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421 Publikationen

2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2674387
Hilker, R., Stadermann, K.B., Doppmeier, D., Kalinowski, J., Stoye, J., Straube, J., Winnebald, J., Goesmann, A.: ReadXplorer - Visualization and Analysis of Mapped Sequences. Bioinformatics. 30, 2247-2254 (2014).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2665038
Schwientek, P., Neshat, A., Kalinowski, J., Klein, A., Rückert, C., Schneiker-Bekel, S., Wendler, S., Stoye, J., Pühler, A.: Improving the genome annotation of the acarbose producer Actinoplanes sp. SE50/110 by sequencing enriched 5'-ends of primary transcripts. Journal of Biotechnology. 190, 85-95 (2014).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2685988
Jakobi, T., Brinkrolf, K., Tauch, A., Noll, T., Stoye, J., Pühler, A., Goesmann, A.: Discovery of transcription start sites in the Chinese hamster genome by next-generation RNA sequencing. Journal of Biotechnology. 190, 64-75 (2014).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2690122
Luhmann, N., Chauve, C., Stoye, J., Wittler, R.: Scaffolding of Ancient Contigs and Ancestral Reconstruction in a Phylogenetic Framework. In: Sérgio, C. (ed.) Proc. of BSB 2014. LNBI. 8826, p. 135-143. Springer Verlag (2014).
PUB | DOI
 
2014 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2677466 OA
Hoffmann, N.: Computational methods for high-throughput metabolomics. Universität Bielefeld, Bielefeld (2014).
PUB | PDF
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2691246
Fueller, E., Schaefer, D., Fischer, U., Krell, P., Stanulla, M., Borkhardt, A., Slany, R.K.: Genomic Inverse PCR for Exploration of Ligated Breakpoints (GIPFEL), a New Method to Detect Translocations in Leukemia. PloS one. 9, 104419 : e104419 (2014).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Lexikoneintrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2693552
Stoye, J.: Suffix Tree Construction. In: Kao, M.-Y. (ed.) Encyclopedia of Algorithms. Springer Verlag (2014).
PUB | DOI
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2643941
Hoffmann, N., Wilhelm, M., Doebbe, A., Niehaus, K., Stoye, J.: BiPACE 2D – Graph-based multiple alignment for comprehensive two-dimensional gas chromatography–mass spectrometry. Bioinformatics. 30, 988-995 (2014).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2693409
Fredrich, E., Ander, C., Stoye, J., Brune, I., Tauch, A.: Metatranskriptomik der Mikrobiota aus der menschlichen Achselhöhle. BIOspektrum. 20, 294-296 (2014).
PUB | DOI
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2691732
Klippel, B., Sahm, K., Basner, A., Wiebusch, S., John, P., Lorenz, U., Peters, A., Abe, F., Takahashi, K., Kaiser, O., Goesmann, A., Jaenicke, S., Grote, R., Horikoshi, K., Antranikian, G.: Carbohydrate-active enzymes identified by metagenomic analysis of deep-sea sediment bacteria. Extremophiles. 18, 853-863 (2014).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2691279
Binder, V., Bartenhagen, C., Okpanyi, V., Gombert, M., Moehlendick, B., Behrens, B., Klein, H.-U., Rieder, H., Krell, P., Dugas, M., Stoecklein, N.H., Borkhardt, A.: A New Workflow for Whole-Genome Sequencing of Single Human Cells. Human mutation. 35, 1260-1270 (2014).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2665333
Henrich, B., Rumming, M., Sczyrba, A., Velleuer, E., Dietrich, R., Gerlach, W., Gombert, M., Rahn, S., Stoye, J., Borkhardt, A., Fischer, U.: Mycoplasma salivarium as a Dominant Coloniser of Fanconi Anaemia Associated Oral Carcinoma. PLoS ONE. 9, e92297 : e92297 (2014).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2673418 OA
Mascher, M.: POPSEQ Anchoring and ordering contig assemblies from next generation sequencing data by population sequencing. Universität Bielefeld, Bielefeld (2014).
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2611630 OA
Willing, E., Zaccaria, S., Dias Vieira Braga, M., Stoye, J.: On the Inversion-Indel Distance. BMC Bioinformatics. 14, S3 : S3 (2013).
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2529309
Bolzan de Campos, S., Youn, J.-W., Farina, R., Jaenicke, S., Jünemann, S., Szczepanowski, R., Beneduzi, A., Vargas, L.K., Goesmann, A., Wendisch, V.F., Passagilia, L.: Changes in Root Bacterial Communities Associated to Two Different Development Stages of Canola (Brassica napus L. var oleifera) Evaluated through Next-Generation Sequencing. Microbial Ecology. 65, 593-601 (2013).
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2013 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2611641
Dias Vieira Braga, M., Stoye, J.: Restricted DCJ-Indel Model Revisited. In: Setubal, J.C. and Almeida, N.F. (eds.) Advances in Bioinformatics and Computational Biology. BSB 2013. Lecture Notes in Bioinformatics. 8213, p. 36-46. Springer Verlag, Cham (2013).
PUB | DOI
 
2013 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2611648
Dias Vieira Braga, M., Chauve, C., Dörr, D., Jahn, K., Stoye, J., Thévenin, A., Wittler, R.: The Potential of Family-Free Genome Comparison. In: Chauve, C., El-Mabrouk, N., and Tannier, E. (eds.) Models and Algorithms for Genome Evolution. Computational Biology Series. 19, p. 287-307. Springer Verlag, London (2013).
PUB | DOI
 
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2575011
Ander, C., Schulz-Trieglaff, O.B., Stoye, J., Cox, A.J.: metaBEETL: high-throughput analysis of heterogeneous microbial populations from shotgun DNA sequences. BMC Bioinformatics. 14, S2 : S2 (2013).
PUB | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2555342
He, P., Hao, K., Blom, J., Rückert, C., Vater, J., Mao, Z., Wu, Y., Hou, M., He, P., He, Y., Borriss, R.: Genome sequence of the plant growth promoting strain Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum B9601-Y2 and expression of mersacidin and other secondary metabolites. Journal of biotechnology. 164, 281-291 (2013).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2641228
Jünemann, S., Sedlazeck, F.J., Prior, K., Albersmeier, A., John, U., Kalinowski, J., Mellmann, A., Goesmann, A., von Haeseler, A., Stoye, J., Harmsen, D.: Corrigendum: Updating benchtop sequencing performance comparison. Nature biotechnology. 31, 1148 (2013).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 

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