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421 Publikationen

2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2674387
Hilker, R., Stadermann, K.B., Doppmeier, D., Kalinowski, J., Stoye, J., Straube, J., Winnebald, J. & Goesmann, A. (2014). ReadXplorer - Visualization and Analysis of Mapped Sequences. Bioinformatics, 30(16), 2247-2254. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/bioinformatics/btu205.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2665038
Schwientek, P., Neshat, A., Kalinowski, J., Klein, A., Rückert, C., Schneiker-Bekel, S., Wendler, S., Stoye, J. & Pühler, A. (2014). Improving the genome annotation of the acarbose producer Actinoplanes sp. SE50/110 by sequencing enriched 5'-ends of primary transcripts. Journal of Biotechnology, 190, 85-95. Elsevier BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2014.03.013.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2685988
Jakobi, T., Brinkrolf, K., Tauch, A., Noll, T., Stoye, J., Pühler, A. & Goesmann, A. (2014). Discovery of transcription start sites in the Chinese hamster genome by next-generation RNA sequencing. Journal of Biotechnology, 190, 64-75. Elsevier BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2014.07.437.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2690122
Luhmann, N., Chauve, C., Stoye, J. & Wittler, R. (2014). Scaffolding of Ancient Contigs and Ancestral Reconstruction in a Phylogenetic Framework (LNBI). In C. Sérgio (Hrsg.), Proc. of BSB 2014 (S. 135-143). Gehalten auf der BSB 2014, Springer Verlag. doi:10.1007/978-3-319-12418-6_17.
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2014 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2677466 OA
Hoffmann, N. (2014). Computational methods for high-throughput metabolomics. Bielefeld: Universität Bielefeld.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2691246
Fueller, E., Schaefer, D., Fischer, U., Krell, P., Stanulla, M., Borkhardt, A. & Slany, R.K. (2014). Genomic Inverse PCR for Exploration of Ligated Breakpoints (GIPFEL), a New Method to Detect Translocations in Leukemia. PloS one, 9(8), 104419: e104419. Public Library of Science (PLoS). doi:10.1371/journal.pone.0104419.
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2014 | Lexikoneintrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2693552
Stoye, J. (2014). Suffix Tree Construction. In M.-Y. Kao (Hrsg.), Encyclopedia of Algorithms. Springer Verlag. doi:10.1007/978-3-642-27848-8_414-2.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2643941
Hoffmann, N., Wilhelm, M., Doebbe, A., Niehaus, K. & Stoye, J. (2014). BiPACE 2D – Graph-based multiple alignment for comprehensive two-dimensional gas chromatography–mass spectrometry. Bioinformatics, 30(7), 988-995. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/bioinformatics/btt738.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2693409
Fredrich, E., Ander, C., Stoye, J., Brune, I. & Tauch, A. (2014). Metatranskriptomik der Mikrobiota aus der menschlichen Achselhöhle. BIOspektrum, 20(5), 294-296. Springer Science + Business Media. doi:10.1007/s12268-014-0468-4.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2691732
Klippel, B., Sahm, K., Basner, A., Wiebusch, S., John, P., Lorenz, U., Peters, A., Abe, F., Takahashi, K., Kaiser, O., Goesmann, A., Jaenicke, S., Grote, R., Horikoshi, K. & Antranikian, G. (2014). Carbohydrate-active enzymes identified by metagenomic analysis of deep-sea sediment bacteria. Extremophiles, 18(5), 853-863. Springer Science + Business Media. doi:10.1007/s00792-014-0676-3.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2691279
Binder, V., Bartenhagen, C., Okpanyi, V., Gombert, M., Moehlendick, B., Behrens, B., Klein, H.-U., Rieder, H., Krell, P., Dugas, M., Stoecklein, N.H. & Borkhardt, A. (2014). A New Workflow for Whole-Genome Sequencing of Single Human Cells. Human mutation, 35(10), 1260-1270. Wiley-Blackwell. doi:10.1002/humu.22625.
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2014 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2673418 OA
Mascher, M. (2014). POPSEQ Anchoring and ordering contig assemblies from next generation sequencing data by population sequencing. Bielefeld: Universität Bielefeld.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2665333
Henrich, B., Rumming, M., Sczyrba, A., Velleuer, E., Dietrich, R., Gerlach, W., Gombert, M., Rahn, S., Stoye, J., Borkhardt, A. & Fischer, U. (2014). Mycoplasma salivarium as a Dominant Coloniser of Fanconi Anaemia Associated Oral Carcinoma. PLoS ONE, 9(3), e92297: e92297. Public Library of Science (PLoS). doi:10.1371/journal.pone.0092297.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2611630 OA
Willing, E., Zaccaria, S., Dias Vieira Braga, M. & Stoye, J. (2013). On the Inversion-Indel Distance. BMC Bioinformatics, 14(Suppl 15: Proc. of RECOMB-CG 2013), S3: S3. Springer Nature. doi:10.1186/1471-2105-14-S15-S3.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2529309
Bolzan de Campos, S., Youn, J.-W., Farina, R., Jaenicke, S., Jünemann, S., Szczepanowski, R., Beneduzi, A., Vargas, L.K., Goesmann, A., Wendisch, V.F. & Passagilia, L. (2013). Changes in Root Bacterial Communities Associated to Two Different Development Stages of Canola (Brassica napus L. var oleifera) Evaluated through Next-Generation Sequencing. Microbial Ecology, 65(3), 593-601. Springer Science + Business Media. doi:10.1007/s00248-012-0132-9.
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2013 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2611641
Dias Vieira Braga, M. & Stoye, J. (2013). Restricted DCJ-Indel Model Revisited (Lecture Notes in Bioinformatics). In J.C. Setubal & N.F. Almeida (Hrsg.), Advances in Bioinformatics and Computational Biology. BSB 2013 (S. 36-46). Gehalten auf der 8th Brazilian Symposium on Bioinformatics, BSB 2013, Cham: Springer Verlag. doi:10.1007/978-3-319-02624-4_4.
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2013 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2611648
Dias Vieira Braga, M., Chauve, C., Dörr, D., Jahn, K., Stoye, J., Thévenin, A. & Wittler, R. (2013). The Potential of Family-Free Genome Comparison (Computational Biology Series). In C. Chauve, N. El-Mabrouk & E. Tannier (Hrsg.), Models and Algorithms for Genome Evolution (S. 287-307). London: Springer Verlag. doi:10.1007/978-1-4471-5298-9_13.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2575011
Ander, C., Schulz-Trieglaff, O.B., Stoye, J. & Cox, A.J. (2013). metaBEETL: high-throughput analysis of heterogeneous microbial populations from shotgun DNA sequences. BMC Bioinformatics, 14(Suppl 5: Proc. of RECOMB-Seq 2013), S2: S2. Springer Science + Business Media. doi:10.1186/1471-2105-14-S5-S2.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2555342
He, P., Hao, K., Blom, J., Rückert, C., Vater, J., Mao, Z., Wu, Y., Hou, M., He, P., He, Y. & Borriss, R. (2013). Genome sequence of the plant growth promoting strain Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum B9601-Y2 and expression of mersacidin and other secondary metabolites. Journal of biotechnology, 164(2), 281-291. Elsevier BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2012.12.014.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2641228
Jünemann, S., Sedlazeck, F.J., Prior, K., Albersmeier, A., John, U., Kalinowski, J., Mellmann, A., Goesmann, A., von Haeseler, A., Stoye, J. & Harmsen, D. (2013). Corrigendum: Updating benchtop sequencing performance comparison. Nature biotechnology, 31(12), 1148. Nature Publishing Group. doi:10.1038/nbt1213-1148e.
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