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414 Publikationen

2019 | Zeitschriftenaufsatz | Im Druck | PUB-ID: 2937712
D. Rubert, F. H. V. Martinez, J. Stoye, and D. Dörr, “Analysis of local genome rearrangement improves resolution of ancestral genomic maps in plants”, BMC Genomics, In Press.
PUB
 
2019 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2937148
J. Alanko, H. Bannai, B. Cazaux, P. Peterlongo, and J. Stoye, in Proceedings of WABI 2019, Schloss Dagstuhl, Leibniz-Zentrum Für Informatik , Dagstuhl, 2019, p. 8:1-8:9.
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2019 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2936900
R. Wittler, in Proceedings of WABI 2019 (Eds.: K. Huber, D. Gusfield), Schloss Dagstuhl--Leibniz-Zentrum Fuer Informatik, Dagstuhl, Germany, 2019.
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2019 | Datenpublikation | PUB-ID: 2936848
D. Dörr, and D. Rubert, Supplementary Data for "Analysis of local genome rearrangement improves resolution of ancestral genomic maps in plants", Bielefeld University, 2019.
PUB | Dateien verfügbar | DOI
 
2019 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2935998
Computational Methods for Microbiome Analysis, Frontiers Media, Lausanne, 2019.
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2019 | Preprint | PUB-ID: 2935604
R. Wittler, “Alignment- and reference-free phylogenomics with colored de-Bruijn graphs”, arXiv:1905.04165, 2019.
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2019 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2932883
D. Dörr, and J. Stoye, in Bioinformatics and Phylogenetics (Ed.: T. Warnow), Springer , Cham, 2019, p. 361-372.
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2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933161
H. Hassan, and S. Shanak, “GOTrapper. A tool to navigate through branches of gene ontology hierarchy”, BMC Bioinformatics, 2019, 20, : 20.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2932884
H. Oey, M. Zakrzewski, K. Gravermann, N. D. Young, P. K. Korhonen, G. N. Gobert, S. Nawaratna, S. Hasan, D. M. Martínez, H. You, et al., “Whole-genome sequence of the bovine blood fluke Schistosoma bovis supports interspecific hybridization with S. haematobium”, PLOS Pathogens, 2019, 15, : e1007513.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2919005
T. Schulz, J. Stoye, and D. Dörr, “GraphTeams. A method for discovering spatial gene clusters in Hi-C sequencing data”, BMC Genomics, 2018, 19, : 308.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2919006
D. Rubert, E. A. Hoshino, M. Dias Vieira Braga, J. Stoye, and F. H. V. Martinez, “Computing the family-free DCJ similarity”, BMC Bioinformatics, 2018, 19, : 152.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2918481
N. Luhmann, C. Chauve, J. Stoye, and R. Wittler, “Scaffolding of Ancient Contigs and Ancestral Reconstruction in a Phylogenetic Framework”, IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2018, 15, 2094-2100.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2932754
S. Bhatia, P. Feijão, and A. R. Francis, “Position and Content Paradigms in Genome Rearrangements. The Wild and Crazy World of Permutations in Genomics”, BULLETIN OF MATHEMATICAL BIOLOGY, 2018, 80, 3227-3246.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2919346
D. Hagenfeld, R. Koch, S. Jünemann, K. Prior, I. Harks, P. Eickholz, T. Hoffmann, T. - S. Kim, T. Kocher, J. Meyle, et al., “Do we treat our patients or rather periodontal microbes with adjunctive antibiotics in periodontal therapy? A 16S rDNA microbial community analysis”, PLOS ONE, 2018, 13, : e0195534.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2018 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2918485
G. Holley, Pan-genome Search and Storage, Universität Bielefeld, Bielefeld, 2018.
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2018 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2919356
E. Willing, On Distance and Sorting of the Double Cut-and-Join and the Inversion-*indel* Model, Universität Bielefeld, Bielefeld, 2018.
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2018 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2930445
L. Cunha, Y. Diekmann, L. Kowada, and J. Stoye, in Proceedings of BSB 2018, Springer Verlag, 2018, p. 26-37.
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2930268
G. Holley, R. Wittler, J. Stoye, and F. Hach, “Dynamic Alignment-Free and Reference-Free Read Compression”, JOURNAL OF COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2018, 25, 825-836.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2018 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2913921
T. Zekic, G. Holley, and J. Stoye, in Comparative Genomics. Methods and Protocols (Eds.: J.C. Setubal, P. Stadler, J. Stoye), Springer Verlag, New York, 2018, p. 29-53.
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2018 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2913922
D. Dörr, P. Feijão, and J. Stoye, in Comparative Genomics: Methods and Protocols (Eds.: J.C. Setubal, P. Stadler, J. Stoye), Springer Verlag, New York, 2018, p. 331-342.
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