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415 Publikationen

2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2406118
N. Välimäki, V. Mäkinen, W. Gerlach, and K. Dixit, “Engineering a compressed suffix tree implementation”, Journal of Experimental Algorithmics (JEA), 2009, 14, 4.2-2:4.23.
PUB | DOI
 
2009 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2304745 OA
E. Fritzilas, Combinatorial aspects of low-rank matrix factorization and two applications in bioinformatics, Bielefeld University, Bielefeld (Germany), 2009.
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2009 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1919207
G. Blin, and J. Stoye, in Proc. of Recomb-CG 2009, 2009, p. 59-69.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2018390
J. Herold, S. Abouna, L. Zhou, S. Pelengaris, D. B. A. Epstein, M. Khan, and T. W. Nattkemper, in SPIE Medical Imaging, 2009.
PUB | DOI
 
2009 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2018422
J. Ontrup, N. Ehnert, M. Bergmann, and T. W. Nattkemper, in OCEANS 2009 - Europe, Bremen, 2009.
PUB | DOI
 
2009 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2018427
H. Qureshi, N. Rajpoot, T. W. Nattkemper, and V. Hans, in MICCAI«2009 Workshop on Optical Tissue Image Analysis in Microscopy, Histology, and Endoscopy, 2009.
PUB
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1783187 OA
J. Blom, S. Albaum, D. Doppmeier, A. Pühler, F. - J. Vorhölter, M. Zakrzewski, and A. Goesmann, “EDGAR: a software framework for the comparative analysis of prokaryotic genomes”, BMC Bioinformatics, 2009, 10, : 154.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1636062
J. Ontrup, H. Ritter, S. Scholz, and R. Wagner, “Detecting, Assessing, and Monitoring Relevant Topics in Virtual Information Environments”, IEEE Transactions on Knowledge and Data Engineering, 2009, 21, 415-427.
PUB | DOI | WoS
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1898137
K. Jahn, and J. Stoye, “Approximative Gencluster und ihre Anwendung in der komparativen Genomik”, Informatik-Spektrum, 2009, 32, 288-300.
PUB | DOI
 
2009 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1893884
P. Husemann, and J. Stoye, in Proc. of WABI 2009, 2009, p. 145-156.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1635314 OA
N. N. Diaz, L. Krause, A. Goesmann, K. Niehaus, and T. W. Nattkemper, “TACOA - Taxonomic classification of environmental genomic fragments using a kernelized nearest neighbor approach”, BMC Bioinformatics, 2009, 10, 56.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1635321 OA
M. Dondrup, S. Albaum, T. Griebel, K. Henckel, S. Jünemann, T. Kahlke, C. K. Kleindt, H. Kuester, B. Linke, D. Mertens, et al., “EMMA 2-A MAGE-compliant system for the collaborative analysis and integration of microarray data”, BMC Bioinformatics, 2009, 10, : 50.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1591507
J. Stoye, and R. Wittler, “A Unified Approach for Reconstructing Ancient Gene Clusters”, IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2009, 6, 387-400.
PUB | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1589098 OA
W. Gerlach, S. Jünemann, F. Tille, A. Goesmann, and J. Stoye, “WebCARMA: a web application for the functional and taxonomic classification of unassembled metagenomic reads”, BMC Bioinformatics, 2009, 10, 430.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1589531
S. Albaum, H. Neuweger, B. Fraenzel, S. Lange, D. Mertens, C. Troetschel, D. Wolters, J. Kalinowski, T. W. Nattkemper, and A. Goesmann, “Qupe-a Rich Internet Application to take a step forward in the analysis of mass spectrometry-based quantitative proteomics experiments”, Bioinformatics, 2009, 25, 3128-3134.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1590204
M. Brudno, P. Medvedev, J. Stoye, and F. M. De La Vega, “A report on the 2009 SIG on short read sequencing and algorithms (Short-SIG)”, BIOINFORMATICS, 2009, 25, 2863-2864.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1588783
A. Purser, M. Bergmann, J. Ontrup, and T. W. Nattkemper, “Use of machine-learning algorithms for the automated detection of cold-water coral habitats: a pilot study”, Marine Ecology Progress Series, 2009, 397, 241-251.
PUB | DOI | WoS
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1898105
S. Böcker, K. Jahn, J. Mixtacki, and J. Stoye, “Computation of Median Gene Clusters”, Journal of Computational Biology, 2009, 16, 1085-1099.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1591319
N. Hoffmann, and J. Stoye, “ChromA: signal-based retention time alignment for chromatography-mass spectrometry data”, Bioinformatics, 2009, 25, 2080-2081.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1588760 OA
M. Dias Vieira Braga, C. Gautier, and M. - F. Sagot, “An asymmetric approach to preserve common intervals while sorting by reversals”, Algorithms for Molecular Biology, 2009, 4, 16.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 

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