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545 Publikationen

2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2938413
Schaffert, L., Schneiker-Bekel, S., Dymek, S., Droste, J., Persicke, M., Busche, T., Brandt, D., Pühler, A., Kalinowski, J.: Essentiality of the Maltase AmlE in Maltose Utilization and Its Transcriptional Regulation by the Repressor AmlR in the Acarbose-Producing Bacterium Actinoplanes sp. SE50/110. Frontiers in Microbiology. 10, : 2448 (2019).
PUB | Dateien verfügbar | DOI | Download (ext.) | EBI - ENA Project
 
2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2936439
Schaffert, L., März, C., Burkhardt, L., Droste, J., Brandt, D., Busche, T., Rosen, W., Schneiker-Bekel, S., Persicke, M., Pühler, A., Kalinowski, J.: Evaluation of vector systems and promoters for overexpression of the acarbose biosynthesis gene acbC in Actinoplanes sp. SE50/110. Microbial Cell Factories. 18, : 114 (2019).
PUB | Dateien verfügbar | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2935899
López, J.L., Lozano, M.J., Lagares, A., Fabre, M.L., Draghi, W.O., Del Papa, M.F., Pistorio, M., Becker, A., Wibberg, D., Schlüter, A., Pühler, A., Blom, J., Goesmann, A., Lagares, A.: Codon Usage Heterogeneity in the Multipartite Prokaryote Genome. Selection-Based Coding Bias Associated with Gene Location, Expression Level, and Ancestry. mBio. 10, : e00505-19 (2019).
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2936223
Belmann, P., Fischer, B., Krüger, J., Procházka, M., Rasche, H., Prinz, M., Hanussek, M., Lang, M., Bartusch, F., Gläßle, B., Krüger, J., Pühler, A., Sczyrba, A.: de.NBI Cloud federation through ELIXIR AAI. F1000Research. 8, : 842 (2019).
PUB | PDF | DOI | PubMed | Europe PMC
 
2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2936839
Nelkner, J., Tejerizo, G.T., Hassa, J., Lin, T.W., Witte, J., Verwaaijen, B., Winkler, A., Bunk, B., Spröer, C., Overmann, J., Grosch, R., Pühler, A., Schlüter, A.: Genetic Potential of the Biocontrol Agent Pseudomonas brassicacearum (Formerly P. trivialis) 3Re2-7 Unraveled by Genome Sequencing and Mining, Comparative Genomics and Transcriptomics. Genes. 10, : 601 (2019).
PUB | PDF | DOI | PubMed | Europe PMC
 
2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2935923
Nelkner, J., Henke, C., Lin, T.W., Pätzold, W., Hassa, J., Jaenicke, S., Grosch, R., Pühler, A., Sczyrba, A., Schlüter, A.: Effect of Long-Term Farming Practices on Agricultural Soil Microbiome Members Represented by Metagenomically Assembled Genomes (MAGs) and Their Predicted Plant-Beneficial Genes. Genes. 10, : 424 (2019).
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2019 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2934570
Castellani, L.G., Nilsson, J.F., Wibberg, D., Schlüter, A., Pühler, A., Brom, S., Pistorio, M., Tejerizo, G.T.: Insight into the structure, function and conjugative transfer of pLPU83a, an accessory plasmid of Rhizobium favelukesii LPU83. Plasmid. (2019).
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2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2935556
Verwaaijen, B., Wibberg, D., Winkler, A., Zrenner, R., Bednarz, H., Niehaus, K., Grosch, R., Pühler, A., Schlüter, A.: A comprehensive analysis of the Lactuca sativa, L. transcriptome during different stages of the compatible interaction with Rhizoctonia solani. Scientific Reports. 9, : 7221 (2019).
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2920160
Arnold, W., Grotjohann, N., Pühler, A., Röllke, K., Selbitschka, W.: Die CeBiT ec Schülerakademie „Synthetische Biologie/Biotechnologie “– Begabtenförderung in einem zukunftsträchtigen Forschungsfeld. ABB-Information. Jahresheft. 2017, (2018).
PUB
 
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2916929
Stolze, Y., Bremges, A., Maus, I., Pühler, A., Sczyrba, A., Schlüter, A.: Targeted in situ metatranscriptomics for selected taxa from mesophilic and thermophilic biogas plants. Microbial Biotechnology. 11, 667-679 (2018).
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2920169
Salto, I.P., Torres Tejerizo, G., Wibberg, D., Pühler, A., Schlüter, A., Pistorio, M.: Comparative genomic analysis of Acinetobacter spp. plasmids originating from clinical settings and environmental habitats. Scientific Reports. 8, : 7783 (2018).
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2920170
Hassa, J., Maus, I., Off, S., Pühler, A., Scherer, P., Klocke, M., Schlüter, A.: Metagenome, metatranscriptome, and metaproteome approaches unraveled compositions and functional relationships of microbial communities residing in biogas plants. Applied Microbiology and Biotechnology. 102, 5045-5063 (2018).
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2920168
Tomazetto, G., Hahnke, S., Wibberg, D., Pühler, A., Klocke, M., Schlüter, A.: Proteiniphilum saccharofermentans str. M3/6 T isolated from a laboratory biogas reactor is versatile in polysaccharide and oligopeptide utilization as deduced from genome-based metabolic reconstructions. Biotechnology Reports. 18, : e00254 (2018).
PUB | DOI
 
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2930510
Alkhateeb, R., Vorhölter, F.-J., Steffens, T., Rückert, C., Ortseifen, V., Hublik, G., Niehaus, K., Pühler, A.: Comparative transcription profiling of two fermentation cultures of Xanthomonas campestris pv. campestris B100 sampled in the growth and in the stationary phase. APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY. 102, 6613-6625 (2018).
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2920750
Maus, I., Rumming, M., Bergmann, I., Heeg, K., Pohl, M., Nettmann, E., Jaenicke, S., Blom, J., Pühler, A., Schlüter, A., Sczyrba, A., Klocke, M.: Characterization of Bathyarchaeota genomes assembled from metagenomes of biofilms residing in mesophilic and thermophilic biogas reactors. Biotechnology for Biofuels. 11, : 167 (2018).
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2920173
Wibberg, D., Salto, I.P., Eikmeyer, F.G., Maus, I., Winkler, A., Nordmann, P., Pühler, A., Poirel, L., Schlüter, A.: Complete Genome Sequencing of Acinetobacter baumannii Strain K50 Discloses the Large Conjugative Plasmid pK50a Encoding Carbapenemase OXA-23 and Extended-Spectrum β-Lactamase GES-11. Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 62, : e00212-18 (2018).
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2917037
Verwaaijen, B., Wibberg, D., Nelkner, J., Gordin, M., Rupp, O., Winkler, A., Bremges, A., Blom, J., Grosch, R., Pühler, A., Schlüter, A.: Assembly of the Lactuca sativa, L. cv. Tizian draft genome sequence reveals differences within major resistance complex 1 as compared to the cv. Salinas reference genome. JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY. 267, 12-18 (2018).
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2908419
Torres Tejerizo, G.A., Wibberg, D., Winkler, A., Ormeño-Orrillo, E., Martínez-Romero, E., Niehaus, K., Pühler, A., Kalinowski, J., Lagares, A., Schlüter, A., Pistorio, M.: Genome Sequence of the Symbiotic Type Strain Rhizobium tibeticum CCBAU85039T. Genome Announcements. 5, e01513-16 (2017).
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2912114
Verwaaijen, B., Wibberg, D., Kröber, M., Winkler, A., Zrenner, R., Bednarz, H., Niehaus, K., Grosch, R., Pühler, A., Schlüter, A.: The Rhizoctonia solani AG1-IB (isolate 7/3/14) transcriptome during interaction with the host plant lettuce (Lactuca sativa L.). PLOS ONE. 12, : e0177278 (2017).
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2913116
Wolf, T., Droste, J., Gren, T., Ortseifen, V., Schneiker-Bekel, S., Zemke, T., Pühler, A., Kalinowski, J.: The MalR type regulator AcrC is a transcriptional repressor of acarbose biosynthetic genes in Actinoplanes sp. SE50/110. BMC Genomics. 18, : 562 (2017).
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