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76 Publikationen

2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1784020 OA
Lamprecht A-L, Margaria T, Steffen B, Sczyrba A, Hartmeier S, Giegerich R (2008)
GeneFisher-P: variations of GeneFisher as processes in Bio-jETI.
BMC Bioinformatics 9(Suppl 4): S13.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1588303
Sczyrba A, Konermann S, Giegerich R (2008)
Two interactive bioinformatics courses at the bielefeld university bioinformatics server.
BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS 9(3): 243-249.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1599756 OA
Spitzer M, Lorkowski S, Cullen P, Sczyrba A, Fuellen G (2006)
IsoSVM - Distinguishing isoforms and paralogs on the protein level.
BMC Bioinformatics 7(1): 110.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773613 OA
Sczyrba A, Beckstette M, Brivanlou AH, Giegerich R, Altmann CR (2005)
XenDB: Full length cDNA prediction and cross species mapping in Xenopus laevis.
BMC Genomics 6(1): 123.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383529
Beckstette M, Mailänder JT, Marhöfer RJ, Sczyrba A, Ohlebusch E, Giegerich R, Selzer PM (2004)
Genlight: Interactive high-throughput sequence analysis and comparative genomics.
Journal of Integrative Bioinformatics 1(1): 0008.
PUB | DOI
 
2004 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383536
Beckstette M, Sczyrba A, Selzer PM (2004)
Genlight: Interactive high-throughput sequence analysis and comparative genomics.
In: Proceedings of the German Conference on Bioinformatics. Lecture Notes in Informatics: GI: 179-186.
PUB
 
2004 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383561
Sczyrba A, Beckstette M, Giegerich R, Altman C (2004)
Identification of 10,500 Xenopus laevis Full Length Clones through EST Clustering and Sequence Analysis.
In: Proceedings of the German Conference on Bioinformatics. Lecture Notes in Informatics: GI.
PUB
 
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1607400 OA
Taher L, Rinner O, Garg S, Sczyrba A, Morgenstern B (2004)
AGenDA: gene prediction by cross-species sequence comparison.
Nucleic Acids Research 32(Web Server): W305-W308.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1607394 OA
Krüger J, Sczyrba A, Kurtz S, Giegerich R (2004)
e2g: an interactive web-based server for efficiently mapping large EST and cDNA sets to genomic sequences.
NUCLEIC ACIDS RESEARCH 32(Web Server): W301-W304.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1609260
Dondrup M, Goesmann A, Bartels D, Kalinowski J, Krause L, Linke B, Rupp O, Sczyrba A, Pühler A, Meyer F (2003)
EMMA: a platform for consistent storage and efficient analysis of microarray data.
JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY 106(2-3): 135-146.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1612470
Morgenstern B, Goel S, Sczyrba A, Dress A (2003)
AltAVisT: Comparing alternative multiple sequence alignments.
BIOINFORMATICS 19(3): 425-426.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773844 OA
Sczyrba A, Krüger J, Mersch H, Kurtz S, Giegerich R (2003)
RNA-related tools on the Bielefeld Bioinformatics Server.
Nucleic Acids Research 31(13): 3767-3770.
PUB | Dateien verfügbar | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1610494
Taher L, Rinner O, Garg S, Sczyrba A, Brudno M, Batzoglou S, Morgenstern B (2003)
AGenDA: homology-based gene prediction.
BIOINFORMATICS 19(12): 1575-1577.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2001 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1897716
Gopal S, Schroeder M, Pieper U, Sczyrba A, Aytekin-Kurban G, Bekiranov S, Fajardo JE, Eswar N, Sanchez R, Sali A, Gaasterland T (2001)
Homology-based annotation yields 1,042 new candidate genes in the Drosophila melanogaster genome.
Nat Genet 27(3): 337-340.
PUB
 
2001 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1616752
Altmann CR, Bell E, Sczyrba A, Pun J, Bekiranov S, Gaasterland T, Brivanlou AH (2001)
Microarray-based analysis of early development in Xenopus laevis.
DEVELOPMENTAL BIOLOGY 236(1): 64-75.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2000 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1897767
Gaasterland T, Sczyrba A, Thomas E, Kurban G (2000)
MAGPIE/EGRET annotation of the 2.9-Mb Drosophila melanogaster Adh region.
Genome Res 10(4): 502-510.
PUB
 

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