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138 Publikationen

2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383518
Reeder J, Giegerich R (2006)
A graphical programming system for molecular motif search.
In: Proceedings of the 5th International Conference on Generative Programming and Component Engineering. ACM Press: 131-140.
PUB
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1946336
Höchsmann T, Höchsmann M, Giegerich R (2006)
Thermodynamic matchers: strengthening the significance of RNA folding energies.
Comput Syst Bioinformatics Conf.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773864 OA
Beckstette M, Homann R, Giegerich R, Kurtz S (2006)
Fast index based algorithms and software for matching position specific scoring matrices.
BMC Bioinformatics 7(1): 389.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773871 OA
Seibel PN, Krüger J, Hartmeier S, Schwarzer K, Löwenthal K, Mersch H, Dandekar T, Giegerich R (2006)
XML schemas for common bioinformatic data types and their application in workflow systems.
BMC Bioinformatics 7(1): 490.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1600726
Malde K, Giegerich R (2006)
Calculating PSSM probabilities with lazy dynamic programming.
Jornal of Functional Programming 16(01): 75-81.
PUB | DOI | WoS
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773640 OA
Steffen P, Giegerich R (2006)
Correction: Versatile and declarative dynamic programming using pair algebras.
BMC Bioinformatics 7(1): 214.
PUB | PDF | DOI | WoS
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1597805
Steffen P, Giegerich R (2006)
Table design in dynamic programming.
INFORMATION AND COMPUTATION 204(9): 1325-1345.
PUB | DOI | WoS
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1600421
Steffen P, Voss B, Rehmsmeier M, Reeder J, Giegerich R (2006)
RNAshapes: an integrated RNA analysis package based on abstract shapes.
Bioinformatics 22(4): 500-503.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773637 OA
Voß B, Giegerich R, Rehmsmeier M (2006)
Complete probabilistic analysis of RNA shapes.
BMC Biology 4(1): 5.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1598807
Reeder J, Höchsmann M, Rehmsmeier M, Voss B, Giegerich R (2006)
Beyond Mfold: recent advances in RNA bioinformatics.
JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY 124(1): 41-55.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1602431
Reeder J, Giegerich R (2005)
Consensus shapes: an alternative to the Sankoff algorithm for RNA consensus structure prediction.
BIOINFORMATICS 21(17): 3516-3523.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773595 OA
Reeder J, Steffen P, Giegerich R (2005)
Effective ambiguity checking in biosequence analysis.
BMC Bioinformatics 6(1): 153.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773598 OA
Steffen P, Giegerich R (2005)
Versatile and declarative dynamic programming using pair algebras.
BMC Bioinformatics 6(1): 224.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773613 OA
Sczyrba A, Beckstette M, Brivanlou AH, Giegerich R, Altmann CR (2005)
XenDB: Full length cDNA prediction and cross species mapping in Xenopus laevis.
BMC Genomics 6(1): 123.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2004 | Bielefelder Masterarbeit | PUB-ID: 2306150 OA
Mersch H (2004)
BiBiWS : ein Framework für die Entwicklung asynchroner WebServices auf dem BiBiServ.
Bielefeld (Germany): Bielefeld University.
PUB | PDF
 
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383529
Beckstette M, Mailänder JT, Marhöfer RJ, Sczyrba A, Ohlebusch E, Giegerich R, Selzer PM (2004)
Genlight: Interactive high-throughput sequence analysis and comparative genomics.
Journal of Integrative Bioinformatics 1(1): 0008.
PUB | DOI
 
2004 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383543
Beckstette M, Strothmann D, Homann R, Giegerich R, Kurtz S (2004)
PoSSuMsearch: Fast and Sensitive Matching of Position Specific Scoring Matrices using Enhanced Suffix Arrays.
In: Proceedings of the German Conference on Bioinformatics. Lecture Notes in Informatics: GI: 53-64.
PUB
 
2004 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2304811 OA
Voß B (2004)
Advanced tools for RNA secondary structure analysis.
Bielefeld (Germany): Bielefeld University.
PUB | PDF
 
2004 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383561
Sczyrba A, Beckstette M, Giegerich R, Altman C (2004)
Identification of 10,500 Xenopus laevis Full Length Clones through EST Clustering and Sequence Analysis.
In: Proceedings of the German Conference on Bioinformatics. Lecture Notes in Informatics: GI.
PUB
 
2004 | Konferenzband | Veröffentlicht | PUB-ID: 1918823
Giegerich R, Stoye J (Eds) (2004)
Proceedings of the German Conference on Bioinformatics, GCB 2004.
Lecture Notes in Informatics P-53.
PUB
 

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