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40 Publikationen

2017 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2913690 OA
Zhu, L.; Ester, M. (2017): Bayesian Collective Markov Random Fields for Subcellular Localization Prediction of Human Proteins. In: Proceedings of the 8th ACM International Conference on Bioinformatics, Computational Biology,and Health Informatics - ACM-BCB '17. ACM Press.
PUB | PDF | DOI
 
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2765914
Zhu, L.; Malatras, A.; Thorley, M.; Aghoghogbe, I.; Mer, A.; Duguez, S.; Butler-Browne, G.; Voit, T.; Duddy, W. (2015): CellWhere: graphical display of interaction networks organized on subcellular localizations Nucleic Acids Research,43:(W1): W571-W575.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2013 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2594322 OA
Janowski, S. J. (2013): VANESA - A bioinformatics software application for the modeling, visualization, analysis, and simulation of biological networks in systems biology applications. Bielefeld: Bielefeld University.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2560811
Lee, H. - M.; Dietz, K. - J.; Hofestädt, R. (2013): Computational construction of specialized biological networks Journal of Bioinformatics and Computational Biology,11:(01):1340003
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2560817
Sommer, B.; Kormeier, B.; Demenkov, P. S.; Arrigo, P.; Hippe, K.; Ates, Ö.; Kochetov, A. V.; Ivanisenko, V. A.; Kolchanov, N. A.; Hofestädt, R. (2013): Subcellular localization charts: a new visual methodology for the semi-automatic localization of protein-related data sets Journal of Bioinformatics and Computational Biology,11:(01):1340005
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374720
Hippe, K.; Kormeier, B.; Janowski, S. J.; Töpel, T.; Hofestädt, R. (2011): DAWIS-M.D. 2.0 - A Data Warehouse Information System for Metabolic Data. In: Proceedings of the 7th International Symposium on Integrative Bioinformatics.
PUB
 
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376427
Hofestädt, R. (2011): Petri Nets and the Simulation of Metabolic Networks. In: Edgar Wingender (Hrsg.): Biological Petri Nets. 1. Edition. Amsterdam: IOS Press. (Studies in health technology and informatics, 162). S. 1-2.
PUB
 
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376491
Hofestädt, R.; Thelen, S. (2011): Quantitative Modeling of Biochemical Networks. In: Edgar Wingender (Hrsg.): Biological Petri Nets. 1. Edition. Amsterdam: IOS Press. (Studies in health technology and informatics, 162). S. 3-16.
PUB
 
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376523
Chen, M.; Hofestädt, R. (2011): Quantitative Petri Net Model of Gene Regulated Metabolic Networks in the Cell. In: Edgar Wingender (Hrsg.): Biological Petri Nets. 1. Edition. Amsterdam: IOS Press. (Studies in health technology and informatics, 162). S. 38-55.
PUB
 
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2290112
Chen, M.; Hu, M.; Hofestädt, R. (2011): A Systematic Petri Net Approach for Multiple-Scale Modeling and Simulation of Biochemical Processes Applied Biochemistry and Biotechnology,164:(3): 338-352.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326407
Chen, M.; Hariharaputran, S.; Hofestädt, R.; Kormeier, B.; Spangardt, S. (2011): Petri net models for the semi-automatic construction of large scale biological networks Natural Computing,10:(3): 1077-1097.
PUB | DOI | WoS
 
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408590
Huang, D.; Huang, Y.; Bai, Y.; Chen, D.; Hofestädt, R.; Klukas, C.; Chen, M. (2011): MyBioNet: interactively visualize, edit and merge biological networks on the Web Bioinformatics,27:(23): 3321-3322.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2458209
Hofestädt, R. (2011): Fundamental Features of Metabolic Computing. In: Ildar Batyrshin; Grigori Sidorov (Hrsg.): Advances in Soft Computing: 10th Mexican International Conference on Artificial Intelligence, MICAI 2011, Puebla, Mexico, November 26 - December 4, 2011, Proceedings, Part II. Berlin, Heidelberg: Springer. (Lecture Notes in Computer Science, 7095). S. 143-152.
PUB | DOI
 
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408602
Kormeier, B.; Hippe, K.; Hofestädt, R. (2011): Data Warehouses in Bioinformatics: Integration of Molecular Biological Data it Information Technology,53:(5): 241-249.
PUB | DOI
 
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408607
Lee, H. - M.; Dietz, K. - J.; Hofestädt, R. (2010): Prediction of thioredoxin and glutaredoxin target proteins by identifying reversibly oxidized cysteinyl residues. Journal of Integrative Bioinformatics (Special Issue),7:(3): 23-34.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2406168
Kormeier, B.; Hippe, K.; Töpel, T.; Hofestädt, R. (2010): CardioVINEdb: a data warehouse approach for integration of life science data in cardiovascular diseases Journal of Integrative Bioinformatics,7:(1):142
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1945096
Kormeier, B.; Hippe, K.; Arrigo, P.; Töpel, T.; Janowski, S. J.; Hofestädt, R. (2010): Reconstruction of biological networks based on life science data integration Journal of Integrative Bioinformatics,7:(2): 3-8.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
2010 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376605
Ralf Hofestädt; Nikolay Kolchanov (Hrsg.) (2010): Computational Systems Biology: German/Russian Network of Computational Systems Biology, In: Ralf Hofestädt; Nikolay Kolchanov (Hrsg.), Medizinische Informatik und Bioinformatik
PUB
 
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409400
Töpel, T.; Scheible, D.; Trefz, F.; Hofestädt, R. (2010): RAMEDIS: a comprehensive information system for variations and corresponding phenotypes of rare metabolic diseases Human Mutation,31:(1): E1081-E1088.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374757
Sommer, B.; Tiys, E. S.; Kormeier, B.; Hippe, K.; Janowski, S. J.; Ivanisenko, T. V.; Bragin, A. O.; Arrigo, P.; Demenkov, P. S.; Kochetov, A. V.; Ivanisenko, V. A.; Kolchanov, N. A.; Hofestädt, R. (2010): Visualization and Analysis of a Cardio Vascular Disease-and MUPP1-related Biological Network combining Text Mining and Data Warehouse Approaches Journal of Integrative Bioinformatics,7:(1): 148.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 

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