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137 Publikationen

2002 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1612812
Giegerich, R., Steffen, P.: Implementing algebraic dynamic programming in the functional and the imperative programming paradigm. MATHEMATICS OF PROGRAM CONSTRUCTION. Lecture Notes in Computer Science. 2386, p. 1-20. SPRINGER-VERLAG BERLIN (2002).
PUB | WoS
 
2001 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2301495 OA
Schleiermacher, C.: Algorithmic support for PCR and genome-wide repeat analysis. Bielefeld University, Bielefeld (Germany) (2001).
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2001 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2301661 OA
Lorenz, D.: Generische Ansätze zur Entwicklung hypermedialer biochemischer Lernlaborsysteme. Bielefeld University, Bielefeld (Germany) (2001).
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2001 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2306041 OA
Meyer, F.: GENDB : a second generation genome annotation system. Bielefeld University, Bielefeld (Germany) (2001).
PUB | PDF
 
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383615
Evers, D., Giegerich, R.: Reducing the Conformation Space in RNA Structure Prediction. Proceedings of the German Conference on Bioinformatics. p. 118-124. (2001).
PUB
 
2001 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2302701 OA
Hildebrand, M.: Modellierung von Klassen biologischer Makromoleküle mittels stochastischer Grammatiken mit kontextsensitiven Elementen. Bielefeld University, Bielefeld (Germany) (2001).
PUB | Datei
 
2001 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2304844 OA
Büschking, C.: Incorporation of structural information in RNA sequence alignment. Bielefeld University, Bielefeld (Germany) (2001).
PUB | Dateien verfügbar
 
2001 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1615460
Fuellen, G., Wägele, J.W., Giegerich, R.: Best systematist practice transferred to molecular data. ORGANISMS DIVERSITY & EVOLUTION. 1, 257-272 (2001).
PUB | DOI | WoS
 
2001 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1615572
Fuellen, G., Wägele, J.W., Giegerich, R.: Minimum conflict: a divide-and-conquer approach to phylogeny estimation. BIOINFORMATICS. 17, 1168-1178 (2001).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2001 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773335 OA
Kurtz, S., Choudhuri, J.V., Ohlebusch, E., Schleiermacher, C., Stoye, J., Giegerich, R.: REPuter: the manifold applications of repeat analysis on a genomic scale. Nucleic Acids Research. 29, 4633-4642 (2001).
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2000 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383618
Giegerich, R., Evers, D.: Bioinformatik: Jäger, Sammler und Forscher im Daten-Dschungel der Molekularbiologie. BIOforum. 1-2, 30-32 (2000).
PUB
 
2000 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2301734 OA
Füllen, G.: Computing phylogenies by comparing biosequences following principles of traditional systematics. Bielefeld University, Bielefeld (Germany) (2000).
PUB | Dateien verfügbar
 
2000 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1618572
Giegerich, R.: Explaining and controlling ambiguity in dynamic programming. In: Giancarlo, R. and Sankoff, D. (eds.) Combinatorial Pattern Matching. 11th Annual Symposium CPM 2000, Proceedings. Lecture Notes in Computer Science. 1848, p. 46-59. Springer, Berlin (2000).
PUB | WoS
 
2000 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1618574
Giegerich, R.: A systematic approach to dynamic programming in bioinformatics. BIOINFORMATICS. 16, 665-677 (2000).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2000 | Report | PUB-ID: 1970490 OA
Stoye, J.: Affix Trees. Forschungsberichte. Technische Fakultät der Universität Bielefeld (2000).
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2000 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773341 OA
Reinert, K., Stoye, J., Will, T.: An iterative method for faster sum-of-pairs multiple sequence alignment. Bioinformatics. 16, 808-814 (2000).
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2000 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1918988
Kurtz, S., Ohlebusch, E., Schleiermacher, C., Stoye, J., Giegerich, R.: Computation and Visualization of Degenerate Repeats in Complete Genomes. Proc. of ISMB 2000. p. 228-238. (2000).
PUB | PubMed | Europe PMC
 
1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1947682
Giegerich, R., Haase, D., Rehmsmeier, M.: Prediction and visualization of structural switches in RNA. Pac Symp Biocomput. (1999).
PUB | PubMed | Europe PMC
 
1999 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1620435
Giegerich, R., Kurtz, S., Stoye, J.: Efficient implementation of lazy suffix trees. Algorithm Engineering. 3rd International Workshop, WAE’99 London, UK, July 19–21, 1999 Proceedings. LNCS. 1668, p. 30-42. (1999).
PUB | DOI | WoS
 
1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1623374
Evers, D.J., Giegerich, R.: RNA movies: visualizing RNA secondary structure spaces. BIOINFORMATICS. 15, 32-37 (1999).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
1999 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1918978
Reinert, K., Will, T., Stoye, J.: Combining Divide-and-Conquer, the A*-Algorithm, and Successive Realignment Approaches to Speed up Multiple Sequence Alignment. Proc. of GCB 1999. p. 17-24. (1999).
PUB | Download (ext.)
 
1998 | Konferenzbeitrag | PUB-ID: 1883741
Lorenz, D., Giegerich, R.: ViSeL: An interactive Virtual Laboratory for DNA Sequencing. Tagungsband zum Workshop "Multimedia-Systeme" im Rahmen der GI-Jahrestagung 1998. p. 53-65. Magdeburg (1998).
PUB
 
1998 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1625402 OA
Stoye, J., Evers, D., Meyer, F.: Rose: generating sequence families. BIOINFORMATICS. 14, 157-163 (1998).
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
1997 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383634
Fuellen, G., Giegerich, R.: International, interdisziplinär und interaaktiv: Der VSNS-Kurs über BioComputing. Proceedings: Virtueller Campus. p. 77-89. (1997).
PUB
 
1997 | Report | PUB-ID: 1970517
Stoye, J., Evers, D., Meyer, F.: Rose: Generating Sequence Families. Forschungsberichte. Technische Fakultät der Universität Bielefeld (1997).
PUB
 
1997 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1627522
Giegerich, R., Kurtz, S.: From Ukkonen to McCreight and Weiner: A unifying view of linear-time suffix tree construction. ALGORITHMICA. 19, 331-353 (1997).
PUB | DOI | WoS
 
1997 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1667885
Stoye, J., Evers, D., Meyer, F.: Generating benchmarks for multiple sequence alignments and phylogenetic reconstructions. Proc. of ISMB 1997. p. 303-306. (1997).
PUB | PubMed | Europe PMC
 
1997 | Report | PUB-ID: 1970532
Stoye, J.: Divide-and-Conquer Multiple Sequence Alignment. Forschungsberichte. Technische Fakultät der Universität Bielefeld (1997).
PUB
 
1996 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1639486
Grüner, W., Giegerich, R., Strothmann, D., Reidys, C., Weber, J., Hofacker, I.L., Stadler, P., Schuster, P.: Analysis of RNA sequence structure maps by exhaustive enumeration .2. structures of neutral networks and shape space covering. Monatshefte für Chemie. 127, 375-389 (1996).
PUB | DOI | WoS
 
1996 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1639477
Grüner, W., Giegerich, R., Strothmann, D., Reidys, C., Weber, J., Hofacker, I.L., Stadler, P., Schuster, P.: Analysis of RNA sequence structure maps by exhaustive enumeration .1. Neutral networks. Monatshefte für Chemie. 127, 355-374 (1996).
PUB | DOI | WoS
 
1996 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1947921
Giegerich, R., Meyer, F., Schleiermacher, C.: GeneFisher--software support for the detection of postulated genes. Proc Int Conf Intell Syst Mol Biol. 4, (1996).
PUB | PubMed | Europe PMC
 
1995 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1628987
Giegerich, R., Kurtz, S.: A comparison of imperative and purely functional suffix tree constructions. SCIENCE OF COMPUTER PROGRAMMING. 25, 187-218 (1995).
PUB | DOI | WoS
 
1995 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1639513
Bütow, B., Giegerich, R., Ohlebusch, E., Thesing, S.: A new calculus for semantic matching. In: Hermenegildo, M. and Swierstra, S.D. (eds.) Programming languages: implementations, logics and programs. 7th international symposium ; proceedings. Lecture Notes in Computer Science. 982, p. 81-96. Springer, Berlin (1995).
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1992 | Report | PUB-ID: 2383632
Giegerich, R.: Embedding Sequence Analysis in the Functional Programming Paradigm - A Feasability Study. Report No. 8. Technische Fakultät, Universität Bielefeld (1992).
PUB
 
1991 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383627
Giegerich, R., Ohlebusch, E.: An Implicit Representation of Infinite Sequences of Terms. Bulletin of the EATCS. 43, 174-182 (1991).
PUB
 
1990 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1651134
Giegerich, R.: CODE SELECTION BY INVERSION OF ORDER-SORTED DERIVORS. THEORETICAL COMPUTER SCIENCE. 73, 177-211 (1990).
PUB | DOI | WoS
 
1990 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1651466
Giegerich, R.: ON THE STRUCTURE OF VERIFIABLE CODE GENERATOR SPECIFICATIONS. SIGPLAN NOTICES. 25, 1-8 (1990).
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