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769 Publikationen

2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2317352
Zakrzewski, F., Weisshaar, B., Fuchs, J., Bannack, E., Minoche, A. E., Dohm, J. C., Himmelbauer, H., et al. (2011). Epigenetic profiling of heterochromatic satellite DNA. Chromosoma, 120(4), 409-422. doi:10.1007/s00412-011-0325-x
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2317371
Küberl, A., Schneider, J., Thallinger, G. G., Anderl, I., Wibberg, D., Hajek, T., Jaenicke, S., et al. (2011). High-quality genome sequence of Pichia pastoris CBS7435. Journal of Biotechnology, 154(4), 312-320. doi:10.1016/j.jbiotec.2011.04.014
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2319675
Wittmann, J., Gartemann, K. - H., Eichenlaub, R., & Dreiseikelmann, B. (2011). Genomic and molecular analysis of phage CMP1 from Clavibacter michiganensis subspecies michiganensis. Bacteriophage, 1(1), 6-14. doi:10.4161/bact.1.1.13873
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326465
Torres Tejerizo, G., Florencia Del Papa, M., Draghi, W., Lozano, M., de los Angeles Giusti, M., Martini, C., Eugenia Salas, M., et al. (2011). First genomic analysis of the broad-host-range Rhizobium sp LPU83 strain, a member of the low-genetic diversity Oregon-like Rhizobium sp group. Journal of Biotechnology, 155(1), 3-10. doi:10.1016/j.jbiotec.2011.01.011
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326511
Rückert, C., Blom, J., Chen, X. H., Reva, O., & Borriss, R. (2011). Genome sequence of B. amyloliquefaciens type strain DSM7(T) reveals differences to plant-associated B. amyloliquefaciens FZB42. Journal of Biotechnology, 155(1), 78-85. doi:10.1016/j.jbiotec.2011.01.006
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396576
Becker, J., Hackel, M., Jakobi, T., Rupp, O., Schneider, J., Szczepanowski, R., Bekel, T., et al. (2011). Unraveling the Chinese hamster ovary cell line transcriptome by next-generation sequencing. Journal of Biotechnology, 156(3), 227-235. doi:10.1016/j.jbiotec.2011.09.014
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2375640
Merkle, T., & Grasser, K. D. (2011). Unexpected mobility of plant chromatin-associated HMGB proteins. Plant Signaling & Behavior, 6(6), 878-880. doi:10.4161/psb.6.6.15255
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2375645
Barzantny, H., Brune, I., & Tauch, A. (2011). Molecular basis of human body odour formation: insights deduced from corynebacterial genome sequences. International Journal of Cosmetic Science, 34(1), 2-11. doi:10.1111/j.1468-2494.2011.00669.x
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394493
Hinse, D., Vollmer, T., Rückert, C., Blom, J., Kalinowski, J., Knabbe, C., & Dreier, J. (2011). Complete genome and comparative analysis of Streptococcus gallolyticus subsp gallolyticus, an emerging pathogen of infective endocarditis. BMC Genomics, 12(1), 400. doi:10.1186/1471-2164-12-400
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394614
Martinez-Moya, P., Watt, S. A., Niehaus, K., Alcaino, J., Baeza, M., & Cifuentes, V. (2011). Proteomic analysis of the carotenogenic yeast Xanthophyllomyces dendrorhous. BMC Microbiology, 11(1), 131. doi:10.1186/1471-2180-11-131
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2289494
Persicke, M., Plassmeier, J., Neuweger, H., Rückert, C., Pühler, A., & Kalinowski, J. (2011). Size exclusion chromatography-An improved method to harvest Corynebacterium glutamicum cells for the analysis of cytosolic metabolites. Journal of Biotechnology, 154(2-3), 171-178. doi:10.1016/j.jbiotec.2010.08.016
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2289773
Sommer, B., Dingersen, T., Gamroth, C., Schneider, S. E., Robert, S., Krueger, J., & Dietz, K. - J. (2011). CELLmicrocosmos 2.2 Membrane Editor: A Modular Interactive Shape-Based Software Approach To Solve Heterogeneous Membrane Packing Problems. Journal of Chemical Information and Modeling, 51(5), 1165-1182. doi:10.1021/ci1003619
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2289850
Schnitzer, D., Seidel, T., Sander, T., Golldack, D., & Dietz, K. - J. (2011). The Cellular Energization State Affects Peripheral Stalk Stability of Plant Vacuolar H+-ATPase and Impairs Vacuolar Acidification. Plant and Cell Physiology, 52(5), 946-956. doi:10.1093/pcp/pcr044
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2307075
Dietz, K. - J. (2011). Peroxiredoxins in Plants and Cyanobacteria. Antioxidants & Redox Signaling, 15(4), 1129-1159. doi:10.1089/ars.2010.3657
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2375954
Borriss, R., Chen, X. - H., Rückert, C., Blom, J., Becker, A., Baumgarth, B., Fan, B., et al. (2011). Relationship of Bacillus amyloliquefaciens clades associated with strains DSM 7T and FZB42T: a proposal for Bacillus amyloliquefaciens subsp. amyloliquefaciens subsp. nov. and Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum subsp. nov. based on complete genome sequence comparisons. Int J Syst Evol Microbiol, 61(8), 1786-1801. doi:10.1099/ijs.0.023267-0
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2438803
Jeong, B. -ryool, Lin, Y., Joe, A., Guo, M., Korneli, C., Yang, H., Wang, P., et al. (2011). Structure function analysis of an ADP-ribosyltransferase type III effector and its RNA-binding target in plant immunity. Journal of Biological Chemistry, 286(50), 43272-43281. doi:10.1074/jbc.M111.290122
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2442429
Dietz, K. - J., & Herth, S. (2011). Plant nanotoxicology. Trends in plant science, 16(11), 582-589. doi:10.1016/j.tplants.2011.08.003
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2425088
Wendisch, V. F., Marx, A., & Kircher, M. (2011). Industrielle Biotechnologie: Entwicklung neuer Ansätze zur Verbesserung von Produktionsprozessen. BIOforum, 2011(2), 12-14.
PUB
 
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326440
Kraft, B., Strous, M., & Tegetmeyer, H. (2011). Microbial nitrate respiration - Genes, enzymes and environmental distribution. Journal of Biotechnology, 155(1), 104-117. doi:10.1016/j.jbiotec.2010.12.025
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2318497
Holtgräwe, D., Weisshaar, B., & Himmelbauer, H. (2011). Die Entschlüsselung der Süßen: GABI-Future-Projekt erstellt Referenzsequenz des Genoms der Zuckerrübe. GenomXPress, 2011(2), 4-6.
PUB
 
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2440575
Luesken, F. A., van Alen, T. A., van der Biezen, E., Frijters, C., Toonen, G., Kampman, C., Hendrickx, T. L. G., et al. (2011). Diversity and enrichment of nitrite-dependent anaerobic methane oxidizing bacteria from wastewater sludge. Applied Microbiology and Biotechnology, 92(4), 845-854. doi:10.1007/s00253-011-3361-9
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326455
Krol, E., Blom, J., Winnebald, J., Berhoerster, A., Barnett, M. J., Goesmann, A., Baumbach, J., et al. (2011). RhizoRegNet-A database of rhizobial transcription factors and regulatory networks. Journal of Biotechnology, 155(1), 127-134. doi:10.1016/j.jbiotec.2010.11.004
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326481
Mayer, L., Vendruscolo, C. T., da Silva, W. P., Vorhölter, F. - J., Becker, A., & Pühler, A. (2011). Insights into the genome of the xanthan-producing phytopathogen Xanthomonas arboricola pv. pruni 109 by comparative genomic hybridization. Journal of Biotechnology, 155(1), 40-49. doi:10.1016/j.jbiotec.2011.04.012
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326518
Szczepanowski, R., Eikmeyer, F. G., Harfmann, J., Blom, J., Rogers, L. M., Top, E. M., & Schlüter, A. (2011). Sequencing and comparative analysis of IncP-1 alpha antibiotic resistance plasmids reveal a highly conserved backbone and differences within accessory regions. Journal of Biotechnology, 155(1), 95-103. doi:10.1016/j.jbiotec.2010.11.018
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326568
Cerdeira, L. T., Carneiro, A. R., Juca Ramos, R. T., de Almeida, S. S., D'Afonseca, V., Cruz Schneider, M. P., Baumbach, J., et al. (2011). Rapid hybrid de novo assembly of a microbial genome using only short reads: Corynebacterium pseudotuberculosis I19 as a case study. Journal of Microbiological Methods, 86(2), 218-223. doi:10.1016/j.mimet.2011.05.008
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2404808
Plassmeier, J., Persicke, M., Pühler, A., Sterthoff, C., Rückert, C., & Kalinowski, J. (2011). Molecular characterization of PrpR, the transcriptional activator of propionate catabolism in Corynebacterium glutamicum. Journal of Biotechnology, 159(1-2), 1-11. doi:10.1016/j.jbiotec.2011.09.009
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2454721
Cerdeira, L. T., Cruz Schneider, M. P., Pinto, A. C., de Almeida, S. S., dos Santos, A. R., Vieira Barbosa, E. G., Ali, A., et al. (2011). Complete Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis Strain CIP 52.97, Isolated from a Horse in Kenya. Journal of Bacteriology, 193(24), 7025-7026. doi:10.1128/JB.06293-11
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2011 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2453768
Becker, J., Timmermann, C., Jakobi, T., Rupp, O., Szczepanowski, R., Hackl, M., Goesmann, A., et al. (2011). Next-generation sequencing of the CHO cell transcriptome. BMC Proceedings, 5(Suppl. 8), P6. doi:10.1186/1753-6561-5-S8-P6
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2011 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2397780
Doppmeier, D., Stracke, R., Lutter, P., Goesmann, A., Niehaus, K., & Weisshaar, B. (2011). Using the GUS Reporter Gene for Quantitative Studies of Promotor Activity in A.thaliana Seedlings. Presented at the ICSB 2011 Heidelberg/Mannheim, Heidelberg/Mannheim, Germany.
PUB
 
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2382565
Borriss, R., Rückert, C., Blom, J., Bezuidt, O., Reva, O., & Klenk, H. P. (2011). Whole Genome Sequence Comparisons in Taxonomy. In F. Rainey & A. Oren (Eds.), Methods in microbiology: Vol. 38. Taxonomy of Prokaryotes (Methods in Microbiology) (p. 473). Waltham, MA, USA: Academic Press,. doi:10.1016/B978-0-12-387730-7.00018-8
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2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2452293
Uelker, B., & Weisshaar, B. (2011). Resources for Reverse Genetics Approaches in Arabidopsis thaliana. In R. Schmidt & I. Bancroft (Eds.), Genetics and Genomics of the Brassicaceae (pp. 527-560). Heidelberg, Germany: Springer. doi:10.1007/978-1-4419-7118-0_19
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2404874
Schatschneider, S., Vorhölter, F. - J., Rückert, C., Becker, A., Eisenreich, W., Pühler, A., & Niehaus, K. (2011). Genome-enabled determination of amino acid biosynthesis in Xanthomonas campestris pv. campestris and identification of biosynthetic pathways for alanine, glycine, and isoleucine by 13C-isotopologue profiling. Molecular Genetics and Genomics, 286(3-4), 247-259. doi:10.1007/s00438-011-0639-7
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2438818
Staiger, D., & Green, R. (2011). RNA-based regulation in the plant circadian clock. Trends in Plant Science, 16(10), 517-523. doi:10.1016/j.tplants.2011.06.002
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2440558
Jankowitsch, F., Kuehm, C., Kellner, R., Kalinowski, J., Pelzer, S., Macheroux, P., & Mack, M. (2011). A Novel N,N-8-Amino-8-demethyl-D-riboflavin Dimethyltransferase (RosA) Catalyzing the Two Terminal Steps of Roseoflavin Biosynthesis in Streptomyces davawensis. Journal of Biological Chemistry, 286(44), 38275-38285. doi:10.1074/jbc.M111.292300
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2286819
Appelhagen, I., Lu, G. - H., Huep, G., Schmelzer, E., Weisshaar, B., & Sagasser, M. (2011). TRANSPARENT TESTA1 interacts with R2R3-MYB factors and affects early and late steps of flavonoid biosynthesis in the endothelium of Arabidopsis thaliana seeds. The Plant Journal, 67(3), 406-419. doi:10.1111/j.1365-313X.2011.04603.x
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2289491
Kalinowski, J. (2011). Regulatory and Metabolic Networks for Amino Acid Production by Corynebacterium glutamicum. Journal of Biotechnology, 154(2-3), 99-100. doi:10.1016/j.jbiotec.2011.05.007
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2285141
Gopinath, V., Meiswinkel, T., Wendisch, V. F., & Nampoothiri, M. K. (2011). Amino acid production from rice straw and wheat bran hydrolysates by recombinant pentose-utilizing Corynebacterium glutamicum. Appl. Microbiol. Biotechnol, 92(5), 985-996. doi:10.1007/s00253-011-3478-x
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2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2277256
Wendisch, V. F. (2011). Synthetische Biologie zum Design Massgeschneiderter Stoffwechselwege. In A. Pühler, B. Müller-Röber, & M. - D. Weitze (Eds.), acatech diskutiert: Synthetische Biologie (pp. 65-70). Berlin, Heidelberg: Springer. doi:10.1007/978-3-642-22354-9_6
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2093276
Keck, M., Gisch, N., Moll, H., Vorhölter, F. - J., Gerth, K., Kahmann, U., Lissel, M., et al. (2011). Unusual Outer Membrane Lipid Composition of the Gram-negative, Lipopolysaccharide-lacking Myxobacterium Sorangium cellulosum So ce56. Journal of Biological Chemistry, 286(15), 12850-12859. doi:10.1074/jbc.M110.194209
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2093360
Ryan, R. P., Vorhölter, F. - J., Potnis, N., Jones, J. B., Van Sluys, M. - A., Bogdanove, A. J., & Dow, J. M. (2011). Pathogenomics of Xanthomonas: understanding bacterium-plant interactions. Nature Reviews Microbiology, 9(5), 344-355. doi:10.1038/nrmicro2558
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2093795
Palmisano, R., Golfi, P., Heimann, P., Shaw, C., Troakes, C., Schmitt-John, T., & Bartsch, J. W. (2011). Endosomal accumulation of APP in wobbler motor neurons reflects impaired vesicle trafficking: Implications for human motor neuron disease. BMC Neuroscience, 12(1), 24. doi:10.1186/1471-2202-12-24
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2300102
Arif, M., Rajpoot, N., Technow, U., Chakraborty, T., Fisch, N., Jensen, N. A., Niehaus, K., et al. (2011). Quantification of Cell Infection Caused by Listeria monocytogenes Invasion. Journal of Biotechnology, 154(1), 76-83. doi:10.1016/j.jbiotec.2011.03.008
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2288416
Lindner, S., Seibold, G., Krämer, R., & Wendisch, V. F. (2011). Impact of a new glucose utilization pathway in amino-acid producing Corynebacterium glutamicum. BioEngineered Bugs, 2(5), 291-295. doi:10.4161/bbug.2.5.17116
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2011 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2289887
Hinse, D., Vollmer, T., Rückert, C., Blom, J., Kalinowski, J., Knabbe, C., & Dreier, J. (2011). Complete Genome Analysis of Streptococcus gallolyticus subsp gallolyticus, an Emerging Pathogen of Infective Endocarditis. Clinical Chemistry and Laboratory Medicine, 49, S837.
PUB | WoS
 
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2289952
Blom, J., Jakobi, T., Doppmeier, D., Jaenicke, S., Kalinowski, J., Stoye, J., & Goesmann, A. (2011). Exact and complete short-read alignment to microbial genomes using Graphics Processing Unit programming. Bioinformatics, 27(10), 1351-1358. doi:10.1093/bioinformatics/btr151
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2317309
Appelhagen, I., Jahns, O., Bartelniewoehner, L., Sagasser, M., Weisshaar, B., & Stracke, R. (2011). Leucoanthocyanidin Dioxygenase in Arabidopsis thaliana: Characterization of mutant alleles and regulation by MYB-BHLH-TTG1 transcription factor complexes. Gene, 484(1-2), 61-68. doi:10.1016/j.gene.2011.05.031
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2317498
Lindner, S., Seibold, G. M., Henrich, A., Kramer, R., & Wendisch, V. F. (2011). Phosphotransferase system-independent glucose utilization in Corynebacterium glutamicum by inositol permeases and glucokinases. Applied and Environmental microbiology, 77(11), 3571-3581. doi:10.1128/AEM.02713-10
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2319672
Eichenlaub, R., & Gartemann, K. - H. (2011). The Clavibacter michiganensis Subspecies: Molecular Investigation of Gram-Positive Bacterial Plant Pathogens. Annu Rev Phytopathol., 49(1), 445-464. doi:10.1146/annurev-phyto-072910-095258
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2411181
Cerdeira, L. T., Pinto, A. C., Schneider, M. P. C., de Almeida, S. S., Dos Santos, A. R., Barbosa, E. G. V., Ali, A., et al. (2011). Whole-Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis PAT10 Strain Isolated from Sheep in Patagonia, Argentina. Journal of Bacteriology, 193(22), 6420-6421. doi:10.1128/JB.06044-11
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2289586
van de Leemput, I. A., Veraart, A. J., Dakos, V., de Klein, J. J. M., Strous, M., & Scheffer, M. (2011). Predicting microbial nitrogen pathways from basic principles. Environmental Microbiology, 13(6), 1477-1487. doi:10.1111/j.1462-2920.2011.02450.x
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