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410 Publikationen

2003 | Report | PUB-ID: 1970475
K. - B. Schürmann, and J. Stoye, Suffix Tree Construction and Storage with Limited Main Memory, Technische Fakultät Der Universität Bielefeld, Bielefeld, 2003.
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1612664
S. Heber, and J. Stoye, “The European Conference on Computational Biology”, Drug Discovery Today, 2003, 8, 113-114.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1918949
R. Giegerich, and J. Stoye, “Finden, fast ohne zu suchen: Indexstrukturen in der Bioinformatik”, Forschung an der Universität Bielefeld, 2003, 26, 63-68.
PUB
 
2003 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1919005
C. Bannert, and J. Stoye, in Proc. of GCB 2003, 2003, p. 21-25.
PUB
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1610397
R. Giegerich, S. Kurtz, and J. Stoye, “Efficient implementation of lazy suffix trees”, SOFTWARE-PRACTICE & EXPERIENCE, 2003, 33, 1035-1049.
PUB | PDF | DOI | WoS
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1609403
M. Sammeth, B. Morgenstern, and J. Stoye, “Divide-and-conquer multiple alignment with segment-based constraints”, BIOINFORMATICS, 2003, 19, ii189-ii195.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2003 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1610433
A. Bergeron, and J. Stoye, in Proc. of COCOON 2003, 2003, p. 68-79.
PUB | DOI | WoS
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1610503
M. Sammeth, J. Rothgänger, W. Esser, J. Albert, J. Stoye, and D. Harmsen, “QAlign: quality-based multiple alignments with dynamic phylogenetic analysis”, BIOINFORMATICS, 2003, 19, 1592-1593.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2003 | Report | PUB-ID: 1970477
A. Bergeron, and J. Stoye, On the Similarity of Sets of Permutations and its Applications to Genome Comparison, Technische Fakultät Der Universität Bielefeld, Bielefeld, 2003.
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2003 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2017545
T. W. Nattkemper, T. Hermann, W. Schubert, and H. Ritter, in Engineering in Medicine and Biology Society. Proceedings of the 25th Annual International Conference of the IEEE, Ieee, Cancun, Mexico, 2003, p. 1311-1314.
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2002 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1918951
J. Stoye, in Lecture Notes in Informatics (Eds.: S. Schubert, B. Reusch, N. Jesse), 2002, p. 67-67.
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2002 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1919000
M. Cieliebak, Z. Lipták, E. Welzl, T. Erlebach, and J. Stoye, in Proc. of IFIP TCS 2002, 2002, p. 143-156.
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2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773578
R. Spang, M. Rehmsmeier, and J. Stoye, “A novel approach to remote homology detection: jumping alignments”, Journal of Computational Biology, 2002, 9, 747-760.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773332
J. Stoye, and D. Gusfield, “Simple and flexible detection of contiguous repeats using a suffix tree”, Theoretical Computer Science, 2002, 270, 843-856.
PUB | PDF | DOI | WoS
 
2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773329
A. Bergeron, S. Heber, and J. Stoye, “Common intervals and sorting by reversals: a marriage of necessity”, Bioinformatics, 2002, 18, S54-S63.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2002 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1918995
S. Heber, J. Stoye, M. Frohme, J. Hoheisel, and M. Vingron, in Proc. of GfKl 2000, 2002, p. 437-444.
PUB
 
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1918992
S. Heber, and J. Stoye, in Proc. of CPM 2001, 2001, p. 207-218.
PUB | DOI
 
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1880197
S. Heber, and J. Stoye, in Proc. of WABI 2001, Sppringer, Berlin, 2001, p. 252-263.
PUB | DOI
 
2001 | Report | PUB-ID: 1970479
M. Cieliebak, T. Erlebach, Z. Lipták, J. Stoye, and E. Welzl, Algorithmic Complexity of Protein Identification: Combinatorics of Weighted Strings, ETH Zürich, Dept. of Computer Science, 2001.
PUB
 
2000 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1918981
S. Heber, J. Stoye, J. Hoheisel, and M. Vingron, in Proc. of RECOMB 2000, 2000, p. 155-164.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 

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