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419 Publikationen

2010 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2301975 OA
Clustering biological data by unraveling hidden transitive substructures
Wittkop T (2010)
Bielefeld (Germany): Bielefeld University.
PUB | PDF
 
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2308298
One-year time series of investigations of analytes within human breath using ion mobility spectrometry
Bunkowski A, Maddula S, Davies AN, Westhoff M, Litterst P, Bödeker B, Baumbach JI (2010)
Int. J. Ion Mobility Spectrometry 13(3-4): 141-148.
PUB | DOI | Download (ext.)
 
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2425329
Software tool for coupling chromatographic total ion current dependencies of GC/MSD and MCC/IMS
Bunkowski A (2010)
Int. J. Ion Mobil. Spectrom. 13(3-4): 169-175.
PUB | DOI
 
2010 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2445157
Computing the Genomic Distance in Linear Time
Bergeron A, Mixtacki J, Stoye J (2010)
In: Dagstuhl Seminar Proceedings: 10231 Abstracts Collection : Structure Discovery in Biology: Motifs, Networks & Phylogenies. Apostolico A, Dress A, Parida L (Eds); , 10231. Dagstuhl: Schloss Dagstuhl - Leibniz-Zentrum für Informatik: 18.
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1929692
CARMEN - Comparative Analysis and in silico Reconstruction of organism-specific MEtabolic Networks
Schneider J, Vorhölter F-J, Trost E, Blom J, Musa YR, Neuweger H, Niehaus K, Schatschneider S, Tauch A, Goesmann A (2010)
Genetics and Molecular Research 9(3): 1660-1672.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2010 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2425332
On Table Arrangements, Scrabble Freaks, and Jumbled Pattern Matching
Burcsi P, Cicalese F, Fici G, Lipták Z (2010)
In: Fun with Algorithms: 5th International Conference, FUN 2010, Ischia, Italy, June 2-4, 2010. Proceedings. Boldi P (Ed); Lecture Notes in Computer Science, 6099. Berlin, Heidelberg: Springer: 89-101.
PUB | DOI
 
2010 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2425351 PUB
 
2010 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2302499 OA
Biological applications for de Bruijn subgraphs and interval group testing
Quitzau JAA (2010)
Bielefeld (Germany): Bielefeld University.
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1893893 OA
Phylogenetic Comparative Assembly
Husemann P, Stoye J (2010)
Algorithms for Molecular Biology 5(1): 3.
PUB | PDF | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2010 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1918836
Indexing and Searching a Mass Spectrometry Database
Besenbacher S, Schwikowski B, Stoye J (2010)
In: Algorithms and Applications: Essays Dedicated to Esko Ukkonen on the Occasion of His 60th Birthday. Elomaa T, Mannila H, Orponen P (Eds); LNCS, 6060. 62-76.
PUB | DOI
 
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1966439
The complete genome sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis FRC41 isolated from a 12-year-old girl with necrotizing lymphadenitis reveals insights into gene-regulatory networks contributing to virulence
Trost E, Ott L, Schneider J, Schröder J, Jaenicke S, Goesmann A, Husemann P, Stoye J, Alves Dorella F, Souza Rocha F, de Castro Soares S, et al. (2010)
BMC Genomics 11(1): 728.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1785275 OA
Complete genome sequence and lifestyle of black-pigmented Corynebacterium aurimucosum ATCC 700975 (formerly C. nigricans CN-1) isolated from a vaginal swab of a woman with spontaneous abortion
Trost E, Götker S, Schneider J, Schneiker-Bekel S, Szczepanowski R, Tilker A, Viehöver P, Arnold W, Bekel T, Blom J, Gartemann K-H, et al. (2010)
BMC Genomics 11(1): 91.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1795670
Partitioning Biological Data with Transitivity Clustering
Wittkop T, Emig D, Lange SJ, Rahmann S, Albrecht M, Morris JH, Böcker S, Stoye J, Baumbach J (2010)
Nature Methods 7(6): 419-420.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1796445
Complete Genome Sequence of the Fire Blight Pathogen Erwinia amylovora CFBP 1430 and Comparison to Other Erwinia spp.
Smits THM, Rezzonico F, Kamber T, Blom J, Goesmann A, Frey JE, Duffy B (2010)
MOLECULAR PLANT-MICROBE INTERACTIONS 23(4): 384-393.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1898012
Finding Nested Common Intervals Efficiently
Blin G, Faye D, Stoye J (2010)
Journal of Computational Biology 17(9): 1183-1194.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2010 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1894907
Practical Guide: Genomic Techniques and How to Apply Them to Marine Questions
Mittard-Runte V, Bekel T, Blom J, Dondrup M, Henckel K, Jaenicke S, Krause L, Linke B, Neuweger H, Schneiker-Bekel S, Goesmann A (2010)
In: Introduction to Marine Genomics (Advances in Marine Genomics). Cock JM, Tessmar-Raible K, Boyen C, Viard F (Eds); , 1. Netherlands: Springer Netherlands: 315-396.
PUB | DOI
 
2010 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1919217
Consistency of Sequence-based Gene Clusters
Wittler R, Stoye J (2010)
In: Proc. of Recomb-CG 2010. LNBI, 6398. Springer Verlag: 252-263.
PUB | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2010 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1893890
Repeat-aware Comparative Genome Assembly
Husemann P, Stoye J (2010)
In: Proc. of GCB 2010. LNI, P-173. 61-70.
PUB | Download (ext.)
 
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1588556
r2cat: Synteny Plots and Comparative Assembly
Husemann P, Stoye J (2010)
Bioinformatics 26(4): 570-571.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1897997
Rearrangement Models and Single-Cut Operations
Bergeron A, Medvedev P, Stoye J (2010)
Journal of Computational Biology 17(9): 1213-1225.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 

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