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769 Publikationen

2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2900055
Plassmeier, J.; Li, Y.; Rückert, C.; Sinskey, A. J. (2016): Metabolic Engineering Corynebacterium glutamicum to Produce Triacylglycerols. Metab Eng,33: 86-97.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2787257
Schwichtenberg, K.; Wenke, T.; Zakrzewski, F.; Seibt, K.; Minoche, A.; Dohm, J.; Weisshaar, B.; Himmelbauer, H.; Schmidt, T. (2016): Diversification, Evolution and Methylation of Short Interspersed Nuclear Element families in sugar beet and related Amaranthaceae species The Plant Journal,85:(2): 229-244.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2753051
Rückert, C.; Albersmeier, A.; Winkler, A.; Tauch, A. (2015): Complete Genome Sequence of Corynebacterium kutscheri DSM 20755, a Corynebacterial Type Strain with Remarkably Low G+C Content of Chromosomal DNA Genome announcements,3:(3)
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2775257
Rückert, C.; Eimer, J.; Winkler, A.; Tauch, A. (2015): Complete Genome Sequence of the Type Strain Corynebacterium mustelae DSM 45274, Isolated from Various Tissues of a Male Ferret with Lethal Sepsis Genome announcements,3:(5)
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2765190
Rückert, C.; Kriete, M.; Jaenicke, S.; Winkler, A.; Tauch, A. (2015): Virulence Factor Genes Detected in the Complete Genome Sequence of Corynebacterium uterequi DSM 45634, Isolated from the Uterus of a Maiden Mare Genome announcements,3:(4)
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2761035
Arnold, M.; Wibberg, D.; Blom, J.; Schatschneider, S.; Winkler, A.; Kutter, Y.; Rückert, C.; Albersmeier, A.; Albaum, S.; Goesmann, A.; Zange, S.; Heesemann, J.; Pühler, A.; Hogardt, M.; Vorhölter, F. - J. (2015): Draft Genome Sequence of Pseudomonas aeruginosa Strain WS136, a Highly Cytotoxic ExoS-Positive Wound Isolate Recovered from Pyoderma Gangrenosum Genome announcements,3:(4)
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2765197
Rückert, C.; Kriete, M.; Jaenicke, S.; Winkler, A.; Tauch, A. (2015): Complete Genome Sequence of the Type Strain Corynebacterium testudinoris DSM 44614, Recovered from Necrotic Lesions in the Mouth of a Tortoise Genome announcements,3:(4)
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2753057
Rückert, C.; Albersmeier, A.; Winkler, A.; Tauch, A. (2015): Complete Genome Sequence of Corynebacterium camporealensis DSM 44610, Isolated from the Milk of a Manchega Sheep with Subclinical Mastitis Genome announcements,3:(3)
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2728042
Merten, M.; Brinkrolf, K.; Albersmeier, A.; Kutter, Y.; Rückert, C.; Tauch, A. (2015): Complete Genome Sequence and Annotation of Corynebacterium singulare DSM 44357, Isolated from a Human Semen Specimen Genome Announcements,3:(2)
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2769395
Rückert, C.; Eimer, J.; Winkler, A.; Tauch, A. (2015): Complete Genome Sequence of the Type Strain Corynebacterium epidermidicanis DSM 45586, Isolated from the Skin of a Dog Suffering from Pruritus Genome announcements,3:(4)
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2782605
Rupp, O.; Brinkrolf, K.; Buerth, C.; Kunigo, M.; Schneider, J.; Jaenicke, S.; Goesmann, A.; Pühler, A.; Jaeger, K. - E.; Ernst, J. F. (2015): The structure of the Cyberlindnera jadinii genome and its relation to Candida utilis analyzed by the occurrence of single nucleotide polymorphisms Journal of Biotechnology,211: 20-30.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2758144
Wibberg, D.; Rupp, O.; Jelonek, L.; Kröber, M.; Verwaaijen, B.; Blom, J.; Winkler, A.; Goesmann, A.; Grosch, R.; Pühler, A.; Schlüter, A. (2015): Improved genome sequence of the phytopathogenic fungus Rhizoctonia solani AG1-IB 7/3/14 as established by deep mate-pair sequencing on the MiSeq (Illumina) system Journal of Biotechnology,203: 19-21.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2768627
Eikmeyer, F. G.; Heinl, S.; Marx, H.; Pühler, A.; Grabherr, R.; Schlüter, A. (2015): Identification of Oxygen-Responsive Transcripts in the Silage Inoculant Lactobacillus buchneri CD034 by RNA Sequencing PLoS ONE,10:(7):e0134149
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2775617
Stadermann, K. B.; Weisshaar, B.; Holtgräwe, D. (2015): SMRT sequencing only de novo assembly of the sugar beet (Beta vulgaris) chloroplast genome BMC Bioinformatics,16:295
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2721868
Persicke, M.; Albersmeier, A.; Bednarz, H.; Niehaus, K.; Kalinowski, J.; Rückert, C. (2015): Genome sequence of the soil bacterium Corynebacterium callunae type strain DSM 20147T Standards in Genomic Sciences,10:5
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2717880
Schierenbeck, L.; Ries, D.; Rogge, K.; Grewe, S.; Weisshaar, B.; Kruse, O. (2015): Fast forward genetics to identify mutations causing a high light tolerant phenotype in Chlamydomonas reinhardtii by whole-genome-sequencing BMC Genomics,16:57
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2722382
Stolze, Y.; Zakrzewski, M.; Maus, I.; Eikmeyer, F. G.; Jaenicke, S.; Rottmann, N.; Siebner, C.; Pühler, A.; Schlüter, A. (2015): Comparative metagenomics of biogas-producing microbial communities from production-scale biogas plants operating under wet or dry fermentation conditions Biotechnology for Biofuels,8:14
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2764063
Minoche, A. E.; Dohm, J. C.; Schneider, J.; Holtgräwe, D.; Viehöver, P.; Montfort, M.; Rosleff Sörensen, T.; Weisshaar, B.; Himmelbauer, H. (2015): Exploiting single-molecule transcript sequencing for eukaryotic gene prediction Genome Biology,16:184
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2771746
Rückert, C.; Leipoldt, F.; Zeyhle, P.; Fenical, W.; Jensen, P. R.; Kalinowski, J.; Heide, L.; Kaysser, L. (2015): Complete Genome Sequence of Streptomyces sp. CNQ-509, a Prolific Producer of Meroterpenoid Chemistry Journal of Biotechnology,216: 140-141.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2770216
Kleinbölting, N.; Huep, G.; Appelhagen, I.; Viehöver, P.; Li, Y.; Weisshaar, B. (2015): The structural features of thousands of T-DNA insertion sites are consistent with a double-strand break repair based insertion mechanism Molecular Plant,8:(11): 1651-1664.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2771555
Müller, C.; Birmes, F. S.; Rückert, C.; Kalinowski, J.; Fetzner, S. (2015): Rhodococcus erythropolis BG43 genes mediating Pseudomonas aeruginosa quinolone signal degradation and virulence factor attenuation Applied and Environmental Microbiology,81:(22): 7720-7729.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2764512
Rückert, C.; Birmes, F. S.; Müller, C.; Niewerth, H.; Winkler, A.; Fetzner, S.; Kalinowski, J. (2015): Complete genome sequence of Rhodococcus erythropolis BG43 (DSM 46869), a degrader of Pseudomonas aeruginosa quorum sensing signal molecules Journal of biotechnology,211: 99-100.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2756434
Oelschlägel, M.; Rückert, C.; Kalinowski, J.; Schmidt, G.; Schlömann, M.; Tischler, D. (2015): Sphingopyxis fribergensis sp. nov., a soil bacterium with the ability to degrade styrene and phenylacetic acid International journal of systematic and evolutionary microbiology,65:(Part 9): 3008-3015.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2735160
Kurosawa, K.; Plassmeier, J.; Kalinowski, J.; Rückert, C.; Sinskey, A. J. (2015): Engineering L-arabinose metabolism in triacylglycerol-producing Rhodococcus opacus for lignocellulosic fuel production Metabolic engineering,30: 89-95.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2689771
Unthan, S.; Baumgart, M.; Radek, A.; Herbst, M.; Siebert, D.; Brühl, N.; Bartsch, A.; Bott, M.; Wiechert, W.; Marin, K.; Hans, S.; Krämer, R.; Seibold, G.; Frunzke, J.; Kalinowski, J.; Rückert, C.; Wendisch, V. F.; Noack, S. (2015): Chassis organism from Corynebacterium glutamicum – a top-down approach to identify and delete irrelevant gene clusters Biotechnology Journal,10:(2): 290-301.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709783
Ortseifen, V.; Winkler, A.; Albersmeier, A.; Wendler, S.; Pühler, A.; Kalinowski, J.; Rückert, C. (2015): Complete Genome Sequence of the Actinobacterium Streptomyces glaucescens GLA.O (DSM 40922) consisting of a linear chromosome and one linear plasmid Journal of Biotechnology,194: 81-83.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2719877
Rückert, C.; Albersmeier, A.; Busche, T.; Jaenicke, S.; Winkler, A.; Friðjónsson, Ó. H.; Hreggviðsson, G. Ó.; Lambert, C.; Badcock, D.; Bernaerts, K.; Anne, J.; Economou, A.; Kalinowski, J. (2015): Complete genome sequence of Streptomyces lividans TK24 Journal of Biotechnology,199: 21-22.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2719679
Vinardell, J. M.; Acosta-Jurado, S.; Göttfert, M.; Zehner, S.; Becker, A.; Baena-Ropero, I.; Blom, J.; Crespo-Rivas, J. C.; Goesmann, A.; Jaenicke, S.; Krol, E.; McIntosh, M.; Margaret, I.; Pérez-Montaño, F.; Schneiker-Bekel, S.; Serrania, J.; Szczepanowski, R.; Buendia-Claveria, A. M.; Lloret, J.; Bonilla, I.; Pühler, A.; Ruiz-Sainz, J. E.; Weidner, S. (2015): The Sinorhizobium fredii HH103 genome: a comparative analysis with S. fredii strains differing in their symbiotic behaviour with soybean Molecular Plant-Microbe Interactions,28:(7): 811-824.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2764185
Schafhauser, T.; Wibberg, D.; Rückert, C.; Winkler, A.; Flor, L.; van Pée, K. - H.; Fewer, D. P.; Sivonen, K.; Jahn, L.; Ludwig-Müller, J.; Caradec, T.; Jacques, P.; Huijbers, M. M. E.; van Berkel, W. J. H.; Weber, T.; Wohlleben, W.; Kalinowski, J. (2015): Draft genome sequence of Talaromyces islandicus ("Penicillium islandicum") WF-38-12, a neglected mold with significant biotechnological potential Journal of Biotechnology,211: 101-102.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2732031
Appelhagen, I.; Nordholt, N.; Seidel, T.; Spelt, K.; Koes, R.; Quattrochio, F.; Sagasser, M.; Weisshaar, B. (2015): Transparent Testa 13 is a tonoplast P3A-ATPase required for vacuolar deposition of proanthocyanidins in Arabidopsis thaliana seeds The Plant Journal,82:(5): 840-849.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2696778
Stracke, R.; Holtgräwe, D.; Schneider, J.; Pucker, B.; Rosleff Sörensen, T.; Weisshaar, B. (2014): Genome-wide identification and characterisation of R2R3-MYB genes in sugar beet ( Beta vulgaris ) BMC Plant Biology,14:(1):249
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2699085
Holtgräwe, D.; Rosleff Sörensen, T.; Viehöver, P.; Schneider, J.; Schulz, B.; Borchardt, D.; Kraft, T.; Himmelbauer, H.; Weisshaar, B. (2014): Reliable In Silico Identification of Sequence Polymorphisms and Their Application for Extending the Genetic Map of Sugar Beet (Beta vulgaris) PLoS ONE,9:(10):e110113
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2700166
Huep, G.; Kleinbölting, N.; Weisshaar, B. (2014): An easy-to-use primer design tool to address paralogous loci and T-DNA insertion sites in the genome of Arabidopsis thaliana Plant Methods,10:28
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2699107
Rebets, Y.; Tokovenko, B.; Lushchyk, I.; Rückert, C.; Zaburannyi, N.; Bechthold, A.; Kalinowski, J.; Luzhetskyy, A. (2014): Complete genome sequence of producer of the glycopeptide antibiotic Aculeximycin Kutzneria albida DSM 43870T, a representative of minor genus of Pseudonocardiaceae BMC genomics,15:(1): 885.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2692360
Tippelt, A.; Möllmann, S.; Albersmeier, A.; Jaenicke, S.; Rückert, C.; Tauch, A. (2014): Mycolic Acid Biosynthesis Genes in the Genome Sequence of Corynebacterium atypicum DSM 44849 Genome announcements,2:(4)
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2682811
Lübke, N. - C.; Wolf, T.; Braun, R.; Rückert, C.; Kalinowski, J. (2014): Vom Schärfesensor zur mikrobiellen Brennstoffzelle BIOspektrum,20:(4): 468-469.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2679399
Neshat, A.; Mentz, A.; Rückert, C.; Kalinowski, J. (2014): Transcriptome sequencing revealed the transcriptional organization at ribosome-mediated attenuation sites in Corynebacterium glutamicum and identified a novel attenuator involved in aromatic amino acid biosynthesis Journal of biotechnology,190: 55-63.
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2014 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2770185
Nolla Ardevol, V. (2014): Anaerobic digestion of the microalga Spirulina at alkaline conditions (pH~10; 2.0 M Na+): biogas production and metagenome analysis. Bielefeld: Bielefeld University.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2674387
Hilker, R.; Stadermann, K. B.; Doppmeier, D.; Kalinowski, J.; Stoye, J.; Straube, J.; Winnebald, J.; Goesmann, A. (2014): ReadXplorer - Visualization and Analysis of Mapped Sequences Bioinformatics,30:(16): 2247-2254.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2678005
Heitkam, T.; Holtgräwe, D.; Dohm, J. C.; Minoche, A. E.; Himmelbauer, H.; Weisshaar, B.; Schmidt, T. (2014): Profiling of extensively diversified plant LINEs reveals distinct plant-specific subclades The Plant Journal,79:(3): 385-397.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2665038
Schwientek, P.; Neshat, A.; Kalinowski, J.; Klein, A.; Rückert, C.; Schneiker-Bekel, S.; Wendler, S.; Stoye, J.; Pühler, A. (2014): Improving the genome annotation of the acarbose producer Actinoplanes sp. SE50/110 by sequencing enriched 5'-ends of primary transcripts Journal of Biotechnology,190: 85-95.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2647992
Flinspach, K.; Rückert, C.; Kalinowski, J.; Heide, L.; Apel, A. K. (2014): Draft Genome Sequence of Streptomyces niveus NCIMB 11891, Producer of the Aminocoumarin Antibiotic Novobiocin Genome announcements,2:(1): e01146-13.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2653196
Wilson, M. C.; Mori, T.; Rückert, C.; Uria, A. R.; Helf, M. J.; Takada, K.; Gernert, C.; Steffens, U. A. E.; Heycke, N.; Schmitt, S.; Rinke, C.; Helfrich, E. J. N.; Brachmann, A. O.; Gurgui, C.; Wakimoto, T.; Kracht, M.; Crüsemann, M.; Hentschel, U.; Abe, I.; Matsunaga, S.; Kalinowski, J.; Takeyama, H.; Piel, J. (2014): An environmental bacterial taxon with a large and distinct metabolic repertoire Nature,506:(7486): 58-62.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2643981
Bolger, M. E.; Weisshaar, B.; Scholz, U.; Stein, N.; Usadel, B.; Mayer, K. F. X. (2014): Plant genome sequencing — applications for crop improvement Current Opinion in Biotechnology,26:(4): 31-37.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2705365
Tippelt, A.; Albersmeier, A.; Brinkrolf, K.; Rückert, C.; Fernández-Natal, I.; Soriano, F.; Tauch, A. (2014): Complete Genome Sequence of Corynebacterium ureicelerivorans DSM 45051, a Lipophilic and Urea-Splitting Isolate from the Blood Culture of a Septicemia Patient Genome announcements,2:(6)
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2693289
Al-Dilaimi, A.; Albersmeier, A.; Kalinowski, J.; Rückert, C. (2014): Complete Genome Sequence of Corynebacterium vitaeruminis DSM 20294T, isolated from the cow rumen as a vitamin B producer Journal of Biotechnology,189: 70-71.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2693296
Walter, F.; Albersmeier, A.; Kalinowski, J.; Rückert, C. (2014): Complete Genome Sequence of Corynebacterium casei LMG S-19264T (=DSM 44701T), isolated from a smear-ripened cheese Journal of Biotechnology,189: 76-77.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2685988
Jakobi, T.; Brinkrolf, K.; Tauch, A.; Noll, T.; Stoye, J.; Pühler, A.; Goesmann, A. (2014): Discovery of transcription start sites in the Chinese hamster genome by next-generation RNA sequencing Journal of Biotechnology,190: 64-75.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2674171
Dubos, C.; Kelemen, Z.; Sebastian, A.; Bülow, L.; Huep, G.; Xu, W.; Grain, D.; Salsac, F.; Brousse, C.; Lepiniec, L.; Weisshaar, B.; Contreras-Moreira, B.; Hehl, R. (2014): Integrating bioinformatic resources to predict transcription factors interacting with cis-sequences conserved in co-regulated genes BMC genomics,15:(1):317
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2631517
Hackmann, C.; Korneli, C.; Kutyniok, M.; Köster, T.; Wiedenlübbert, M.; Müller, C.; Staiger, D. (2014): Salicylic acid-dependent and -independent impact of an RNA-binding protein on plant immunity Plant, Cell & Environment,37:(3): 696-706.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2701280
Noll, T.; Pühler, A.; Weisshaar, B.; Wendisch, V. F. (2014): The Genomics Revolution and its Impact on Future Biotechnology Journal of Biotechnology,190: 1-1.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2658490
Dziewit, L.; Czarnecki, J.; Wibberg, D.; Radlinska, M.; Mrozek, P.; Szymczak, M.; Schlüter, A.; Pühler, A.; Bartosik, D. (2014): Architecture and functions of a multipartite genome of the methylotrophic bacterium Paracoccus aminophilus JCM 7686, containing primary and secondary chromids BMC Genomics,15:(1):124
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | GenBank
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2687120
Albersmeier, A.; Bomholt, C.; Glaub, A.; Rückert, C.; Soriano, F.; Fernández-Natal, I.; Tauch, A. (2014): Draft Genome Sequence of the Multidrug-Resistant Clinical Isolate Dermabacter hominis 1368 Genome announcements,2:(4)
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2643941
Hoffmann, N.; Wilhelm, M.; Doebbe, A.; Niehaus, K.; Stoye, J. (2014): BiPACE 2D – Graph-based multiple alignment for comprehensive two-dimensional gas chromatography–mass spectrometry Bioinformatics,30:(7): 988-995.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2643946
Dohm, J. C.; Minoche, A. E.; Holtgräwe, D.; Capella-Gutiérrez, S.; Zakrzewski, F.; Tafer, H.; Rupp, O.; Rosleff Sörensen, T.; Stracke, R.; Reinhardt, R.; Goesmann, A.; Kraft, T.; Schulz, B.; Stadler, P. F.; Schmidt, T.; Gabaldón, T.; Lehrach, H.; Weisshaar, B.; Himmelbauer, H. (2014): The genome of the recently domesticated crop plant sugar beet (Beta vulgaris) Nature,505:(7484): 546-549.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2647986
Rückert, C.; Kalinowski, J.; Heide, L.; Apel, A. K. (2014): Draft Genome Sequence of Streptomyces roseochromogenes subsp. oscitans DS 12.976, Producer of the Aminocoumarin Antibiotic Clorobiocin Genome announcements,2:(1): e01147-13.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2651944
Tielen, P.; Wibberg, D.; Blom, J.; Rosin, N.; Meyer, A. - K.; Bunk, B.; Schobert, M.; Tüpker, R.; Schatschneider, S.; Rückert, C.; Albersmeier, A.; Goesmann, A.; Vorhölter, F. - J.; Jahn, D.; Pühler, A. (2014): Genome Sequence of the Small-Colony Variant Pseudomonas aeruginosa MH27, Isolated from a Chronic Urethral Catheter Infection Genome announcements,2:(1)
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2693409
Fredrich, E.; Ander, C.; Stoye, J.; Brune, I.; Tauch, A. (2014): Metatranskriptomik der Mikrobiota aus der menschlichen Achselhöhle BIOspektrum,20:(5): 294-296.
PUB | DOI
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2676806
Busche, T.; Pfeifer-Sancar, K.; Rückert, C.; Kalinowski, J. (2014): Identifizierung von Promotoren in Corynebacterium glutamicum BIOspektrum,20:(3): 284-287.
PUB | DOI
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2664976
Rückert, C.; Szczepanowski, R.; Albersmeier, A.; Goesmann, A.; Fischer, N.; Steinkämper, A.; Pühler, A.; Biener, R.; Schwartz, D.; Kalinowski, J. (2014): Complete Genome Sequence of the Actinobacterium Actinoplanes friuliensis HAG 010964, producer of the lipopeptide antibiotic friulimycin Journal of biotechnology,178: 41-42.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2689749
Milse, J.; Petri, K.; Rückert, C.; Kalinowski, J. (2014): Transcriptional response of Corynebacterium glutamicum ATCC 13032 to hydrogen peroxide stress and characterization of the OxyR regulon Journal of Biotechnology,190: 40-54.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2689802
Fechter, I.; Hausmann, L.; Zyprian, E.; Daum, M.; Holtgräwe, D.; Weisshaar, B.; Töpfer, R. (2014): QTL analysis of flowering time and ripening traits suggests an impact of a genomic region on linkage group 1 in Vitis. Theoretical and Applied Genetics,127:(9): 1857-1872.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2662843
Myronovskyi, M.; Tokovenko, B.; Brötz, E.; Rückert, C.; Kalinowski, J.; Luzhetskyy, A. (2014): Genome rearrangements of Streptomyces albus J1074 lead to the carotenoid gene cluster activation Applied microbiology and biotechnology,98:(2): 795-806.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2685861
Torres Tejerizo, G.; Pistorio, M.; Althabegoiti, M. J.; Cervantes, L.; Wibberg, D.; Schlüter, A.; Pühler, A.; Lagares, A.; Romero, D.; Brom, S. (2014): Rhizobial plasmid pLPU83a is able to switch between different transfer machineries depending on its genomic background FEMS Microbiology Ecology,88:(3): 565-578.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2684495
Dally, N.; Xiao, K.; Holtgräwe, D.; Jung, C. (2014): The B2 flowering time locus of beet encodes a zinc finger transcription factor Proceedings of the National Academy of Sciences,111:(28): 10365-10370.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2679186
Appelhagen, I.; Thiedig, K.; Nordholt, N.; Schmidt, N.; Huep, G.; Sagasser, M.; Weisshaar, B. (2014): Update on transparent testa mutants from Arabidopsis thaliana: characterisation of new alleles from an isogenic collection Planta,240:(5): 955-970.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2675608
Wibberg, D.; Torres Tejerizo, G.; Florencia Del Papa, M.; Martini, C.; Pühler, A.; Lagares, A.; Schlüter, A.; Pistorio, M. (2014): Genome sequence of the acid-tolerant strain Rhizobium sp LPU83 Journal of Biotechnology,176: 40-41.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2668850
Zakrzewski, F.; Schubert, V.; Viehöver, P.; Minoche, A. E.; Dohm, J. C.; Himmelbauer, H.; Weisshaar, B.; Schmidt, T. (2014): The CHH motif in sugar beet satellite DNA: a modulator for cytosine methylation The Plant Journal,78:(6): 937-950.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2693535
Stegmann, E.; Albersmeier, A.; Spohn, M.; Gert, H.; Weber, T.; Wohlleben, W.; Kalinowski, J.; Rückert, C. (2014): Complete Genome Sequence of the Actinobacterium Amycolatopsis japonica MG417-CF17T (=DSM 44213T) producing (S,S)-N,N'-ethylenediaminedisuccinic acid Journal of biotechnology,189: 46-47.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2705374
Möllmann, S.; Albersmeier, A.; Rückert, C.; Tauch, A. (2014): Complete Genome Sequence of Corynebacterium imitans DSM 44264, Isolated from a Five-Month-Old Boy with Suspected Pharyngeal Diphtheria Genome announcements,2:(6)
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2676082
Ian, E.; Malko, D. B.; Sekurova, O. N.; Bredholt, H.; Rückert, C.; Borisova, M. E.; Albersmeier, A.; Kalinowski, J.; Gelfand, M. S.; Zotchev, S. B. (2014): Genomics of Sponge-Associated Streptomyces spp. Closely Related to Streptomyces albus J1074: Insights into Marine Adaptation and Secondary Metabolite Biosynthesis Potential PloS one,9:(5): 96719.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2662834
Glaub, A.; Bomholt, C.; Gravermann, K.; Brinkrolf, K.; Albersmeier, A.; Rückert, C.; Tauch, A. (2014): Complete Genome Sequence of Corynebacterium falsenii DSM 44353 To Study the Evolution of Corynebacterium Cluster 3 Species Genome announcements,2:(2)
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2644101
Schaffert, L.; Albersmeier, A.; Bednarz, H.; Niehaus, K.; Kalinowski, J.; Rückert, C. (2013): Genome sequence of the marine bacterium Corynebacterium maris type strain Coryn-1T (= DSM 45190T) Standards in Genomic Sciences,8:(3): 516-524.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2631977
Petri, K.; Walter, F.; Persicke, M.; Rückert, C.; Kalinowski, J. (2013): A novel type of N-acetylglutamate synthase is involved in the first step of arginine biosynthesis in Corynebacterium glutamicum BMC Genomics,14:(1):713
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2631969
Mentz, A.; Neshat, A.; Pfeifer-Sancar, K.; Pühler, A.; Rückert, C.; Kalinowski, J. (2013): Comprehensive discovery and characterization of small RNAs in Corynebacterium glutamicum ATCC 13032 BMC Genomics,14:(1): 714.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2643373
Pfeifer-Sancar, K.; Mentz, A.; Rückert, C.; Kalinowski, J. (2013): Comprehensive analysis of the Corynebacterium glutamicum transcriptome using an improved RNAseq technique BMC Genomics,14:(1): 888.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2605193
Eikmeyer, F. G.; Rademacher, A.; Hanreich, A.; Hennig, M.; Jaenicke, S.; Maus, I.; Wibberg, D.; Zakrzewski, M.; Pühler, A.; Klocke, M.; Schlüter, A. (2013): Detailed analysis of metagenome datasets obtained from biogas-producing microbial communities residing in biogas reactors does not indicate the presence of putative pathogenic microorganisms Biotechnology for Biofuels,6:(1):49
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2555342
He, P.; Hao, K.; Blom, J.; Rückert, C.; Vater, J.; Mao, Z.; Wu, Y.; Hou, M.; He, P.; He, Y.; Borriss, R. (2013): Genome sequence of the plant growth promoting strain Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum B9601-Y2 and expression of mersacidin and other secondary metabolites Journal of biotechnology,164:(2): 281-291.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2614869
Soares, S. C.; Trost, E.; Ramos, R. T. J.; Carneiro, A. R.; Santos, A. R.; Pinto, A. C.; Barbosa, E.; Aburjaile, F.; Ali, A.; Diniz, C. A. A.; Hassan, S. S.; Fiaux, K.; Guimarães, L. C.; Bakhtiar, S. M.; Pereira, U.; Almeida, S. S.; Abreu, V. A. C.; Rocha, F. S.; Dorella, F. A.; Miyoshi, A.; Silva, A.; Azevedo, V.; Tauch, A. (2013): Genome sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis biovar equi strain 258 and prediction of antigenic targets to improve biotechnological vaccine production Journal of Biotechnology,167:(2): 135-141.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2641228
Jünemann, S.; Sedlazeck, F. J.; Prior, K.; Albersmeier, A.; John, U.; Kalinowski, J.; Mellmann, A.; Goesmann, A.; von Haeseler, A.; Stoye, J.; Harmsen, D. (2013): Corrigendum: Updating benchtop sequencing performance comparison Nature biotechnology,31:(12): 1148.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2637220
Wu, H.; Qiao, J.; Blom, J.; Rückert, C.; Reva, O.; Gao, X.; Borriss, R. (2013): The Rhizobacterium Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum NAU-B3 Contains a Large Inversion within the Central Portion of the Genome Genome announcements,1:(6): e00941-13.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2633427
Wibberg, D.; Blom, J.; Rückert, C.; Winkler, A.; Albersmeier, A.; Pühler, A.; Schlüter, A.; Scharf, B. E. (2013): Draft Genome Sequence of Sinorhizobium meliloti RU11/001, a model organism for flagellum structure, motility and chemotaxis Journal of Biotechnology,168:(4): 731-733.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2632946
Köhler, K. A. K.; Rückert, C.; Schatschneider, S.; Vorhölter, F. - J.; Szczepanowski, R.; Blank, L. M.; Niehaus, K.; Goesmann, A.; Pühler, A.; Kalinowski, J.; Schmid, A. (2013): Complete genome sequence of Pseudomonas sp. strain VLB120 a solvent tolerant, styrene degrading bacterium, isolated from forest soil Journal of Biotechnology,168:(4): 729-730.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2629570
Huep, G.; Kleinbölting, N.; Appelhagen, I.; Viehöver, P.; Weisshaar, B. (2013): Insertionslinien als Werkzeuge für funktionelle Genomforschung BIOspektrum,19:(6): 639-641.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2582332
Guimarães, L. C.; Soares, S. C.; Albersmeier, A.; Blom, J.; Jaenicke, S.; Azevedo, V.; Soriano, F.; Tauch, A.; Trost, E. (2013): Complete Genome Sequence of Corynebacterium urealyticum Strain DSM 7111, Isolated from a 9-Year-Old Patient with Alkaline-Encrusted Cystitis Genome announcements,1:(3):e00264-13
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2558460
Roetzer, A.; Diel, R.; Kohl, T. A.; Rückert, C.; Nübel, U.; Blom, J.; Wirth, T.; Jaenicke, S.; Schuback, S.; Rüsch-Gerdes, S.; Supply, P.; Kalinowski, J.; Niemann, S. (2013): Whole Genome Sequencing versus Traditional Genotyping for Investigation of a Mycobacterium tuberculosis Outbreak: A Longitudinal Molecular Epidemiological Study PLoS medicine,10:(2): e1001387.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2631956
Rückert, C.; Szczepanowski, R.; Albersmeier, A.; Goesmann, A.; Iftime, D.; Musiol, E. M.; Blin, K.; Wohlleben, W.; Pühler, A.; Kalinowski, J.; Weber, T. (2013): Complete genome sequence of the kirromycin producer Streptomyces collinus Tü 365 consisting of a linear chromosome and two linear plasmids Journal of Biotechnology,168:(4): 739-740.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2624418
Staiger, D.; Shin, J.; Johansson, M.; Davis, S. J. (2013): The circadian clock goes genomic Genome Biology,14:(6):208
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2629377
Bomholt, C.; Glaub, A.; Gravermann, K.; Albersmeier, A.; Brinkrolf, K.; Rückert, C.; Tauch, A. (2013): Whole-Genome Sequence of the Clinical Strain Corynebacterium argentoratense DSM 44202, Isolated from a Human Throat Specimen Genome announcements,1:(5): e00793-13.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2566922
Jünemann, S.; Sedlazeck, F. J.; Prior, K.; Albersmeier, A.; John, U.; Kalinowski, J.; Mellmann, A.; Goesmann, A.; von Haeseler, A.; Stoye, J.; Harmsen, D. (2013): Updating benchtop sequencing performance comparison Nature Biotechnology,31:(4): 294-296.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2629112
Lummer, M.; Humpert, F.; Wiedenlübbert, M.; Sauer, M.; Schüttpelz, M.; Staiger, D. (2013): A new set of reversibly photoswitchable fluorescent proteins for use in transgenic plants Molecular plant,6:(5): 1518-1530.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2557779
Weidner, S.; Baumgarth, B.; Göttfert, M.; Jaenicke, S.; Pühler, A.; Schneiker-Bekel, S.; Serrania, J.; Szczepanowski, R.; Becker, A. (2013): Genome Sequence of Sinorhizobium meliloti Rm41 Genome Announcements,1:(1): e00013-12.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2614036
Baumgart, M.; Unthan, S.; Rückert, C.; Sivalingam, J.; Grünberger, A.; Kalinowski, J.; Bott, M.; Noack, S.; Frunzke, J. (2013): Construction of a prophage-free variant of Corynebacterium glutamicum ATCC 13032 - a platform strain for basic research and industrial biotechnology Applied and environmental microbiology,79:(19): 6006-6015.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2548236
Schwientek, P.; Wendler, S.; Neshat, A.; Eirich, C.; Rückert, C.; Klein, A.; Wehmeier, U. F.; Kalinowski, J.; Stoye, J.; Pühler, A. (2013): Comparative RNA-sequencing of the acarbose producer Actinoplanes sp. SE50/110 cultivated in different growth media Journal of Biotechnology,167:(2): 166-177.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2548779
Zaprasis, A.; Brill, J.; Thüring, M.; Wünsche, G.; Heun, M.; Barzantny, H.; Hoffmann, T.; Bremer, E. (2013): Osmoprotection of Bacillus subtilis through Import and Proteolysis of Proline-Containing Peptides Applied and environmental microbiology,79:(2): 576-587.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2555355
Plassmeier, J.; Busche, T.; Molck, S.; Persicke, M.; Pühler, A.; Rückert, C.; Kalinowski, J. (2013): A propionate-inducible expression system based on the Corynebacterium glutamicum prpD2 promoter and PrpR activator and its application for the redirection of amino acid biosynthesis pathways Journal of Biotechnology,163:(2): 225-232.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2648007
Rückert, C.; Albersmeier, A.; Al-Dilaimi, A.; Bednarz, H.; Niehaus, K.; Szczepanowski, R.; Kalinowski, J. (2013): Genome sequence of the squalene-degrading bacterium Corynebacterium terpenotabidum type strain Y-11T (= DSM 44721T) Standards in Genomic Sciences,9:(3): 505-513.
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2013 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1923975
Wendisch, V. F.; Polen, T. (2013): Transcriptome/proteome analysis of *Corynebacterium glutamicum*. In: Hideaki Yukawa; Masayuki Inui (Hrsg.): Corynebacterium glutamicum: Biology and Biotechnology. Heidelberg, Germany: Springer. (Microbiology Monographs, 23). S. 173-216.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2518071
Astals, S.; Nolla Ardevol, V.; Mata-Alvarez, J. (2012): Anaerobic co-digestion of pig manure and crude glycerol at mesophilic conditions: Biogas and digestate Bioresource Technology,110: 63-70.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2517239
Hoffmann, N.; Keck, M.; Neuweger, H.; Wilhelm, M.; Högy, P.; Niehaus, K.; Stoye, J. (2012): Combining peak- and chromatogram-based retention time alignment algorithms for multiple chromatography-mass spectrometry datasets BMC Bioinformatics,13:(1): 21.
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