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138 Publikationen

2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1615366
Goesmann A, Haubrock M, Meyer F, Kalinowski J, Giegerich R (2002)
PathFinder: reconstruction and dynamic visualization of metabolic pathways.
BIOINFORMATICS 18(1): 124-129.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2002 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1612812
Giegerich R, Steffen P (2002)
Implementing algebraic dynamic programming in the functional and the imperative programming paradigm.
In: MATHEMATICS OF PROGRAM CONSTRUCTION. Lecture Notes in Computer Science, 2386. SPRINGER-VERLAG BERLIN: 1-20.
PUB | WoS
 
2001 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2301661 OA
Lorenz D (2001)
Generische Ansätze zur Entwicklung hypermedialer biochemischer Lernlaborsysteme.
Bielefeld (Germany): Bielefeld University.
PUB | Datei
 
2001 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2301495 OA
Schleiermacher C (2001)
Algorithmic support for PCR and genome-wide repeat analysis.
Bielefeld (Germany): Bielefeld University.
PUB | Datei
 
2001 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2306041 OA
Meyer F (2001)
GENDB : a second generation genome annotation system.
Bielefeld (Germany): Bielefeld University.
PUB | PDF
 
2001 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2302701 OA
Hildebrand M (2001)
Modellierung von Klassen biologischer Makromoleküle mittels stochastischer Grammatiken mit kontextsensitiven Elementen.
Bielefeld (Germany): Bielefeld University.
PUB | Datei
 
2001 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2304844 OA
Büschking C (2001)
Incorporation of structural information in RNA sequence alignment.
Bielefeld (Germany): Bielefeld University.
PUB | Dateien verfügbar
 
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383615
Evers D, Giegerich R (2001)
Reducing the Conformation Space in RNA Structure Prediction.
In: Proceedings of the German Conference on Bioinformatics. 118-124.
PUB
 
2001 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1615460
Fuellen G, Wägele JW, Giegerich R (2001)
Best systematist practice transferred to molecular data.
ORGANISMS DIVERSITY & EVOLUTION 1(4): 257-272.
PUB | DOI | WoS
 
2001 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1615572
Fuellen G, Wägele JW, Giegerich R (2001)
Minimum conflict: a divide-and-conquer approach to phylogeny estimation.
BIOINFORMATICS 17(12): 1168-1178.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2001 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773335 OA
Kurtz S, Choudhuri JV, Ohlebusch E, Schleiermacher C, Stoye J, Giegerich R (2001)
REPuter: the manifold applications of repeat analysis on a genomic scale.
Nucleic Acids Research 29(22): 4633-4642.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2000 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2301734 OA
Füllen G (2000)
Computing phylogenies by comparing biosequences following principles of traditional systematics.
Bielefeld (Germany): Bielefeld University.
PUB | Dateien verfügbar
 
2000 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383618
Giegerich R, Evers D (2000)
Bioinformatik: Jäger, Sammler und Forscher im Daten-Dschungel der Molekularbiologie.
BIOforum 1-2: 30-32.
PUB
 
2000 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1618572
Giegerich R (2000)
Explaining and controlling ambiguity in dynamic programming.
In: Combinatorial Pattern Matching. 11th Annual Symposium CPM 2000, Proceedings. Giancarlo R, Sankoff D (Eds); Lecture Notes in Computer Science, 1848. Berlin: Springer: 46-59.
PUB | WoS
 
2000 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1618574
Giegerich R (2000)
A systematic approach to dynamic programming in bioinformatics.
BIOINFORMATICS 16(8): 665-677.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2000 | Report | PUB-ID: 1970490 OA
Stoye J (2000)
Affix Trees. Forschungsberichte.
Technische Fakultät der Universität Bielefeld.
PUB | PDF
 
2000 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773341 OA
Reinert K, Stoye J, Will T (2000)
An iterative method for faster sum-of-pairs multiple sequence alignment.
Bioinformatics 16(9): 808-814.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2000 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1918988
Kurtz S, Ohlebusch E, Schleiermacher C, Stoye J, Giegerich R (2000)
Computation and Visualization of Degenerate Repeats in Complete Genomes.
In: Proc. of ISMB 2000. 228-238.
PUB | PubMed | Europe PMC
 
1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1947682
Giegerich R, Haase D, Rehmsmeier M (1999)
Prediction and visualization of structural switches in RNA.
Pac Symp Biocomput.
PUB | PubMed | Europe PMC
 
1999 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1620435
Giegerich R, Kurtz S, Stoye J (1999)
Efficient implementation of lazy suffix trees.
In: Algorithm Engineering. 3rd International Workshop, WAE’99 London, UK, July 19–21, 1999 Proceedings. LNCS, 1668. 30-42.
PUB | DOI | WoS
 
1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1623374
Evers DJ, Giegerich R (1999)
RNA movies: visualizing RNA secondary structure spaces.
BIOINFORMATICS 15(1): 32-37.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
1999 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1918978
Reinert K, Will T, Stoye J (1999)
Combining Divide-and-Conquer, the A*-Algorithm, and Successive Realignment Approaches to Speed up Multiple Sequence Alignment.
In: Proc. of GCB 1999. 17-24.
PUB | Download (ext.)
 
1998 | Konferenzbeitrag | PUB-ID: 1883741
Lorenz D, Giegerich R (1998)
ViSeL: An interactive Virtual Laboratory for DNA Sequencing.
In: Tagungsband zum Workshop "Multimedia-Systeme" im Rahmen der GI-Jahrestagung 1998. Magdeburg: 53-65.
PUB
 
1998 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1625402 OA
Stoye J, Evers D, Meyer F (1998)
Rose: generating sequence families.
BIOINFORMATICS 14(2): 157-163.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
1997 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383634
Fuellen G, Giegerich R (1997)
International, interdisziplinär und interaaktiv: Der VSNS-Kurs über BioComputing.
In: Proceedings: Virtueller Campus. 77-89.
PUB
 
1997 | Report | PUB-ID: 1970517
Stoye J, Evers D, Meyer F (1997)
Rose: Generating Sequence Families. Forschungsberichte.
Technische Fakultät der Universität Bielefeld.
PUB
 
1997 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1627522
Giegerich R, Kurtz S (1997)
From Ukkonen to McCreight and Weiner: A unifying view of linear-time suffix tree construction.
ALGORITHMICA 19(3): 331-353.
PUB | DOI | WoS
 
1997 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1667885
Stoye J, Evers D, Meyer F (1997)
Generating benchmarks for multiple sequence alignments and phylogenetic reconstructions.
In: Proc. of ISMB 1997. 303-306.
PUB | PubMed | Europe PMC
 
1997 | Report | PUB-ID: 1970532
Stoye J (1997)
Divide-and-Conquer Multiple Sequence Alignment. Forschungsberichte.
Technische Fakultät der Universität Bielefeld.
PUB
 
1996 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1639486
Grüner W, Giegerich R, Strothmann D, Reidys C, Weber J, Hofacker IL, Stadler P, Schuster P (1996)
Analysis of RNA sequence structure maps by exhaustive enumeration .2. structures of neutral networks and shape space covering.
Monatshefte für Chemie 127(4): 375-389.
PUB | DOI | WoS
 
1996 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1639477
Grüner W, Giegerich R, Strothmann D, Reidys C, Weber J, Hofacker IL, Stadler P, Schuster P (1996)
Analysis of RNA sequence structure maps by exhaustive enumeration .1. Neutral networks.
Monatshefte für Chemie 127(4): 355-374.
PUB | DOI | WoS
 
1996 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1947921
Giegerich R, Meyer F, Schleiermacher C (1996)
GeneFisher--software support for the detection of postulated genes.
Proc Int Conf Intell Syst Mol Biol 4.
PUB | PubMed | Europe PMC
 
1995 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1628987
Giegerich R, Kurtz S (1995)
A comparison of imperative and purely functional suffix tree constructions.
SCIENCE OF COMPUTER PROGRAMMING 25(2-3): 187-218.
PUB | DOI | WoS
 
1995 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1639513
Bütow B, Giegerich R, Ohlebusch E, Thesing S (1995)
A new calculus for semantic matching.
In: Programming languages: implementations, logics and programs. 7th international symposium ; proceedings. Hermenegildo M, Swierstra SD (Eds); Lecture Notes in Computer Science, 982. Berlin: Springer: 81-96.
PUB | WoS
 
1992 | Report | PUB-ID: 2383632
Giegerich R (1992)
Embedding Sequence Analysis in the Functional Programming Paradigm - A Feasability Study. Report No. 8.
Universität Bielefeld: Technische Fakultät.
PUB
 
1991 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383627
Giegerich R, Ohlebusch E (1991)
An Implicit Representation of Infinite Sequences of Terms.
Bulletin of the EATCS 43: 174-182.
PUB
 
1990 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1651134
Giegerich R (1990)
CODE SELECTION BY INVERSION OF ORDER-SORTED DERIVORS.
THEORETICAL COMPUTER SCIENCE 73(2): 177-211.
PUB | DOI | WoS
 
1990 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1651466
Giegerich R (1990)
ON THE STRUCTURE OF VERIFIABLE CODE GENERATOR SPECIFICATIONS.
SIGPLAN NOTICES 25(6): 1-8.
PUB | WoS
 

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