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76 Publikationen

2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2935923 OA
Nelkner, J., Henke, C., Lin, T.W., Pätzold, W., Hassa, J., Jaenicke, S., Grosch, R., Pühler, A., Sczyrba, A., Schlüter, A.: Effect of Long-Term Farming Practices on Agricultural Soil Microbiome Members Represented by Metagenomically Assembled Genomes (MAGs) and Their Predicted Plant-Beneficial Genes. Genes. 10, : 424 (2019).
PUB | PDF | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2936223 OA
Belmann, P., Fischer, B., Krüger, J., Procházka, M., Rasche, H., Prinz, M., Hanussek, M., Lang, M., Bartusch, F., Gläßle, B., Krüger, J., Pühler, A., Sczyrba, A.: de.NBI Cloud federation through ELIXIR AAI. F1000Research. 8, : 842 (2019).
PUB | PDF | DOI | PubMed | Europe PMC
 
2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2934798
Pankoke, H., Maus, I., Loh, G., Huser, A., Seifert, J., Tilker, A., Hark, S., Sczyrba, A., Pelzer, S., Kleinbolting, J.: F5Evaluation of commercially available DNA extraction kits for the analysis of the broiler chicken cecal microbiota. FEMS microbiology letters. (2019).
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933767
Fritz, A., Hofmann, P., Majda, S., Dahms, E., Dröge, J., Fiedler, J., Lesker, T.R., Belmann, P., DeMaere, M.Z., Darling, A.E., Sczyrba, A., Bremges, A., McHardy, A.C.: CAMISIM: simulating metagenomes and microbial communities. Microbiome. 7, : 17 (2019).
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2916929
Stolze, Y., Bremges, A., Maus, I., Pühler, A., Sczyrba, A., Schlüter, A.: Targeted in situ metatranscriptomics for selected taxa from mesophilic and thermophilic biogas plants. Microbial Biotechnology. 11, 667-679 (2018).
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2920777
Celis, J.S., Wibberg, D., Ramírez-Portilla, C., Rupp, O., Sczyrba, A., Winkler, A., Kalinowski, J., Wilke, T.: Binning Enables Efficient Host Genome Reconstruction in Cnidarian Holobionts. GigaScience. 7, : giy075 (2018).
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2920723
Meyer, F., Hofmann, P., Belmann, P., Garrido-Oter, R., Fritz, A., Sczyrba, A., McHardy, A.C.: AMBER: Assessment of Metagenome BinnERs. GigaScience. : giy069 (2018).
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2930593 OA
Linden, M., Prochazka, M., Lappalainen, I., Bucik, D., Vyskocil, P., Kuba, M., Silén, S., Belmann, P., Sczyrba, A., Newhouse, S., Matyska, L., Nyrönen, T.: Common ELIXIR Service for Researcher Authentication and Authorisation. F1000Research. 7, : 1199 (2018).
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2915890
Huang, L., Krüger, J., Sczyrba, A.: Analyzing large scale genomic data on the cloud with Sparkhit. Bioinformatics. 34, 1457-1465 (2018).
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2920750
Maus, I., Rumming, M., Bergmann, I., Heeg, K., Pohl, M., Nettmann, E., Jaenicke, S., Blom, J., Pühler, A., Schlüter, A., Sczyrba, A., Klocke, M.: Characterization of Bathyarchaeota genomes assembled from metagenomes of biofilms residing in mesophilic and thermophilic biogas reactors. Biotechnology for Biofuels. 11, : 167 (2018).
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