Please note that PUB no longer supports Internet Explorer versions 8 or 9 (or earlier).

We recommend upgrading to the latest Internet Explorer, Google Chrome, or Firefox.

84 Publikationen

2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1794419
Herold, J., Zhou, L., Abouna, S., Pelengaris, S., Epstein, D., Khan, M. & Nattkemper, T.W. (2010). Integrating semantic annotation and information visualization for the analysis of multichannel fluorescence micrographs from pancreatic tissue. Computerized Medical Imaging and Graphics, 34(6), 446-452. Elsevier BV. doi:10.1016/j.compmedimag.2009.10.004.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1929311
Gölzhäuser, A., Nattkemper, T.W., Niehaus, K., Pühler, A. & Sauer, M. (2010). BioImaging: Contributions from biology, physics and informatics. Journal of Biotechnology, 149(4), 227-228. Elsevier BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2010.08.015.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1929335
Herold, J., Schubert, W. & Nattkemper, T.W. (2010). Automated detection and quantification of fluorescently labeled synapses in murine brain tissue sections for high throughput applications. JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY, 149(4), 299-309. Elsevier BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2010.03.004.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2018390
Herold, J., Abouna, S., Zhou, L., Pelengaris, S., Epstein, D.B.A., Khan, M. & Nattkemper, T.W. (2009). A way towards analyzing high-content bioimage data by means of semantic annotation and visual data mining. SPIE Medical Imaging. doi:10.1117/12.811710.
PUB | DOI
 
2009 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2018422
Ontrup, J., Ehnert, N., Bergmann, M. & Nattkemper, T.W. (2009). BIIGLE - Web 2.0 enabled labelling and exploring of images from the Arctic deep-sea observatory HAUSGARTEN. OCEANS 2009 - Europe. Gehalten auf der OCEANS 2009, Bremen. doi:10.1109/oceanse.2009.5278332.
PUB | DOI
 
2009 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2018427
Qureshi, H., Rajpoot, N., Nattkemper, T.W. & Hans, V. (2009). A Robust Adaptive Wavelet-based Method for Classification of Meningioma Histology Images. MICCAI«2009 Workshop on Optical Tissue Image Analysis in Microscopy, Histology, and Endoscopy. Gehalten auf der OPTIMHisE.
PUB
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1635314 OA
Diaz, N.N., Krause, L., Goesmann, A., Niehaus, K. & Nattkemper, T.W. (2009). TACOA - Taxonomic classification of environmental genomic fragments using a kernelized nearest neighbor approach. BMC Bioinformatics, 10(1), 56. Springer Science + Business Media. doi:10.1186/1471-2105-10-56.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1589531
Albaum, S., Neuweger, H., Fraenzel, B., Lange, S., Mertens, D., Troetschel, C., Wolters, D., Kalinowski, J., Nattkemper, T.W. & Goesmann, A. (2009). Qupe-a Rich Internet Application to take a step forward in the analysis of mass spectrometry-based quantitative proteomics experiments. Bioinformatics, 25(23), 3128-3134. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/bioinformatics/btp568.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1588783
Purser, A., Bergmann, M., Ontrup, J. & Nattkemper, T.W. (2009). Use of machine-learning algorithms for the automated detection of cold-water coral habitats: a pilot study. Marine Ecology Progress Series, 397, 241-251. Inter-Research Science Center. doi:10.3354/meps08154.
PUB | DOI | WoS
 
2009 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1591448
Saalbach, A., Lange, O., Nattkemper, T.W. & Meyer-Baese, A. (2009). On the application of (topographic) independent and tree-dependent component analysis for the examination of DCE-MRI data (BIOMEDICAL SIGNAL PROCESSING AND CONTROL), 4(3), 247-253. ELSEVIER SCI LTD. doi:10.1016/j.bspc.2009.03.010.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2018440
Schoening, T., Ehnert, N., Ontrup, J. & Nattkemper, T.W. (2009). BIIGLE Tools - A Web 2.0 Approach for Visual Bioimage Database Mining. IV 09 - Intl. Conference on Information Visualization. doi:10.1109/iv.2009.71.
PUB | DOI
 
2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2018405
Loyek, C., Woermann, F.G. & Nattkemper, T.W. (2008). Detection of Focal Cortical Dysplasia in MRI Using Textural Features. Proceedings of BVM 2008 (S. 432-436). Berlin, Heidelberg: Springer Verlag. doi:10.1007/978-3-540-78640-5_87.
PUB | DOI
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1636280 OA
Timm, W., Scherbart, A., Boecker, S., Kohlbacher, O. & Nattkemper, T.W. (2008). Peak intensity prediction in MALDI-TOF mass spectrometry: A machine learning study to support quantitative proteomics. BMC Bioinformatics, 9(1), 443. BIOMED CENTRAL LTD. doi:10.1186/1471-2105-9-443.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585611 OA
Wei, N., Flaschel, E., Friehs, K. & Nattkemper, T.W. (2008). A machine vision system for automated non-invasive assessment of cell viability via dark field microscopy, wavelet feature selection and classification. BMC Bioinformatics, 9(1), 449. BIOMED CENTRAL LTD. doi:10.1186/1471-2105-9-449.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1587052
Martin, C., Diaz, N.N., Ontrup, J. & Nattkemper, T.W. (2008). Hyperbolic SOM-based clustering of DNA fragment features for taxonomic visualization and classification. Bioinformatics, 24(14), 1568-1574. OXFORD UNIV PRESS. doi:10.1093/bioinformatics/btn257.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1588286
Twellmann, T., Meyer-Baese, A., Lange, O., Foo, S. & Nattkemper, T.W. (2008). Model-free visualization of suspicious lesions in breast MRI based on supervised and unsupervised learning. ENGINEERING APPLICATIONS OF ARTIFICIAL INTELLIGENCE, 21(2), 129-140. PERGAMON-ELSEVIER SCIENCE LTD. doi:10.1016/j.engappai.2007.04.005.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1783364 OA
Krause, L., Diaz, N.N., Goesmann, A., Kelley, S., Nattkemper, T.W., Rohwer, F., Edwards, R.A. & Stoye, J. (2008). Phylogenetic classification of short environmental DNA fragments. Nucleic Acids Research, 36(7), 2230-2239. doi:10.1093/nar/gkn038.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2018409
Martin, C. & Nattkemper, T.W. (2008). A Tree Index to Support Clustering Based Exploratory Data Analysis (Communications in Computer and Information Science). Bioinformatics Research and Development : Second International Conference, BIRD 2008 Vienna, Austria, July 7-9, 2008 Proceedings (S. 1-15). Gehalten auf der BIRD«08 (2nd International Conference on Bioinformatics Research and Development), Berlin, Heidelberg: Springer. doi:10.1007/978-3-540-70600-7_1.
PUB | DOI
 
2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2018435
Scherbart, A., Timm, W., Böcker, S. & Nattkemper, T.W. (2008). Improved Mass Spectrometry Peak Intensity Prediction by Adaptive Feature Weighting. International Conference on Neural Information Processing. Gehalten auf der ICONIP 2008, Auckland, New Zealand. doi:10.1007/978-3-642-02490-0_63.
PUB | DOI
 
2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2018381
Albaum, S., Neuweger, H., Lange, S., Mertens, D., Runte, K., Kalinowski, J., Nattkemper, T.W. & Goesmann, A. (2008). ProSE - "Software as a Service" for Quantitative Proteomics (Poster abstract). HUPO 7th Annual World Congress.
PUB
 
2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2018398
Herold, J., Friedenberger, M., Bode, M., Rajpoot, N., Schubert, W. & Nattkemper, T.W. (2008). Flexible Synapse Detection in Fluorescence Micrographs by Modeling Human Expert Grading. Proc. of 2008 IEEE International Symposium on Biomedical Imaging. Gehalten auf der ISBI. doi:10.1109/isbi.2008.4541254.
PUB | DOI
 
2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2018432
Scherbart, A. & Nattkemper, T.W. (2008). The Diversity of Regression Ensembles Combining Bagging and Random Subspace Method. International Conference on Neural Information Processing. Gehalten auf der ICONIP 2008. doi:10.1007/978-3-642-03040-6_111.
PUB | DOI
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1630738
Pobigaylo, N., Szymczak, S., Nattkemper, T.W. & Becker, A. (2008). Identification of genes relevant to symbiosis and competitiveness in Sinorhizobium meliloti using signature-tagged mutants. MOLECULAR PLANT-MICROBE INTERACTIONS, 21(2), 219-231. AMER PHYTOPATHOLOGICAL SOC. doi:10.1094/MPMI-21-2-0219.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2018412
Martin, C., Díaz Solórzano, N.N., Ontrup, J. & Nattkemper, T.W. (2007). Genome feature exploration using hyperbolic Self-Organizing Maps. Proceedings of the 6th International Workshop on Self-Organizing Maps (WSOM 2007). Gehalten auf der WSOM 2007, Bielefeld: Bielefeld University. doi:10.2390/biecoll-wsom2007-140 .
PUB | DOI
 
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1595739
Wei, N., You, J., Friehs, K., Flaschel, E. & Nattkemper, T.W. (2007). In situ dark field microscopy for on-line monitoring of yeast cultures. BIOTECHNOLOGY LETTERS, 29(3), 373-378. SPRINGER. doi:10.1007/s10529-006-9245-x.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1593120
Wei, N., You, J., Friehs, K., Flaschel, E. & Nattkemper, T.W. (2007). An in situ probe for on-line monitoring of cell density and viability on the basis of dark field microscopy in conjunction with image processing and supervised machine learning. Biotechnology and Bioengineering, 97(6), 1489-1500. Wiley. doi:10.1002/bit.21368.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1630749
Lessmann, B., Nattkemper, T.W., Hans, V.H. & Degenhard, A. (2007). A method for linking computed image features to histological semantics in neuropathology. Journal of Biomedical Informatics, 40(6), 631-641. ACADEMIC PRESS INC ELSEVIER SCIENCE. doi:10.1016/j.jbi.2007.06.007.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1783345 OA
Krause, L., McHardy, A.C., Nattkemper, T.W., Pühler, A., Stoye, J. & Meyer, F. (2007). GISMO - gene identification using a support vector machine for ORF classification. Nucleic Acids Research, 35(2), 540-549. doi:10.1093/nar/gkl1083.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2007 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2018416
Nattkemper, T.W., Degenhard, A. & Twellmann, T. (2007). Breas. In M.A. Hayat (Hrsg.), Cancer Imaging - Lung and breast carcinomas (S. 309-324). Academic Press.
PUB
 
2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374232
Varini, C., Lessmann, B., Degenhard, A., Hans, V.H. & Nattkemper, T.W. (2006). Visual Exploration of Pathology Images by a Discrete Wavelet Transform Preprocessed Locally Linear Embedding. In H. Handels, J. Ehrhardt, A. Horsch, H.-P. Meinzer & T. Tolxdorff (Hrsg.), Bildverarbeitung für die Medizin (S. 66-70). Springer.
PUB | Download (ext.)
 
2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374254
Lessmann, B., Nattkemper, T.W., Huth, J., Loyek, C., Kessar, P., Khazen, M., Pointon, L., Leach, M.O. & Degenhard, A. (2006). Content Based Image Retrieval for Dynamic Time Series Data. Proceedings of BVM (S. 61-65).
PUB
 
2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374494
Timm, W., Böcker, S., Twellmann, T. & Nattkemper, T.W. (2006). Peak intensity prediction for pmf mass spectra using support vector regression. Proc. of the 7th International FLINS Conference on Applied Artificial Intelligence (S. 565-572). doi:10.1142/9789812774118_0080.
PUB | DOI
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1600329
Miksch, G., Bettenworth, F., Friehs, K., Flaschel, E., Saalbach, A. & Nattkemper, T.W. (2006). A rapid reporter system using GFP as a reporter protein for identification and screening of synthetic stationary-phase promoters in Escherichia coli. APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY, 70(2), 229-236. SPRINGER. doi:10.1007/s00253-005-0060-4.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1597259
Martin, C., Deters, H. grosse & Nattkemper, T.W. (2006). Fusing biomedical multi-modal data for exploratory data analysis. ARTIFICIAL NEURAL NETWORKS - ICANN 2006, PT 2 (S. 798-807). SPRINGER-VERLAG BERLIN. doi:10.1007/11840930_83.
PUB | DOI | WoS
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1598838
Pobigaylo, N., Wetter, D., Szymczak, S., Schiller, U., Kurtz, S., Meyer, F., Nattkemper, T.W. & Becker, A. (2006). Construction of a large signature-tagged mini-Tn5 transposon library and its application to mutagenesis of Sinorhizobium meliloti. APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, 72(6), 4329-4337. AMER SOC MICROBIOLOGY. doi:10.1128/AEM.03072-05.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1598535
Varini, C., Degenhard, A. & Nattkemper, T.W. (2006). ISOLLE: LLE with geodesic distance. NEUROCOMPUTING, 69(13-15), 1768-1771. ELSEVIER SCIENCE BV. doi:10.1016/j.neucom.2005.12.120.
PUB | DOI | WoS
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1596731
Varini, C., Degenhard, A. & Nattkemper, T.W. (2006). Visual exploratory analysis of DCE-MRI data in breast cancer by dimensional data reduction: A comparative study. BIOMEDICAL SIGNAL PROCESSING AND CONTROL, 1(1), 56-63. ELSEVIER SCI LTD. doi:10.1016/j.bspc.2006.05.001.
PUB | DOI | WoS
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1603560
Nattkemper, T.W., Arnrich, B., Lichte, O., Timm, W., Degenhard, A., Pointon, L., Hayes, C. & Leach, M.O. (2005). Evaluation of radiological features for breast tumour classification in clinical screening with machine learning methods. ARTIFICIAL INTELLIGENCE IN MEDICINE, 34(2), 129-139. ELSEVIER SCIENCE BV. doi:10.1016/j.artmed.2004.09.001.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374546
Saalbach, A., Twellmann, T., Nattkemper, T.W., Wismüller, A., Ontrup, J. & Ritter, H. (2005). A hyperbolic topographic mapping for proximity data. Proc. of the IASTED International Conference of Artificial Intelligence and Applications (S. 106-111).
PUB
 
2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374666
Twellmann, T., Lichte, O., Saalbach, A., Wismüller, A. & Nattkemper, T.W. (2005). An Adaptive Colour Scale for Comparison of Pseudo Colouring Techniques for DCE-MRI Data. Gehalten auf der Workshop für Bildverarbeiteung für die Medzin, Workshop für Bildverarbeituing für die Medizin 2005.
PUB
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374187
Saalbach, A., Ontrup, J., Ritter, H. & Nattkemper, T.W. (2005). Image fusion based on topographic mappings using the hyperbolic space. Information Visualization, 4(4), 266-275. Palgrave Macmillan. doi:10.1057/palgrave.ivs.9500106.
PUB | DOI
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1603030
Nattkemper, T.W. & Wismuller, A. (2005). Tumor feature visualization with unsupervised learning. MEDICAL IMAGE ANALYSIS, 9(4), 344-351. ELSEVIER SCIENCE BV. doi:10.1016/j.media.2005.01.004.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1946602
Wei, N., Flaschel, E., Saalbach, A., Twellmann, T. & Nattkemper, T.W. (2005). Reagent-free automatic cell viability determination using neural networks based machine vision and dark-field microscopy in Saccharomyces cerevisiae. Conf Proc IEEE Eng Med Biol Soc, 6. doi:10.1109/iembs.2005.1615939.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1602344
Prank, K., Schulze, E., Eckert, O., Nattkemper, T.W., Bettendorf, M., Maser-Gluth, C., Sejnowski, T.J., Grote, A., Penner, E., von zur Muhlen, A. & Brabant, G. (2005). Machine learning approaches for phenotype-genotype mapping: predicting heterozygous mutations in the CYP21B gene from steroid profiles. EUROPEAN JOURNAL OF ENDOCRINOLOGY, 153(2), 301-305. BIO SCIENTIFICA LTD. doi:10.1530/eje.1.01957.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1601519
Varini, C., Degenhard, A. & Nattkemper, T.W. (2005). ISOLLE: Locally linear embedding with geodesic distance. KNOWLEDGE DISCOVERY IN DATABASES: PKDD 2005 (S. 331-342). SPRINGER-VERLAG BERLIN. doi:10.1007/11564126_34.
PUB | DOI | WoS
 
2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1601848
Miksch, G., Bettenworth, F., Friehs, K., Flaschel, E., Saalbach, A., Twellmann, T. & Nattkemper, T.W. (2005). Libraries of synthetic stationary-phase and stress promoters as a tool for fine-tuning of expression of recombinant proteins in Escherichia coli (JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY), 120(1), 25-37. ELSEVIER SCIENCE BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2005.04.027.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1601906
Lessmann, B., Degenhard, A., Kessar, P., Pointon, L., Khazen, M., Leach, M.O. & Nattkemper, T.W. (2005). SOM-based wavelet filtering for the exploration of medical images. ARTIFICIAL NEURAL NETWORKS: BIOLOGICAL INSPIRATIONS - ICANN 2005, PT 1, PROCEEDINGS (S. 671-676). SPRINGER-VERLAG BERLIN. doi:10.1007/11550822_104.
PUB | DOI | WoS
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1602177
Twellmann, T., Lichte, O. & Nattkemper, T.W. (2005). An adaptive tissue characterization network for model-free visualization of dynamic contrast-enhanced magnetic resonance image data. IEEE TRANSACTIONS ON MEDICAL IMAGING, 24(10), 1256-1266. IEEE-INST ELECTRICAL ELECTRONICS ENGINEERS INC. doi:10.1109/TMI.2005.854517.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2004 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2375262
Varini, C., Nattkemper, T.W., Degenhard, A. & Wismüller, A. (2004). Visualisation of Breast Tumour DCE-MRI Data using LLE. Proc. Medical Image Understanding and Analysis (MIUA) (S. 97-100). BMVA.
PUB
 
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606041
Nattkemper, T.W. (2004). Multivariate image analysis in biomedicine. JOURNAL OF BIOMEDICAL INFORMATICS, 37(5), 380-391. ACADEMIC PRESS INC ELSEVIER SCIENCE. doi:10.1016/j.jbi.2004.07.010.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 

Filter und Suchbegriffe

department=33067409

Suche

Publikationen filtern

Darstellung / Sortierung

Zitationsstil: dgps

Export / Einbettung