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154 Publikationen

2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2576080
Toepel, J., Illmer-Kephalides, M., Jaenicke, S., Straube, J., May, P., Goesmann, A., Kruse, O.: New insights into Chlamydomonas reinhardtii hydrogen production processes by combined microarray/RNA-seq transcriptomics. Plant Biotechnology Journal. 11, 717-733 (2013).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2576539
Wichmann, F., Vorhölter, F.-J., Hersemann, L., Widmer, F., Blom, J., Niehaus, K., Reinhard, S., Conradin, C., Kölliker, R.: The noncanonical type III secretion system of Xanthomonas translucens pv. graminis is essential for forage grass infection. Molecular plant pathology. 14, 576-588 (2013).
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2631956
Rückert, C., Szczepanowski, R., Albersmeier, A., Goesmann, A., Iftime, D., Musiol, E.M., Blin, K., Wohlleben, W., Pühler, A., Kalinowski, J., Weber, T.: Complete genome sequence of the kirromycin producer Streptomyces collinus Tü 365 consisting of a linear chromosome and two linear plasmids. Journal of Biotechnology. 168, 739-740 (2013).
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2566922
Jünemann, S., Sedlazeck, F.J., Prior, K., Albersmeier, A., John, U., Kalinowski, J., Mellmann, A., Goesmann, A., von Haeseler, A., Stoye, J., Harmsen, D.: Updating benchtop sequencing performance comparison. Nature Biotechnology. 31, 294-296 (2013).
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2635526
Koeck, D.E., Wibberg, D., Koellmeier, T., Blom, J., Jaenicke, S., Winkler, A., Albersmeier, A., Zverlov, V.V., Pühler, A., Schwarz, W.H., Schlüter, A.: Draft genome sequence of the cellulolytic Clostridium thermocellum wild-type strain BC1 playing a role in cellulosic biomass degradation. Journal of Biotechnology. 168, 62-63 (2013).
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2561776
Trötschel, C., Albaum, S., Poetsch, A.: Proteome turnover in bacteria: current status for Corynebacterium glutamicum and related bacteria. Microbial biotechnology. 708-719 (2013).
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2557938
Mann, R.A., Smits, T.H.M., Bühlmann, A., Blom, J., Goesmann, A., Frey, J.E., Plummer, K.M., Beer, S.V., Luck, J., Duffy, B., Rodoni, B.: Comparative Genomics of 12 Strains of Erwinia amylovora Identifies a Pan-Genome with a Large Conserved Core. PLOS ONE. 8, e55644 (2013).
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2554079
Kuenne, C., Billion, A., Mraheil, M.A., Strittmatter, A., Daniel, R., Goesmann, A., Barbuddhe, S., Hain, T., Chakraborty, T.: Reassessment of the Listeria monocytogenes pan-genome reveals dynamic integration hotspots and mobile genetic elements as major components of the accessory genome. BMC Genomics. 14, 47 (2013).
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2548286
Luque-Almagro, V.M., Acera, F., Igeño, M.I., Wibberg, D., Roldán, M.D., Sáez, L.P., Hennig, M., Quesada, A., Huertas, M.J., Blom, J., Merchán, F., Escribano, M.P., Jaenicke, S., Estepa, J., Guijo, M.I., Martínez-Luque, M., Macías, D., Szczepanowski, R., Becerra, G., Ramirez, S., Carmona, M.I., Gutiérrez, O., Manso, I., Pühler, A., Castillo, F., Moreno-Vivián, C., Schlüter, A., Blasco, R.: Draft whole genome sequence of the cyanide-degrading bacterium Pseudomonas pseudoalcaligenes CECT5344. Environmental Microbiology. 15, 253-270 (2013).
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2645668
Bogen, C., Al-Dilaimi, A., Albersmeier, A., Wichmann, J., Grundmann, M., Rupp, O., Lauersen, K.J., Blifernez-Klassen, O., Kalinowski, J., Goesmann, A., Mussgnug, J.H., Kruse, O.: Reconstruction of the lipid metabolism for the microalga Monoraphidium neglectum from its genome sequence reveals characteristics suitable for biofuel production. BMC Genomics. 14, 926 (2013).
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2635520
Dam, B., Dam, S., Blom, J., Liesack, W.: Genome Analysis Coupled with Physiological Studies Reveals a Diverse Nitrogen Metabolism in Methylocystis sp Strain SC2. Plos One. 8, e74767 (2013).
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2610129
Kessler, N., Bonte, A., Langenkämper, G., Niehaus, K., Goesmann, A., Nattkemper, T.W.: MeltDB 2.0 - Advances of the metabolomics software system. Bioinformatics. 29, 2452-2459 (2013).
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2607974
Niu, B., Vater, J., Rückert, C., Blom, J., Lehmann, M., Ru, J.-J., Chen, X.-H., Wang, Q., Borriss, R.: Polymyxin P is the active principle in suppressing phytopathogenic Erwinia spp. by the biocontrol rhizobacterium Paenibacillus polymyxa M-1. BMC microbiology. 13, 137 (2013).
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2529309
Bolzan de Campos, S., Youn, J.-W., Farina, R., Jaenicke, S., Jünemann, S., Szczepanowski, R., Beneduzi, A., Vargas, L.K., Wendisch, V.F., Passaglia, L.: Changes in Root Bacterial Communities Associated to Two Different Development Stages of Canola (*Brassica napus* L. var oleifera) Evaluated through Next-Generation Sequencing. Microbial Ecology. 65, 593-601 (2013).
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2529202
Zakrzewski, M., Bekel, T., Ander, C., Pühler, A., Rupp, O., Stoye, J., Schlüter, A., Goesmann, A.: MetaSAMS - A novel software platform for taxonomic classification, functional annotation and comparative analysis of metagenome datasets. Journal of Biotechnology. 167, 156-165 (2013).
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2013 | Konferenzbeitrag | Im Druck | PUB-ID: 2538625
Bonte, A., Kessler, N., Nattkemper, T.W., Goesmann, A., Cecile, T., Mäder, P., Niehaus, K., Langenkämper, G.: Einsatz von Protein- und Metabolit-Profiling-Methoden zur Unterscheidung von ökologischem und konventionellem Weizen. Presented at the 12. Wissenschaftstagung Ökologischer Landbau „Ideal und Wirklichkeit – Perspektiven Ökologischer Landbewirtschaftung“, Bonn, Germany (In Press).
PUB
 
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2498160
Schröder, J., Maus, I., Meyer, K., Wördemann, S., Blom, J., Jaenicke, S., Schneider, J., Trost, E., Tauch, A.: Complete genome sequence, lifestyle, and multi-drug resistance of the human pathogen Corynebacterium resistens DSM 45100 isolated from blood samples of a leukemia patient. BMC Genomics. 13, : 141 (2012).
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2484618
Zakrzewski, M., Goesmann, A., Jaenicke, S., Jünemann, S., Eikmeyer, F.G., Szczepanowski, R., Al-Soud, W.A., Sørensen, S., Pühler, A., Schlüter, A.: Profiling of the metabolically active community from a production-scale biogas plant by means of high-throughput metatranscriptome sequencing. Journal of Biotechnology. 158, 248-258 (2012).
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2513347
Trost, E., Blom, J., de Castro Soares, S., Huang, I.-H., Al-Dilaimi, A., Schröder, J., Jaenicke, S., Dorella, F.A., Rocha, F.S., Miyoshi, A., Azevedo, V., Schneider, M.P., Silva, A., Camello, T.C., Sabbadini, P.S., Santos, C.S., Santos, L.S., Hirata, R.J., Mattos-Guaraldi, A.L., Efstratiou, A., Schmitt, M.P., Ton-That, H., Tauch, A.: Pangenomic Study of Corynebacterium diphtheriae That Provides Insights into the Genomic Diversity of Pathogenic Isolates from Cases of Classical Diphtheria, Endocarditis, and Pneumonia. Journal of bacteriology. 194, 3199-3215 (2012).
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2500990
Rose, M.T., Rose, T.J., Pariasca-Tanaka, J., Yoshihashi, T., Neuweger, H., Goesmann, A., Frei, M., Wissuwa, M.: Root metabolic response of rice (Oryza sativa L.) genotypes with contrasting tolerance to zinc deficiency and bicarbonate excess. Planta. 236, 959-973 (2012).
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