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138 Publikationen

2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941280
Phylogenomics of 10,575 genomes reveals evolutionary proximity between domains Bacteria and Archaea
Zhu Q, Mai U, Pfeiffer W, Janssen S, Asnicar F, Sanders JG, Belda-Ferre P, Al-Ghalith GA, Kopylova E, McDonald D, Kosciolek T, et al. (2019)
Nature Communications 10(1): 5477.
PUB | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941281
The impact of skin care products on skin chemistry and microbiome dynamics
Bouslimani A, da Silva R, Kosciolek T, Janssen S, Callewaert C, Amir A, Dorrestein K, Melnik AV, Zaramela LS, Kim J-N, Humphrey G, et al. (2019)
BMC Biology 17(1): 47.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901460
The BRaliBase Dent – a Tale of Benchmark Design and Interpretation
Löwes B, Chauve C, Ponty Y, Giegerich R (2017)
Briefings in Bioinformatics 18(2): 306-311.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2903044
Integrating Pareto Optimization into Dynamic Programming
Gatter T, Giegerich R, Saule C (2016)
ALGORITHMS 9(1): 12.
PUB | DOI | WoS
 
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2917100
Transcriptomic Profiling of Yersinia pseudotuberculosis Reveals Reprogramming of the Crp Regulon by Temperature and Uncovers Crp as a Master Regulator of Small RNAs
Nuss AM, Heroven AK, Waldmann B, Reinkensmeier J, Jarek M, Beckstette M, Dersch P (2015)
PLOS GENETICS 11(3): e1005087.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2905757 PUB | DOI
 
2014 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2682131 OA PUB | PDF
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2699802
Genome-wide profiling of Hfq-binding RNAs uncovers extensive post-transcriptional rewiring of major stress response and symbiotic regulons in Sinorhizobium meliloti
Torres-Quesada O, Reinkensmeier J, Schlueter J-P, Robledo M, Peregrina A, Giegerich R, Toro N, Becker A, Jimenez-Zurdo JI (2014)
RNA Biology 11(5): 563-579.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2681698
Yield grammar analysis and product optimization in a domain-specific language for dynamic programming
Sauthoff G, Giegerich R (2014)
Science of Computer Programming 87: 2-22.
PUB | DOI | WoS
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2699792
Riboregulation in plant-associated alpha-proteobacteria
Becker A, Overloeper A, Schlueter J-P, Reinkensmeier J, Robledo M, Giegerich R, Narberhaus F, Evguenieva-Hackenberg E (2014)
RNA Biology 11(5): 550-562.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2584661
Global mapping of transcription start sites and promoter motifs in the symbiotic a-proteobacterium Sinorhizobium meliloti 1021
Schlueter J-P, Reinkensmeier J, Barnett MJ, Lang C, Krol E, Giegerich R, Long SR, Becker A (2013)
Bmc Genomics 14(1): 156.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2645192
A Silent Exonic SNP in Kdm3a Affects Nucleic Acids Structure but Does Not Regulate Experimental Autoimmune Encephalomyelitis
Gillett A, Bergman P, Parsa R, Bremges A, Giegerich R, Jagodic M (2013)
Plos One 8(12): e81912.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2013 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901275
Avoiding Ambiguity and Assessing Uniqueness in Minisatellite Alignment
Löwes B, Giegerich R (2013)
In: German Conference on Bioinformatics 2013. Beißbarth T, Kollmar M, Leha A, Morgenstern B, Schultz A-K, Waack S, Wingender E (Eds); OpenAccess Series in Informatics (OASIcs), 34. Dagstuhl, Germany: Schloss Dagstuhl - Leibniz-Zentrum für Informatik: 110-124.
PUB | DOI
 
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2607289
Forest alignment with affine gaps and anchors, applied in RNA structure comparison
Schirmer S, Giegerich R (2013)
Theoretical Computer Science 483: 51-67.
PUB | DOI | WoS
 
2012 | Sammelwerksbeitrag | PUB-ID: 2439665
Abstract Shape Analysis of RNA
Janssen S, Giegerich R (2012)
In: RNA Bioinformatics t.b.a. Gorodkin J, Weinberg Z (Eds); 1-35.
PUB
 
2011 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2302459 OA
Analytische und empirische Untersuchungen über abstrakte Shapes von RNA-Sekundärstrukturen
Abdul-Hak S (2011)
Bielefeld (Germany): Bielefeld University.
PUB | PDF
 
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2410526 OA
Lost in folding space? Comparing four variants of the thermodynamic model for RNA secondary structure prediction
Janssen S, Schudoma C, Steger G, Giegerich R (2011)
BMC Bioinformatics 12(1): 429.
PUB | PDF | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2427226
Conservation and Occurrence of Trans-Encoded sRNAs in the Rhizobiales
Reinkensmeier J, Schlüter J-P, Giegerich R, Becker A (2011)
GENES 2(4): 925-956.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383357
Yield grammar analysis in the Bellman's GAP compiler
Giegerich R, Sauthoff G (2011)
In: Proceedings of the Eleventh Workshop on Language Descriptions, Tools and Applications (ACM).
PUB
 
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383363
Forest Alignment with Affine Gaps and Anchors
Schirmer S, Giegerich R (2011)
Combinatorial Pattern Matching: 104-117.
PUB | DOI
 

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