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484 Publikationen

2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2905930 OA
S. Winter, K. Jahn, S. Wehner, L. Kuchenbecker, M. Marz, J. Stoye, and S. Böcker, “Finding approximate gene clusters with GECKO 3”, Nucleic Acids Research, 2016, 44, 9600-9610, : gkw843.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2016 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2903708
D. Rubert, P. Feijão, M. Dias Vieira Braga, J. Stoye, and F. H. V. Martinez, in Algorithms in Bioinformatics. WABI 2016 (Eds.: M. Frith, C.N. Storm Pedersen), Springer, Cham, 2016, p. 293-306.
PUB | DOI
 
2016 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2900111
L. A. B. Kowada, D. Doerr, S. Dantas, and J. Stoye, in Research in Computational Molecular Biology. RECOMB 2016 (Ed.: M. Singh), Springer, 2016, p. 204-224.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2900421
L. Krause, K. Nones, K. A. Loffler, D. Nancarrow, H. Oey, Y. H. Tang, N. J. Wayte, A. M. Patch, K. Patel, S. Brosda, et al., “Identification of the CIMP-like subtype and aberrant methylation of members of the chromosomal segregation and spindle assembly pathways in esophageal adenocarcinoma”, Carcinogenesis, 2016, 37, 356-365.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2016 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901740
N. Luhmann, A. Thévenin, A. Ouangraoua, R. Wittler, and C. Chauve, in Proceedings 12th International Symposium, ISBRA 2016, Springer International Publishing, 2016, p. 200-210.
PUB | DOI | Download (ext.) | arXiv
 
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2726366 OA
F. H. Viduani Martinez, P. Feijão, M. Dias Vieira Braga, and J. Stoye, “On the family-free DCJ distance and similarity”, Algorithms for Molecular Biology, 2015, 10, 13, : 13.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2764612 OA
R. Wittler, T. Marschall, A. Schönhuth, and V. Makinen, “Repeat- and error-aware comparison of deletions”, Bioinformatics, 2015, 31, 2947-2954.
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2015 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901466
B. Osterholz, P. Wiebke, A. Fust, M. Rumming, A. Schlüter, and A. Sczyrba, in (Ed.: Julius Kühn-Institut, Bundesforschungsinstitut für Kulturpflanzen Institut für Epidemiologie und Pathogendiagnostik), 2015.
PUB
 
2015 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2757497
G. Holley, R. Wittler, and J. Stoye, in Algorithms in Bioinformatics. WABI 2015. Proceedings (Eds.: M. Pop, H. Touzet), Springer, Berlin, Heidelberg, 2015, p. 217-230.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2677844
M. Dias Vieira Braga, and J. Stoye, “Sorting linear genomes with rearrangements and indels”, IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2015, 12, 500-506.
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2015 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901462
M. Rumming, P. Krusche, and P. M. Tedder, in (Ed.: EMBL Heidelberg), 2015.
PUB
 
2015 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2780229
“Proceedings of the 13th Annual Research in Computational Molecular Biology (RECOMB) Satellite Workshop on Comparative Genomics: Bioinformatics”, BMC Bioinformatics, 2015, 16.
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2015 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2780232
“Proceedings of the 13th Annual Research in Computational Molecular Biology (RECOMB) Satellite Workshop on Comparative Genomics: Genomics”, BMC Genomics, 2015, 16.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2689773
S. Jünemann, K. Prior, A. Albersmeier, S. Albaum, J. Kalinowski, A. Goesmann, J. Stoye, and D. Harmsen, “GABenchToB: A Genome Assembly Benchmark Tuned on Bacteria and Benchtop Sequencers”, PLOS ONE, 2014, 9, e107014, : e107014.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2685362 OA
M. Lechner, M. Hernandez-Rosales, D. Dörr, N. Wieseke, A. Thévenin, J. Stoye, R. K. Hartmann, S. J. Prohaska, and P. F. Stadler, “Orthology Detection Combining Clustering and Synteny for Very Large Datasets”, PLoS ONE, 2014, 9, e105015, : e105015.
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2014 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2684241
F. H. Viduani Martinez, P. Feijão, M. Dias Vieira Braga, and J. Stoye, in Algorithms in Bioinformatics. WABI 2014 (Eds.: D. Brown, B. Morgenstern), Springer Verlag, Berlin ; Heidelberg, 2014, p. 174-186.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2687033 OA
D. Dörr, J. Stoye, S. Böcker, and K. Jahn, “Identifying Gene Clusters by Discovering Common Intervals in Indeterminate Strings”, BMC Genomics, 2014, 15, S2, : S2.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2674387
R. Hilker, K. B. Stadermann, D. Doppmeier, J. Kalinowski, J. Stoye, J. Straube, J. Winnebald, and A. Goesmann, “ReadXplorer - Visualization and Analysis of Mapped Sequences”, Bioinformatics, 2014, 30, 2247-2254.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2665038
P. Schwientek, A. Neshat, J. Kalinowski, A. Klein, C. Rückert, S. Schneiker-Bekel, S. Wendler, J. Stoye, and A. Pühler, “Improving the genome annotation of the acarbose producer Actinoplanes sp. SE50/110 by sequencing enriched 5'-ends of primary transcripts”, Journal of Biotechnology, 2014, 190, 85-95.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2685988
T. Jakobi, K. Brinkrolf, A. Tauch, T. Noll, J. Stoye, A. Pühler, and A. Goesmann, “Discovery of transcription start sites in the Chinese hamster genome by next-generation RNA sequencing”, Journal of Biotechnology, 2014, 190, 64-75.
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