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413 Publikationen

2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1919012
Schürmann, K.-B. & Stoye, J. (2005). An Incomplex Algorithm for Fast Suffix Array Construction. Proc. of ALENEX/ANALCO 2005 (S. 77-85). Gehalten auf der ALENEX/ANALCO 2005.
PUB
 
2005 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1918824
Bergeron, A., Mixtacki, J. & Stoye, J. (2005). Chapter 10: The Inversion Distance Problem. In O. Gascuel (Hrsg.), Mathematics of Evolution and Phylogeny (S. 262-290). Oxford University Press.
PUB
 
2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1603220
Bergeron, A., Mixtacki, J. & Stoye, J. (2005). On Sorting by Translocations (LNBI). Proc. of RECOMB 2005 (S. 615-629). Gehalten auf der RECOMB 2005, SPRINGER-VERLAG BERLIN. doi:10.1007/11415770_47.
PUB | DOI | WoS
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1775168
Krause, A., Stoye, J. & Vingron, M. (2005). Large scale hierarchical clustering of protein sequences. BMC Bioinformatics, 6(1), 15. doi:10.1186/1471-2105-6-15.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773302
Bartels, D., Kespohl, S., Albaum, S., Drüke, T., Goesmann, A., Herold, J., Kaiser, O., Pühler, A., Pfeiffer, F., Raddatz, G., Stoye, J., Meyer, F. & Schuster, S.C. (2005). BACCardI - a tool for the validation of genomic assemblies, assisting genome finishing and intergenome comparison. Bioinformatics, 21(7), 853-859. Oxford University Press. doi:10.1093/bioinformatics/bti091.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1602793
Böcker, S. & Kaltenbach, H.M. (2005). Mass spectra alignments and their significance. COMBINATORIAL PATTERN MATCHING, PROCEEDINGS (S. 429-441). SPRINGER-VERLAG BERLIN.
PUB | WoS
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1918947
Böcker, S. & Stoye, J. (2005). Informatische Methoden zur Protein-Identifikation. LaborPraxis, 29(10), 24-26.
PUB
 
2005 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2301827
Sammeth, M. (2005). Integrated multiple sequence alignment. Bielefeld (Germany): Bielefeld University.
PUB | PDF
 
2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1601348
Bannert, C. & Stoye, J. (2005). Protein Annotation by Secondary Structure Based Alignments (PASSTA) (LNBI). Proc. of CompLife 2005 (S. 79-90). Gehalten auf der CompLife 2005, Springer-Verlag. doi:10.1007/11560500_8.
PUB | DOI | WoS
 
2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1603216
Rasmussen, K.R., Stoye, J. & Myers, E.W. (2005). Efficient q-Gram Filters for Finding All ε-Matches Over a Given Length (LNBI). Proc. of RECOMB 2005 (S. 189-203). Gehalten auf der RECOMB 2005, SPRINGER-VERLAG BERLIN. doi:10.1007/11415770_15.
PUB | DOI | WoS
 
2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1601361
Sammeth, M., Weniger, T., Harmsen, D. & Stoye, J. (2005). Alignment of Tandem Repeats with Excision, Duplication, Substitution and Indels (EDSI) (LNBI). Proc. of WABI 2005 (S. 276-290). Gehalten auf der WABI 2005, SPRINGER-VERLAG BERLIN. doi:10.1007/11557067_23.
PUB | DOI | WoS
 
2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1919026
Schürmann, K.-B. & Stoye, J. (2005). Counting Suffix Arrays and Strings (LNCS). Proc. of SPIRE 2005 (S. 55-66). Gehalten auf der SPIRE 2005. doi:10.1007/11575832_8.
PUB | DOI
 
2005 | Report | PUB-ID: 1970472
Schürmann, K.-B. & Stoye, J. (2005). Counting Suffix Arrays and Strings (Forschungsberichte). Bielefeld: Technische Fakultät der Universität Bielefeld.
PUB | PDF
 
2004 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2309420
Zimmermann, J., Lipták, Z. & Hazelhurst, S. (2004). A Method for Evaluating the Quality of String Dissimilarity Measures and Clustering Algorithms for EST Clustering. Proc. BIBE (S. 301-309).
PUB
 
2004 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 1918823
Proceedings of the German Conference on Bioinformatics, GCB 2004 (Lecture Notes in Informatics). (2004). Proceedings of the German Conference on Bioinformatics, GCB 2004 (Lecture Notes in Informatics). (R. Giegerich & J. Stoye, Hrsg.), P-53. Bonn.
PUB
 
2004 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606286
Michael, M., Dieterich, C. & Stoye, J. (2004). Suboptimal Local Alignments across Multiple Scoring Schemes (LNBI). Proc. of WABI 2004 (S. 99-110). Gehalten auf der WABI 2004, SPRINGER-VERLAG BERLIN. doi:10.1007/978-3-540-30219-3_9.
PUB | DOI | WoS
 
2004 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1607260
Schmidt, T. & Stoye, J. (2004). Quadratic Time Algorithms for Finding Common Intervals in Two and More Sequences (LNCS). Proc. of CPM 2004 (S. 347-358). Gehalten auf der CPM 2004. doi:10.1007/978-3-540-27801-6_26.
PUB | DOI | WoS
 
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773554
Pollard, D.A., Bergman, C.M., Stoye, J., Celniker, S.E. & Eisen, M.B. (2004). Correction: Benchmarking tools for the alignment of functional noncoding DNA. BMC Bioinformatics, 5(1), 73. doi:10.1186/1471-2105-5-73.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773560
Cieliebak, M., Erlebach, T., Lipták, Z., Stoye, J. & Welzl, E. (2004). Algorithmic complexity of protein identification: combinatorics of weighted strings. Discrete Applied Mathematics, 137(1), 27-46. doi:10.1016/S0166-218X(03)00187-2.
PUB | PDF | DOI | WoS
 
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773312
Pollard, D.A., Bergman, C.M., Stoye, J., Celniker, S.E. & Eisen, M.B. (2004). Benchmarking tools for the alignment of functional noncoding DNA. BMC Bioinformatics, 5(1), 6. doi:10.1186/1471-2105-5-6.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 

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