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428 Publikationen

2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773578 OA
Spang R, Rehmsmeier M, Stoye J. A novel approach to remote homology detection: jumping alignments. Journal of Computational Biology. 2002;9(5):747-760.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773332 OA
Stoye J, Gusfield D. Simple and flexible detection of contiguous repeats using a suffix tree. Theoretical Computer Science. 2002;270(1-2):843-856.
PUB | PDF | DOI | WoS
 
2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773329 OA
Bergeron A, Heber S, Stoye J. Common intervals and sorting by reversals: a marriage of necessity. Bioinformatics. 2002;18(Suppl 2):S54-S63.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2002 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1918995
Heber S, Stoye J, Frohme M, Hoheisel J, Vingron M. Resampling Methods in Physical Mapping. In: Proc. of GfKl 2000. 2002: 437-444.
PUB
 
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1918992
Heber S, Stoye J. Finding all Common Intervals of k Permutations. In: Proc. of CPM 2001. LNCS. Vol 2089. 2001: 207-218.
PUB | DOI
 
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1880197
Heber S, Stoye J. Algorithms for Finding Gene Clusters. In: Proc. of WABI 2001. LNCS. Vol 2149. Berlin: Sppringer; 2001: 252-263.
PUB | DOI
 
2001 | Report | PUB-ID: 1970479
Cieliebak M, Erlebach T, Lipták Z, Stoye J, Welzl E. Algorithmic Complexity of Protein Identification: Combinatorics of Weighted Strings. Technical Report. ETH Zürich, Dept. of Computer Science; 2001.
PUB
 
2000 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1918981
Heber S, Stoye J, Hoheisel J, Vingron M. Contig Selection in Physical Mapping. In: Proc. of RECOMB 2000. 2000: 155-164.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2000 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1918817
Brodal GS, Lyngsø RB, Pedersen CNS, Stoye J. Finding Maximal Pairs with Bounded Gap. In: Crochemore M, Gąsieniec L, eds. Matching Patterns (Journal of Discrete Algorithms). 2000: 77-104.
PUB
 
2000 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773345 OA
Krause A, Stoye J, Vingron M. The SYSTERS protein sequence cluster set. Nucleic Acids Research. 2000;28(1):270-272.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 

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