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413 Publikationen

2019 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2937148
Alanko, J.; Bannai, H.; Cazaux, B.; Peterlongo, P.; Stoye, J. (2019): Finding All Maximal Perfect Haplotype Blocks in Linear Time. In: Proceedings of WABI 2019. Dagstuhl: Schloss Dagstuhl, Leibniz-Zentrum für Informatik . (Leibniz International Proceedings in Informatics. LIPIcs, 143). S. 8:1-8:9.
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2019 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2936900
Wittler, R. (2019): Alignment- and reference-free phylogenomics with colored de Bruijn graphs. In: Katharina Huber; Dan Gusfield (Hrsg.): Proceedings of WABI 2019. Dagstuhl, Germany: Schloss Dagstuhl--Leibniz-Zentrum fuer Informatik. (LIPIcs, 143).
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2019 | Datenpublikation | PUB-ID: 2936848
Dörr, D.; Rubert, D. (2019): Supplementary Data for "Analysis of local genome rearrangement improves resolution of ancestral genomic maps in plants". Bielefeld University.
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2019 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2935998
João C. Setubal; Jens Stoye; Bas E. Dutilh (Hrsg.) (2019): Computational Methods for Microbiome Analysis. Lausanne: Frontiers Media.
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2019 | Preprint | PUB-ID: 2935604
Wittler, R. (2019): Alignment- and reference-free phylogenomics with colored de-Bruijn graphs arXiv:1905.04165
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2019 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2932883
Dörr, D.; Stoye, J. (2019): A Perspective on Comparative and Functional Genomics. In: Tandy Warnow (Hrsg.): Bioinformatics and Phylogenetics. Cham: Springer . (Computational Biology, 29). S. 361-372.
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2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933161
Hassan, H.; Shanak, S. (2019): GOTrapper. A tool to navigate through branches of gene ontology hierarchy BMC Bioinformatics,20:(1):20
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2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2932884
Oey, H.; Zakrzewski, M.; Gravermann, K.; Young, N. D.; Korhonen, P. K.; Gobert, G. N.; Nawaratna, S.; Hasan, S.; Martínez, D. M.; You, H.; Lavin, M.; Jones, M.; Ragan, M. A.; Stoye, J.; Oleaga, A.; Emery, A. M.; Webster, B.; Rollinson, D.; Gasser, R. B.; McManus, D. P.; Krause, L. (2019): Whole-genome sequence of the bovine blood fluke Schistosoma bovis supports interspecific hybridization with S. haematobium PLOS Pathogens,15:(1):e1007513
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2919005
Schulz, T.; Stoye, J.; Dörr, D. (2018): GraphTeams. A method for discovering spatial gene clusters in Hi-C sequencing data BMC Genomics,19:(Suppl. 5):308
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2919006
Rubert, D.; Hoshino, E. A.; Dias Vieira Braga, M.; Stoye, J.; Martinez, F. H. V. (2018): Computing the family-free DCJ similarity BMC Bioinformatics,19:(Suppl. 6):152
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2918481
Luhmann, N.; Chauve, C.; Stoye, J.; Wittler, R. (2018): Scaffolding of Ancient Contigs and Ancestral Reconstruction in a Phylogenetic Framework IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics,15:(6): 2094-2100.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2932754
Bhatia, S.; Feijão, P.; Francis, A. R. (2018): Position and Content Paradigms in Genome Rearrangements. The Wild and Crazy World of Permutations in Genomics BULLETIN OF MATHEMATICAL BIOLOGY,80:(12): 3227-3246.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2919346
Hagenfeld, D.; Koch, R.; Jünemann, S.; Prior, K.; Harks, I.; Eickholz, P.; Hoffmann, T.; Kim, T. - S.; Kocher, T.; Meyle, J.; Kaner, D.; Schlagenhauf, U.; Ehmke, B.; Harmsen, D. (2018): Do we treat our patients or rather periodontal microbes with adjunctive antibiotics in periodontal therapy? A 16S rDNA microbial community analysis PLOS ONE,13:(4):e0195534
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2018 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2918485
Holley, G. (2018): Pan-genome Search and Storage. Bielefeld: Universität Bielefeld.
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2018 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2919356
Willing, E. (2018): On Distance and Sorting of the Double Cut-and-Join and the Inversion-*indel* Model. Bielefeld: Universität Bielefeld.
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2018 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2930445
Cunha, L.; Diekmann, Y.; Kowada, L.; Stoye, J. (2018): Identifying Maximal Perfect Haplotype Blocks. In: Proceedings of BSB 2018. Springer Verlag. (LNBI, 11228). S. 26-37.
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2930268
Holley, G.; Wittler, R.; Stoye, J.; Hach, F. (2018): Dynamic Alignment-Free and Reference-Free Read Compression JOURNAL OF COMPUTATIONAL BIOLOGY,25:(7): 825-836.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2018 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2913921
Zekic, T.; Holley, G.; Stoye, J. (2018): Pan-genome Storage and Analysis Techniques. In: João C. Setubal; Peter Stadler; Jens Stoye (Hrsg.): Comparative Genomics. Methods and Protocols. New York: Springer Verlag. (Methods in Molecular Biology, 1704). S. 29-53.
PUB
 
2018 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2913922
Dörr, D.; Feijão, P.; Stoye, J. (2018): Family-Free Genome Comparison. In: João C. Setubal; Peter Stadler; Jens Stoye (Hrsg.): Comparative Genomics: Methods and Protocols. New York: Springer Verlag. (Methods in Molecular Biology, 1704). S. 331-342.
PUB
 
2018 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2913920
João C Setubal; Peter Stadler; Jens Stoye (Hrsg.) (2018): Comparative Genomics: Methods and Protocols. New York: Springer Verlag.
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