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264 Publikationen

 
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2731076
Diversity and role of plasmids in adaptation of bacteria inhabiting the Lubin copper mine in Poland, an environment rich in heavy metals
Dziewit L, Pyzik A, Szuplewska M, Matlakowska R, Mielnicki S, Wibberg D, Schlüter A, Pühler A, Bartosik D (2015)
Frontiers in Microbiology 6: 152.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2731292 PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2732884
Complete genome sequence of Paenibacillus riograndensis SBR5T, a Gram-positive diazotrophic rhizobacterium
Fernandes de Brito L, Bach E, Kalinowski J, Rückert C, Wibberg D, Passaglia L, Wendisch VF (2015)
Journal of Biotechnology 207: 30-31.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2722001
Dependency of the fatty acid composition of Euglena gracilis on growth phase and culture conditions
Schwarzhans JP, Cholewa D, Grimm P, Beshay U, Risse JM, Friehs K, Flaschel E (2015)
Journal of Applied Phycology 27(4): 1389-1399.
PUB | DOI | WoS
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2706029
ALLocator: An Interactive Web Platform for the Analysis of Metabolomic LC-ESI-MS Datasets, Enabling Semi-Automated, User-Revised Compound Annotation and Mass Isotopomer Ratio Analysis
Kessler N, Walter F, Persicke M, Albaum S, Kalinowski J, Goesmann A, Niehaus K, Nattkemper TW (2014)
PLoS ONE 9(11): e113909.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2678800
Effect of the strain Bacillus amyloliquefaciens FZB42 on the microbial community in the rhizosphere of lettuce under field conditions analyzed by whole metagenome sequencing
Kröber M, Wibberg D, Grosch R, Eikmeyer FG, Verwaaijen B, Chowdhury SP, Hartmann A, Pühler A, Schlüter A (2014)
Frontiers in Microbiology 5: 252.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2687033
Identifying Gene Clusters by Discovering Common Intervals in Indeterminate Strings
Dörr D, Stoye J, Böcker S, Jahn K (2014)
BMC Genomics 15(Suppl. 6: Proc. of RECOMB-CG 2014): S2.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2685362
Orthology Detection Combining Clustering and Synteny for Very Large Datasets
Lechner M, Hernandez-Rosales M, Dörr D, Wieseke N, Thévenin A, Stoye J, Hartmann RK, Prohaska SJ, Stadler PF (2014)
PLoS ONE 9(8): e105015.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2682811
Vom Schärfesensor zur mikrobiellen Brennstoffzelle
Lübke N-C, Wolf T, Braun R, Rückert C, Kalinowski J (2014)
BIOspektrum 20(4): 468-469.
PUB | DOI
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2679399 PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2723541
Bioinformatic methods for the analysis and comparison of metagenomes and metatranscriptomes
Ander C (2014)
Bielefeld: Universitätsbibliothek Bielefeld.
PUB | PDF
 
2014 | Dissertation | PUB-ID: 2717323 PUB
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2717549 PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2770185 PUB | PDF
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2674387
ReadXplorer - Visualization and Analysis of Mapped Sequences
Hilker R, Stadermann KB, Doppmeier D, Kalinowski J, Stoye J, Straube J, Winnebald J, Goesmann A (2014)
Bioinformatics 30(16): 2247-2254.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2665038
Improving the genome annotation of the acarbose producer Actinoplanes sp. SE50/110 by sequencing enriched 5'-ends of primary transcripts
Schwientek P, Neshat A, Kalinowski J, Klein A, Rückert C, Schneiker-Bekel S, Wendler S, Stoye J, Pühler A (2014)
Journal of Biotechnology 190: 85-95.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2645148
Histidine biosynthesis, its regulation and biotechnological application in Corynebacterium glutamicum
Kulis-Horn R, Persicke M, Kalinowski J (2014)
Microbial Biotechnology 7(1): 5-25.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2718661 PUB | Dateien verfügbar
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2656819
Establishment of a CpG island microarray for analyses of genome-wide DNA methylation in Chinese hamster ovary cells
Wippermann A, Klausing S, Rupp O, Albaum S, Büntemeyer H, Noll T, Hoffrogge R (2014)
Applied Microbiology and Biotechnology 98(2): 579-589.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2693296
Complete Genome Sequence of Corynebacterium casei LMG S-19264T (=DSM 44701T), isolated from a smear-ripened cheese
Walter F, Albersmeier A, Kalinowski J, Rückert C (2014)
Journal of Biotechnology 189: 76-77.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2685988
Discovery of transcription start sites in the Chinese hamster genome by next-generation RNA sequencing
Jakobi T, Brinkrolf K, Tauch A, Noll T, Stoye J, Pühler A, Goesmann A (2014)
Journal of Biotechnology 190: 64-75.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2690300
Interactive Exploration of Spatial Distribution in Mass Spectrometry Imaging
Kölling J, Zurowietz M, Nattkemper TW (2014)
Presented at the 4th Symposium on Biological Data Visualization (BioVis), Boston, MA, USA.
PUB | Download (ext.)
 
2014 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2682078
ColE1-Plasmidproduktion in Escherichia coli: Simulation und Experiment
Freudenau I (2014)
Bielefeld: Universitätsbibliothek.
PUB | PDF
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2676552
Transcriptome analyses of CHO cells with the next-generation microarray CHO41K: Development and validation by analysing the influence of the growth stimulating substance IGF-1 substitute LongR(3.)
Becker J, Timmermann C, Rupp O, Albaum S, Brinkrolf K, Goesmann A, Pühler A, Tauch A, Noll T (2014)
Journal of biotechnology 178: 23-31.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2656773
Construction of a Public CHO Cell Line Transcript Database Using Versatile Bioinformatics Analysis Pipelines
Rupp O, Becker J, Brinkrolf K, Timmermann C, Borth N, Pühler A, Noll T, Goesmann A (2014)
PLoS ONE 9(1): e85568.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2658490
Architecture and functions of a multipartite genome of the methylotrophic bacterium Paracoccus aminophilus JCM 7686, containing primary and secondary chromids
Dziewit L, Czarnecki J, Wibberg D, Radlinska M, Mrozek P, Szymczak M, Schlüter A, Pühler A, Bartosik D (2014)
BMC Genomics 15(1): 124.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | GenBank
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2689746
Complete genome sequence of *Bacillus methanolicus* MGA3, a thermotolerant amino acid producing methylotroph
Irla M, Neshat A, Winkler A, Albersmeier A, Heggeset TM, Brautaset T, Kalinowski J, Wendisch VF, Rückert C (2014)
Journal of Biotechnology 188: 110-111.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2699819
Metabolic flux pattern of glucose utilization by Xanthomonas campestris pv. campestris: prevalent role of the Entner-Doudoroff pathway and minor fluxes through the pentose phosphate pathway and glycolysis
Schatschneider S, Huber C, Neuweger H, Watt T, Pühler A, Eisenreich W, Wittmann C, Niehaus K, Vorhölter F-J (2014)
Molecular BioSystems 10(10): 2663-2676.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2693310
Transcriptome analysis of the phytopathogenic fungus Rhizoctonia solani AG1-IB 7/3/14 applying high-throughput sequencing of expressed sequence tags (ESTs)
Wibberg D, Jelonek L, Rupp O, Kröber M, Goesmann A, Grosch R, Pühler A, Schlüter A (2014)
Fungal Biology 118(9-10): 800-813.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2693409
Metatranskriptomik der Mikrobiota aus der menschlichen Achselhöhle
Fredrich E, Ander C, Stoye J, Brune I, Tauch A (2014)
BIOspektrum 20(5): 294-296.
PUB | DOI
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2694915
Whole genome sequence of Clostridium bornimense strain M2/40 isolated from a lab-scale mesophilic two-phase biogas reactor digesting maize silage and wheat straw
Hahnke S, Wibberg D, Geizecler T, Pühler A, Klocke M, Schlüter A (2014)
Journal of Biotechnology 184: 199-200.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2676806
Identifizierung von Promotoren in Corynebacterium glutamicum
Busche T, Pfeifer-Sancar K, Rückert C, Kalinowski J (2014)
BIOspektrum 20(3): 284-287.
PUB | DOI
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2643915
Metabolic engineering of *Corynebacterium glutamicum* for glycolate production
Zahoor ul Hassan A, Otten A, Wendisch VF (2014)
Journal of Biotechnology 192: 366-375.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2651944
Genome Sequence of the Small-Colony Variant Pseudomonas aeruginosa MH27, Isolated from a Chronic Urethral Catheter Infection
Tielen P, Wibberg D, Blom J, Rosin N, Meyer A-K, Bunk B, Schobert M, Tüpker R, Schatschneider S, Rückert C, Albersmeier A, et al. (2014)
Genome announcements 2(1).
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Konferenzbeitrag | Im Druck | PUB-ID: 2690335
Interactive and dynamic web-based visual exploration of high dimensional bioimages with real time clustering
Rathke M, Kölling J, Gorzolka K, Niehaus K, Nattkemper TW (In Press)
Presented at the German Conference on Bioinformatics (GCB), Bielefeld, Germany.
PUB
 
2014 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Im Druck | PUB-ID: 2690436
Spatio-temporal analysis of metabolite profiles during barley germination
Kölling J, Gorzolka K, Niehaus K, Nattkemper TW (In Press)
Presented at the German Conference on Bioinformatics (GCB), Bielefeld, Germany.
PUB | PDF
 
2014 | Dissertation | PUB-ID: 2763157 PUB
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2644144
Engineering biotin prototrophic *Corynebacterium glutamicum* strains for amino acid, diamine and carotenoid production
Peters-Wendisch P, Götker S, Heider S, Komati Reddy G, Nguyen AQ, Stansen KC, Wendisch VF (2014)
Journal of Biotechnology 192: 346-354.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2685861
Rhizobial plasmid pLPU83a is able to switch between different transfer machineries depending on its genomic background
Torres Tejerizo G, Pistorio M, Althabegoiti MJ, Cervantes L, Wibberg D, Schlüter A, Pühler A, Lagares A, Romero D, Brom S (2014)
FEMS Microbiology Ecology 88(3): 565-578.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2690322
Interactive Exploration of Spatial Distribution in Mass Spectrometry Imaging
Kölling J, Zurowietz M, Nattkemper TW (2014)
Presented at the 22nd Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB), Boston, MA, USA.
PUB | Download (ext.)
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2672926
Genome Sequence of the Acute Urethral Catheter Isolate Pseudomonas aeruginosa MH38
Wibberg D, Tielen P, Blom J, Rosin N, Schobert M, Tüpker R, Schatschneider S, Spilker D, Albersmeier A, Goesmann A, Vorhölter F-J, et al. (2014)
Genome announcements 2(2): e00161-14.
PUB | PDF | DOI | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2675608
Genome sequence of the acid-tolerant strain Rhizobium sp LPU83
Wibberg D, Torres Tejerizo G, Florencia Del Papa M, Martini C, Pühler A, Lagares A, Schlüter A, Pistorio M (2014)
Journal of Biotechnology 176: 40-41.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2723909
Identification of engineering targets for improving putrescine production by Corynebacterium glutamicum
Nguyen AQ, Schneider J, Wendisch VF (2014)
New Biotechnology 31: S166-S166.
PUB | DOI | WoS
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2717539
Complete genome sequence of the methanogenic neotype strain Methanobacterium formicicum MFT
Maus I, Stantscheff R, Wibberg D, Stolze Y, Winkler A, Pühler A, König H, Schlüter A (2014)
Journal of Biotechnology 192: 40-41.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2717558
First draft genome sequence of the amylolytic Bacillus thermoamylovorans wild-type strain 1A1 isolated from a thermophilic biogas plant
Koeck DE, Wibberg D, Maus I, Winkler A, Albersmeier A, Zverlov VV, Pühler A, Schwarz WH, Liebl W, Schlüter A (2014)
Journal of Biotechnology 192: 154-155.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2703966
Bioinformatic methods for eukaryotic RNA-Seq-based promoter identification
Jakobi T (2014)
Bielefeld: Bielefeld University.
PUB | PDF
 
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2707731
Complete genome sequence of the cellulolytic thermophile Ruminoclostridium cellulosi wild-type strain DG5 isolated from a thermophilic biogas plant
Koeck DE, Wibberg D, Maus I, Winkler A, Albersmeier A, Zverlov VV, Liebl W, Pühler A, Schwarz WH, Schlüter A (2014)
Journal of Biotechnology 188: 136-137.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 

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