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266 Publikationen

2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2317371
Küberl, A.; Schneider, J.; Thallinger, G. G.; Anderl, I.; Wibberg, D.; Hajek, T.; Jaenicke, S.; Brinkrolf, K.; Goesmann, A.; Szczepanowski, R.; Pühler, A.; Schwab, H.; Glieder, A.; Pichler, H. (2011): High-quality genome sequence of Pichia pastoris CBS7435 Journal of Biotechnology,154:(4): 312-320.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326465
Torres Tejerizo, G.; Florencia Del Papa, M.; Draghi, W.; Lozano, M.; de los Angeles Giusti, M.; Martini, C.; Eugenia Salas, M.; Salto, I.; Wibberg, D.; Szczepanowski, R.; Weidner, S.; Schlüter, A.; Lagares, A.; Pistorio, M. (2011): First genomic analysis of the broad-host-range Rhizobium sp LPU83 strain, a member of the low-genetic diversity Oregon-like Rhizobium sp group Journal of Biotechnology,155:(1): 3-10.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396576
Becker, J.; Hackel, M.; Jakobi, T.; Rupp, O.; Schneider, J.; Szczepanowski, R.; Bekel, T.; Borth, N.; Goesmann, A.; Grillari, J.; Kaltschmidt, C.; Noll, T.; Pühler, A.; Tauch, A.; Brinkrolf, K. (2011): Unraveling the Chinese hamster ovary cell line transcriptome by next-generation sequencing Journal of Biotechnology,156:(3): 227-235.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2375645
Barzantny, H.; Brune, I.; Tauch, A. (2011): Molecular basis of human body odour formation: insights deduced from corynebacterial genome sequences International Journal of Cosmetic Science,34:(1): 2-11.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326445
Schneider, J.; Blom, J.; Jaenicke, S.; Linke, B.; Brinkrolf, K.; Neuweger, H.; Tauch, A.; Goesmann, A. (2011): RAPYD - Rapid Annotation Platform for Yeast Data Journal of Biotechnology,155:(1): 118-126.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326518
Szczepanowski, R.; Eikmeyer, F. G.; Harfmann, J.; Blom, J.; Rogers, L. M.; Top, E. M.; Schlüter, A. (2011): Sequencing and comparative analysis of IncP-1 alpha antibiotic resistance plasmids reveal a highly conserved backbone and differences within accessory regions Journal of Biotechnology,155:(1): 95-103.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2454721
Cerdeira, L. T.; Cruz Schneider, M. P.; Pinto, A. C.; de Almeida, S. S.; dos Santos, A. R.; Vieira Barbosa, E. G.; Ali, A.; Aburjaile, F. F.; Carvalho de Abreu, V. A.; Guimaraes, L. C.; Soares, S. de C.; Dorella, F. A.; Rocha, F. S.; Bol, E.; Caracciolo Gomes de Sa, P. H.; Lopes, T. S.; Barbosa, M. S.; Carneiro, A. R.; Juca Ramos, R. T.; da Rocha Coimbra, N. A.; Jeronimo Lima, A. R.; Barh, D.; Jain, N.; Tiwari, S.; Raja, R.; Zambare, V.; Ghosh, P.; Trost, E.; Tauch, A.; Miyoshi, A.; Azevedo, V.; Silva, A. (2011): Complete Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis Strain CIP 52.97, Isolated from a Horse in Kenya Journal of Bacteriology,193:(24): 7025-7026.
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2011 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2453768
Becker, J.; Timmermann, C.; Jakobi, T.; Rupp, O.; Szczepanowski, R.; Hackl, M.; Goesmann, A.; Tauch, A.; Borth, N.; Grillari, J.; Pühler, A.; Noll, T.; Brinkrolf, K. (2011): Next-generation sequencing of the CHO cell transcriptome, In: Hansjörg Hauser (Hrsg.), BMC Proceedings,5:(Suppl. 8): P6.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2404874
Schatschneider, S.; Vorhölter, F. - J.; Rückert, C.; Becker, A.; Eisenreich, W.; Pühler, A.; Niehaus, K. (2011): Genome-enabled determination of amino acid biosynthesis in Xanthomonas campestris pv. campestris and identification of biosynthetic pathways for alanine, glycine, and isoleucine by 13C-isotopologue profiling Molecular Genetics and Genomics,286:(3-4): 247-259.
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2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2447751
Jaenicke, S.; Zakrzewski, M.; Jünemann, S.; Pühler, A.; Goesmann, A.; Schlüter, A. (2011): Analysis of the Metagenome from a Biogas-Producing Microbial Community by Means of Bioinformatics Methods. In: Frans J. de Bruijn (Hrsg.): Handbook of Molecular Microbial Ecology II: Metagenomics in Different Habitats. Wiley-Blackwell. S. 403-414.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2289952
Blom, J.; Jakobi, T.; Doppmeier, D.; Jaenicke, S.; Kalinowski, J.; Stoye, J.; Goesmann, A. (2011): Exact and complete short-read alignment to microbial genomes using Graphics Processing Unit programming Bioinformatics,27:(10): 1351-1358.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2289971
Ruiz, J. C.; D'Afonseca, V.; Silva, A.; Ali, A.; Pinto, A. C.; Santos, A. R.; Rocha, A. A. M. C.; Lopes, D. O.; Dorella, F. A.; Pacheco, L. G. C.; Costa, M. P.; Turk, M. Z.; Seyffert, N.; Moraes, P. M. R. O.; Soares, S. C.; Almeida, S. S.; Castro, T. L. P.; Abreu, V. A. C.; Trost, E.; Baumbach, J.; Tauch, A.; Schneider, M. P. C.; McCulloch, J.; Cerdeira, L. T.; Ramos, R. T. J.; Zerlotini, A.; Dominitini, A.; Resende, D. M.; Coser, E. M.; Oliveira, L. M.; Pedrosa, A. L.; Vieira, C. U.; Guimaraes, C. T.; Bartholomeu, D. C.; Oliveira, D. M.; Santos, F. R.; Rabelo, E. M.; Lobo, F. P.; Franco, G. R.; Costa, A. F.; Castro, I. M.; Costa Dias, S. R.; Ferro, J. A.; Ortega, J. M.; Paiva, L. V.; Goulart, L. R.; Almeida, J. F.; Ferro, M. I. T.; Carneiro, N. P.; Falcao, P. R. K.; Grynberg, P.; Teixeira, S. M. R.; Brommonschenkel, S.; Oliveira, S. C.; Meyer, R.; Moore, R. J.; Miyoshi, A.; Oliveira, G. C.; Azevedo, V. (2011): Evidence for Reductive Genome Evolution and Lateral Acquisition of Virulence Functions in Two Corynebacterium pseudotuberculosis Strains PLoS ONE,6:(4):e18551
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2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2323705 OA
Langenkämper, D.; Kölling, J.; Abouna, S.; Khan, M.; Niehaus, K.; Nattkemper, T. W. (2011): TICAL - a web-tool for multivariate image clustering and data topology preserving visualization.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2411181
Cerdeira, L. T.; Pinto, A. C.; Schneider, M. P. C.; de Almeida, S. S.; Dos Santos, A. R.; Barbosa, E. G. V.; Ali, A.; Barbosa, M. S.; Carneiro, A. R.; Ramos, R. T. J.; de Oliveira, R. S.; Barh, D.; Barve, N.; Zambare, V.; Belchior, S. E.; Guimaraes, L. C.; de Castro Soares, S.; Dorella, F. A.; Rocha, F. S.; de Abreu, V. A. C.; Tauch, A.; Trost, E.; Miyoshi, A.; Azevedo, V.; Silva, A. (2011): Whole-Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis PAT10 Strain Isolated from Sheep in Patagonia, Argentina Journal of Bacteriology,193:(22): 6420-6421.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Im Druck | PUB-ID: 2017892
Schneiker-Bekel, S.; Wibberg, D.; Bekel, T.; Blom, J.; Linke, B.; Neuweger, H.; Stiens, M.; Vorhölter, F. - J.; Weidner, S.; Goesmann, A.; Pühler, A.; Schlüter, A. (In Press): The complete genome sequence of the dominant Sinorhizobium meliloti field isolate SM11 extends the S. meliloti pan-genome Journal of Biotechnology,155:(1): 20-33.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2003276
Jaenicke, S.; Ander, C.; Bekel, T.; Bisdorf, R.; Dröge, M.; Gartemann, K. - H.; Jünemann, S.; Kaiser, O.; Krause, L.; Tille, F.; Zakrzewski, M.; Pühler, A.; Schlüter, A.; Goesmann, A. (2011): Comparative and Joint Analysis of Two Metagenomic Datasets from a Biogas Fermenter Obtained by 454-Pyrosequencing PLoS ONE,6:(1): e14519.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2087955
Hackl, M.; Jakobi, T.; Blom, J.; Doppmeier, D.; Brinkrolf, K.; Szczepanowski, R.; Bernhart, S. H.; Höner zu Siederdissen, C.; Bort, J. A. H.; Wieser, M.; Kunert, R.; Jeffs, S.; Hofacker, I. L.; Goesmann, A.; Pühler, A.; Borth, N.; Grillari, J. (2011): Next-generation sequencing of the Chinese hamster ovary microRNA transcriptome: Identification, annotation and profiling of microRNAs as targets for cellular engineering Journal of Biotechnology,153:(1-2): 62-75.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1968054
Silva, A.; Schneider, M. P. C.; Cerdeira, L.; Barbosa, M. S.; Ramos, R. T. J.; Carneiro, A. R.; Santos, R.; Lima, M.; D'Afonseca, V.; Almeida, S. S.; Santos, A. R.; Soares, S. C.; Pinto, A. C.; Ali, A.; Dorella, F. A.; Rocha, F.; Carvalho de Abreu, V. A.; Trost, E.; Tauch, A.; Shpigel, N.; Miyoshi, A.; Azevedo, V. (2011): Complete Genome Sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis I19, a Strain Isolated from a Cow in Israel with Bovine Mastitis Journal of Bacteriology,193:(1): 323-324.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2003180
Brune, I.; Barzantny, H.; Kloetzel, M.; Jones, J.; James, G.; Tauch, A. (2011): Identification of McbR as transcription regulator of aecD and genes involved in methionine and cysteine biosynthesis in Corynebacterium jeikeium K411 Journal of Biotechnology,151:(1): 22-29.
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1929692
Schneider, J.; Vorhölter, F. - J.; Trost, E.; Blom, J.; Musa, Y. R.; Neuweger, H.; Niehaus, K.; Schatschneider, S.; Tauch, A.; Goesmann, A. (2010): CARMEN - Comparative Analysis and in silico Reconstruction of organism-specific MEtabolic Networks Genetics and Molecular Research,9:(3): 1660-1672.
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