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543 Publikationen

2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2916528
Wolf, T., Schneiker-Bekel, S., Neshat, A., Ortseifen, V., Wibberg, D., Zemke, T., Pühler, A. & Kalinowski, J. (2017). Genome improvement of the acarbose producer Actinoplanes sp SE50/110 and annotation refinement based on RNA-seq analysis. JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY, 251, 112-123. Elsevier Science Bv. doi:10.1016/j.jbiotec.2017.04.013.
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2911997
Omar Draghi, W., Florencia Del Papa, M., Barsch, A., Albicoro, F.J., Lozano, M.J., Pühler, A., Niehaus, K. & Lagares, A. (2017). A metabolomic approach to characterize the acid-tolerance response in Sinorhizobium meliloti. METABOLOMICS, 13(6): 71. Springer. doi:10.1007/s11306-017-1210-2.
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2916470
Tomazetto, G., Hahnke, S., Langer, T., Wibberg, D., Blom, J., Maus, I., Pühler, A., Klocke, M. & Schlüter, A. (2017). The completely annotated genome and comparative genomics of the Peptoniphilaceae bacterium str. ING2-D1G, a novel acidogenic bacterium isolated from a mesophilic biogas reactor. Journal of Biotechnology, 257, 178-186. Elsevier Science Bv. doi:10.1016/j.jbiotec.2017.05.027.
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2910373
Bartholomäus, A., Wibberg, D., Winkler, A., Pühler, A., Schlüter, A. & Varrelmann, M. (2017). Identification of a novel mycovirus isolated from Rhizoctonia solani (AG 2-2 IV) provides further information about genome plasticity within the order Tymovirales. Archives of Virology, 162(2), 555-559. Springer Wien. doi:10.1007/s00705-016-3085-3.
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2916406
Lasek, R., Dziewit, L., Ciok, A., Decewicz, P., Romaniuk, K., Jedrys, Z., Wibberg, D., Schlüter, A., Pühler, A. & Bartosik, D. (2017). Genome content, metabolic pathways and biotechnological potential of the psychrophilic Arctic bacterium Psychrobacter sp DAB_AL43B, a source and a host of novel Psychrobacter-specific vectors. Journal of Biotechnology, 263, 64-74. Elsevier Science Bv. doi:10.1016/j.jbiotec.2017.09.011.
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2916435
Czarnecki, J., Dziewit, L., Puzyna, M., Prochwicz, E., Tudek, A., Wibberg, D., Schlüter, A., Pühler, A. & Bartosik, D. (2017). Lifestyle-determining extrachromosomal replicon pAMV1 and its contribution to the carbon metabolism of the methylotrophic bacterium Paracoccus aminovorans JCM 7685. Environmental Microbiology, 19(11), 4536-4550. Wiley. doi:10.1111/1462-2920.13901.
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2914538
Ortseifen, V., Kalinowski, J., Pühler, A. & Rückert, C. (2017). The complete genome sequence of the actinobacterium Streptomyces glaucescens GLA.O (DSM 40922) carrying gene clusters for the biosynthesis of tetracenomycin C, 5`-hydroxy streptomycin, and acarbose. J Biotechnol, 262, 84-88. doi:10.1016/j.jbiotec.2017.09.008.
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2916490
Wibberg, D., Genzel, F., Verwaaijen, B., Blom, J., Rupp, O., Goesmann, A., Zrenner, R., Grosch, R., Pühler, A. & Schlüter, A. (2017). Draft genome sequence of the potato pathogen Rhizoctonia solani AG3-PT isolate Ben3. Archives of Microbiology, 199(7), 1065-1068. Springer. doi:10.1007/s00203-017-1394-x.
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2911777
Torres Tejerizo, G.A., Kim, Y.S., Maus, I., Wibberg, D., Winkler, A., Off, S., Pühler, A., Scherer, P. & Schlüter, A. (2017). Genome sequence of Methanobacterium congolense strain Buetzberg, a hydrogenotrophic, methanogenic archaeon, isolated from a mesophilic industrial-scale biogas plant utilizing bio-waste. Journal of Biotechnology, 247, 1-5. Elsevier Science Bv. doi:10.1016/j.jbiotec.2017.02.015.
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2911462
Alkhateeb, R., Rückert, C., Rupp, O., Pucker, B., Hublik, G., Wibberg, D., Niehaus, K., Pühler, A. & Vorhölter, F.-J. (2017). Refined annotation of the complete genome of the phytopathogenic and xanthan producing Xanthomonas campestris pv. campestris strain B100 based on RNA sequence data. Journal of Biotechnology, 253, 55-61. Elsevier BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2017.05.009.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2904970
Maus, I., Wibberg, D., Winkler, A., Pühler, A., Schnürer, A. & Schlüter, A. (2016). Complete Genome Sequence of the MethanogenMethanoculleus bourgensisBA1 Isolated from a Biogas Reactor. Genome Announcements, 4(3): e00568-16. American Society for Microbiology. doi:10.1128/genomea.00568-16.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2907676
Jaenicke, S., Bunk, B., Wibberg, D., Spröer, C., Hersemann, L., Blom, J., Winkler, A., Schatschneider, S., Albaum, S., Kölliker, R., Goesmann, A., Pühler, A., Overmann, J. & Vorhölter, F.-J. (2016). Complete Genome Sequence of the Barley Pathogen Xanthomonas translucens pv. translucens DSM 18974 T (ATCC 19319 T). Genome Announcements, 4(6): e01334-16. American Society for Microbiology. doi:10.1128/genomea.01334-16.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2904978
Koeck, D.E., Maus, I., Wibberg, D., Winkler, A., Zverlov, V.V., Liebl, W., Pühler, A., Schwarz, W.H. & Schlüter, A. (2016). Draft Genome Sequence of Propionisporasp. Strain 2/2-37, a New Xylan-Degrading Bacterium Isolated from a Mesophilic Biogas Reactor. Genome Announcements, 4(3), e00609-16. American Society for Microbiology. doi:10.1128/genomea.00609-16.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2904993
Koeck, D.E., Maus, I., Wibberg, D., Winkler, A., Zverlov, V.V., Liebl, W., Pühler, A., Schwarz, W.H. & Schlüter, A. (2016). Complete Genome Sequence of Herbinix luporumSD1D, a New Cellulose-Degrading Bacterium Isolated from a Thermophilic Biogas Reactor. Genome Announcements, 4(4), e00687-16. American Society for Microbiology. doi:10.1128/genomea.00687-16.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2907431
Bartholomaeus, A., Wibberg, D., Winkler, A., Pühler, A., Schlüter, A. & Varrelmann, M. (2016). Deep Sequencing Analysis Reveals the Mycoviral Diversity of the Virome of an Avirulent Isolate of Rhizoctonia solani AG-2-2 IV. PLOS ONE, 11(11): e0165965. Public Library Science. doi:10.1371/journal.pone.0165965.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2904815
Stolze, Y., Bremges, A., Rumming, M., Henke, C., Maus, I., Pühler, A., Sczyrba, A. & Schlüter, A. (2016). Identification and genome reconstruction of abundant distinct taxa in microbiomes from one thermophilic and three mesophilic production-scale biogas plants. Biotechnology for Biofuels, 9: 156. Springer Nature. doi:10.1186/s13068-016-0565-3.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2903660
Steffens, T., Vorhölter, F.-J., Giampa, M., Hublik, G., Pühler, A. & Niehaus, K. (2016). The influence of a modified lipopolysaccharide O-antigen on the biosynthesis of xanthan in Xanthomonas campestris pv. campestris B100. BMC Microbiology, 16: 93. Biomed Central. doi:10.1186/s12866-016-0710-y.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2917144
Wibberg, D., Andersson, L., Tzelepis, G., Rupp, O., Blom, J., Jelonek, L., Pühler, A., Fogelqvist, J., Varrelmann, M., Schlüter, A. & Dixelius, C. (2016). Genome analysis of the sugar beet pathogen Rhizoctonia solani AG2-2IIIB revealed high numbers in secreted proteins and cell wall degrading enzymes. BMC Genomics, 17: 245. Springer Nature. doi:10.1186/s12864-016-2561-1.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2906715
Koeck, D.E., Wibberg, D., Maus, I., Winkler, A., Albersmeier, A., Zverlov, V.V., Liebl, W., Pühler, A., Schwarz, W.H. & Schlüter, A. (2016). Corrigendum to "Complete genome sequence of the cellulolytic thermophile Ruminoclostridium cellulosi wild-type strain DG5 isolated from a thermophilic biogas plant (J. Biotechnol. 188 (2014) 136–137)")". Journal of Biotechnology, 237, 35. Elsevier Science Bv. doi:10.1016/j.jbiotec.2016.08.020.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2905630
Gren, T., Ortseifen, V., Wibberg, D., Schneiker-Bekel, S., Bednarz, H., Niehaus, K., Zemke, T., Persicke, M., Pühler, A. & Kalinowski, J. (2016). Genetic engineering in Actinoplanes sp SE50/110-development of an intergeneric conjugation system for the introduction of actinophage-based integrative vectors. Journal of Biotechnology, 232, 79-88. Gehalten auf der 10th CeBiTec Symposium on Bioinformatics for Biotechnology and Biomedicine, Elsevier Science BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2016.05.012.
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