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76 Publikationen

2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2563543
Campbell AG, Campbell JH, Schwientek P, et al. Multiple Single-Cell Genomes Provide Insight into Functions of Uncultured Deltaproteobacteria in the Human Oral Cavity. PLoS ONE. 2013;8(3): e59361.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2613623
Swan BK, Tupper B, Sczyrba A, et al. Prevalent genome streamlining and latitudinal divergence of planktonic bacteria in the surface ocean. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2013;110(28):11463-11468.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2518330
Garcia SL, McMahon KD, Martinez-Garcia M, et al. Metabolic potential of a single cell belonging to one of the most abundant lineages in freshwater bacterioplankton. The ISME journal. 2012;7(1):137-147.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2547307
El-Kalioby M, Abouelhoda M, Krüger J, et al. Personalized cloud-based bioinformatics services for research and education: use cases and the elasticHPC package. BMC Bioinformatics. 2012;13(Suppl 17):S22.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2329885
Swan BK, Martinez-Garcia M, Preston CM, et al. Potential for Chemolithoautotrophy Among Ubiquitous Bacteria Lineages in the Dark Ocean. Science. 2011;333(6047):1296-1300.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2351462
Kim T-W, Chokhawala HA, Hess M, et al. High-Throughput In Vitro Glycoside Hydrolase (HIGH) Screening for Enzyme Discovery. Angewandte Chemie. 2011;123(47):11411-11414.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2789582
Sales CM, Mahendra S, Grostern A, et al. Genome sequence of the 1,4-dioxane-degrading Pseudonocardia dioxanivorans strain CB1190. Journal of Bacteriology. 2011;193(17):4549-4550.
PUB | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC | GenBank
 
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2410148
Woyke T, Sczyrba A, Lee J, et al. Decontamination of MDA Reagents for Single Cell Whole Genome Amplification. PLoS ONE. 2011;6(10):e26161.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1991643
Hess M, Sczyrba A, Egan R, et al. Metagenomic discovery of biomass-degrading genes and genomes from cow rumen. Science. 2011;331(6016):463-467.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1991615
Gilbert JA, Meyer F, Antonopoulos D, et al. Meeting report: the terabase metagenomics workshop and the vision of an Earth microbiome project. Stand Genomic Sci. 2010;3(3):243-248.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1784020 OA
Lamprecht A-L, Margaria T, Steffen B, Sczyrba A, Hartmeier S, Giegerich R. GeneFisher-P: variations of GeneFisher as processes in Bio-jETI. BMC Bioinformatics. 2008;9(Suppl 4):S13.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1588303
Sczyrba A, Konermann S, Giegerich R. Two interactive bioinformatics courses at the bielefeld university bioinformatics server. BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS. 2008;9(3):243-249.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1599756 OA
Spitzer M, Lorkowski S, Cullen P, Sczyrba A, Fuellen G. IsoSVM - Distinguishing isoforms and paralogs on the protein level. BMC Bioinformatics. 2006;7(1):110.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773613 OA
Sczyrba A, Beckstette M, Brivanlou AH, Giegerich R, Altmann CR. XenDB: Full length cDNA prediction and cross species mapping in Xenopus laevis. BMC Genomics. 2005;6(1):123.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383529
Beckstette M, Mailänder JT, Marhöfer RJ, et al. Genlight: Interactive high-throughput sequence analysis and comparative genomics. Journal of Integrative Bioinformatics. 2004;1(1):0008.
PUB | DOI
 
2004 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383536
Beckstette M, Sczyrba A, Selzer PM. Genlight: Interactive high-throughput sequence analysis and comparative genomics. In: Proceedings of the German Conference on Bioinformatics. Lecture Notes in Informatics: GI; 2004: 179-186.
PUB
 
2004 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383561
Sczyrba A, Beckstette M, Giegerich R, Altman C. Identification of 10,500 Xenopus laevis Full Length Clones through EST Clustering and Sequence Analysis. In: Proceedings of the German Conference on Bioinformatics. Lecture Notes in Informatics: GI; 2004.
PUB
 
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1607400 OA
Taher L, Rinner O, Garg S, Sczyrba A, Morgenstern B. AGenDA: gene prediction by cross-species sequence comparison. Nucleic Acids Research. 2004;32(Web Server):W305-W308.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1607394 OA
Krüger J, Sczyrba A, Kurtz S, Giegerich R. e2g: an interactive web-based server for efficiently mapping large EST and cDNA sets to genomic sequences. NUCLEIC ACIDS RESEARCH. 2004;32(Web Server):W301-W304.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1609260
Dondrup M, Goesmann A, Bartels D, et al. EMMA: a platform for consistent storage and efficient analysis of microarray data. JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY. 2003;106(2-3):135-146.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1612470
Morgenstern B, Goel S, Sczyrba A, Dress A. AltAVisT: Comparing alternative multiple sequence alignments. BIOINFORMATICS. 2003;19(3):425-426.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773844 OA
Sczyrba A, Krüger J, Mersch H, Kurtz S, Giegerich R. RNA-related tools on the Bielefeld Bioinformatics Server. Nucleic Acids Research. 2003;31(13):3767-3770.
PUB | Dateien verfügbar | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1610494
Taher L, Rinner O, Garg S, et al. AGenDA: homology-based gene prediction. BIOINFORMATICS. 2003;19(12):1575-1577.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2001 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1897716
Gopal S, Schroeder M, Pieper U, et al. Homology-based annotation yields 1,042 new candidate genes in the Drosophila melanogaster genome. Nat Genet. 2001;27(3):337-340.
PUB
 
2001 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1616752
Altmann CR, Bell E, Sczyrba A, et al. Microarray-based analysis of early development in Xenopus laevis. DEVELOPMENTAL BIOLOGY. 2001;236(1):64-75.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2000 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1897767
Gaasterland T, Sczyrba A, Thomas E, Kurban G. MAGPIE/EGRET annotation of the 2.9-Mb Drosophila melanogaster Adh region. Genome Res. 2000;10(4):502-510.
PUB
 

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