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413 Publikationen

2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1919012
An Incomplex Algorithm for Fast Suffix Array Construction
Schürmann K-B, Stoye J (2005)
In: Proc. of ALENEX/ANALCO 2005. 77-85.
PUB
 
2005 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1918824
Chapter 10: The Inversion Distance Problem
Bergeron A, Mixtacki J, Stoye J (2005)
In: Mathematics of Evolution and Phylogeny. Gascuel O (Ed); Oxford University Press: 262-290.
PUB
 
2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1603220
On Sorting by Translocations
Bergeron A, Mixtacki J, Stoye J (2005)
In: Proc. of RECOMB 2005. LNBI, 3500. SPRINGER-VERLAG BERLIN: 615-629.
PUB | DOI | WoS
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1775168
Large scale hierarchical clustering of protein sequences
Krause A, Stoye J, Vingron M (2005)
BMC Bioinformatics 6(1): 15.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773302
BACCardI - a tool for the validation of genomic assemblies, assisting genome finishing and intergenome comparison
Bartels D, Kespohl S, Albaum S, Drüke T, Goesmann A, Herold J, Kaiser O, Pühler A, Pfeiffer F, Raddatz G, Stoye J, et al. (2005)
Bioinformatics 21(7): 853-859.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1602793
Mass spectra alignments and their significance
Böcker S, Kaltenbach HM (2005)
In: COMBINATORIAL PATTERN MATCHING, PROCEEDINGS., 3537. SPRINGER-VERLAG BERLIN: 429-441.
PUB | WoS
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1918947
Informatische Methoden zur Protein-Identifikation
Böcker S, Stoye J (2005)
LaborPraxis 29(10): 24-26.
PUB
 
2005 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2301827
Integrated multiple sequence alignment
Sammeth M (2005)
Bielefeld (Germany): Bielefeld University.
PUB | PDF
 
2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1601348
Protein Annotation by Secondary Structure Based Alignments (PASSTA)
Bannert C, Stoye J (2005)
In: Proc. of CompLife 2005. LNBI, 3695. Springer-Verlag: 79-90.
PUB | DOI | WoS
 
2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1603216
Efficient q-Gram Filters for Finding All ε-Matches Over a Given Length
Rasmussen KR, Stoye J, Myers EW (2005)
In: Proc. of RECOMB 2005. LNBI, 3500. SPRINGER-VERLAG BERLIN: 189-203.
PUB | DOI | WoS
 
2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1601361
Alignment of Tandem Repeats with Excision, Duplication, Substitution and Indels (EDSI)
Sammeth M, Weniger T, Harmsen D, Stoye J (2005)
In: Proc. of WABI 2005. LNBI, 3692. SPRINGER-VERLAG BERLIN: 276-290.
PUB | DOI | WoS
 
2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1919026
Counting Suffix Arrays and Strings
Schürmann K-B, Stoye J (2005)
In: Proc. of SPIRE 2005. LNCS, 3772. 55-66.
PUB | DOI
 
2005 | Report | PUB-ID: 1970472
Counting Suffix Arrays and Strings
Schürmann K-B, Stoye J (2005) Forschungsberichte.
Bielefeld: Technische Fakultät der Universität Bielefeld.
PUB | PDF
 
2004 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2309420 PUB
 
2004 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 1918823
Proceedings of the German Conference on Bioinformatics, GCB 2004
Giegerich R, Stoye J (Eds) (2004)
Lecture Notes in Informatics P-53.
PUB
 
2004 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606286
Suboptimal Local Alignments across Multiple Scoring Schemes
Michael M, Dieterich C, Stoye J (2004)
In: Proc. of WABI 2004. LNBI, 3240. SPRINGER-VERLAG BERLIN: 99-110.
PUB | DOI | WoS
 
2004 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1607260
Quadratic Time Algorithms for Finding Common Intervals in Two and More Sequences
Schmidt T, Stoye J (2004)
In: Proc. of CPM 2004. LNCS, 3109. 347-358.
PUB | DOI | WoS
 
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773554
Correction: Benchmarking tools for the alignment of functional noncoding DNA
Pollard DA, Bergman CM, Stoye J, Celniker SE, Eisen MB (2004)
BMC Bioinformatics 5(1): 73.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773560
Algorithmic complexity of protein identification: combinatorics of weighted strings
Cieliebak M, Erlebach T, Lipták Z, Stoye J, Welzl E (2004)
Discrete Applied Mathematics 137(1): 27-46.
PUB | PDF | DOI | WoS
 
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773312
Benchmarking tools for the alignment of functional noncoding DNA
Pollard DA, Bergman CM, Stoye J, Celniker SE, Eisen MB (2004)
BMC Bioinformatics 5(1): 6.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 

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