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544 Publikationen

2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2905630
Gren, T.; Ortseifen, V.; Wibberg, D.; Schneiker-Bekel, S.; Bednarz, H.; Niehaus, K.; Zemke, T.; Persicke, M.; Pühler, A.; Kalinowski, J. (2016): Genetic engineering in Actinoplanes sp SE50/110-development of an intergeneric conjugation system for the introduction of actinophage-based integrative vectors Journal of Biotechnology,232: 79-88.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2908260
Torres Tejerizo, G. A.; Antonio Rogel, M.; Ormeno-Orrillo, E.; Julia Althabegoiti, M.; Fernanda Nilsson, J.; Niehaus, K.; Schlüter, A.; Pühler, A.; Florencia Del Papa, M.; Lagares, A.; Martinez-Romero, E.; Pistorio, M. (2016): Rhizobium favelukesii sp nov., isolated from the root nodules of alfalfa (Medicago sativa L) INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY,66: 4451-4457.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2905122
Draghi, W. O.; Del Papa, M. F.; Hellweg, C.; Watt, S. A.; Watt, T. F.; Barsch, A.; Lozano, M. J.; Lagares, A., J.; Salas, M. E.; Lopez, J. L.; Albicoro, F. J.; Nilsson, J. F.; Torres Tejerizo, G. A.; Luna, M. F.; Pistorio, M.; Boiardi, J. L.; Pühler, A.; Weidner, S.; Niehaus, K.; Lagares, A. (2016): A consolidated analysis of the physiologic and molecular responses induced under acid stress in the legume-symbiont model-soil bacterium Sinorhizobium meliloti SCIENTIFIC REPORTS,6:29278
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2917142
Wibberg, D.; Andersson, L.; Rupp, O.; Goesmann, A.; Pühler, A.; Varrelmann, M.; Dixelius, C.; Schlüter, A. (2016): Draft genome sequence of the sugar beet pathogen Rhizoctonia solani AG2-2IIIB strain BBA69670 Journal of Biotechnology,222: 11-12.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2904691
Martini, M. C.; Wibberg, D.; Lozano, M.; Torres Tejerizo, G.; Albicoro, F. J.; Jaenicke, S.; van Elsas, J. D.; Petroni, A.; Garcillan-Barcia, M. P.; de la Cruz, F.; Schlüter, A.; Pühler, A.; Pistorio, M.; Lagares, A.; Del Papa, M. F. (2016): Genomics of high molecular weight plasmids isolated from an on-farm biopurification system Scientific Reports,6:28284
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2903489
Maus, I.; Cibis, K. G.; Bremges, A.; Stolze, Y.; Wibberg, D.; Tomazetto, G.; Blom, J.; Sczyrba, A.; König, H.; Pühler, A.; Schlüter, A. (2016): Genomic characterization of Defluviitoga tunisiensis L3, a key hydrolytic bacterium in a thermophilic biogas plant and its abundance as determined by metagenome fragment recruitment Journal of Biotechnology,232: 50-60.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2903302
Wibberg, D.; Bremges, A.; Dammann-Kalinowski, T.; Maus, I.; Igeño, M. I.; Vogelsang, R.; König, C.; Luque-Almagro, V. M.; Roldán, M. D.; Sczyrba, A.; Moreno-Vivián, C.; Blasco, R.; Pühler, A.; Schlüter, A. (2016): Finished genome sequence and methylome of the cyanide-degrading Pseudomonas pseudoalcaligenes strain CECT5344 as resolved by single-molecule real-time sequencing Journal of Biotechnology,232: 61-68.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2902126
Liebe, S.; Wibberg, D.; Winkler, A.; Pühler, A.; Schlüter, A.; Varrelmann, M. (2016): Taxonomic analysis of the microbial community in stored sugar beets using high-throughput sequencing of different marker genes FEMS Microbiology Ecology,92:(2):fiw004
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2905505
Wolf, T.; Gren, T.; Thieme, E.; Wibberg, D.; Zemke, T.; Pühler, A.; Kalinowski, J. (2016): Targeted genome editing in the rare actinomycete Actinoplanes sp SE50/110 by using the CRISPR/Cas9 System Journal of Biotechnology,231: 122-128.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2900928
Nesme, J.; Achouak, W.; Agathos, S.; Bailey, M.; Baldrian, P.; Brunel, D.; Frostegard, A.; Heulin, T.; Jansson, J. K.; Jurkevitch, E.; Kowalchuk, G. A.; Kruus, K. L.; Lagares, A.; Lapin-Scott, H. M.; Le Paslier, D.; ic-Mulec, I.; Murrell, C.; Myrold, D. D.; Nalin, R.; Nannipieri, P.; Neufeld, J. D.; O'Gara, F.; Parnell, J. J.; Pühler, A.; Pylro, V.; Ramos, J. L.; Roesch, L.; Schleper, C.; Schloter, M.; Sczyrba, A.; Sessitsch, A.; Sjöling, S.; Sørensen, J.; Sørensen, S. J.; Tebbe, C. C.; Topp, E.; Tsiamis, G.; Van Elsas, J. D.; Van Keulen, G.; Wagner, M.; Widmer, F.; Zhang, T.; Zhang, X.; Zhao, L.; Zhu, Y. - G.; Vogel, T. M.; Simonet, P. (2016): Back to the future of soil metagenomics Frontiers in Microbiology,7:73
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901243
Wendler, S.; Otto, A.; Ortseifen, V.; Bonn, F.; Neshat, A.; Schneiker-Bekel, S.; Wolf, T.; Zemke, T.; Wehmeier, U. F.; Hecker, M.; Kalinowski, J.; Becher, D.; Pühler, A. (2016): Comparative proteome analysis of Actinoplanes sp SE50/110 grown with maltose or glucose shows Minor differences for acarbose biosynthesis proteins but major differences for saccharide transporters Journal of Proteomics,131: 140-148.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901675
Krahn, T.; Wibberg, D.; Maus, I.; Winkler, A.; Bontron, S.; Sczyrba, A.; Nordmann, P.; Pühler, A.; Poirel, L.; Schlüter, A. (2016): Intraspecies transfer of the chromosomally encoded Acinetobacter baumannii blaNDM-1 carbapenemase gene. Antimicrobial Agents and Chemotherapy,60:(5): 3032-3040.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901808
Alkhateeb, R.; Vorhölter, F. - J.; Rückert, C.; Mentz, A.; Wibberg, D.; Hublik, G.; Niehaus, K.; Pühler, A. (2016): Genome wide transcription start sites analysis of the Xanthomonas campestris pv. campestris B100 with insights into the gum gene cluster directing the biosynthesis of the exopolysaccharide xanthan. J Biotechnol,225: 18-28.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2905260
Maus, I.; Koeck, D. E.; Cibis, K. G.; Hahnke, S.; Kim, Y. S.; Langer, T.; Kreubel, J.; Erhard, M.; Bremges, A.; Off, S.; Stolze, Y.; Jaenicke, S.; Goesmann, A.; Sczyrba, A.; Scherer, P.; König, H.; Schwarz, W. H.; Zverlov, V. V.; Liebl, W.; Pühler, A.; Schlüter, A.; Klocke, M. (2016): Unraveling the microbiome of a thermophilic biogas plant by metagenome and metatranscriptome analysis complemented by characterization of bacterial and archaeal isolates Biotechnology for Biofuels,9:(1):171
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2905504
Kröber, M.; Verwaaijen, B.; Wibberg, D.; Winkler, A.; Pühler, A.; Schlüter, A. (2016): Comparative transcriptome analysis of the biocontrol strain Bacillus amyloliquefaciens FZB42 as response to biofilm formation analyzed by RNA sequencing Journal of Biotechnology,231: 212-223.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2905629
Tomazetto, G.; Hahnke, S.; Koeck, D. E.; Wibberg, D.; Maus, I.; Pühler, A.; Klocke, M.; Schlüter, A. (2016): Complete genome analysis of Clostridium bornimense strain M2/40(T). A new acidogenic Clostridium species isolated from a mesophilic two-phase laboratory-scale biogas reactor Journal of Biotechnology,232: 38-49.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2905631
Leßmeier, L.; Alkhateeb, R.; Schulte, F.; Steffens, T.; Loka, T. P.; Pühler, A.; Niehaus, K.; Vorhölter, F. - J. (2016): Applying DNA affinity chromatography to specifically screen for sucrose-related DNA-binding transcriptional regulators of Xanthomonas campestris Journal of Biotechnology,232: 89-98.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2904234
Ortseifen, V.; Stolze, Y.; Maus, I.; Sczyrba, A.; Bremges, A.; Albaum, S.; Jaenicke, S.; Fracowiak, J.; Pühler, A.; Schlüter, A. (2016): An integrated metagenome and -proteome analysis of the microbial community residing in a biogas production plant Journal of Biotechnology,231: 268-279.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2911748
Krahn, T.; Wibberg, D.; Maus, I.; Winkler, A.; Pühler, A.; Poirel, L.; Schlüter, A. (2015): Complete Genome Sequence ofAcinetobacter baumanniiCIP 70.10, a Susceptible Reference Strain for Comparative Genome Analyses Genome Announcements,3:(4): e00850-15.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2785064
Krahn, T.; Wibberg, D.; Maus, I.; Winkler, A.; Nordmann, P.; Pühler, A.; Poirel, L.; Schlüter, A. (2015): Complete Genome Sequence of the Clinical Strain Acinetobacter baumannii R2090 Carrying the Chromosomally Encoded Metallo-β-Lactamase GeneblaNDM-1 Genome Announcements,3:(5):e01008-15
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