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413 Publikationen

2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1919012
Schürmann K-B, Stoye J. An Incomplex Algorithm for Fast Suffix Array Construction. In: Proc. of ALENEX/ANALCO 2005. 2005: 77-85.
PUB
 
2005 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1918824
Bergeron A, Mixtacki J, Stoye J. Chapter 10: The Inversion Distance Problem. In: Gascuel O, ed. Mathematics of Evolution and Phylogeny. Oxford University Press; 2005: 262-290.
PUB
 
2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1603220
Bergeron A, Mixtacki J, Stoye J. On Sorting by Translocations. In: Proc. of RECOMB 2005. LNBI. Vol 3500. SPRINGER-VERLAG BERLIN; 2005: 615-629.
PUB | DOI | WoS
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1775168
Krause A, Stoye J, Vingron M. Large scale hierarchical clustering of protein sequences. BMC Bioinformatics. 2005;6(1):15.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773302
Bartels D, Kespohl S, Albaum S, et al. BACCardI - a tool for the validation of genomic assemblies, assisting genome finishing and intergenome comparison. Bioinformatics. 2005;21(7):853-859.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1602793
Böcker S, Kaltenbach HM. Mass spectra alignments and their significance. In: COMBINATORIAL PATTERN MATCHING, PROCEEDINGS. Vol 3537. SPRINGER-VERLAG BERLIN; 2005: 429-441.
PUB | WoS
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1918947
Böcker S, Stoye J. Informatische Methoden zur Protein-Identifikation. LaborPraxis. 2005;29(10):24-26.
PUB
 
2005 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2301827
Sammeth M. Integrated multiple sequence alignment. Bielefeld (Germany): Bielefeld University; 2005.
PUB | PDF
 
2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1601348
Bannert C, Stoye J. Protein Annotation by Secondary Structure Based Alignments (PASSTA). In: Proc. of CompLife 2005. LNBI. Vol 3695. Springer-Verlag; 2005: 79-90.
PUB | DOI | WoS
 
2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1601361
Sammeth M, Weniger T, Harmsen D, Stoye J. Alignment of Tandem Repeats with Excision, Duplication, Substitution and Indels (EDSI). In: Proc. of WABI 2005. LNBI. Vol 3692. SPRINGER-VERLAG BERLIN; 2005: 276-290.
PUB | DOI | WoS
 
2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1603216
Rasmussen KR, Stoye J, Myers EW. Efficient q-Gram Filters for Finding All ε-Matches Over a Given Length. In: Proc. of RECOMB 2005. LNBI. Vol 3500. SPRINGER-VERLAG BERLIN; 2005: 189-203.
PUB | DOI | WoS
 
2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1919026
Schürmann K-B, Stoye J. Counting Suffix Arrays and Strings. In: Proc. of SPIRE 2005. LNCS. Vol 3772. 2005: 55-66.
PUB | DOI
 
2005 | Report | PUB-ID: 1970472
Schürmann K-B, Stoye J. Counting Suffix Arrays and Strings. Forschungsberichte. Bielefeld: Technische Fakultät der Universität Bielefeld; 2005.
PUB | PDF
 
2004 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2309420
Zimmermann J, Lipták Z, Hazelhurst S. A Method for Evaluating the Quality of String Dissimilarity Measures and Clustering Algorithms for EST Clustering. In: Proc. BIBE. 2004: 301-309.
PUB
 
2004 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 1918823
Giegerich R, Stoye J, eds. Proceedings of the German Conference on Bioinformatics, GCB 2004. Lecture Notes in Informatics. 2004;P-53.
PUB
 
2004 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606286
Michael M, Dieterich C, Stoye J. Suboptimal Local Alignments across Multiple Scoring Schemes. In: Proc. of WABI 2004. LNBI. Vol 3240. SPRINGER-VERLAG BERLIN; 2004: 99-110.
PUB | DOI | WoS
 
2004 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1607260
Schmidt T, Stoye J. Quadratic Time Algorithms for Finding Common Intervals in Two and More Sequences. In: Proc. of CPM 2004. LNCS. Vol 3109. 2004: 347-358.
PUB | DOI | WoS
 
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773554
Pollard DA, Bergman CM, Stoye J, Celniker SE, Eisen MB. Correction: Benchmarking tools for the alignment of functional noncoding DNA. BMC Bioinformatics. 2004;5(1):73.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773560
Cieliebak M, Erlebach T, Lipták Z, Stoye J, Welzl E. Algorithmic complexity of protein identification: combinatorics of weighted strings. Discrete Applied Mathematics. 2004;137(1):27-46.
PUB | PDF | DOI | WoS
 
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773312
Pollard DA, Bergman CM, Stoye J, Celniker SE, Eisen MB. Benchmarking tools for the alignment of functional noncoding DNA. BMC Bioinformatics. 2004;5(1):6.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 

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