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154 Publikationen

2015 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2786037
Hilker, R.: Development of a read mapping analysis software and computational pan genome analysis of 20 Pseudomonas aeruginosa strains. Bielefeld University, Bielefeld (2015).
PUB | Dateien verfügbar
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2656773
Rupp, O., Becker, J., Brinkrolf, K., Timmermann, C., Borth, N., Pühler, A., Noll, T., Goesmann, A.: Construction of a Public CHO Cell Line Transcript Database Using Versatile Bioinformatics Analysis Pipelines. PLoS ONE. 9, e85568 (2014).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2643946
Dohm, J.C., Minoche, A.E., Holtgräwe, D., Capella-Gutiérrez, S., Zakrzewski, F., Tafer, H., Rupp, O., Rosleff Sörensen, T., Stracke, R., Reinhardt, R., Goesmann, A., Kraft, T., Schulz, B., Stadler, P.F., Schmidt, T., Gabaldón, T., Lehrach, H., Weisshaar, B., Himmelbauer, H.: The genome of the recently domesticated crop plant sugar beet (Beta vulgaris). Nature. 505, 546-549 (2014).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2651944
Tielen, P., Wibberg, D., Blom, J., Rosin, N., Meyer, A.-K., Bunk, B., Schobert, M., Tüpker, R., Schatschneider, S., Rückert, C., Albersmeier, A., Goesmann, A., Vorhölter, F.-J., Jahn, D., Pühler, A.: Genome Sequence of the Small-Colony Variant Pseudomonas aeruginosa MH27, Isolated from a Chronic Urethral Catheter Infection. Genome announcements. 2, (2014).
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2691732
Klippel, B., Sahm, K., Basner, A., Wiebusch, S., John, P., Lorenz, U., Peters, A., Abe, F., Takahashi, K., Kaiser, O., Goesmann, A., Jaenicke, S., Grote, R., Horikoshi, K., Antranikian, G.: Carbohydrate-active enzymes identified by metagenomic analysis of deep-sea sediment bacteria. Extremophiles. 18, 853-863 (2014).
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2555342
He, P., Hao, K., Blom, J., Rückert, C., Vater, J., Mao, Z., Wu, Y., Hou, M., He, P., He, Y., Borriss, R.: Genome sequence of the plant growth promoting strain Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum B9601-Y2 and expression of mersacidin and other secondary metabolites. Journal of biotechnology. 164, 281-291 (2013).
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2552500
Soares, S.C., Silva, A., Trost, E., Blom, J., Ramos, R., Carneiro, A., Ali, A., Santos, A.R., Pinto, A.C., Diniz, C., Barbosa, E.G.V., Dorella, F.A., Aburjaile, F., Rocha, F.S., Nascimento, K.K.F., Guimares, L.C., Almeida, S., Hassan, S.S., Bakhtiar, S.M., Pereira, U.P., Abreu, V.A.C., Schneider, M.P.C., Miyoshi, A., Tauch, A., Azevedo, V.: The Pan-Genome of the Animal Pathogen Corynebacterium pseudotuberculosis Reveals Differences in Genome Plasticity between the Biovar ovis and equi Strains. PLoS ONE. 8, : e53818 (2013).
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2549908
Wibberg, D., Jelonek, L., Rupp, O., Kröber, M., Eikmeyer, F.G., Goesmann, A., Hartmann, A., Borriss, R., Grosch, R., Pühler, A., Schlüter, A.: Establishment and interpretation of the genome sequence of the phytopathogenic fungus Rhizoctonia solani AG1-IB isolate 7/3/14. Journal of Biotechnology. 167, 142-155 (2013).
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2602756
Smits, T.H.M., Rezzonico, F., López, M.M., Blom, J., Goesmann, A., Frey, J.E., Duffy, B.: Phylogenetic position and virulence apparatus of the pear flower necrosis pathogen Erwinia piriflorinigrans CFBP 5888(T) as assessed by comparative genomics. Systematic and applied microbiology. 36, 449-456 (2013).
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2606943
Vences, M., Hauswaldt, S., Steinfartz, S., Rupp, O., Goesmann, A., Künzel, S., Orozco-Terwengel, P., Vieites, D.R., Nieto-Roman, S., Haas, S., Laugsch, C., Gehara, M., Bruchmann, S., Pabijan, M., Ludewig, A.-K., Rudert, D., Angelini, C., Borkin, L.J., Crochet, P.-A., Crottini, A., Dubois, A., Ficetola, G.F., Galán, P., Geniez, P., Hachtel, M., Jovanovic, O., Litvinchuk, S.N., Lymberakis, P., Ohler, A., Smirnov, N.A.: Radically different phylogeographies and patterns of genetic variation in two European brown frogs, genus Rana. Molecular phylogenetics and evolution. 68, 657-670 (2013).
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2641228
Jünemann, S., Sedlazeck, F.J., Prior, K., Albersmeier, A., John, U., Kalinowski, J., Mellmann, A., Goesmann, A., von Haeseler, A., Stoye, J., Harmsen, D.: Corrigendum: Updating benchtop sequencing performance comparison. Nature biotechnology. 31, 1148 (2013).
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2633427
Wibberg, D., Blom, J., Rückert, C., Winkler, A., Albersmeier, A., Pühler, A., Schlüter, A., Scharf, B.E.: Draft Genome Sequence of Sinorhizobium meliloti RU11/001, a model organism for flagellum structure, motility and chemotaxis. Journal of Biotechnology. 168, 731-733 (2013).
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2637220
Wu, H., Qiao, J., Blom, J., Rückert, C., Reva, O., Gao, X., Borriss, R.: The Rhizobacterium Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum NAU-B3 Contains a Large Inversion within the Central Portion of the Genome. Genome announcements. 1, e00941-13 (2013).
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2632946
Köhler, K.A.K., Rückert, C., Schatschneider, S., Vorhölter, F.-J., Szczepanowski, R., Blank, L.M., Niehaus, K., Goesmann, A., Pühler, A., Kalinowski, J., Schmid, A.: Complete genome sequence of Pseudomonas sp. strain VLB120 a solvent tolerant, styrene degrading bacterium, isolated from forest soil. Journal of Biotechnology. 168, 729-730 (2013).
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2622238
Barbe, S., Llop, P., Blom, J., Cabrefiga, J., Goesmann, A., Duffy, B., Montesinos, E., Smits, T.H.M., Lopez, M.M.: Complete sequence of Erwinia piriflorinigrans plasmids pEPIR37 and pEPIR5 and role of pEPIR37 in pathogen virulence. Plant Pathology. 62, 786-798 (2013).
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2615581
Brinkrolf, K., Rupp, O., Laux, H., Kollin, F., Ernst, W., Linke, B., Kofler, R., Romand, S., Hesse, F., Budach, W.E., Galosy, S., Müller, D., Noll, T., Wienberg, J., Jostock, T., Leonard, M., Grillari, J., Tauch, A., Goesmann, A., Helk, B., Mott, J.E., Pühler, A., Borth, N.: Chinese hamster genome sequenced from sorted chromosomes. Nature Biotechnology. 31, 694-695 (2013).
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2013 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2604883
Blom, J.: Comparative genomics on gene and single nucleotide level. Universitätsbibliothek, Bielefeld (2013).
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2564601
Riedel, T., Gómez-Consarnau, L., Tomasch, J., Martin, M., Jarek, M., González, J.M., Spring, S., Rohlfs, M., Brinkhoff, T., Cypionka, H., Göker, M., Fiebig, A., Klein, J., Goesmann, A., Fuhrman, J.A., Wagner-Döbler, I.: Genomics and Physiology of a Marine Flavobacterium Encoding a Proteorhodopsin and a Xanthorhodopsin-Like Protein. PLOS ONE. 8, e57487 (2013).
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2558460
Roetzer, A., Diel, R., Kohl, T.A., Rückert, C., Nübel, U., Blom, J., Wirth, T., Jaenicke, S., Schuback, S., Rüsch-Gerdes, S., Supply, P., Kalinowski, J., Niemann, S.: Whole Genome Sequencing versus Traditional Genotyping for Investigation of a Mycobacterium tuberculosis Outbreak: A Longitudinal Molecular Epidemiological Study. PLoS medicine. 10, e1001387 (2013).
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2560837
Fritzenwanker, M., Kuenne, C., Billion, A., Hain, T., Zimmermann, K., Goesmann, A., Chakraborty, T., Domann, E.: Complete Genome Sequence of the Probiotic Enterococcus faecalis Symbioflor 1 Clone DSM 16431. Genome Announcements. 1, e00165-12 (2013).
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