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484 Publikationen

2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2908574
N. Luhmann, M. Lafond, A. Thévenin, A. Ouangraoua, R. Wittler, and C. Chauve, “The SCJ Small Parsimony Problem for Weighted Gene Adjacencies”, IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2019, 16.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2019 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2936900 OA
R. Wittler, in Proceedings of WABI 2019 (Eds.: K. Huber, D. Gusfield), Schloss Dagstuhl--Leibniz-Zentrum Fuer Informatik, Dagstuhl, Germany, 2019.
PUB | DOI | Download (ext.)
 
2019 | Preprint | PUB-ID: 2935604 OA
R. Wittler, “Alignment- and reference-free phylogenomics with colored de-Bruijn graphs”, arXiv:1905.04165, 2019.
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2019 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2932883
D. Dörr, and J. Stoye, in Bioinformatics and Phylogenetics (Ed.: T. Warnow), Springer , Cham, 2019, p. 361-372.
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2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2932884
H. Oey, M. Zakrzewski, K. Gravermann, N. D. Young, P. K. Korhonen, G. N. Gobert, S. Nawaratna, S. Hasan, D. M. Martínez, H. You, et al., “Whole-genome sequence of the bovine blood fluke Schistosoma bovis supports interspecific hybridization with S. haematobium”, PLOS Pathogens, 2019, 15, : e1007513.
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2018 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2913924
Y. Anselmetti, N. Luhmann, S. Bérard, E. Tannier, and C. Chauve, in Comparative Genomics: Methods and Protocols (Eds.: J.C. Setubal, J. Stoye, P. Stadler), Humana Press, New York, NY, 2018, p. 343-362.
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2919005 OA
T. Schulz, J. Stoye, and D. Dörr, “GraphTeams. A method for discovering spatial gene clusters in Hi-C sequencing data”, BMC Genomics, 2018, 19, : 308.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2919006 OA
D. Rubert, E. A. Hoshino, M. Dias Vieira Braga, J. Stoye, and F. H. V. Martinez, “Computing the family-free DCJ similarity”, BMC Bioinformatics, 2018, 19, : 152.
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2018 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2913921
T. Zekic, G. Holley, and J. Stoye, in Comparative Genomics. Methods and Protocols (Eds.: J.C. Setubal, P. Stadler, J. Stoye), Springer Verlag, New York, 2018, p. 29-53.
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2018 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2913922
D. Dörr, P. Feijão, and J. Stoye, in Comparative Genomics: Methods and Protocols (Eds.: J.C. Setubal, P. Stadler, J. Stoye), Springer Verlag, New York, 2018, p. 331-342.
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2018 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2913920
Comparative Genomics: Methods and Protocols, Springer Verlag, New York, 2018.
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2918481
N. Luhmann, C. Chauve, J. Stoye, and R. Wittler, “Scaffolding of Ancient Contigs and Ancestral Reconstruction in a Phylogenetic Framework”, IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2018, 15, 2094-2100.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2919012
S. Jaenicke, S. Albaum, P. Blumenkamp, B. Linke, J. Stoye, and A. Goesmann, “Flexible metagenome analysis using the MGX framework”, Microbiome, 2018, 6, : 76.
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2909057 OA
D. Rubert, P. Feijão, M. Dias Vieira Braga, J. Stoye, and F. H. V. Martinez, “Approximating the DCJ distance of balanced genomes in linear time”, Algorithms for Molecular Biology, 2017, 12, : 3.
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2017 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2909409
L. Cunha, S. Dantas, T. Gagie, R. Wittler, L. Kowada, and J. Stoye, in Proceedings of CPM 2017, 2017, p. 19:1-19:9.
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2912492
N. Luhmann, D. Dörr, and C. Chauve, “Comparative scaffolding and gap filling of ancient bacterial genomes applied to two ancient Yersinia pestis genomes”, Microbial Genomics, 2017, 3.
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2017 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2907587
G. Holley, R. Wittler, J. Stoye, and F. Hach, in Proceedings of RECOMB 2017, 2017, p. 50-65.
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2909967
D. Dörr, L. A. B. Kowada, F. E. Soares de Araujo, S. Deshpande, S. Dantas, B. M. E. Moret, and J. Stoye, “New Genome Similarity Measures based on Conserved Gene Adjacencies”, Journal of Computational Biology, 2017, 24, 616-634.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901413 OA
K. Gorzolka, J. Kölling, T. W. Nattkemper, and K. Niehaus, “Spatio-Temporal Metabolite Profiling of the Barley Germination Process by MALDI MS Imaging”, PLOS ONE, 2016, 11, : 0150208.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2905930
S. Winter, K. Jahn, S. Wehner, L. Kuchenbecker, M. Marz, J. Stoye, and S. Böcker, “Finding approximate gene clusters with GECKO 3”, Nucleic Acids Research, 2016, 44, 9600-9610.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 

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