Theis, F. J. (2017). netReg: network-regularized linear models for biological association studies. Bioinformatics, 34(5), 896-898. doi:10.1093/bioinformatics/btx677
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941793
Gregor, I., Schönhuth, A., & McHardy, A. C. (2016). Snowball: strain aware gene assembly of metagenomes. Bioinformatics, 32(17), i649-i657. doi:10.1093/bioinformatics/btw426
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2912555
Helfrich, S., Azzouzi, C. E., Probst, C., Seiffarth, J., Grünberger, A., Wiechert, W., Kohlheyer, D., et al. (2015). Vizardous: interactive analysis of microbial populations with single cell resolution. Bioinformatics, 31(23), 3875-3877., btv468. doi:10.1093/bioinformatics/btv468
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2674387
Hilker, R., Stadermann, K. B., Doppmeier, D., Kalinowski, J., Stoye, J., Straube, J., Winnebald, J., et al. (2014). ReadXplorer - Visualization and Analysis of Mapped Sequences. Bioinformatics, 30(16), 2247-2254. doi:10.1093/bioinformatics/btu205
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2643941
Hoffmann, N., Wilhelm, M., Doebbe, A., Niehaus, K., & Stoye, J. (2014). BiPACE 2D – Graph-based multiple alignment for comprehensive two-dimensional gas chromatography–mass spectrometry. Bioinformatics, 30(7), 988-995. doi:10.1093/bioinformatics/btt738
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2700599
Janssen, S., & Giegerich, R. (2014). The RNA shapes studio. Bioinformatics, 31(3), 423-425. doi:10.1093/bioinformatics/btu649
PUB | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941836
Marschall, T., Hajirasouliha, I., & Schönhuth, A. (2013). MATE-CLEVER: Mendelian-inheritance-aware discovery and genotyping of midsize and long indels. Bioinformatics, 29(24), 3143-3150. doi:10.1093/bioinformatics/btt556
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2551798
Sauthoff, G., Mohl, M., Janssen, S., & Giegerich, R. (2013). Bellman's GAP -- a Language and Compiler for Dynamic Programming in Sequence Analysis. Bioinformatics, 29(5), 551-560. doi:10.1093/bioinformatics/btt022
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2610129
Kessler, N., Bonte, A., Langenkämper, G., Niehaus, K., Goesmann, A., & Nattkemper, T. W. (2013). MeltDB 2.0 - Advances of the metabolomics software system. Bioinformatics, 29(19), 2452-2459. doi:10.1093/bioinformatics/btt414
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941839
Marschall, T., Costa, I. G., Canzar, S., Bauer, M., Klau, G. W., Schliep, A., & Schönhuth, A. (2012). CLEVER: clique-enumerating variant finder. Bioinformatics, 28(22), 2875-2882. doi:10.1093/bioinformatics/bts566
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941840
Hajirasouliha, I., Schönhuth, A., de Juan, D., Valencia, A., & Sahinalp, S. C. (2012). Mirroring co-evolving trees in the light of their topologies. Bioinformatics, 28(9), 1202-1208. doi:10.1093/bioinformatics/bts109
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2510984
Hilker, R., Sickinger, C., Pedersen, C. N. S., & Stoye, J. (2012). UniMoG - A unifying framework for genomic distance calculation and sorting based on DCJ. Bioinformatics, 28(19), 2509-2511. doi:10.1093/bioinformatics/bts440
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 

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