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410 Publikationen

2003 | Report | PUB-ID: 1970475
Suffix Tree Construction and Storage with Limited Main Memory
Schürmann K-B, Stoye J (2003) Forschungsberichte.
Bielefeld: Technische Fakultät der Universität Bielefeld.
PUB | PDF
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1612664
The European Conference on Computational Biology
Heber S, Stoye J (2003)
Drug Discovery Today 8(3): 113-114.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1918949
Finden, fast ohne zu suchen: Indexstrukturen in der Bioinformatik
Giegerich R, Stoye J (2003)
Forschung an der Universität Bielefeld 26: 63-68.
PUB
 
2003 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1919005
Evaluation of the Jumping Alignment Algorithm with Artificial and Biological Data
Bannert C, Stoye J (2003)
In: Proc. of GCB 2003. 21-25.
PUB
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1610397
Efficient implementation of lazy suffix trees
Giegerich R, Kurtz S, Stoye J (2003)
SOFTWARE-PRACTICE & EXPERIENCE 33(11): 1035-1049.
PUB | PDF | DOI | WoS
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1609403
Divide-and-conquer multiple alignment with segment-based constraints
Sammeth M, Morgenstern B, Stoye J (2003)
BIOINFORMATICS 19(Suppl 2): ii189-ii195.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2003 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1610433
On the similarity of sets of permutations and its applications to genome comparison
Bergeron A, Stoye J (2003)
In: Proc. of COCOON 2003. LNCS, 2697. 68-79.
PUB | DOI | WoS
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1610503
QAlign: quality-based multiple alignments with dynamic phylogenetic analysis
Sammeth M, Rothgänger J, Esser W, Albert J, Stoye J, Harmsen D (2003)
BIOINFORMATICS 19(12): 1592-1593.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2003 | Report | PUB-ID: 1970477
On the Similarity of Sets of Permutations and its Applications to Genome Comparison
Bergeron A, Stoye J (2003) Forschungsberichte.
Bielefeld: Technische Fakultät der Universität Bielefeld.
PUB | PDF
 
2003 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2017545
Look & Listen: Sonification and Visualization of Multiparameter Micrographs
Nattkemper TW, Hermann T, Schubert W, Ritter H (2003)
In: Engineering in Medicine and Biology Society. Proceedings of the 25th Annual International Conference of the IEEE., 2. Cancun, Mexico: IEEE: 1311-1314.
PUB | PDF
 
2002 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1918951
Index Structures for Large Sequence Data: Suffix Trees and Affix Trees
Stoye J (2002)
In: Lecture Notes in Informatics. Schubert S, Reusch B, Jesse N (Eds); , P-20(Ergänzungsband). 67-67.
PUB
 
2002 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1919000
Algorithmic Complexity of Protein Identification: Searching in Weighted Strings
Cieliebak M, Lipták Z, Welzl E, Erlebach T, Stoye J (2002)
In: Proc. of IFIP TCS 2002. 143-156.
PUB
 
2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773578
A novel approach to remote homology detection: jumping alignments
Spang R, Rehmsmeier M, Stoye J (2002)
Journal of Computational Biology 9(5): 747-760.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773332
Simple and flexible detection of contiguous repeats using a suffix tree
Stoye J, Gusfield D (2002)
Theoretical Computer Science 270(1-2): 843-856.
PUB | PDF | DOI | WoS
 
2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773329
Common intervals and sorting by reversals: a marriage of necessity
Bergeron A, Heber S, Stoye J (2002)
Bioinformatics 18(Suppl 2): S54-S63.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2002 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1918995
Resampling Methods in Physical Mapping
Heber S, Stoye J, Frohme M, Hoheisel J, Vingron M (2002)
In: Proc. of GfKl 2000. 437-444.
PUB
 
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1918992
Finding all Common Intervals of k Permutations
Heber S, Stoye J (2001)
In: Proc. of CPM 2001. LNCS, 2089. 207-218.
PUB | DOI
 
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1880197
Algorithms for Finding Gene Clusters
Heber S, Stoye J (2001)
In: Proc. of WABI 2001. LNCS, 2149. Berlin: Sppringer: 252-263.
PUB | DOI
 
2001 | Report | PUB-ID: 1970479
Algorithmic Complexity of Protein Identification: Combinatorics of Weighted Strings
Cieliebak M, Erlebach T, Lipták Z, Stoye J, Welzl E (2001) Technical Report.
ETH Zürich, Dept. of Computer Science.
PUB
 
2000 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1918981
Contig Selection in Physical Mapping
Heber S, Stoye J, Hoheisel J, Vingron M (2000)
In: Proc. of RECOMB 2000. 155-164.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 

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