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137 Publikationen

2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606822
Choudhuri, J.V., Schleiermacher, C., Kurtz, S., Giegerich, R.: GenAlyzer: interactive visualization of sequence similarities between entire genomes. BIOINFORMATICS. 20, 1964-1965 (2004).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1607394 OA
Krüger, J., Sczyrba, A., Kurtz, S., Giegerich, R.: e2g: an interactive web-based server for efficiently mapping large EST and cDNA sets to genomic sequences. NUCLEIC ACIDS RESEARCH. 32, W301-W304 (2004).
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1607419
Voss, B., Meyer, C., Giegerich, R.: Evaluating the predictability of conformational switching in RNA. Bioinformatics. 20, 1573-1582 (2004).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1607656
Giegerich, R., Meyer, C., Steffen, P.: A discipline of dynamic programming over sequence data. SCIENCE OF COMPUTER PROGRAMMING. 51, 215-263 (2004).
PUB | DOI | WoS
 
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606393 OA
Giegerich, R., Voss, B., Rehmsmeier, M.: Abstract shapes of RNA. Nucleic Acids Research. 32, 4843-4851 (2004).
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773758 OA
Reeder, J., Giegerich, R.: Design, implementation and evaluation of a practical pseudoknot folding algorithm based on thermodynamics. BMC Bioinformatics. 5, 104 (2004).
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773747 OA
Gardner, P.P., Giegerich, R.: A comprehensive comparison of comparative RNA structure prediction approaches. BMC Bioinformatics. 5, 140 (2004).
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1600293
Höchsmann, M., Voss, B., Giegerich, R.: Pure multiple RNA secondary structure alignments: A progressive profile approach. IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATIOCS. 1, 53-62 (2004).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383602
Dress, A., Giegerich, R., Grünewald, S., Wagner, H.: Fibonacci-Cayley-numbers and Repetition Pattern in Genomic DNA. Annals of Combinatorics. 259-279 (2003).
PUB
 
2003 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2303583 OA
Evers, D.J.: RNA folding via algebraic dynamic programming. Bielefeld University, Bielefeld (Germany) (2003).
PUB | PDF
 
2003 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2304461 OA
Choudhuri, J.V.: Bioinformatics approaches to large scale genome comparison, including the identification of conserved noncoding regions. Bielefeld University, Bielefeld (Germany) (2003).
PUB | PDF
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1918949
Giegerich, R., Stoye, J.: Finden, fast ohne zu suchen: Indexstrukturen in der Bioinformatik. Forschung an der Universität Bielefeld. 26, 63-68 (2003).
PUB
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1610397 OA
Giegerich, R., Kurtz, S., Stoye, J.: Efficient implementation of lazy suffix trees. SOFTWARE-PRACTICE & EXPERIENCE. 33, 1035-1049 (2003).
PUB | PDF | DOI | WoS
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773844 OA
Sczyrba, A., Krüger, J., Mersch, H., Kurtz, S., Giegerich, R.: RNA-related tools on the Bielefeld Bioinformatics Server. Nucleic Acids Research. 31, 3767-3770 (2003).
PUB | Dateien verfügbar | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773880 OA
Meyer, F., Goesmann, A., McHardy, A.C., Bartels, D., Bekel, T., Clausen, J., Kalinowski, J., Linke, B., Rupp, O., Giegerich, R., Pühler, A.: GenDB - an open source genome annotation system for prokaryote genomes. Nucleic Acids Research. 31, 2187-2195 (2003).
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1666680
Höchsmann, M., Töller, T., Giegerich, R., Kurtz, S.: Local similarity in RNA secondary structures. Proc IEEE Comput Soc Bioinform Conf. 2, (2003).
PUB | PubMed | Europe PMC
 
2002 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2305597 OA
Krause, A.: Large scale clustering of protein sequences. Bielefeld University, Bielefeld (Germany) (2002).
PUB | Datei
 
2002 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383608
Giegerich, R., Meyer, C.: Algebraic Dynamic Programming. Algebraic Methodology and Software Technology. p. 349-364. Springer (2002).
PUB
 
2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1614870
Meyer, C., Giegerich, R.: Matching and significance evaluation of combined sequence-structure motifs in RNA. ZEITSCHRIFT FÜR PHYSIKALISCHE CHEMIE-INTERNATIONAL JOURNAL OF RESEARCH IN PHYSICAL CHEMISTRY & CHEMICAL PHYSICS. 216, 193-216 (2002).
PUB | DOI | WoS
 
2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1615366
Goesmann, A., Haubrock, M., Meyer, F., Kalinowski, J., Giegerich, R.: PathFinder: reconstruction and dynamic visualization of metabolic pathways. BIOINFORMATICS. 18, 124-129 (2002).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 

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