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67 Publikationen

2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941761
Baaijens JA, Schönhuth A. Overlap graph-based generation of haplotigs for diploids and polyploids. Bioinformatics. 2019;35(21):4281-4289.
PUB | DOI
 
2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941754
Baaijens JA, Van der Roest B, Köster J, Stougie L, Schönhuth A. Full-length de novo viral quasispecies assembly through variation graph construction. Bioinformatics. 2019;35(24):5086-5094.
PUB | DOI
 
2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941756
Yin B, Balvert M, van der Spek RAA, et al. Using the structure of genome data in the design of deep neural networks for predicting amyotrophic lateral sclerosis from genotype. Bioinformatics. 2019;35(14):i538-i547.
PUB | DOI
 
2019 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2936939
Sharifi-Noghabi H, Zolotareva O, Collins CC, Ester M. MOLI: multi-omics late integration with deep neural networks for drug response prediction. Bioinformatics. 2019;35(14):I501-I509.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2935584
Theorell A, Seiffarth J, Grünberger A, Noeh K. When a single lineage is not enough: Uncertainty-Aware Tracking for spatio-temporal live-cell image analysis. BIOINFORMATICS. 2019;35(7):1221-1228.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2018 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2917896
Lux M, Brinkman RR, Chauve C, et al. flowLearn: Fast and precise identification and quality checking of cell populations in flow cytometry. Bioinformatics. 2018;34(13):2245-2253.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2017 | Zeitschriftenaufsatz | PUB-ID: 2918897
Thijssen B, Dijkstra TMH, Heskes T, Wessels LFA. Bayesian data integration for quantifying the contribution of diverse measurements to parameter estimates. Bioinformatics. 2017;34(5):803-811.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941786
Ebler J, Schönhuth A, Marschall T. Genotyping inversions and tandem duplications. Bioinformatics. 2017;33(24):4015-4023.
PUB | DOI
 
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933892
Dirmeier S, Fuchs C, Mueller NS, Theis FJ. netReg: network-regularized linear models for biological association studies. Bioinformatics. 2017;34(5):896-898.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941793
Gregor I, Schönhuth A, McHardy AC. Snowball: strain aware gene assembly of metagenomes. Bioinformatics. 2016;32(17):i649-i657.
PUB | DOI
 
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2912555
Helfrich S, Azzouzi CE, Probst C, et al. Vizardous: interactive analysis of microbial populations with single cell resolution. Bioinformatics. 2015;31(23):3875-3877: btv468.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2674387
Hilker R, Stadermann KB, Doppmeier D, et al. ReadXplorer - Visualization and Analysis of Mapped Sequences. Bioinformatics. 2014;30(16):2247-2254.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2643941
Hoffmann N, Wilhelm M, Doebbe A, Niehaus K, Stoye J. BiPACE 2D – Graph-based multiple alignment for comprehensive two-dimensional gas chromatography–mass spectrometry. Bioinformatics. 2014;30(7):988-995.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2700599
Janssen S, Giegerich R. The RNA shapes studio. Bioinformatics. 2014;31(3):423-425.
PUB | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941836
Marschall T, Hajirasouliha I, Schönhuth A. MATE-CLEVER: Mendelian-inheritance-aware discovery and genotyping of midsize and long indels. Bioinformatics. 2013;29(24):3143-3150.
PUB | DOI
 
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2551798
Sauthoff G, Mohl M, Janssen S, Giegerich R. Bellman's GAP -- a Language and Compiler for Dynamic Programming in Sequence Analysis. Bioinformatics. 2013;29(5):551-560.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2610129
Kessler N, Bonte A, Langenkämper G, Niehaus K, Goesmann A, Nattkemper TW. MeltDB 2.0 - Advances of the metabolomics software system. Bioinformatics. 2013;29(19):2452-2459.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941840
Hajirasouliha I, Schönhuth A, de Juan D, Valencia A, Sahinalp SC. Mirroring co-evolving trees in the light of their topologies. Bioinformatics. 2012;28(9):1202-1208.
PUB | DOI
 
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941839
Marschall T, Costa IG, Canzar S, et al. CLEVER: clique-enumerating variant finder. Bioinformatics. 2012;28(22):2875-2882.
PUB | DOI
 
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2510984
Hilker R, Sickinger C, Pedersen CNS, Stoye J. UniMoG - A unifying framework for genomic distance calculation and sorting based on DCJ. Bioinformatics. 2012;28(19):2509-2511.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 

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