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3393 Publikationen

2003 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1609762
Kandlbinder, A.; Wormuth, D.; Baier, M.; Scheibe, R.; Dietz, K. - J. (2003): Redox control of chloroplast and nuclear gene expression FREE RADICAL RESEARCH,37:(Suppl. 2): 24.
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1610221
Pühler, A.; Tauch, A. (2003): A new era in Corynebacterium glutamicum biotechnology JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY,104:(1-3): 1-3.
PUB | DOI | WoS
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1610269
Rückert, C.; Pühler, A.; Kalinowski, J. (2003): Genome-wide analysis of the L-methionine biosynthetic pathway in Corynebacterium glutamicum by targeted gene deletion and homologous complementation JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY,104:(1-3): 213-228.
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1610687
Li, Y.; Rosso, M. G.; Strizhov, N.; Viehöver, P.; Weisshaar, B. (2003): GABI-Kat SimpleSearch: a flanking sequence tag (FST) database for the identification of T-DNA insertion mutants in Arabidopsis thaliana Bioinformatics,19:(11): 1441-1442.
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1610941
König, J.; Lotte, K.; Plessow, R.; Brockhinke, A.; Baier, M.; Dietz, K. - J. (2003): Reaction mechanism of plant 2-Cys peroxiredoxin - Role of the C terminus and the quaternary structure JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY,278:(27): 24409-24420.
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1611014
Brand, S.; Niehaus, K.; Pühler, A.; Kalinowski, J. (2003): Identification and functional analysis of six mycolyltransferase genes of Corynebacterium glutamicum ATCC 13032: the genes cop1, cmt1, and cmt2 can replace each other in the synthesis of trehalose dicorynomycolate, a component of the mycolic acid layer of the cell envelope Archives of Microbiology,180:(1): 33-44.
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1611196
Campbell, G. R. O.; Sharypova, L. A.; Scheidle, H.; Jones, K. M.; Niehaus, K.; Becker, A.; Walker, G. C. (2003): Striking complexity of lipopolysaccharide defects in a collection of Sinorhizobium meliloti mutants Journal of Bacteriology,185:(13): 3853-3862.
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1609247
Pühler, A.; Selbitschka, W. (2003): Genome research on bacteria relevant for agriculture, environment and biotechnology JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY,106:(2-3): 119-120.
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1609350
Watt, S. A.; Patschkowski, T.; Kalinowski, J.; Niehaus, K. (2003): Qualitative and quantitative proteomics by two-dimensional gel electrophoresis, peptide mass fingerprint and a chemically-coded affinity tag (CCAT) Journal of Biotechnology,106:(2-3): 287-300.
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1609437
Beshay, U.; Friehs, K.; Azzam, A. E. M.; Flaschel, E. (2003): Analysis of the behaviour of Dictyostelium discoideum in immobilised state by means of continuous cultivation BIOPROCESS AND BIOSYSTEMS ENGINEERING,26:(2): 117-122.
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1610023
Baar, C.; Eppinger, M.; Raddatz, G.; Simon, J.; Lanz, C.; Klimmek, O.; Nandakumar, R.; Gross, R.; Rosinus, A.; Keller, H.; Jagtap, P.; Linke, B.; Meyer, F.; Lederer, H.; Schuster, S. C. (2003): Complete genome sequence and analysis of Wolinella succinogenes PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA,100:(20): 11690-11695.
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1610193
Hohnjec, N.; Perlick, A. M.; Pühler, A.; Küster, H. (2003): The Medicago truncatula sucrose synthase gene MtSucS1 is activated both in the infected region of root nodules and in the cortex of roots colonized by arbuscular mycorrhizal fungi Mol Plant Microbe Interact,16:(10): 903-915.
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1610484
Tennstedt, T.; Szczepanowski, R.; Braun, S.; Pühler, A.; Schluter, A. (2003): Occurrence of integron-associated resistance gene cassettes located on antibiotic resistance plasmids isolated from a wastewater treatment plant FEMS MICROBIOLOGY ECOLOGY,45:(3): 239-252.
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1918949
Giegerich, R.; Stoye, J. (2003): Finden, fast ohne zu suchen: Indexstrukturen in der Bioinformatik Forschung an der Universität Bielefeld,26: 63-68.
PUB
 
2003 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1919005
Bannert, C.; Stoye, J. (2003): Evaluation of the Jumping Alignment Algorithm with Artificial and Biological Data. In: Proc. of GCB 2003. S. 21-25.
PUB
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1611080
Kluge, C.; Lamkemeyer, P.; Tavakoli, N.; Golldack, D.; Kandlbinder, A.; Dietz, K. - J. (2003): cDNA cloning of 12 subunits of the V-type ATPase from Mesembryanthemum crystallinum and their expression under stress MOLECULAR MEMBRANE BIOLOGY,20:(2): 171-183.
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2003 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1609756
Finkemeier, I.; Lamkemeyer, P.; Kandlbinder, A.; Baier, M.; Dietz, K. - J. (2003): New insights into the antioxidant defence of mitochondria: The role of type II peroxiredoxin F (PRXII F) FREE RADICAL RESEARCH,37:(Suppl. 2): 21-22.
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2003 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1609768
Lamkemeyer, P.; Finkemeier, I.; Kandlbinder, A.; Baier, M.; Dietz, K. - J. (2003): The role of the peroxiredoxin Q in the antioxidant defence system of the chloroplast FREE RADICAL RESEARCH,37:(Suppl. 2): 40-40.
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1609927
Wieneke, S.; Heimann, P.; Leibovitz, S.; Nudel, U.; Jockusch, H. (2003): Acute pathophysiological effects of muscle-expressed Dp71 transgene on normal and dystrophic mouse muscle Journal of Applied Physiology,95:(5): 1861-1866.
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1610260
Hartmann, M.; Tauch, A.; Eggeling, L.; Bathe, B.; Mockel, B.; Pühler, A.; Kalinowski, J. (2003): Identification and characterization of the last two unknown genes, dapC and dapF, in the succinylase branch of the L-lysine biosynthesis of Corynebacterium glutamicum J Biotechnol,104:(1-3): 199-211.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | GenBank
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1610392
Dietz, K. - J. (2003): Plant peroxiredoxins ANNUAL REVIEW OF PLANT BIOLOGY,54: 93-107.
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1610397 OA
Giegerich, R.; Kurtz, S.; Stoye, J. (2003): Efficient implementation of lazy suffix trees SOFTWARE-PRACTICE & EXPERIENCE,33:(11): 1035-1049.
PUB | PDF | DOI | WoS
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1609136
Frohnmeyer, H.; Staiger, D. (2003): Ultraviolet-B radiation-mediated responses in plants. Balancing damage and protection Plant Physiology,133:(4): 1420-1428.
PUB | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1609251
Kaiser, O.; Bartels, D.; Bekel, T.; Goesmann, A.; Kespohl, S.; Pühler, A.; Meyer, F. (2003): Whole genome shotgun sequencing guided-by bioinformatics pipelines - An optimized approach for an established technique JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY,106:(2-3): 121-133.
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1609403 OA
Sammeth, M.; Morgenstern, B.; Stoye, J. (2003): Divide-and-conquer multiple alignment with segment-based constraints BIOINFORMATICS,19:(Suppl 2): ii189-ii195.
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1612098
Sharypova, L. A.; Niehaus, K.; Scheidle, H.; Holst, O.; Becker, A. (2003): Sinorhizobium meliloti acpXL mutant lacks the C28 hydroxylated fatty acid moiety of lipid A and does not express a slow migrating form of lipopolysaccharide JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY,278:(15): 12946-12954.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1612500
Puehler, F.; Schwarz, H.; Waidner, B.; Kalinowski, J.; Kaspers, B.; Bereswill, S.; Staeheli, P. (2003): An interferon-gamma-binding protein of novel structure encoded by the fowlpox virus JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY,278:(9): 6905-6911.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1610798
Popova, O. V.; Dietz, K. - J.; Golldack, D. (2003): Salt-dependent expression of a nitrate transporter and two amino acid transporter genes in Mesembryanthemum crystallinum PLANT MOLECULAR BIOLOGY,52:(3): 569-578.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1609190
Rosso, M. G.; Li, Y.; Strizhov, N.; Reiss, B.; Dekker, K.; Weisshaar, B. (2003): An Arabidopsis thaliana T-DNA mutagenized population (GABI-Kat) for flanking sequence tag-based reverse genetics Plant Molecular Biology,53:(1/2): 247-259.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | GenBank | NASC Seedstock
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1609260
Dondrup, M.; Goesmann, A.; Bartels, D.; Kalinowski, J.; Krause, L.; Linke, B.; Rupp, O.; Sczyrba, A.; Pühler, A.; Meyer, F. (2003): EMMA: a platform for consistent storage and efficient analysis of microarray data JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY,106:(2-3): 135-146.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1609272
Wilke, A.; Rückert, C.; Bartels, D.; Dondrup, M.; Goesmann, A.; Hüser, A. T.; Kespohl, S.; Linke, B.; Mahne, M.; McHardy, A.; Pühler, A.; Meyer, F. (2003): Bioinformatics support for high-throughput proteomics JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY,106:(2-3): 147-156.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1609328
Rüberg, S.; Tian, Z. X.; Krol, E.; Linke, B.; Meyer, F.; Wang, Y. P.; Pühler, A.; Weidner, S.; Becker, A. (2003): Construction and validation of a Sinorhizobium meliloti whole genome DNA microarray: genome-wide profiling of osmoadaptive gene expression JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY,106:(2-3): 255-268.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1609443
Del Papa, M. F.; Pistorio, M.; Balague, L. J.; Draghi, W. O.; Wegener, C.; Perticari, A.; Niehaus, K.; Lagares, A. (2003): A microcosm study on the influence of pH and the host-plant on the soil persistence of two alfalfa-nodulating rhizobia with different saprophytic and symbiotic characteristics Biology and Fertility of Soils,39:(2): 112-116.
PUB | DOI | WoS
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1610274
McHardy, A. C.; Tauch, A.; Rückert, C.; Pühler, A.; Kalinowski, J. (2003): Genome-based analysis of biosynthetic aminotransferase genes of Corynebacterium glutamicum J Biotechnol,104:(1-3): 229-240.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | GenBank
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1610281
Kirchner, O.; Tauch, A. (2003): Tools for genetic engineering in the amino acid-producing bacterium Corynebacterium glutamicum JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY,104:(1-3): 287-299.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | GenBank
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1610402
Metwally, A.; Finkemeier, I.; Georgi, M.; Dietz, K. - J. (2003): Salicylic acid alleviates the cadmium toxicity in barley seedlings PLANT PHYSIOLOGY,132:(1): 272-281.
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2003 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1610433
Bergeron, A.; Stoye, J. (2003): On the similarity of sets of permutations and its applications to genome comparison. In: Proc. of COCOON 2003. (LNCS, 2697). S. 68-79.
PUB | DOI | WoS
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1610503 OA
Sammeth, M.; Rothgänger, J.; Esser, W.; Albert, J.; Stoye, J.; Harmsen, D. (2003): QAlign: quality-based multiple alignments with dynamic phylogenetic analysis BIOINFORMATICS,19:(12): 1592-1593.
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2003 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1610736
Schleef, M.; Voß, C.; Schmidt, T.; Flaschel, E. (2003): Plasmid topology - An important factor influencing the performance of DNA drug delivery JOURNAL OF LIPOSOME RESEARCH,13:(1): 82-83.
PUB | WoS
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1612324 OA
Tauch, A.; Schlüter, A.; Bischoff, N.; Goesmann, A.; Meyer, F.; Pühler, A. (2003): The 79,370-bp conjugative plasmid pB4 consists of an IncP-1 beta backbone loaded with a chromate resistance transposon, the strA-strB streptomycin resistance gene pair, the oxacillinase gene bla(NPS-1), and a tripartite antibiotic efflux system of the resistance-nodulation-division family Molecular Genetics and Genomics,268:(5): 570-584.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | GenBank
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1612470
Morgenstern, B.; Goel, S.; Sczyrba, A.; Dress, A. (2003): AltAVisT: Comparing alternative multiple sequence alignments BIOINFORMATICS,19:(3): 425-426.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1612610
Horling, F.; Lamkemeyer, P.; König, J.; Finkemeier, I.; Kandlbinder, A.; Baier, M.; Dietz, K. - J. (2003): Divergent light-, ascorbate-, and oxidative stress-dependent regulation of expression of the peroxiredoxin gene family in Arabidopsis Plant Physiology,131:(1): 317-325.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1611943
Golldack, D.; Vera, P.; Dietz, K. - J. (2003): Expression of subtilisin-like serine proteases in Arabidopsis thaliana is cell-specific and responds to jasmonic acid and heavy metals with developmental differences PHYSIOLOGIA PLANTARUM,118:(1): 64-73.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773767 OA
Brudno, M.; Chapman, M.; Göttgens, B.; Batzoglou, S.; Morgenstern, B. (2003): Fast and sensitive multiple alignment of large genomic sequences BMC Bioinformatics,4:(1):66
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773844 OA
Sczyrba, A.; Krüger, J.; Mersch, H.; Kurtz, S.; Giegerich, R. (2003): RNA-related tools on the Bielefeld Bioinformatics Server Nucleic Acids Research,31:(13): 3767-3770.
PUB | Dateien verfügbar | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1990229
Hunger, S.; Di Gaspero, G.; Mohring, S.; Bellin, D.; Schafer-Pregl, R.; Borchardt, D. C.; Durel, C. - E.; Werber, M.; Weisshaar, B.; Salamini, F.; Schneider, K. (2003): Isolation and linkage analysis of expressed disease-resistance gene analogues of sugar beet (Beta vulgaris L.) Genome,46:(1): 70-82.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1895107
Lange, C.; Rittmann, D.; Wendisch, V. F.; Bott, M.; Sahm, H. (2003): Global expression profiling and physiological characterization of Corynebacterium glutamicum grown in the presence of L-valine Applied and Environmental Microbiology,69:(5): 2521-2532.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773880 OA
Meyer, F.; Goesmann, A.; McHardy, A. C.; Bartels, D.; Bekel, T.; Clausen, J.; Kalinowski, J.; Linke, B.; Rupp, O.; Giegerich, R.; Pühler, A. (2003): GenDB - an open source genome annotation system for prokaryote genomes Nucleic Acids Research,31:(8): 2187-2195.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1914161
Piechaczek, C.; Widera, D.; Micheli, D.; Schwamborn, E.; Völkel, T.; Schmitz, J. (2003): Differentiation of adult CD133+ cells isolated from peripheral blood into cells with a neural phenotype MACS & more,7:(1): 9-10.
PUB
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1666680
Höchsmann, M.; Töller, T.; Giegerich, R.; Kurtz, S. (2003): Local similarity in RNA secondary structures. Proc IEEE Comput Soc Bioinform Conf,2: 159-168.
PUB | PubMed | Europe PMC
 

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