Please note that PUB no longer supports Internet Explorer versions 8 or 9 (or earlier).

We recommend upgrading to the latest Internet Explorer, Google Chrome, or Firefox.

421 Publikationen

2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1589531
Albaum, S., Neuweger, H., Fraenzel, B., Lange, S., Mertens, D., Troetschel, C., Wolters, D., et al. (2009). Qupe-a Rich Internet Application to take a step forward in the analysis of mass spectrometry-based quantitative proteomics experiments. Bioinformatics, 25(23), 3128-3134. doi:10.1093/bioinformatics/btp568
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1590204
Brudno, M., Medvedev, P., Stoye, J., & De La Vega, F. M. (2009). A report on the 2009 SIG on short read sequencing and algorithms (Short-SIG). BIOINFORMATICS, 25(21), 2863-2864. doi:10.1093/bioinformatics/btp525
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1588783
Purser, A., Bergmann, M., Ontrup, J., & Nattkemper, T. W. (2009). Use of machine-learning algorithms for the automated detection of cold-water coral habitats: a pilot study. Marine Ecology Progress Series, 397, 241-251. doi:10.3354/meps08154
PUB | DOI | WoS
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1898105
Böcker, S., Jahn, K., Mixtacki, J., & Stoye, J. (2009). Computation of Median Gene Clusters. Journal of Computational Biology, 16(8), 1085-1099. doi:10.1089/cmb.2009.0098
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1591319
Hoffmann, N., & Stoye, J. (2009). ChromA: signal-based retention time alignment for chromatography-mass spectrometry data. Bioinformatics, 25(16), 2080-2081. doi:10.1093/bioinformatics/btp343
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1588760 OA
Dias Vieira Braga, M., Gautier, C., & Sagot, M. - F. (2009). An asymmetric approach to preserve common intervals while sorting by reversals. Algorithms for Molecular Biology, 4(1), 16. doi:10.1186/1748-7188-4-16
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1919209
Medvedev, P., & Stoye, J. (2009). Rearrangement Models and Single-Cut Operations. Comparative Genomics : International Workshop, RECOMB-CG 2009, Budapest, Hungary, September 27-29, 2009. Proceedings, 5817, 84-97. doi:10.1007/978-3-642-04744-2_8
PUB | DOI
 
2009 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2018440
Schoening, T., Ehnert, N., Ontrup, J., & Nattkemper, T. W. (2009). BIIGLE Tools - A Web 2.0 Approach for Visual Bioimage Database Mining. IV 09 - Intl. Conference on Information Visualization. doi:10.1109/iv.2009.71
PUB | DOI
 
2009 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1918945
Stoye, J. (2009). Computational Short Read Metagenomics. Presented at the JOBIM 2009, Nantes, France
PUB
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1634447
Bekel, T., Henckel, K., Küster, H., Meyer, F., Mittard-Runte, V., Neuweger, H., Paarmann, D., et al. (2009). The Sequence Analysis and Management System - SAMS-2.0: Data management and sequence analysis adapted to changing requirements from traditional sanger sequencing to ultrafast sequencing technologies. Journal of Biotechnology, 140(1-2), 3-12. doi:10.1016/j.jbiotec.2009.01.006
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1634615
Zeschnigk, M., Martin, M., Betzl, G., Kalbe, A., Sirsch, C., Buiting, K., Gross, S., et al. (2009). Massive parallel bisulfite sequencing of CG-rich DNA fragments reveals that methylation of many X-chromosomal CpG islands in female blood DNA is incomplete. HUMAN MOLECULAR GENETICS, 18(8), 1439-1448. doi:10.1093/hmg/ddp054
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2427252
Alekseev, V. E., Lozin, V. V., Malyshev, D., & Milanič, M. (2008). The Maximum Independent Set Problem in Planar Graphs. Proc. MFCS 2008, 96-107. doi:10.1007/978-3-540-85238-4_7
PUB | DOI
 
2008 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2306324 OA
Baumbach, J. (2008). CoryneRegNet : a reference database and analysis platform for corynebacterial gene regulatory networks. Bielefeld (Germany): Bielefeld University.
PUB | PDF
 
2008 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2302950 OA
Zakotnik, J. (2008). The double cut and join operation and its applications to genome rearrangements. Bielefeld (Germany): Bielefeld University.
PUB | PDF
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2659345
Oliveira, M. T., Barau, J. G., Junqueira, A. C. M., Feijão, P., Rosa, A. C. da, Abreu, C. F., Azeredo-Espin, A. M. L., et al. (2008). Structure and evolution of the mitochondrial genomes of Haematobia irritans and Stomoxys calcitrans: The Muscidae (Diptera: Calyptratae) perspective. Molecular Phylogenetics and Evolution, 48(3), 850-857. doi:10.1016/j.ympev.2008.05.022
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2308903
Cicalese, F., & Laber, E. S. (2008). Function Evaluation Via Linear Programming in the Priced Information Model. Proc. ICALP 2008, 173-185. doi:10.1007/978-3-540-70575-8_15
PUB | DOI
 
2008 | Report | Veröffentlicht | PUB-ID: 2308927 OA
Cicalese, F., & Milanivc, M. (2008). On Parsimony Haplotyping (Forschungsberichte der Technischen Fakultät, Abteilung Informationstechnik / Universität Bielefeld). Bielefeld: Universität Bielefeld, Technische Fakultät.
PUB | PDF
 
2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2308974
Fritzilas, E., Rios-Solis, Y. A., & Rahmann, S. (2008). Structural Identifiability in Low-Rank Matrix Factorization. In X. Hu & J. Wang (Eds.), Lecture Notes in Computer Science, 5092. Computing and Combinatorics 14th Annual International Conference, COCOON 2008 Dalian, China, June 27-29, 2008 Proceedings (pp. 140-148). Berlin u.a.: Springer. doi:10.1007/978-3-540-69733-6_15
PUB | DOI
 
2008 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2499103
Milanivc, M., & Monnot, J. (2008). The Complexity of the Exact Weighted Independent Set Problem. Combinatorial optimization and theoretical computer science: interfaces and perspectives : 30th anniversary of the LAMSADE, 393-432. doi:10.1002/9780470611098.ch16
PUB | DOI
 
2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2499108
Mixtacki, J. (2008). Genome Halving under DCJ Revisited. In X. Hu & J. Wang (Eds.), Lecture Notes in Computer Science, 5092. Computing and Combinatorics. 14th Annual International Conference, COCOON 2008 Dalian, China, June 27-29, 2008 Proceedings (pp. 276-286).
PUB
 
2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1919198
Quitzau, J. A. A., & Stoye, J. (2008). Detecting Repeat Families in Incompletely Sequenced Genomes. Proc. of WABI 2008, 5251, 342-353. doi:10.1007/978-3-540-87361-7_29
PUB | DOI
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2498846
Boyar, J., & Medvedev, P. (2008). The relative worst order ratio applied to seat reservation. ACM Transactions on Algorithms, 4(4), 1-22. doi:10.1145/1383369.1383379
PUB | DOI | WoS
 
2008 | Report | Veröffentlicht | PUB-ID: 2499065
Cicalese, F., & Milanic, M. (2008). Computing with Priced Information: game trees and the value dependent cost model. Technische Fakultät, Universität Bielefeld.
PUB
 
2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2499072
Herms, I., & Rahmann, S. (2008). Computing Alignment Seed Sensitivity with Probabilistic Arithmetic Automata. In K. A. Crandall & J. Lagergren (Eds.), Lecture Notes in Computer Science, 5251. Algorithms in Bioinformatics: 8th International Workshop, WABI 2008, Karlsruhe, Germany, September 15-19, 2008. Proceedings (pp. 318-329). Berlin u.a.: Springer. doi:10.1007/978-3-540-87361-7_27
PUB | DOI
 
2008 | Report | Veröffentlicht | PUB-ID: 2308930 OA
Cicalese, F., & Milanivc, M. (2008). Computing with Priced Information: game trees and the value dependent cost model (Forschungsberichte der Technischen Fakultät, Abteilung Informationstechnik / Universität Bielefeld). Bielefeld: Universität Bielefeld, Technische Fakultät.
PUB | PDF
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2499098
Lozin, V. V., & Milanic, M. (2008). A polynomial algorithm to find an independent set of maximum weight in a fork-free graph. J. Discr. Alg., 6(4), 595-604. doi:10.1016/j.jda.2008.04.001
PUB | DOI
 
2008 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2499120
Rahmann, S., & Klau, G. W. (2008). Integer Linear Programming Techniques for Discovering Approximate Gene Clusters. In I. I. Mǎndoiu & A. Zelikovsky (Eds.), Bioinformatics Algorithms: Techniques and Applications (pp. 203-222). Wiley Interscience. doi:10.1002/9780470253441.ch9
PUB | DOI
 
2008 | Report | PUB-ID: 1970459 OA
Quitzau, J. A. A., & Stoye, J. (2008). A space efficient representation for sparse de Bruijn subgraphs (Forschungsberichte der Technischen Fakultät, Abteilung Informationstechnik / Universität Bielefeld). Bielefeld: Technische Fakultät der Universität Bielefeld.
PUB | PDF
 
2008 | Report | PUB-ID: 1970461 OA
Ejaz, T., Rahmann, S., & Stoye, J. (2008). Online Abelian Pattern Matching (Forschungsberichte der Technischen Fakultät, Abteilung Informationstechnik / Universität Bielefeld). Bielefeld: Technische Fakultät der Universität Bielefeld.
PUB | PDF
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1636699
Neuweger, H., Albaum, S., Dondrup, M., Persicke, M., Watt, T., Niehaus, K., Stoye, J., et al. (2008). MeltDB: a software platform for the analysis and integration of metabolomics experiment data. Bioinformatics, 24(23), 2726-2732. doi:10.1093/bioinformatics/btn452
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2305571 OA
Bannert, C. (2008). Flexible protein annotation with sequence- and secondary structure information. Bielefeld (Germany): Bielefeld University.
PUB | PDF
 
2008 | Lexikoneintrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1918834
Stoye, J. (2008). Suffix Tree Construction in RAM (1997; Farach-Colton). In M. - Y. Kao (Ed.), Encyclopedia of Algorithms (pp. 925-928). Springer Verlag. doi:10.1007/978-0-387-30162-4_414
PUB | DOI
 
2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1919192
Böcker, S., Jahn, K., Mixtacki, J., & Stoye, J. (2008). Computation of Median Gene Clusters. Proc. of RECOMB 2008, 4955, 331-345. doi:10.1007/978-3-540-78839-3_28
PUB | DOI
 
2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1919200
Bergeron, A., Mixtacki, J., & Stoye, J. (2008). On Computing the Breakpoint Reuse Rate in Rearrangement Scenarios. Proc. of Recomb-CG 2008, 5267, 226-240. doi:10.1007/978-3-540-87989-3_17
PUB | DOI
 
2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2018405
Loyek, C., Woermann, F. G., & Nattkemper, T. W. (2008). Detection of Focal Cortical Dysplasia in MRI Using Textural Features. Proceedings of BVM 2008, 432-436. Berlin, Heidelberg: Springer Verlag. doi:10.1007/978-3-540-78640-5_87
PUB | DOI
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1636280 OA
Timm, W., Scherbart, A., Boecker, S., Kohlbacher, O., & Nattkemper, T. W. (2008). Peak intensity prediction in MALDI-TOF mass spectrometry: A machine learning study to support quantitative proteomics. BMC Bioinformatics, 9(1), 443. doi:10.1186/1471-2105-9-443
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1592257
Schoen, C., Blom, J., Claus, H., Schramm-Glueck, A., Brandt, P., Mueller, T., Goesmann, A., et al. (2008). Whole-genome comparison of disease and carriage strains provides insights into virulence evolution in Neisseria meningitidis. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, 105(9), 3473-3478. doi:10.1073/pnas.0800151105
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | GenBank
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1587304
Hazelhurst, S., Hide, W., Lipták, Z., Nogueira, R., & Starfield, R. (2008). An overview of the wcd EST clustering tool. BIOINFORMATICS, 24(13), 1542-1546. doi:10.1093/bioinformatics/btn203
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1592737
Boecker, S., Lipták, Z., Martin, M., Pervukhin, A., & Sudek, H. (2008). DECOMP - from interpreting mass spectrometry peaks to solving the money changing problem. BIOINFORMATICS, 24(4), 591-593. doi:10.1093/bioinformatics/btm631
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1587078
Schürmann, K. - B., & Stoye, J. (2008). Counting suffix arrays and strings. THEORETICAL COMPUTER SCIENCE, 395(2-3), 220-234. doi:10.1016/j.tcs.2008.01.011
PUB | DOI | WoS
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1586009
Krause, L., Diaz, N. N., Edwards, R. A., Gartemann, K. - H., Krömeke, H., Neuweger, H., Pühler, A., et al. (2008). Taxonomic composition and gene content of a methane-producing microbial community isolated from a biogas reactor. JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY, 136(1-2), 91-101. doi:10.1016/j.jbiotec.2008.06.003
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1587052
Martin, C., Diaz, N. N., Ontrup, J., & Nattkemper, T. W. (2008). Hyperbolic SOM-based clustering of DNA fragment features for taxonomic visualization and classification. Bioinformatics, 24(14), 1568-1574. doi:10.1093/bioinformatics/btn257
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1586785 OA
Oehm, S., Gilbert, D., Tauch, A., Stoye, J., & Goesmann, A. (2008). Comparative Pathway Analyzer - a web server for comparative analysis, clustering and visualization of metabolic networks in multiple organisms. NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 36(Web Server), W433-W437. doi:10.1093/nar/gkn284
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585939
Tauch, A., Schneider, J., Szczepanowski, R., Tilker, A., Viehöver, P., Gartemann, K. - H., Arnold, W., et al. (2008). Ultrafast pyrosequencing of Corynebacterium kroppenstedtii DSM44385 revealed insights into the physiology of a lipophilic corynebacterium that lacks mycolic acids. Journal of Biotechnology, 136(1-2), 22-30. doi:10.1016/j.jbiotec.2008.03.004
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1783364 OA
Krause, L., Diaz, N. N., Goesmann, A., Kelley, S., Nattkemper, T. W., Rohwer, F., Edwards, R. A., et al. (2008). Phylogenetic classification of short environmental DNA fragments. Nucleic Acids Research, 36(7), 2230-2239. doi:10.1093/nar/gkn038
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1919195
Bergeron, A., Mixtacki, J., & Stoye, J. (2008). HP Distance via Double Cut and Join Distance. Combinatorial Pattern Matching. 19th Annual Symposium, CPM 2008, Pisa, Italy, June 18-20, 2008 Proceedings, 56-68. doi:10.1007/978-3-540-69068-9_8
PUB | DOI
 
2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2018409
Martin, C., & Nattkemper, T. W. (2008). A Tree Index to Support Clustering Based Exploratory Data Analysis. Bioinformatics Research and Development : Second International Conference, BIRD 2008 Vienna, Austria, July 7-9, 2008 Proceedings, 13, 1-15. doi:10.1007/978-3-540-70600-7_1
PUB | DOI
 
2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2018435
Scherbart, A., Timm, W., Böcker, S., & Nattkemper, T. W. (2008). Improved Mass Spectrometry Peak Intensity Prediction by Adaptive Feature Weighting. International Conference on Neural Information Processing. doi:10.1007/978-3-642-02490-0_63
PUB | DOI
 
2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2018381
Albaum, S., Neuweger, H., Lange, S., Mertens, D., Runte, K., Kalinowski, J., Nattkemper, T. W., et al. (2008). ProSE - "Software as a Service" for Quantitative Proteomics (Poster abstract). HUPO 7th Annual World Congress
PUB
 
2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2018398
Herold, J., Friedenberger, M., Bode, M., Rajpoot, N., Schubert, W., & Nattkemper, T. W. (2008). Flexible Synapse Detection in Fluorescence Micrographs by Modeling Human Expert Grading. Proc. of 2008 IEEE International Symposium on Biomedical Imaging. doi:10.1109/isbi.2008.4541254
PUB | DOI
 

Filter und Suchbegriffe

department=66100

Suche

Publikationen filtern

Darstellung / Sortierung

Zitationsstil: apa

Export / Einbettung