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769 Publikationen

2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326465
Torres Tejerizo, G.; Florencia Del Papa, M.; Draghi, W.; Lozano, M.; de los Angeles Giusti, M.; Martini, C.; Eugenia Salas, M.; Salto, I.; Wibberg, D.; Szczepanowski, R.; Weidner, S.; Schlüter, A.; Lagares, A.; Pistorio, M. (2011): First genomic analysis of the broad-host-range Rhizobium sp LPU83 strain, a member of the low-genetic diversity Oregon-like Rhizobium sp group Journal of Biotechnology,155:(1): 3-10.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326511
Rückert, C.; Blom, J.; Chen, X. H.; Reva, O.; Borriss, R. (2011): Genome sequence of B. amyloliquefaciens type strain DSM7(T) reveals differences to plant-associated B. amyloliquefaciens FZB42 Journal of Biotechnology,155:(1): 78-85.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2375640
Merkle, T.; Grasser, K. D. (2011): Unexpected mobility of plant chromatin-associated HMGB proteins Plant Signaling & Behavior,6:(6): 878-880.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2375645
Barzantny, H.; Brune, I.; Tauch, A. (2011): Molecular basis of human body odour formation: insights deduced from corynebacterial genome sequences International Journal of Cosmetic Science,34:(1): 2-11.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394493
Hinse, D.; Vollmer, T.; Rückert, C.; Blom, J.; Kalinowski, J.; Knabbe, C.; Dreier, J. (2011): Complete genome and comparative analysis of Streptococcus gallolyticus subsp gallolyticus, an emerging pathogen of infective endocarditis BMC Genomics,12:(1): 400.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394614
Martinez-Moya, P.; Watt, S. A.; Niehaus, K.; Alcaino, J.; Baeza, M.; Cifuentes, V. (2011): Proteomic analysis of the carotenogenic yeast Xanthophyllomyces dendrorhous BMC Microbiology,11:(1): 131.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396576
Becker, J.; Hackel, M.; Jakobi, T.; Rupp, O.; Schneider, J.; Szczepanowski, R.; Bekel, T.; Borth, N.; Goesmann, A.; Grillari, J.; Kaltschmidt, C.; Noll, T.; Pühler, A.; Tauch, A.; Brinkrolf, K. (2011): Unraveling the Chinese hamster ovary cell line transcriptome by next-generation sequencing Journal of Biotechnology,156:(3): 227-235.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2289773
Sommer, B.; Dingersen, T.; Gamroth, C.; Schneider, S. E.; Robert, S.; Krueger, J.; Dietz, K. - J. (2011): CELLmicrocosmos 2.2 Membrane Editor: A Modular Interactive Shape-Based Software Approach To Solve Heterogeneous Membrane Packing Problems Journal of Chemical Information and Modeling,51:(5): 1165-1182.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2289850
Schnitzer, D.; Seidel, T.; Sander, T.; Golldack, D.; Dietz, K. - J. (2011): The Cellular Energization State Affects Peripheral Stalk Stability of Plant Vacuolar H+-ATPase and Impairs Vacuolar Acidification Plant and Cell Physiology,52:(5): 946-956.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2289494
Persicke, M.; Plassmeier, J.; Neuweger, H.; Rückert, C.; Pühler, A.; Kalinowski, J. (2011): Size exclusion chromatography-An improved method to harvest Corynebacterium glutamicum cells for the analysis of cytosolic metabolites Journal of Biotechnology,154:(2-3): 171-178.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2307075
Dietz, K. - J. (2011): Peroxiredoxins in Plants and Cyanobacteria Antioxidants & Redox Signaling,15:(4): 1129-1159.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2375954
Borriss, R.; Chen, X. - H.; Rückert, C.; Blom, J.; Becker, A.; Baumgarth, B.; Fan, B.; Pukall, R.; Schumann, P.; Sproer, C.; Junge, H.; Vater, J.; Pühler, A.; Klenk, H. - P. (2011): Relationship of Bacillus amyloliquefaciens clades associated with strains DSM 7T and FZB42T: a proposal for Bacillus amyloliquefaciens subsp. amyloliquefaciens subsp. nov. and Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum subsp. nov. based on complete genome sequence comparisons Int J Syst Evol Microbiol,61:(8): 1786-1801.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2438803
Jeong, B. -ryool; Lin, Y.; Joe, A.; Guo, M.; Korneli, C.; Yang, H.; Wang, P.; Yu, M.; Cerny, R. L.; Staiger, D.; Alfano, J. R.; Xu, Y. (2011): Structure function analysis of an ADP-ribosyltransferase type III effector and its RNA-binding target in plant immunity Journal of Biological Chemistry,286:(50): 43272-43281.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2442429
Dietz, K. - J.; Herth, S. (2011): Plant nanotoxicology Trends in plant science,16:(11): 582-589.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2425088
Wendisch, V. F.; Marx, A.; Kircher, M. (2011): Industrielle Biotechnologie: Entwicklung neuer Ansätze zur Verbesserung von Produktionsprozessen BIOforum,2011:(2): 12-14.
PUB
 
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2411830
Ausec, L.; Zakrzewski, M.; Goesmann, A.; Schlüter, A.; Mandic-Mulec, I. (2011): Bioinformatic analysis reveals high diversity of bacterial genes for laccase-like enzymes PLoS ONE,6:(10):e25724
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2318497
Holtgräwe, D.; Weisshaar, B.; Himmelbauer, H. (2011): Die Entschlüsselung der Süßen: GABI-Future-Projekt erstellt Referenzsequenz des Genoms der Zuckerrübe GenomXPress,2011:(2): 4-6.
PUB
 
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326440
Kraft, B.; Strous, M.; Tegetmeyer, H. (2011): Microbial nitrate respiration - Genes, enzymes and environmental distribution Journal of Biotechnology,155:(1): 104-117.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2440575
Luesken, F. A.; van Alen, T. A.; van der Biezen, E.; Frijters, C.; Toonen, G.; Kampman, C.; Hendrickx, T. L. G.; Zeeman, G.; Temmink, H.; Strous, M.; den Camp, H. J. M. O.; Jetten, M. S. M. (2011): Diversity and enrichment of nitrite-dependent anaerobic methane oxidizing bacteria from wastewater sludge Applied Microbiology and Biotechnology,92:(4): 845-854.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326455
Krol, E.; Blom, J.; Winnebald, J.; Berhoerster, A.; Barnett, M. J.; Goesmann, A.; Baumbach, J.; Becker, A. (2011): RhizoRegNet-A database of rhizobial transcription factors and regulatory networks Journal of Biotechnology,155:(1): 127-134.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326481
Mayer, L.; Vendruscolo, C. T.; da Silva, W. P.; Vorhölter, F. - J.; Becker, A.; Pühler, A. (2011): Insights into the genome of the xanthan-producing phytopathogen Xanthomonas arboricola pv. pruni 109 by comparative genomic hybridization Journal of Biotechnology,155:(1): 40-49.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326518
Szczepanowski, R.; Eikmeyer, F. G.; Harfmann, J.; Blom, J.; Rogers, L. M.; Top, E. M.; Schlüter, A. (2011): Sequencing and comparative analysis of IncP-1 alpha antibiotic resistance plasmids reveal a highly conserved backbone and differences within accessory regions Journal of Biotechnology,155:(1): 95-103.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326568
Cerdeira, L. T.; Carneiro, A. R.; Juca Ramos, R. T.; de Almeida, S. S.; D'Afonseca, V.; Cruz Schneider, M. P.; Baumbach, J.; Tauch, A.; McCulloch, J. A.; Carvalho Azevedo, V. A.; Silva, A. (2011): Rapid hybrid de novo assembly of a microbial genome using only short reads: Corynebacterium pseudotuberculosis I19 as a case study Journal of Microbiological Methods,86:(2): 218-223.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2404808
Plassmeier, J.; Persicke, M.; Pühler, A.; Sterthoff, C.; Rückert, C.; Kalinowski, J. (2011): Molecular characterization of PrpR, the transcriptional activator of propionate catabolism in Corynebacterium glutamicum Journal of Biotechnology,159:(1-2): 1-11.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2454721
Cerdeira, L. T.; Cruz Schneider, M. P.; Pinto, A. C.; de Almeida, S. S.; dos Santos, A. R.; Vieira Barbosa, E. G.; Ali, A.; Aburjaile, F. F.; Carvalho de Abreu, V. A.; Guimaraes, L. C.; Soares, S. de C.; Dorella, F. A.; Rocha, F. S.; Bol, E.; Caracciolo Gomes de Sa, P. H.; Lopes, T. S.; Barbosa, M. S.; Carneiro, A. R.; Juca Ramos, R. T.; da Rocha Coimbra, N. A.; Jeronimo Lima, A. R.; Barh, D.; Jain, N.; Tiwari, S.; Raja, R.; Zambare, V.; Ghosh, P.; Trost, E.; Tauch, A.; Miyoshi, A.; Azevedo, V.; Silva, A. (2011): Complete Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis Strain CIP 52.97, Isolated from a Horse in Kenya Journal of Bacteriology,193:(24): 7025-7026.
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2011 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2453768
Becker, J.; Timmermann, C.; Jakobi, T.; Rupp, O.; Szczepanowski, R.; Hackl, M.; Goesmann, A.; Tauch, A.; Borth, N.; Grillari, J.; Pühler, A.; Noll, T.; Brinkrolf, K. (2011): Next-generation sequencing of the CHO cell transcriptome, In: Hansjörg Hauser (Hrsg.), BMC Proceedings,5:(Suppl. 8): P6.
PUB | DOI
 
2011 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2397780
Doppmeier, D.; Stracke, R.; Lutter, P.; Goesmann, A.; Niehaus, K.; Weisshaar, B. (2011): Using the GUS Reporter Gene for Quantitative Studies of Promotor Activity in A.thaliana Seedlings. S. 218.
PUB
 
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2382565
Borriss, R.; Rückert, C.; Blom, J.; Bezuidt, O.; Reva, O.; Klenk, H. P. (2011): Whole Genome Sequence Comparisons in Taxonomy. In: F. Rainey; A. Oren (Hrsg.): Taxonomy of Prokaryotes (Methods in Microbiology). Waltham, MA, USA: Academic Press,.
PUB | DOI | WoS
 
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2452293
Uelker, B.; Weisshaar, B. (2011): Resources for Reverse Genetics Approaches in Arabidopsis thaliana. In: Renate Schmidt; Ian Bancroft (Hrsg.): Genetics and Genomics of the Brassicaceae. Heidelberg, Germany: Springer. S. 527-560.
PUB | DOI
 
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2404874
Schatschneider, S.; Vorhölter, F. - J.; Rückert, C.; Becker, A.; Eisenreich, W.; Pühler, A.; Niehaus, K. (2011): Genome-enabled determination of amino acid biosynthesis in Xanthomonas campestris pv. campestris and identification of biosynthetic pathways for alanine, glycine, and isoleucine by 13C-isotopologue profiling Molecular Genetics and Genomics,286:(3-4): 247-259.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2438818
Staiger, D.; Green, R. (2011): RNA-based regulation in the plant circadian clock Trends in Plant Science,16:(10): 517-523.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2440558
Jankowitsch, F.; Kuehm, C.; Kellner, R.; Kalinowski, J.; Pelzer, S.; Macheroux, P.; Mack, M. (2011): A Novel N,N-8-Amino-8-demethyl-D-riboflavin Dimethyltransferase (RosA) Catalyzing the Two Terminal Steps of Roseoflavin Biosynthesis in Streptomyces davawensis Journal of Biological Chemistry,286:(44): 38275-38285.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2286819
Appelhagen, I.; Lu, G. - H.; Huep, G.; Schmelzer, E.; Weisshaar, B.; Sagasser, M. (2011): TRANSPARENT TESTA1 interacts with R2R3-MYB factors and affects early and late steps of flavonoid biosynthesis in the endothelium of Arabidopsis thaliana seeds The Plant Journal,67:(3): 406-419.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2289491
Kalinowski, J. (2011): Regulatory and Metabolic Networks for Amino Acid Production by Corynebacterium glutamicum Journal of Biotechnology,154:(2-3): 99-100.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2285141
Gopinath, V.; Meiswinkel, T.; Wendisch, V. F.; Nampoothiri, M. K. (2011): Amino acid production from rice straw and wheat bran hydrolysates by recombinant pentose-utilizing Corynebacterium glutamicum Appl. Microbiol. Biotechnol,92:(5): 985-996.
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2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2277256
Wendisch, V. F. (2011): Synthetische Biologie zum Design Massgeschneiderter Stoffwechselwege. In: Alfred Pühler; Bernd Müller-Röber; Marc-Denis Weitze (Hrsg.): acatech diskutiert: Synthetische Biologie. Springer. S. 65-70.
PUB | DOI
 
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2093276
Keck, M.; Gisch, N.; Moll, H.; Vorhölter, F. - J.; Gerth, K.; Kahmann, U.; Lissel, M.; Lindner, B.; Niehaus, K.; Hoist, O. (2011): Unusual Outer Membrane Lipid Composition of the Gram-negative, Lipopolysaccharide-lacking Myxobacterium Sorangium cellulosum So ce56 Journal of Biological Chemistry,286:(15): 12850-12859.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2093360
Ryan, R. P.; Vorhölter, F. - J.; Potnis, N.; Jones, J. B.; Van Sluys, M. - A.; Bogdanove, A. J.; Dow, J. M. (2011): Pathogenomics of Xanthomonas: understanding bacterium-plant interactions Nature Reviews Microbiology,9:(5): 344-355.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2093795
Palmisano, R.; Golfi, P.; Heimann, P.; Shaw, C.; Troakes, C.; Schmitt-John, T.; Bartsch, J. W. (2011): Endosomal accumulation of APP in wobbler motor neurons reflects impaired vesicle trafficking: Implications for human motor neuron disease BMC Neuroscience,12:(1): 24.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2300102
Arif, M.; Rajpoot, N.; Technow, U.; Chakraborty, T.; Fisch, N.; Jensen, N. A.; Niehaus, K.; Nattkemper, T. W. (2011): Quantification of Cell Infection Caused by Listeria monocytogenes Invasion Journal of Biotechnology,154:(1): 76-83.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
2011 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2289887
Hinse, D.; Vollmer, T.; Rückert, C.; Blom, J.; Kalinowski, J.; Knabbe, C.; Dreier, J. (2011): Complete Genome Analysis of Streptococcus gallolyticus subsp gallolyticus, an Emerging Pathogen of Infective Endocarditis Clinical Chemistry and Laboratory Medicine,49: S837.
PUB | WoS
 
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2289952
Blom, J.; Jakobi, T.; Doppmeier, D.; Jaenicke, S.; Kalinowski, J.; Stoye, J.; Goesmann, A. (2011): Exact and complete short-read alignment to microbial genomes using Graphics Processing Unit programming Bioinformatics,27:(10): 1351-1358.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2289971
Ruiz, J. C.; D'Afonseca, V.; Silva, A.; Ali, A.; Pinto, A. C.; Santos, A. R.; Rocha, A. A. M. C.; Lopes, D. O.; Dorella, F. A.; Pacheco, L. G. C.; Costa, M. P.; Turk, M. Z.; Seyffert, N.; Moraes, P. M. R. O.; Soares, S. C.; Almeida, S. S.; Castro, T. L. P.; Abreu, V. A. C.; Trost, E.; Baumbach, J.; Tauch, A.; Schneider, M. P. C.; McCulloch, J.; Cerdeira, L. T.; Ramos, R. T. J.; Zerlotini, A.; Dominitini, A.; Resende, D. M.; Coser, E. M.; Oliveira, L. M.; Pedrosa, A. L.; Vieira, C. U.; Guimaraes, C. T.; Bartholomeu, D. C.; Oliveira, D. M.; Santos, F. R.; Rabelo, E. M.; Lobo, F. P.; Franco, G. R.; Costa, A. F.; Castro, I. M.; Costa Dias, S. R.; Ferro, J. A.; Ortega, J. M.; Paiva, L. V.; Goulart, L. R.; Almeida, J. F.; Ferro, M. I. T.; Carneiro, N. P.; Falcao, P. R. K.; Grynberg, P.; Teixeira, S. M. R.; Brommonschenkel, S.; Oliveira, S. C.; Meyer, R.; Moore, R. J.; Miyoshi, A.; Oliveira, G. C.; Azevedo, V. (2011): Evidence for Reductive Genome Evolution and Lateral Acquisition of Virulence Functions in Two Corynebacterium pseudotuberculosis Strains PLoS ONE,6:(4):e18551
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2288416
Lindner, S.; Seibold, G.; Krämer, R.; Wendisch, V. F. (2011): Impact of a new glucose utilization pathway in amino-acid producing Corynebacterium glutamicum BioEngineered Bugs,2:(5): 291-295.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2317309
Appelhagen, I.; Jahns, O.; Bartelniewoehner, L.; Sagasser, M.; Weisshaar, B.; Stracke, R. (2011): Leucoanthocyanidin Dioxygenase in Arabidopsis thaliana: Characterization of mutant alleles and regulation by MYB-BHLH-TTG1 transcription factor complexes Gene,484:(1-2): 61-68.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2317498
Lindner, S.; Seibold, G. M.; Henrich, A.; Kramer, R.; Wendisch, V. F. (2011): Phosphotransferase system-independent glucose utilization in Corynebacterium glutamicum by inositol permeases and glucokinases Applied and Environmental microbiology,77:(11): 3571-3581.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2319672
Eichenlaub, R.; Gartemann, K. - H. (2011): The Clavibacter michiganensis Subspecies: Molecular Investigation of Gram-Positive Bacterial Plant Pathogens Annu Rev Phytopathol.,49:(1): 445-464.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2411181
Cerdeira, L. T.; Pinto, A. C.; Schneider, M. P. C.; de Almeida, S. S.; Dos Santos, A. R.; Barbosa, E. G. V.; Ali, A.; Barbosa, M. S.; Carneiro, A. R.; Ramos, R. T. J.; de Oliveira, R. S.; Barh, D.; Barve, N.; Zambare, V.; Belchior, S. E.; Guimaraes, L. C.; de Castro Soares, S.; Dorella, F. A.; Rocha, F. S.; de Abreu, V. A. C.; Tauch, A.; Trost, E.; Miyoshi, A.; Azevedo, V.; Silva, A. (2011): Whole-Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis PAT10 Strain Isolated from Sheep in Patagonia, Argentina Journal of Bacteriology,193:(22): 6420-6421.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2307115
Dutilh, B. E.; Jurgelenaite, R.; Szklarczyk, R.; van Hijum, S. A. F. T.; Harhangi, H. R.; Schmid, M.; de Wild, B.; Francoijs, K. - J.; Stunnenberg, H. G.; Strous, M.; Jetten, M. S. M.; Op den Camp, H. J. M.; Huynen, M. A. (2011): FACIL: Fast and Accurate Genetic Code Inference and Logo Bioinformatics,27:(14): 1929-1933.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2289841
Lummer, M.; Humpert, F.; Steuwe, C.; Caesar, K.; Schüttpelz, M.; Sauer, M.; Staiger, D. (2011): Reversible Photoswitchable DRONPA-s Monitors Nucleocytoplasmic Transport of an RNA-Binding Protein in Transgenic Plants Traffic,12:(6): 693-702.
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