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769 Publikationen

2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2900055
Plassmeier, J.; Li, Y.; Rückert, C.; Sinskey, A. J. (2016): Metabolic Engineering Corynebacterium glutamicum to Produce Triacylglycerols. Metab Eng,33: 86-97.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2787257
Schwichtenberg, K.; Wenke, T.; Zakrzewski, F.; Seibt, K.; Minoche, A.; Dohm, J.; Weisshaar, B.; Himmelbauer, H.; Schmidt, T. (2016): Diversification, Evolution and Methylation of Short Interspersed Nuclear Element families in sugar beet and related Amaranthaceae species The Plant Journal,85:(2): 229-244.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2753051
Rückert, C.; Albersmeier, A.; Winkler, A.; Tauch, A. (2015): Complete Genome Sequence of Corynebacterium kutscheri DSM 20755, a Corynebacterial Type Strain with Remarkably Low G+C Content of Chromosomal DNA Genome announcements,3:(3)
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2775257
Rückert, C.; Eimer, J.; Winkler, A.; Tauch, A. (2015): Complete Genome Sequence of the Type Strain Corynebacterium mustelae DSM 45274, Isolated from Various Tissues of a Male Ferret with Lethal Sepsis Genome announcements,3:(5)
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2765190
Rückert, C.; Kriete, M.; Jaenicke, S.; Winkler, A.; Tauch, A. (2015): Virulence Factor Genes Detected in the Complete Genome Sequence of Corynebacterium uterequi DSM 45634, Isolated from the Uterus of a Maiden Mare Genome announcements,3:(4)
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2761035
Arnold, M.; Wibberg, D.; Blom, J.; Schatschneider, S.; Winkler, A.; Kutter, Y.; Rückert, C.; Albersmeier, A.; Albaum, S.; Goesmann, A.; Zange, S.; Heesemann, J.; Pühler, A.; Hogardt, M.; Vorhölter, F. - J. (2015): Draft Genome Sequence of Pseudomonas aeruginosa Strain WS136, a Highly Cytotoxic ExoS-Positive Wound Isolate Recovered from Pyoderma Gangrenosum Genome announcements,3:(4)
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2765197
Rückert, C.; Kriete, M.; Jaenicke, S.; Winkler, A.; Tauch, A. (2015): Complete Genome Sequence of the Type Strain Corynebacterium testudinoris DSM 44614, Recovered from Necrotic Lesions in the Mouth of a Tortoise Genome announcements,3:(4)
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2753057
Rückert, C.; Albersmeier, A.; Winkler, A.; Tauch, A. (2015): Complete Genome Sequence of Corynebacterium camporealensis DSM 44610, Isolated from the Milk of a Manchega Sheep with Subclinical Mastitis Genome announcements,3:(3)
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2728042
Merten, M.; Brinkrolf, K.; Albersmeier, A.; Kutter, Y.; Rückert, C.; Tauch, A. (2015): Complete Genome Sequence and Annotation of Corynebacterium singulare DSM 44357, Isolated from a Human Semen Specimen Genome Announcements,3:(2)
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2769395
Rückert, C.; Eimer, J.; Winkler, A.; Tauch, A. (2015): Complete Genome Sequence of the Type Strain Corynebacterium epidermidicanis DSM 45586, Isolated from the Skin of a Dog Suffering from Pruritus Genome announcements,3:(4)
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2782605
Rupp, O.; Brinkrolf, K.; Buerth, C.; Kunigo, M.; Schneider, J.; Jaenicke, S.; Goesmann, A.; Pühler, A.; Jaeger, K. - E.; Ernst, J. F. (2015): The structure of the Cyberlindnera jadinii genome and its relation to Candida utilis analyzed by the occurrence of single nucleotide polymorphisms Journal of Biotechnology,211: 20-30.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2758144
Wibberg, D.; Rupp, O.; Jelonek, L.; Kröber, M.; Verwaaijen, B.; Blom, J.; Winkler, A.; Goesmann, A.; Grosch, R.; Pühler, A.; Schlüter, A. (2015): Improved genome sequence of the phytopathogenic fungus Rhizoctonia solani AG1-IB 7/3/14 as established by deep mate-pair sequencing on the MiSeq (Illumina) system Journal of Biotechnology,203: 19-21.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2768627
Eikmeyer, F. G.; Heinl, S.; Marx, H.; Pühler, A.; Grabherr, R.; Schlüter, A. (2015): Identification of Oxygen-Responsive Transcripts in the Silage Inoculant Lactobacillus buchneri CD034 by RNA Sequencing PLoS ONE,10:(7):e0134149
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2775617
Stadermann, K. B.; Weisshaar, B.; Holtgräwe, D. (2015): SMRT sequencing only de novo assembly of the sugar beet (Beta vulgaris) chloroplast genome BMC Bioinformatics,16:295
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2721868
Persicke, M.; Albersmeier, A.; Bednarz, H.; Niehaus, K.; Kalinowski, J.; Rückert, C. (2015): Genome sequence of the soil bacterium Corynebacterium callunae type strain DSM 20147T Standards in Genomic Sciences,10:5
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2717880
Schierenbeck, L.; Ries, D.; Rogge, K.; Grewe, S.; Weisshaar, B.; Kruse, O. (2015): Fast forward genetics to identify mutations causing a high light tolerant phenotype in Chlamydomonas reinhardtii by whole-genome-sequencing BMC Genomics,16:57
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2722382
Stolze, Y.; Zakrzewski, M.; Maus, I.; Eikmeyer, F. G.; Jaenicke, S.; Rottmann, N.; Siebner, C.; Pühler, A.; Schlüter, A. (2015): Comparative metagenomics of biogas-producing microbial communities from production-scale biogas plants operating under wet or dry fermentation conditions Biotechnology for Biofuels,8:14
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2771746
Rückert, C.; Leipoldt, F.; Zeyhle, P.; Fenical, W.; Jensen, P. R.; Kalinowski, J.; Heide, L.; Kaysser, L. (2015): Complete Genome Sequence of Streptomyces sp. CNQ-509, a Prolific Producer of Meroterpenoid Chemistry Journal of Biotechnology,216: 140-141.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2764063
Minoche, A. E.; Dohm, J. C.; Schneider, J.; Holtgräwe, D.; Viehöver, P.; Montfort, M.; Rosleff Sörensen, T.; Weisshaar, B.; Himmelbauer, H. (2015): Exploiting single-molecule transcript sequencing for eukaryotic gene prediction Genome Biology,16:184
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2770216
Kleinbölting, N.; Huep, G.; Appelhagen, I.; Viehöver, P.; Li, Y.; Weisshaar, B. (2015): The structural features of thousands of T-DNA insertion sites are consistent with a double-strand break repair based insertion mechanism Molecular Plant,8:(11): 1651-1664.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | GenBank
 
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2771555
Müller, C.; Birmes, F. S.; Rückert, C.; Kalinowski, J.; Fetzner, S. (2015): Rhodococcus erythropolis BG43 genes mediating Pseudomonas aeruginosa quinolone signal degradation and virulence factor attenuation Applied and Environmental Microbiology,81:(22): 7720-7729.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2764512
Rückert, C.; Birmes, F. S.; Müller, C.; Niewerth, H.; Winkler, A.; Fetzner, S.; Kalinowski, J. (2015): Complete genome sequence of Rhodococcus erythropolis BG43 (DSM 46869), a degrader of Pseudomonas aeruginosa quorum sensing signal molecules Journal of biotechnology,211: 99-100.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2756434
Oelschlägel, M.; Rückert, C.; Kalinowski, J.; Schmidt, G.; Schlömann, M.; Tischler, D. (2015): Sphingopyxis fribergensis sp. nov., a soil bacterium with the ability to degrade styrene and phenylacetic acid International journal of systematic and evolutionary microbiology,65:(Part 9): 3008-3015.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2735160
Kurosawa, K.; Plassmeier, J.; Kalinowski, J.; Rückert, C.; Sinskey, A. J. (2015): Engineering L-arabinose metabolism in triacylglycerol-producing Rhodococcus opacus for lignocellulosic fuel production Metabolic engineering,30: 89-95.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2689771
Unthan, S.; Baumgart, M.; Radek, A.; Herbst, M.; Siebert, D.; Brühl, N.; Bartsch, A.; Bott, M.; Wiechert, W.; Marin, K.; Hans, S.; Krämer, R.; Seibold, G.; Frunzke, J.; Kalinowski, J.; Rückert, C.; Wendisch, V. F.; Noack, S. (2015): Chassis organism from Corynebacterium glutamicum – a top-down approach to identify and delete irrelevant gene clusters Biotechnology Journal,10:(2): 290-301.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709783
Ortseifen, V.; Winkler, A.; Albersmeier, A.; Wendler, S.; Pühler, A.; Kalinowski, J.; Rückert, C. (2015): Complete Genome Sequence of the Actinobacterium Streptomyces glaucescens GLA.O (DSM 40922) consisting of a linear chromosome and one linear plasmid Journal of Biotechnology,194: 81-83.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2719877
Rückert, C.; Albersmeier, A.; Busche, T.; Jaenicke, S.; Winkler, A.; Friðjónsson, Ó. H.; Hreggviðsson, G. Ó.; Lambert, C.; Badcock, D.; Bernaerts, K.; Anne, J.; Economou, A.; Kalinowski, J. (2015): Complete genome sequence of Streptomyces lividans TK24 Journal of Biotechnology,199: 21-22.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2719679
Vinardell, J. M.; Acosta-Jurado, S.; Göttfert, M.; Zehner, S.; Becker, A.; Baena-Ropero, I.; Blom, J.; Crespo-Rivas, J. C.; Goesmann, A.; Jaenicke, S.; Krol, E.; McIntosh, M.; Margaret, I.; Pérez-Montaño, F.; Schneiker-Bekel, S.; Serrania, J.; Szczepanowski, R.; Buendia-Claveria, A. M.; Lloret, J.; Bonilla, I.; Pühler, A.; Ruiz-Sainz, J. E.; Weidner, S. (2015): The Sinorhizobium fredii HH103 genome: a comparative analysis with S. fredii strains differing in their symbiotic behaviour with soybean Molecular Plant-Microbe Interactions,28:(7): 811-824.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2764185
Schafhauser, T.; Wibberg, D.; Rückert, C.; Winkler, A.; Flor, L.; van Pée, K. - H.; Fewer, D. P.; Sivonen, K.; Jahn, L.; Ludwig-Müller, J.; Caradec, T.; Jacques, P.; Huijbers, M. M. E.; van Berkel, W. J. H.; Weber, T.; Wohlleben, W.; Kalinowski, J. (2015): Draft genome sequence of Talaromyces islandicus ("Penicillium islandicum") WF-38-12, a neglected mold with significant biotechnological potential Journal of Biotechnology,211: 101-102.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2732031
Appelhagen, I.; Nordholt, N.; Seidel, T.; Spelt, K.; Koes, R.; Quattrochio, F.; Sagasser, M.; Weisshaar, B. (2015): Transparent Testa 13 is a tonoplast P3A-ATPase required for vacuolar deposition of proanthocyanidins in Arabidopsis thaliana seeds The Plant Journal,82:(5): 840-849.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2696778
Stracke, R.; Holtgräwe, D.; Schneider, J.; Pucker, B.; Rosleff Sörensen, T.; Weisshaar, B. (2014): Genome-wide identification and characterisation of R2R3-MYB genes in sugar beet ( Beta vulgaris ) BMC Plant Biology,14:(1):249
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2699085
Holtgräwe, D.; Rosleff Sörensen, T.; Viehöver, P.; Schneider, J.; Schulz, B.; Borchardt, D.; Kraft, T.; Himmelbauer, H.; Weisshaar, B. (2014): Reliable In Silico Identification of Sequence Polymorphisms and Their Application for Extending the Genetic Map of Sugar Beet (Beta vulgaris) PLoS ONE,9:(10):e110113
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2700166
Huep, G.; Kleinbölting, N.; Weisshaar, B. (2014): An easy-to-use primer design tool to address paralogous loci and T-DNA insertion sites in the genome of Arabidopsis thaliana Plant Methods,10:28
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2699107
Rebets, Y.; Tokovenko, B.; Lushchyk, I.; Rückert, C.; Zaburannyi, N.; Bechthold, A.; Kalinowski, J.; Luzhetskyy, A. (2014): Complete genome sequence of producer of the glycopeptide antibiotic Aculeximycin Kutzneria albida DSM 43870T, a representative of minor genus of Pseudonocardiaceae BMC genomics,15:(1): 885.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2692360
Tippelt, A.; Möllmann, S.; Albersmeier, A.; Jaenicke, S.; Rückert, C.; Tauch, A. (2014): Mycolic Acid Biosynthesis Genes in the Genome Sequence of Corynebacterium atypicum DSM 44849 Genome announcements,2:(4)
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2682811
Lübke, N. - C.; Wolf, T.; Braun, R.; Rückert, C.; Kalinowski, J. (2014): Vom Schärfesensor zur mikrobiellen Brennstoffzelle BIOspektrum,20:(4): 468-469.
PUB | DOI
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2679399
Neshat, A.; Mentz, A.; Rückert, C.; Kalinowski, J. (2014): Transcriptome sequencing revealed the transcriptional organization at ribosome-mediated attenuation sites in Corynebacterium glutamicum and identified a novel attenuator involved in aromatic amino acid biosynthesis Journal of biotechnology,190: 55-63.
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2014 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2770185
Nolla Ardevol, V. (2014): Anaerobic digestion of the microalga Spirulina at alkaline conditions (pH~10; 2.0 M Na+): biogas production and metagenome analysis. Bielefeld: Bielefeld University.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2678005
Heitkam, T.; Holtgräwe, D.; Dohm, J. C.; Minoche, A. E.; Himmelbauer, H.; Weisshaar, B.; Schmidt, T. (2014): Profiling of extensively diversified plant LINEs reveals distinct plant-specific subclades The Plant Journal,79:(3): 385-397.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2674387
Hilker, R.; Stadermann, K. B.; Doppmeier, D.; Kalinowski, J.; Stoye, J.; Straube, J.; Winnebald, J.; Goesmann, A. (2014): ReadXplorer - Visualization and Analysis of Mapped Sequences Bioinformatics,30:(16): 2247-2254.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2665038
Schwientek, P.; Neshat, A.; Kalinowski, J.; Klein, A.; Rückert, C.; Schneiker-Bekel, S.; Wendler, S.; Stoye, J.; Pühler, A. (2014): Improving the genome annotation of the acarbose producer Actinoplanes sp. SE50/110 by sequencing enriched 5'-ends of primary transcripts Journal of Biotechnology,190: 85-95.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2647992
Flinspach, K.; Rückert, C.; Kalinowski, J.; Heide, L.; Apel, A. K. (2014): Draft Genome Sequence of Streptomyces niveus NCIMB 11891, Producer of the Aminocoumarin Antibiotic Novobiocin Genome announcements,2:(1): e01146-13.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2653196
Wilson, M. C.; Mori, T.; Rückert, C.; Uria, A. R.; Helf, M. J.; Takada, K.; Gernert, C.; Steffens, U. A. E.; Heycke, N.; Schmitt, S.; Rinke, C.; Helfrich, E. J. N.; Brachmann, A. O.; Gurgui, C.; Wakimoto, T.; Kracht, M.; Crüsemann, M.; Hentschel, U.; Abe, I.; Matsunaga, S.; Kalinowski, J.; Takeyama, H.; Piel, J. (2014): An environmental bacterial taxon with a large and distinct metabolic repertoire Nature,506:(7486): 58-62.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2643981
Bolger, M. E.; Weisshaar, B.; Scholz, U.; Stein, N.; Usadel, B.; Mayer, K. F. X. (2014): Plant genome sequencing — applications for crop improvement Current Opinion in Biotechnology,26:(4): 31-37.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2705365
Tippelt, A.; Albersmeier, A.; Brinkrolf, K.; Rückert, C.; Fernández-Natal, I.; Soriano, F.; Tauch, A. (2014): Complete Genome Sequence of Corynebacterium ureicelerivorans DSM 45051, a Lipophilic and Urea-Splitting Isolate from the Blood Culture of a Septicemia Patient Genome announcements,2:(6)
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2693289
Al-Dilaimi, A.; Albersmeier, A.; Kalinowski, J.; Rückert, C. (2014): Complete Genome Sequence of Corynebacterium vitaeruminis DSM 20294T, isolated from the cow rumen as a vitamin B producer Journal of Biotechnology,189: 70-71.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2693296
Walter, F.; Albersmeier, A.; Kalinowski, J.; Rückert, C. (2014): Complete Genome Sequence of Corynebacterium casei LMG S-19264T (=DSM 44701T), isolated from a smear-ripened cheese Journal of Biotechnology,189: 76-77.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2685988
Jakobi, T.; Brinkrolf, K.; Tauch, A.; Noll, T.; Stoye, J.; Pühler, A.; Goesmann, A. (2014): Discovery of transcription start sites in the Chinese hamster genome by next-generation RNA sequencing Journal of Biotechnology,190: 64-75.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2674171
Dubos, C.; Kelemen, Z.; Sebastian, A.; Bülow, L.; Huep, G.; Xu, W.; Grain, D.; Salsac, F.; Brousse, C.; Lepiniec, L.; Weisshaar, B.; Contreras-Moreira, B.; Hehl, R. (2014): Integrating bioinformatic resources to predict transcription factors interacting with cis-sequences conserved in co-regulated genes BMC genomics,15:(1):317
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2631517
Hackmann, C.; Korneli, C.; Kutyniok, M.; Köster, T.; Wiedenlübbert, M.; Müller, C.; Staiger, D. (2014): Salicylic acid-dependent and -independent impact of an RNA-binding protein on plant immunity Plant, Cell & Environment,37:(3): 696-706.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 

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