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769 Publikationen

2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2676082
Genomics of Sponge-Associated Streptomyces spp. Closely Related to Streptomyces albus J1074: Insights into Marine Adaptation and Secondary Metabolite Biosynthesis Potential
Ian E, Malko DB, Sekurova ON, Bredholt H, Rückert C, Borisova ME, Albersmeier A, Kalinowski J, Gelfand MS, Zotchev SB (2014)
PloS one 9(5): e96719.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2662834
Complete Genome Sequence of Corynebacterium falsenii DSM 44353 To Study the Evolution of Corynebacterium Cluster 3 Species
Glaub A, Bomholt C, Gravermann K, Brinkrolf K, Albersmeier A, Rückert C, Tauch A (2014)
Genome announcements 2(2).
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2582332
Complete Genome Sequence of Corynebacterium urealyticum Strain DSM 7111, Isolated from a 9-Year-Old Patient with Alkaline-Encrusted Cystitis
Guimarães LC, Soares SC, Albersmeier A, Blom J, Jaenicke S, Azevedo V, Soriano F, Tauch A, Trost E (2013)
Genome announcements 1(3): e00264-13.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2624418 OA
The circadian clock goes genomic
Staiger D, Shin J, Johansson M, Davis SJ (2013)
Genome Biology 14(6): 208.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2631977 OA
A novel type of N-acetylglutamate synthase is involved in the first step of arginine biosynthesis in Corynebacterium glutamicum
Petri K, Walter F, Persicke M, Rückert C, Kalinowski J (2013)
BMC Genomics 14(1): 713.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2605193 OA
Detailed analysis of metagenome datasets obtained from biogas-producing microbial communities residing in biogas reactors does not indicate the presence of putative pathogenic microorganisms
Eikmeyer FG, Rademacher A, Hanreich A, Hennig M, Jaenicke S, Maus I, Wibberg D, Zakrzewski M, Pühler A, Klocke M, Schlüter A (2013)
Biotechnology for Biofuels 6(1): 49.
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2013 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1923975
Transcriptome/proteome analysis of Corynebacterium glutamicum
Wendisch VF, Polen T (2013)
In: Corynebacterium glutamicum: Biology and Biotechnology. Yukawa H, Inui M (Eds); Microbiology Monographs, 23. Heidelberg, Germany: Springer: 173-216.
PUB | DOI
 
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2644101 OA
Genome sequence of the marine bacterium Corynebacterium maris type strain Coryn-1T (= DSM 45190T)
Schaffert L, Albersmeier A, Bednarz H, Niehaus K, Kalinowski J, Rückert C (2013)
Standards in Genomic Sciences 8(3): 516-524.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2631969 OA
Comprehensive discovery and characterization of small RNAs in Corynebacterium glutamicum ATCC 13032
Mentz A, Neshat A, Pfeifer-Sancar K, Pühler A, Rückert C, Kalinowski J (2013)
BMC Genomics 14(1): 714.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2643373 OA
Comprehensive analysis of the Corynebacterium glutamicum transcriptome using an improved RNAseq technique
Pfeifer-Sancar K, Mentz A, Rückert C, Kalinowski J (2013)
BMC Genomics 14(1): 888.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2555342
Genome sequence of the plant growth promoting strain Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum B9601-Y2 and expression of mersacidin and other secondary metabolites
He P, Hao K, Blom J, Rückert C, Vater J, Mao Z, Wu Y, Hou M, He P, He Y, Borriss R (2013)
Journal of biotechnology 164(2): 281-291.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2614869
Genome sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis biovar equi strain 258 and prediction of antigenic targets to improve biotechnological vaccine production
Soares SC, Trost E, Ramos RTJ, Carneiro AR, Santos AR, Pinto AC, Barbosa E, Aburjaile F, Ali A, Diniz CAA, Hassan SS, et al. (2013)
Journal of Biotechnology 167(2): 135-141.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2641228
Corrigendum: Updating benchtop sequencing performance comparison
Jünemann S, Sedlazeck FJ, Prior K, Albersmeier A, John U, Kalinowski J, Mellmann A, Goesmann A, von Haeseler A, Stoye J, Harmsen D (2013)
Nature biotechnology 31(12): 1148.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2637220
The Rhizobacterium Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum NAU-B3 Contains a Large Inversion within the Central Portion of the Genome
Wu H, Qiao J, Blom J, Rückert C, Reva O, Gao X, Borriss R (2013)
Genome announcements 1(6): e00941-13.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2633427
Draft Genome Sequence of Sinorhizobium meliloti RU11/001, a model organism for flagellum structure, motility and chemotaxis
Wibberg D, Blom J, Rückert C, Winkler A, Albersmeier A, Pühler A, Schlüter A, Scharf BE (2013)
Journal of Biotechnology 168(4): 731-733.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2632946
Complete genome sequence of Pseudomonas sp. strain VLB120 a solvent tolerant, styrene degrading bacterium, isolated from forest soil
Köhler KAK, Rückert C, Schatschneider S, Vorhölter F-J, Szczepanowski R, Blank LM, Niehaus K, Goesmann A, Pühler A, Kalinowski J, Schmid A (2013)
Journal of Biotechnology 168(4): 729-730.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2629570
Insertionslinien als Werkzeuge für funktionelle Genomforschung
Huep G, Kleinbölting N, Appelhagen I, Viehöver P, Weisshaar B (2013)
BIOspektrum 19(6): 639-641.
PUB | DOI
 
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2558460
Whole Genome Sequencing versus Traditional Genotyping for Investigation of a Mycobacterium tuberculosis Outbreak: A Longitudinal Molecular Epidemiological Study
Roetzer A, Diel R, Kohl TA, Rückert C, Nübel U, Blom J, Wirth T, Jaenicke S, Schuback S, Rüsch-Gerdes S, Supply P, et al. (2013)
PLoS medicine 10(2): e1001387.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2631956
Complete genome sequence of the kirromycin producer Streptomyces collinus Tü 365 consisting of a linear chromosome and two linear plasmids
Rückert C, Szczepanowski R, Albersmeier A, Goesmann A, Iftime D, Musiol EM, Blin K, Wohlleben W, Pühler A, Kalinowski J, Weber T (2013)
Journal of Biotechnology 168(4): 739-740.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2566922
Updating benchtop sequencing performance comparison
Jünemann S, Sedlazeck FJ, Prior K, Albersmeier A, John U, Kalinowski J, Mellmann A, Goesmann A, von Haeseler A, Stoye J, Harmsen D (2013)
Nature Biotechnology 31(4): 294-296.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2629377
Whole-Genome Sequence of the Clinical Strain Corynebacterium argentoratense DSM 44202, Isolated from a Human Throat Specimen
Bomholt C, Glaub A, Gravermann K, Albersmeier A, Brinkrolf K, Rückert C, Tauch A (2013)
Genome announcements 1(5): e00793-13.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2557779
Genome Sequence of Sinorhizobium meliloti Rm41
Weidner S, Baumgarth B, Göttfert M, Jaenicke S, Pühler A, Schneiker-Bekel S, Serrania J, Szczepanowski R, Becker A (2013)
Genome Announcements 1(1): e00013-12.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2629112
A new set of reversibly photoswitchable fluorescent proteins for use in transgenic plants
Lummer M, Humpert F, Wiedenlübbert M, Sauer M, Schüttpelz M, Staiger D (2013)
Molecular plant 6(5): 1518-1530.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2614036
Construction of a prophage-free variant of Corynebacterium glutamicum ATCC 13032 - a platform strain for basic research and industrial biotechnology
Baumgart M, Unthan S, Rückert C, Sivalingam J, Grünberger A, Kalinowski J, Bott M, Noack S, Frunzke J (2013)
Applied and environmental microbiology 79(19): 6006-6015.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2548236
Comparative RNA-sequencing of the acarbose producer Actinoplanes sp. SE50/110 cultivated in different growth media
Schwientek P, Wendler S, Neshat A, Eirich C, Rückert C, Klein A, Wehmeier UF, Kalinowski J, Stoye J, Pühler A (2013)
Journal of Biotechnology 167(2): 166-177.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2548779
Osmoprotection of Bacillus subtilis through Import and Proteolysis of Proline-Containing Peptides
Zaprasis A, Brill J, Thüring M, Wünsche G, Heun M, Barzantny H, Hoffmann T, Bremer E (2013)
Applied and environmental microbiology 79(2): 576-587.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2555355
A propionate-inducible expression system based on the Corynebacterium glutamicum prpD2 promoter and PrpR activator and its application for the redirection of amino acid biosynthesis pathways
Plassmeier J, Busche T, Molck S, Persicke M, Pühler A, Rückert C, Kalinowski J (2013)
Journal of Biotechnology 163(2): 225-232.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2648007
Genome sequence of the squalene-degrading bacterium Corynebacterium terpenotabidum type strain Y-11T (= DSM 44721T)
Rückert C, Albersmeier A, Al-Dilaimi A, Bednarz H, Niehaus K, Szczepanowski R, Kalinowski J (2013)
Standards in Genomic Sciences 9(3): 505-513.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2517239 OA
Combining peak- and chromatogram-based retention time alignment algorithms for multiple chromatography-mass spectrometry datasets
Hoffmann N, Keck M, Neuweger H, Wilhelm M, Högy P, Niehaus K, Stoye J (2012)
BMC Bioinformatics 13(1): 21.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2486060 OA
The complete genome sequence of the acarbose producer Actinoplanes sp. SE50/110
Schwientek P, Szczepanowski R, Rückert C, Kalinowski J, Klein A, Selber K, Wehmeier UF, Stoye J, Pühler A (2012)
BMC Genomics 13(1): 112.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2549356
The binning of metagenomic contigs for microbial physiology of mixed cultures.
Strous M, Kraft B, Bisdorf R, Tegetmeyer H (2012)
Frontiers in Microbiology 3: 410.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2518071
Anaerobic co-digestion of pig manure and crude glycerol at mesophilic conditions: Biogas and digestate
Astals S, Nolla Ardevol V, Mata-Alvarez J (2012)
Bioresource Technology 110: 63-70.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2352741
TNF-alpha alpha influences the lateral dynamics of TNF receptor I in living cells
Heidbreder M, Zander C, Malkusch S, Widera D, Kaltschmidt B, Kaltschmidt C, Nair D, Sibarita J-B, Choquet D, Heilemann M (2012)
Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Cell Research 1823(10): 1984-1989.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2352758
Isolation of Novel Multipotent Neural Crest-Derived Stem Cells from Adult Human Inferior Turbinate
Hauser S, Widera D, Qunneis F, Müller J, Zander C, Greiner J, Strauss C, Lüningschrör P, Heimann P, Schwarze H, Ebmeyer J, et al. (2012)
Stem Cells and Development 21(5): 742-756.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2551038
Genome sequence of the halotolerant bacterium Corynebacterium halotolerans type strain YIM 70093T (= DSM 44683T)
Rückert C, Albersmeier A, Al-Dilaimi A, Niehaus K, Szczepanowski R, Kalinowski J (2012)
Standards in Genomic Sciences 7(2): 284-293.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2607124
Combining Genomics and Metabolomics for the Discovery of Regulatory Genes and Their Use in Metabolic Engineering to Produce 'Healthy Foods'
Martin C, Luo J, Lebouteiller B, Mock HP, Matros A, Peterek S, Schijlen EGWM, Hall R, Shintu L, Colquhoun I, Weisshaar B, et al. (2012)
Acta Horticulturae 941: 73-84.
PUB
 
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2473849
Genome Sequence of the Soybean Symbiont Sinorhizobium fredii HH103
Weidner S, Becker A, Bonilla I, Jaenicke S, Lloret J, Margaret I, Pühler A, Ruiz-Sainz JE, Schneiker-Bekel S, Szczepanowski R, Vinardell JM, et al. (2012)
Journal of Bacteriology 194(6): 1617-1618.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2485565
Regrowing the adult brain: NF-kappaB controls functional circuit formation and tissue homeostasis in the dentate gyrus
Imielski Y, Schwamborn JC, Lüningschrör P, Heimann P, Holzberg M, Werner H, Leske O, Puschel AW, Memet S, Heumann R, Israel A, et al. (2012)
PLoS ONE 7(2): e30838.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2448791 OA
GABI-Kat SimpleSearch: new features of the Arabidopsis thaliana T-DNA mutant database
Kleinbölting N, Huep G, Klotgen A, Viehöver P, Weisshaar B (2012)
Nucleic Acids Research 40(D1): D1211-D1215.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2513347
Pangenomic Study of Corynebacterium diphtheriae That Provides Insights into the Genomic Diversity of Pathogenic Isolates from Cases of Classical Diphtheria, Endocarditis, and Pneumonia
Trost E, Blom J, de Castro Soares S, Huang I-H, Al-Dilaimi A, Schröder J, Jaenicke S, Dorella FA, Rocha FS, Miyoshi A, Azevedo V, et al. (2012)
Journal of bacteriology 194(12): 3199-3215.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2530872
Draft Genome Sequence of Bacillus anthracis UR-1, Isolated from a German Heroin User
Rückert C, Licht K, Kalinowski J, Espírito Santo C, Antwerpen M, Hanczaruk M, Reischl U, Holzmann T, Gessner A, Tiemann C, Grass G (2012)
Journal of bacteriology 194(21): 5997-5998.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2530221
The genome sequence of the bacterium Streptomyces davawensis JCM 4913 and heterologous production of the unique antibiotic roseoflavin
Jankowitsch F, Schwarz J, Rückert C, Gust B, Szczepanowski R, Blom J, Pelzer S, Kalinowski J, Mack M (2012)
Journal of bacteriology 194(24): 6818-6827.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2486155
Elongation-related functions of LEAFY COTYLEDON1 during the development of Arabidopsis thaliana
Junker A, Mönke G, Rutten T, Keilwagen J, Seifert M, Thi TMN, Renou J-P, Balzergue S, Viehöver P, Hähnel U, Ludwig-Müller J, et al. (2012)
The Plant Journal 71(3): 427-442.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2548248
Draft genome sequence of Bacillus anthracis BF-1, Isolated from Bavarian cattle
Antwerpen M, Proença DN, Rückert C, Licht K, Kalinowski J, Hanczaruk M, Tiemann C, Grass G (2012)
Journal of bacteriology 194(22): 6360-6361.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2460882
Candidate genes within a 143 kb region of the flower sex locus in Vitis
Fechter I, Hausmann L, Daum M, Rosleff Sörensen T, Viehöver P, Weisshaar B, Töpfer R (2012)
Molecular Genetics and Genomics 287(3): 247-259.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2454417
Palaeohexaploid Ancestry for Caryophyllales Inferred from Extensive Gene-Based Physical and Genetic Mapping of the Sugar Beet Genome (Beta vulgaris)
Dohm JC, Lange C, Holtgräwe D, Rosleff Sörensen T, Borchardt D, Schulz B, Lehrach H, Weisshaar B, Himmelbauer H (2012)
The Plant Journal 70(3): 528-540.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2536068
Activity and diversity of haloalkaliphilic methanogens in Central Asian soda lakes
Nolla Ardevol V, Strous M, Sorokin DY, Merkel AY, Tegetmeyer H (2012)
Journal of Biotechnology 161(2): 167-173.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2532965
Evolutionary reshuffling in the Errantivirus lineage Elbe within the Beta vulgaris genome
Wollrab C, Heitkam T, Holtgräwe D, Weisshaar B, Minoche AE, Dohm JC, Himmelbauer H, Schmidt T (2012)
The Plant Journal 72(4): 636-651.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2398758
miR-290 cluster modulates pluripotency by repressing canonical NF-κB signaling
Lüningschrör P, Stoecker B, Kaltschmidt B, Kaltschmidt C (2012)
Stem Cells 30(4): 655-664.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2425069
Biotin protein ligase from Corynebacterium glutamicum: role for growth and L-lysine production
Peters-Wendisch P, Stansen KC, Götker S, Wendisch VF (2012)
Applied Microbiology and Biotechnology 93(6): 2493-2502.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 

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