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413 Publikationen

2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1919012
Schürmann, K. - B., & Stoye, J. (2005). An Incomplex Algorithm for Fast Suffix Array Construction. Proc. of ALENEX/ANALCO 2005, 77-85
PUB
 
2005 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1918824
Bergeron, A., Mixtacki, J., & Stoye, J. (2005). Chapter 10: The Inversion Distance Problem. In O. Gascuel (Ed.), Mathematics of Evolution and Phylogeny (pp. 262-290). Oxford University Press.
PUB
 
2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1603220
Bergeron, A., Mixtacki, J., & Stoye, J. (2005). On Sorting by Translocations. Proc. of RECOMB 2005, LNBI, 3500, 615-629. SPRINGER-VERLAG BERLIN. doi:10.1007/11415770_47
PUB | DOI | WoS
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1775168
Krause, A., Stoye, J., & Vingron, M. (2005). Large scale hierarchical clustering of protein sequences. BMC Bioinformatics, 6(1), 15. doi:10.1186/1471-2105-6-15
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773302
Bartels, D., Kespohl, S., Albaum, S., Drüke, T., Goesmann, A., Herold, J., Kaiser, O., et al. (2005). BACCardI - a tool for the validation of genomic assemblies, assisting genome finishing and intergenome comparison. Bioinformatics, 21(7), 853-859. doi:10.1093/bioinformatics/bti091
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1602793
Böcker, S., & Kaltenbach, H. M. (2005). Mass spectra alignments and their significance. COMBINATORIAL PATTERN MATCHING, PROCEEDINGS, 3537, 429-441. SPRINGER-VERLAG BERLIN.
PUB | WoS
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1918947
Böcker, S., & Stoye, J. (2005). Informatische Methoden zur Protein-Identifikation. LaborPraxis, 29(10), 24-26.
PUB
 
2005 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2301827
Sammeth, M. (2005). Integrated multiple sequence alignment. Bielefeld (Germany): Bielefeld University.
PUB | PDF
 
2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1601348
Bannert, C., & Stoye, J. (2005). Protein Annotation by Secondary Structure Based Alignments (PASSTA). Proc. of CompLife 2005, LNBI, 3695, 79-90. Springer-Verlag. doi:10.1007/11560500_8
PUB | DOI | WoS
 
2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1603216
Rasmussen, K. R., Stoye, J., & Myers, E. W. (2005). Efficient q-Gram Filters for Finding All ε-Matches Over a Given Length. Proc. of RECOMB 2005, LNBI, 3500, 189-203. SPRINGER-VERLAG BERLIN. doi:10.1007/11415770_15
PUB | DOI | WoS
 
2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1601361
Sammeth, M., Weniger, T., Harmsen, D., & Stoye, J. (2005). Alignment of Tandem Repeats with Excision, Duplication, Substitution and Indels (EDSI). Proc. of WABI 2005, LNBI, 3692, 276-290. SPRINGER-VERLAG BERLIN. doi:10.1007/11557067_23
PUB | DOI | WoS
 
2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1919026
Schürmann, K. - B., & Stoye, J. (2005). Counting Suffix Arrays and Strings. Proc. of SPIRE 2005, 3772, 55-66. doi:10.1007/11575832_8
PUB | DOI
 
2005 | Report | PUB-ID: 1970472
Schürmann, K. - B., & Stoye, J. (2005). Counting Suffix Arrays and Strings (Forschungsberichte). Bielefeld: Technische Fakultät der Universität Bielefeld.
PUB | PDF
 
2004 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2309420
Zimmermann, J., Lipták, Z., & Hazelhurst, S. (2004). A Method for Evaluating the Quality of String Dissimilarity Measures and Clustering Algorithms for EST Clustering. Proc. BIBE, 301-309
PUB
 
2004 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 1918823
Giegerich R., & Stoye J. (Eds.) (2004). Proceedings of the German Conference on Bioinformatics, GCB 2004. Lecture Notes in Informatics, P-53
PUB
 
2004 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606286
Michael, M., Dieterich, C., & Stoye, J. (2004). Suboptimal Local Alignments across Multiple Scoring Schemes. Proc. of WABI 2004, LNBI, 3240, 99-110. SPRINGER-VERLAG BERLIN. doi:10.1007/978-3-540-30219-3_9
PUB | DOI | WoS
 
2004 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1607260
Schmidt, T., & Stoye, J. (2004). Quadratic Time Algorithms for Finding Common Intervals in Two and More Sequences. Proc. of CPM 2004, LNCS, 3109, 347-358. doi:10.1007/978-3-540-27801-6_26
PUB | DOI | WoS
 
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773554
Pollard, D. A., Bergman, C. M., Stoye, J., Celniker, S. E., & Eisen, M. B. (2004). Correction: Benchmarking tools for the alignment of functional noncoding DNA. BMC Bioinformatics, 5(1), 73. doi:10.1186/1471-2105-5-73
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773560
Cieliebak, M., Erlebach, T., Lipták, Z., Stoye, J., & Welzl, E. (2004). Algorithmic complexity of protein identification: combinatorics of weighted strings. Discrete Applied Mathematics, 137(1), 27-46. doi:10.1016/S0166-218X(03)00187-2
PUB | PDF | DOI | WoS
 
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773312
Pollard, D. A., Bergman, C. M., Stoye, J., Celniker, S. E., & Eisen, M. B. (2004). Benchmarking tools for the alignment of functional noncoding DNA. BMC Bioinformatics, 5(1), 6. doi:10.1186/1471-2105-5-6
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 

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