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138 Publikationen

2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606377
Rehmsmeier M, Steffen P, Höchsmann M, Giegerich R (2004)
Fast and effective prediction of microRNA/target duplexes.
RNA-A PUBLICATION OF THE RNA SOCIETY 10(10): 1507-1517.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606822
Choudhuri JV, Schleiermacher C, Kurtz S, Giegerich R (2004)
GenAlyzer: interactive visualization of sequence similarities between entire genomes.
BIOINFORMATICS 20(12): 1964-1965.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1607394 OA
Krüger J, Sczyrba A, Kurtz S, Giegerich R (2004)
e2g: an interactive web-based server for efficiently mapping large EST and cDNA sets to genomic sequences.
NUCLEIC ACIDS RESEARCH 32(Web Server): W301-W304.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1607419
Voss B, Meyer C, Giegerich R (2004)
Evaluating the predictability of conformational switching in RNA.
Bioinformatics 20(10): 1573-1582.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1607656
Giegerich R, Meyer C, Steffen P (2004)
A discipline of dynamic programming over sequence data.
SCIENCE OF COMPUTER PROGRAMMING 51(3): 215-263.
PUB | DOI | WoS
 
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606393 OA
Giegerich R, Voss B, Rehmsmeier M (2004)
Abstract shapes of RNA.
Nucleic Acids Research 32(16): 4843-4851.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773758 OA
Reeder J, Giegerich R (2004)
Design, implementation and evaluation of a practical pseudoknot folding algorithm based on thermodynamics.
BMC Bioinformatics 5(1): 104.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773747 OA
Gardner PP, Giegerich R (2004)
A comprehensive comparison of comparative RNA structure prediction approaches.
BMC Bioinformatics 5(1): 140.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1600293
Höchsmann M, Voss B, Giegerich R (2004)
Pure multiple RNA secondary structure alignments: A progressive profile approach.
IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATIOCS 1(1): 53-62.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383602
Dress A, Giegerich R, Grünewald S, Wagner H (2003)
Fibonacci-Cayley-numbers and Repetition Pattern in Genomic DNA.
Annals of Combinatorics: 259-279.
PUB
 
2003 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2303583 OA
Evers DJ (2003)
RNA folding via algebraic dynamic programming.
Bielefeld (Germany): Bielefeld University.
PUB | PDF
 
2003 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2304461 OA
Choudhuri JV (2003)
Bioinformatics approaches to large scale genome comparison, including the identification of conserved noncoding regions.
Bielefeld (Germany): Bielefeld University.
PUB | PDF
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1918949
Giegerich R, Stoye J (2003)
Finden, fast ohne zu suchen: Indexstrukturen in der Bioinformatik.
Forschung an der Universität Bielefeld 26: 63-68.
PUB
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1610397 OA
Giegerich R, Kurtz S, Stoye J (2003)
Efficient implementation of lazy suffix trees.
SOFTWARE-PRACTICE & EXPERIENCE 33(11): 1035-1049.
PUB | PDF | DOI | WoS
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773844 OA
Sczyrba A, Krüger J, Mersch H, Kurtz S, Giegerich R (2003)
RNA-related tools on the Bielefeld Bioinformatics Server.
Nucleic Acids Research 31(13): 3767-3770.
PUB | Dateien verfügbar | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773880 OA
Meyer F, Goesmann A, McHardy AC, Bartels D, Bekel T, Clausen J, Kalinowski J, Linke B, Rupp O, Giegerich R, Pühler A (2003)
GenDB - an open source genome annotation system for prokaryote genomes.
Nucleic Acids Research 31(8): 2187-2195.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1666680
Höchsmann M, Töller T, Giegerich R, Kurtz S (2003)
Local similarity in RNA secondary structures.
Proc IEEE Comput Soc Bioinform Conf 2.
PUB | PubMed | Europe PMC
 
2002 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2305597 OA
Krause A (2002)
Large scale clustering of protein sequences.
Bielefeld (Germany): Bielefeld University.
PUB | Datei
 
2002 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383608
Giegerich R, Meyer C (2002)
Algebraic Dynamic Programming.
In: Algebraic Methodology and Software Technology. Springer: 349-364.
PUB
 
2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1614870
Meyer C, Giegerich R (2002)
Matching and significance evaluation of combined sequence-structure motifs in RNA.
ZEITSCHRIFT FÜR PHYSIKALISCHE CHEMIE-INTERNATIONAL JOURNAL OF RESEARCH IN PHYSICAL CHEMISTRY & CHEMICAL PHYSICS 216(2/2002): 193-216.
PUB | DOI | WoS
 

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