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421 Publikationen

2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1589531
Albaum, S., Neuweger, H., Fraenzel, B., Lange, S., Mertens, D., Troetschel, C., Wolters, D., Kalinowski, J., Nattkemper, T.W. & Goesmann, A. (2009). Qupe-a Rich Internet Application to take a step forward in the analysis of mass spectrometry-based quantitative proteomics experiments. Bioinformatics, 25(23), 3128-3134. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/bioinformatics/btp568.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1590204
Brudno, M., Medvedev, P., Stoye, J. & De La Vega, F.M. (2009). A report on the 2009 SIG on short read sequencing and algorithms (Short-SIG). BIOINFORMATICS, 25(21), 2863-2864. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/bioinformatics/btp525.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1588783
Purser, A., Bergmann, M., Ontrup, J. & Nattkemper, T.W. (2009). Use of machine-learning algorithms for the automated detection of cold-water coral habitats: a pilot study. Marine Ecology Progress Series, 397, 241-251. Inter-Research Science Center. doi:10.3354/meps08154.
PUB | DOI | WoS
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1898105
Böcker, S., Jahn, K., Mixtacki, J. & Stoye, J. (2009). Computation of Median Gene Clusters. Journal of Computational Biology, 16(8), 1085-1099. Mary Ann Liebert Inc. doi:10.1089/cmb.2009.0098.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1591319
Hoffmann, N. & Stoye, J. (2009). ChromA: signal-based retention time alignment for chromatography-mass spectrometry data. Bioinformatics, 25(16), 2080-2081. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/bioinformatics/btp343.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1588760 OA
Dias Vieira Braga, M., Gautier, C. & Sagot, M.-F. (2009). An asymmetric approach to preserve common intervals while sorting by reversals. Algorithms for Molecular Biology, 4(1), 16. Springer Science + Business Media. doi:10.1186/1748-7188-4-16.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1919209
Medvedev, P. & Stoye, J. (2009). Rearrangement Models and Single-Cut Operations (Lecture Notes in Computer Science). Comparative Genomics : International Workshop, RECOMB-CG 2009, Budapest, Hungary, September 27-29, 2009. Proceedings (S. 84-97). Gehalten auf der Recomb-CG 2009, Berlin, Heidelberg: Springer. doi:10.1007/978-3-642-04744-2_8.
PUB | DOI
 
2009 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2018440
Schoening, T., Ehnert, N., Ontrup, J. & Nattkemper, T.W. (2009). BIIGLE Tools - A Web 2.0 Approach for Visual Bioimage Database Mining. IV 09 - Intl. Conference on Information Visualization. doi:10.1109/iv.2009.71.
PUB | DOI
 
2009 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1918945
Stoye, J. (2009). Computational Short Read Metagenomics (S. 3-4). Gehalten auf der JOBIM 2009.
PUB
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1634447
Bekel, T., Henckel, K., Küster, H., Meyer, F., Mittard-Runte, V., Neuweger, H., Paarmann, D., Rupp, O., Zakrzewski, M., Pühler, A., Stoye, J. & Goesmann, A. (2009). The Sequence Analysis and Management System - SAMS-2.0: Data management and sequence analysis adapted to changing requirements from traditional sanger sequencing to ultrafast sequencing technologies. Journal of Biotechnology, 140(1-2), 3-12. Elsevier BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2009.01.006.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1634615
Zeschnigk, M., Martin, M., Betzl, G., Kalbe, A., Sirsch, C., Buiting, K., Gross, S., Fritzilas, E., Frey, B., Rahmann, S. & Horsthemke, B. (2009). Massive parallel bisulfite sequencing of CG-rich DNA fragments reveals that methylation of many X-chromosomal CpG islands in female blood DNA is incomplete. HUMAN MOLECULAR GENETICS, 18(8), 1439-1448. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/hmg/ddp054.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2427252
Alekseev, V.E., Lozin, V.V., Malyshev, D. & Milanič, M. (2008). The Maximum Independent Set Problem in Planar Graphs. Proc. MFCS 2008 (S. 96-107). doi:10.1007/978-3-540-85238-4_7.
PUB | DOI
 
2008 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2306324 OA
Baumbach, J. (2008). CoryneRegNet : a reference database and analysis platform for corynebacterial gene regulatory networks. Bielefeld (Germany): Bielefeld University.
PUB | PDF
 
2008 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2302950 OA
Zakotnik, J. (2008). The double cut and join operation and its applications to genome rearrangements. Bielefeld (Germany): Bielefeld University.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2659345
Oliveira, M.T., Barau, J.G., Junqueira, A.C.M., Feijão, P., Rosa, A.C. da, Abreu, C.F., Azeredo-Espin, A.M.L. & Lessinger, A.C. (2008). Structure and evolution of the mitochondrial genomes of Haematobia irritans and Stomoxys calcitrans: The Muscidae (Diptera: Calyptratae) perspective. Molecular Phylogenetics and Evolution, 48(3), 850-857. doi:10.1016/j.ympev.2008.05.022.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2308903
Cicalese, F. & Laber, E.S. (2008). Function Evaluation Via Linear Programming in the Priced Information Model. Proc. ICALP 2008 (S. 173-185). doi:10.1007/978-3-540-70575-8_15.
PUB | DOI
 
2008 | Report | Veröffentlicht | PUB-ID: 2308927 OA
Cicalese, F. & Milanivc, M. (2008). On Parsimony Haplotyping (Forschungsberichte der Technischen Fakultät, Abteilung Informationstechnik / Universität Bielefeld). Bielefeld: Universität Bielefeld, Technische Fakultät.
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2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2308974
Fritzilas, E., Rios-Solis, Y.A. & Rahmann, S. (2008). Structural Identifiability in Low-Rank Matrix Factorization (Lecture Notes in Computer Science, 5092). In X. Hu & J. Wang (Hrsg.), Computing and Combinatorics 14th Annual International Conference, COCOON 2008 Dalian, China, June 27-29, 2008 Proceedings (S. 140-148). Gehalten auf der 14th Annual International Conference, COCOON 2008, Berlin u.a.: Springer. doi:10.1007/978-3-540-69733-6_15.
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2008 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2499103
Milanivc, M. & Monnot, J. (2008). The Complexity of the Exact Weighted Independent Set Problem. Combinatorial optimization and theoretical computer science: interfaces and perspectives : 30th anniversary of the LAMSADE (S. 393-432). doi:10.1002/9780470611098.ch16.
PUB | DOI
 
2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2499108
Mixtacki, J. (2008). Genome Halving under DCJ Revisited (Lecture Notes in Computer Science, 5092). In X. Hu & J. Wang (Hrsg.), Computing and Combinatorics. 14th Annual International Conference, COCOON 2008 Dalian, China, June 27-29, 2008 Proceedings (S. 276-286). Gehalten auf der 14th Annual International Conference, COCOON 2008.
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