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546 Publikationen

2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2938413 OA
Schaffert, L.; Schneiker-Bekel, S.; Dymek, S.; Droste, J.; Persicke, M.; Busche, T.; Brandt, D.; Pühler, A.; Kalinowski, J. (2019): Essentiality of the Maltase AmlE in Maltose Utilization and Its Transcriptional Regulation by the Repressor AmlR in the Acarbose-Producing Bacterium Actinoplanes sp. SE50/110 Frontiers in Microbiology,10:2448
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2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2939194
Mayer, G.; Quast, C.; Felden, J.; Lange, M.; Prinz, M.; Pühler, A.; Lawerenz, C.; Scholz, U.; Gloeckner, F. O.; Mueller, W.; Marcus, K.; Eisenacher, M. (2019): A generally applicable lightweight method for calculating a value structure for tools and services in bioinformatics infrastructure projects BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS,20:(4): 1215-1221.
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2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2936839 OA
Nelkner, J.; Tejerizo, G. T.; Hassa, J.; Lin, T. W.; Witte, J.; Verwaaijen, B.; Winkler, A.; Bunk, B.; Spröer, C.; Overmann, J.; Grosch, R.; Pühler, A.; Schlüter, A. (2019): Genetic Potential of the Biocontrol Agent Pseudomonas brassicacearum (Formerly P. trivialis) 3Re2-7 Unraveled by Genome Sequencing and Mining, Comparative Genomics and Transcriptomics Genes,10:(8):601
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2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2936439 OA
Schaffert, L.; März, C.; Burkhardt, L.; Droste, J.; Brandt, D.; Busche, T.; Rosen, W.; Schneiker-Bekel, S.; Persicke, M.; Pühler, A.; Kalinowski, J. (2019): Evaluation of vector systems and promoters for overexpression of the acarbose biosynthesis gene acbC in Actinoplanes sp. SE50/110 Microbial Cell Factories,18:114
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2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2935556 OA
Verwaaijen, B.; Wibberg, D.; Winkler, A.; Zrenner, R.; Bednarz, H.; Niehaus, K.; Grosch, R.; Pühler, A.; Schlüter, A. (2019): A comprehensive analysis of the Lactuca sativa, L. transcriptome during different stages of the compatible interaction with Rhizoctonia solani Scientific Reports,9:7221
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2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2935899 OA
López, J. L.; Lozano, M. J.; Lagares, A.; Fabre, M. L.; Draghi, W. O.; Del Papa, M. F.; Pistorio, M.; Becker, A.; Wibberg, D.; Schlüter, A.; Pühler, A.; Blom, J.; Goesmann, A.; Lagares, A. (2019): Codon Usage Heterogeneity in the Multipartite Prokaryote Genome. Selection-Based Coding Bias Associated with Gene Location, Expression Level, and Ancestry mBio,10:(3):e00505-19
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2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2936223 OA
Belmann, P.; Fischer, B.; Krüger, J.; Procházka, M.; Rasche, H.; Prinz, M.; Hanussek, M.; Lang, M.; Bartusch, F.; Gläßle, B.; Krüger, J.; Pühler, A.; Sczyrba, A. (2019): de.NBI Cloud federation through ELIXIR AAI F1000Research,8:842
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2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2935923 OA
Nelkner, J.; Henke, C.; Lin, T. W.; Pätzold, W.; Hassa, J.; Jaenicke, S.; Grosch, R.; Pühler, A.; Sczyrba, A.; Schlüter, A. (2019): Effect of Long-Term Farming Practices on Agricultural Soil Microbiome Members Represented by Metagenomically Assembled Genomes (MAGs) and Their Predicted Plant-Beneficial Genes Genes,10:(6):424
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2019 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2934570
Castellani, L. G.; Nilsson, J. F.; Wibberg, D.; Schlüter, A.; Pühler, A.; Brom, S.; Pistorio, M.; Tejerizo, G. T. (2019): Insight into the structure, function and conjugative transfer of pLPU83a, an accessory plasmid of Rhizobium favelukesii LPU83 Plasmid
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2920160
Arnold, W.; Grotjohann, N.; Pühler, A.; Röllke, K.; Selbitschka, W. (2018): Die CeBiT ec Schülerakademie „Synthetische Biologie/Biotechnologie “– Begabtenförderung in einem zukunftsträchtigen Forschungsfeld ABB-Information. Jahresheft,2017
PUB
 
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2916929
Stolze, Y.; Bremges, A.; Maus, I.; Pühler, A.; Sczyrba, A.; Schlüter, A. (2018): Targeted in situ metatranscriptomics for selected taxa from mesophilic and thermophilic biogas plants Microbial Biotechnology,11:(4): 667-679.
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2920169
Salto, I. P.; Torres Tejerizo, G.; Wibberg, D.; Pühler, A.; Schlüter, A.; Pistorio, M. (2018): Comparative genomic analysis of Acinetobacter spp. plasmids originating from clinical settings and environmental habitats Scientific Reports,8:(1):7783
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2920170
Hassa, J.; Maus, I.; Off, S.; Pühler, A.; Scherer, P.; Klocke, M.; Schlüter, A. (2018): Metagenome, metatranscriptome, and metaproteome approaches unraveled compositions and functional relationships of microbial communities residing in biogas plants Applied Microbiology and Biotechnology,102:(12): 5045-5063.
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2920168
Tomazetto, G.; Hahnke, S.; Wibberg, D.; Pühler, A.; Klocke, M.; Schlüter, A. (2018): Proteiniphilum saccharofermentans str. M3/6 T isolated from a laboratory biogas reactor is versatile in polysaccharide and oligopeptide utilization as deduced from genome-based metabolic reconstructions Biotechnology Reports,18:e00254
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2930510
Alkhateeb, R.; Vorhölter, F. - J.; Steffens, T.; Rückert, C.; Ortseifen, V.; Hublik, G.; Niehaus, K.; Pühler, A. (2018): Comparative transcription profiling of two fermentation cultures of Xanthomonas campestris pv. campestris B100 sampled in the growth and in the stationary phase APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY,102:(15): 6613-6625.
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2920750
Maus, I.; Rumming, M.; Bergmann, I.; Heeg, K.; Pohl, M.; Nettmann, E.; Jaenicke, S.; Blom, J.; Pühler, A.; Schlüter, A.; Sczyrba, A.; Klocke, M. (2018): Characterization of Bathyarchaeota genomes assembled from metagenomes of biofilms residing in mesophilic and thermophilic biogas reactors Biotechnology for Biofuels,11:167
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2920173
Wibberg, D.; Salto, I. P.; Eikmeyer, F. G.; Maus, I.; Winkler, A.; Nordmann, P.; Pühler, A.; Poirel, L.; Schlüter, A. (2018): Complete Genome Sequencing of Acinetobacter baumannii Strain K50 Discloses the Large Conjugative Plasmid pK50a Encoding Carbapenemase OXA-23 and Extended-Spectrum β-Lactamase GES-11 Antimicrobial Agents and Chemotherapy,62:(5):e00212-18
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2917037
Verwaaijen, B.; Wibberg, D.; Nelkner, J.; Gordin, M.; Rupp, O.; Winkler, A.; Bremges, A.; Blom, J.; Grosch, R.; Pühler, A.; Schlüter, A. (2018): Assembly of the Lactuca sativa, L. cv. Tizian draft genome sequence reveals differences within major resistance complex 1 as compared to the cv. Salinas reference genome JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY,267: 12-18.
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2915516 OA
Maus, I.; Bremges, A.; Stolze, Y.; Hahnke, S.; Cibis, K. G.; Koeck, D. E.; Kim, Y. S.; Kreubel, J.; Hassa, J.; Wibberg, D.; Weimann, A.; Off, S.; Stantscheff, R.; Zverlov, V. V.; Schwarz, W. H.; König, H.; Liebl, W.; Scherer, P.; McHardy, A. C.; Sczyrba, A.; Klocke, M.; Pühler, A.; Schlüter, A. (2017): Genomics and prevalence of bacterial and archaeal isolates from biogas-producing microbiomes Biotechnology for Biofuels,10:(1):264
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2913116 OA
Wolf, T.; Droste, J.; Gren, T.; Ortseifen, V.; Schneiker-Bekel, S.; Zemke, T.; Pühler, A.; Kalinowski, J. (2017): The MalR type regulator AcrC is a transcriptional repressor of acarbose biosynthetic genes in Actinoplanes sp. SE50/110 BMC Genomics,18:562
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