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545 Publikationen

2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1631327
Complete genome sequence of the myxobacterium Sorangium cellulosum
Schneiker-Bekel S, Perlova O, Kaiser O, Gerth K, Alici A, Altmeyer MO, Bartels D, Bekel T, Beyer S, Bode E, Bode HB, et al. (2007)
Nature Biotechnology 25(11): 1281-1289.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1595908
Novel macrolide resistance module carried by the IncP-1 beta resistance plasmid pRSB111, isolated from a wastewater treatment plant
Szczepanowski R, Krahn I, Bohn N, Pühler A, Schlueter A (2007)
ANTIMICROBIAL AGENTS AND CHEMOTHERAPY 51(2): 673-678.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1595939
Molecular basics of mycorrhizal symbioses
Pühler A, Strack D (2007)
PHYTOCHEMISTRY 68(1): 6-7.
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2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1594087
The Ic1R-type transcriptional repressor LtbR regulates the expression of leucine and tryptophan biosynthesis genes in the amino acid producer Corynebacterium glutamicum
Brune I, Jochmann N, Brinkrolf K, Hueser AT, Gerstmeir R, Eikmanns BJ, Kalinowski J, Pühler A, Tauch A (2007)
JOURNAL OF BACTERIOLOGY 189(7): 2720-2733.
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2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1594426
A comprehensive proteome map of the lipid-requiring nosocomial pathogen Corynebacterium jeikeium K411
Hansmeier N, Chao T-C, Daschkey S, Muesken M, Kalinowski J, Pühler A, Tauch A (2007)
PROTEOMICS 7(7): 1076-1096.
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2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1631103
In memoriam: Wolf-Dieter Deckwer - Merging process engineering and systems biology
Rinas U, Pühler A (2007)
JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY 132(4): 341.
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2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1593538 PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1593371
The extracytoplasmic function-type sigma factor SigM of Corynebacterium glutamicum ATCC 13032 is involved in transcription of disulfide stress-related genes
Nakunst D, Larisch C, Hueser AT, Tauch A, Pühler A, Kalinowski J (2007)
JOURNAL OF BACTERIOLOGY 189(13): 4696-4707.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1595014 PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1596137
Identification and characterization of a nodH ortholog from the alfalfa-nodulating Or191-like rhizobia
Del Papa MF, Pistorio M, Draghi WO, Lozano MJ, Giusti MA, Medina C, van Dillewijn P, Martinez-Abarca F, Flores BM, Ruiz-Sainz JE, Megias M, et al. (2007)
Molecular Plant - Microbe Interactions 20(2): 138-145.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1593746 PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1894739
Development of bioinformatic tools to support EST-sequencing, in silico- and microarray-based transcriptome profiling in mycorrhizal symbioses
Küster H, Becker A, Firnhaber C, Hohnjec N, Manthey K, Perlick AM, Bekel T, Dondrup M, Henckel K, Goesmann A, Meyer F, et al. (2007)
Phytochemistry 68(1): 19-32.
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2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1783345 OA
GISMO - gene identification using a support vector machine for ORF classification
Krause L, McHardy AC, Nattkemper TW, Pühler A, Stoye J, Meyer F (2007)
Nucleic Acids Research 35(2): 540-549.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1783727 OA
The DeoR-type transcriptional regulator SugR acts as a repressor for genes encoding the phosphoenolpyruvate: sugar phosphotransferase system (PTS) in Corynebacterium glutamicum
Gaigalat L, Schlüter J-P, Hartmann M, Mormann S, Tauch A, Pühler A, Kalinowski J (2007)
BMC Molecular Biology 8(1): 104.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1593996
Molecular systems biology
Sewald N, Pühler A (2007)
JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY 129(2): 171-172.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1946125
IncP-1-beta plasmid pGNB1 isolated from a bacterial community from a wastewater treatment plant mediates decolorization of triphenylmethane dyes
Schlüter A, Krahn I, Kollin F, Bonemann G, Stiens M, Szczepanowski R, Schneiker-Bekel S, Pühler A (2007)
Appl Environ Microbiol 73(20): 6345-6350.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | GenBank
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1946381 PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773628 OA PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1599402
Mapping and comprehensive analysis of the extracellular and cell surface proteome of the human pathogen Corynebacterium diphtheriae
Hansmeier N, Chao TC, Kalinowski J, Pühler A, Tauch A (2006)
PROTEOMICS 6(8): 2465-2476.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1596821
Long-term field release of bioluminescent Sinorhizobium meliloti strains to assess the influence of a recA mutation on the strains' survival
Selbitschka W, Keller M, Miethling-Graff R, Dresing U, Schwieger F, Krahn I, Homann I, Dammann-Kalinowski T, Pühler A, Tebbe CC (2006)
MICROBIAL ECOLOGY 52(3): 583-595.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1597413
Aspects of prokaryotic genome research
Gottschalk G, Goebel W, Pühler A (2006)
JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY 126(1): 1-2.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1598081
Mobilizable IncQ-related plasmid carrying a new quinolone resistance gene, qnrS2, isolated from the bacterial community of a wastewater treatment plant
Bönemann G, Stiens M, Pühler A, Schlüter A (2006)
ANTIMICROBIAL AGENTS AND CHEMOTHERAPY 50(9): 3075-3080.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1598182
Genome sequence of the ubiquitous hydrocarbon-degrading marine bacterium Alcanivorax borkumensis
Schneiker-Bekel S, dos Santos VAPM, Bartels D, Bekel T, Brecht M, Buhrmester J, Chernikova TN, Denaro R, Ferrer M, Gertler C, Goesmann A, et al. (2006)
Nature Biotechnology 24(8): 997-1004.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1598803
BioPerspectives - From basic research to industrial production
Grabley S, Pühler A (2006)
JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY 124(1): 1-3.
PUB | DOI | WoS
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1599618
The surface (S)-layer gene cspB of Corynebacterium glutamicum is transcriptionally activated by a LuxR-type regulator and located on a 6 kb genomic island absent from the type strain ATCC 13032
Hansmeier N, Albersmeier A, Tauch A, Damberg T, Ros R, Anselmetti D, Pühler A, Kalinowski J (2006)
Microbiology 152(4): 923-935.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1600852 PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1598296
Highlights from ECB12 - Bringing genomes to life
Nielsen J, Pühler A (2006)
JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY 124(4): 627-628.
PUB | DOI | WoS
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1599383
Sequence analysis of the 144-kilobase accessory plasmid pSmeSM11a, isolated from a dominant Sinorhizobium meliloti strain identified during a long-term field release experimerit
Stiens M, Schneiker-Bekel S, Keller M, Kuhn S, Pühler A, Schlüter A (2006)
Appl Environ Microbiol 72(5): 3662-3672.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1600185
The clc element of Pseudomonas sp strain B13, a genomic island with various catabolic properties
Gaillard M, Vallaeys T, Vorhölter F-J, Minoia M, Werlen C, Sentchilo V, Pühler A, van der Meer JR (2006)
JOURNAL OF BACTERIOLOGY 188(5): 1999-2013.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1868701
Ultrafast de novo sequencing of Corynebacterium urealyticum using the Genome Sequencer 20 System
Tauch A, Trost E, Bekel T, Goesmann A, Ludewig U, Pühler A (2006)
Biochemica 4: 4-6.
PUB
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773853 OA PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1599211 PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1596976
Complete genome of the mutualistic, N-2-fixing grass endophyte Azoarcus sp strain BH72
Krause A, Ramakumar A, Bartels D, Battistoni F, Bekel T, Boch J, Boehm M, Friedrich F, Hurek T, Krause L, Linke B, et al. (2006)
Nature Biotechnology 24(11): 1385-1391.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1597316
Whole-genome sequence of Listeria welshimeri reveals common steps in genome reduction with Listeria innocua as compared to Listeria monocytogenes
Hain T, Steinweg C, Kuenne CT, Billion A, Ghai R, Chatterjee SS, Domann E, Kaerst U, Goesmann A, Bekel T, Bartels D, et al. (2006)
Journal of Bacteriology 188(23): 8299-8302.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1631957
Finding novel genes in bacterial communities isolated from the environment
Krause L, Diaz NN, Bartels D, Edwards RA, Pühler A, Rohwer F, Meyer F, Stoye J (2006)
BIOINFORMATICS 22(14): e281-e289.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2447862
What can bacterial genome research teach us about iron uptake in Sinorhizobium meliloti?
Pühler A, Becker A, Buhrmester J, Chao T-C, Rüberg S, Weidner S (2005)
In: Biological Nitrogen Fixation, Sustainable Agriculture and the Environment: Proceedings of the 14th International Nitrogen Fixation Congress. Wang Y-P, Lin M, Tian Z-X, Elmerich C, Newton WE (Eds); Current Plant Science and Biotechnology in Agriculture, 41. Springer: 119-122.
PUB
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1603458
Rational design of a Corynebacterium glutamicum pantothenate production strain and its characterization by metabolic flux analysis and genorne-wide transcriptional profiling
Hüser AT, Chassagnole C, Lindley ND, Merkamm M, Guyonvarch A, Elisakova V, Patek M, Kalinowski J, Brune I, Pühler A, Tauch A (2005)
APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY 71(6): 3255-3268.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1603821 PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1603291
Characterization of the Xanthomonas campestris pv. campestris lipopolysaccharide substructures essential for elicitation of an oxidative burst in tobacco cells
Braun SG, Meyer A, Olst O, Pühler A, Niehaus K (2005)
Molecular Plant - Microbe Interactions 18(7): 674-681.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773302 OA
BACCardI - a tool for the validation of genomic assemblies, assisting genome finishing and intergenome comparison
Bartels D, Kespohl S, Albaum S, Drüke T, Goesmann A, Herold J, Kaiser O, Pühler A, Pfeiffer F, Raddatz G, Stoye J, et al. (2005)
Bioinformatics 21(7): 853-859.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1604683 PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1604328 PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1864013
Genomics of resistance plasmids isolated from wastewater treatment plants
Tennstedt T, Heuer H, Top EM, Szczepanowski R, Pühler A, Schlüter A (2005)
Plasmid 53(1): 40-41.
PUB
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1602311 PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1601712
Insights into genome plasticity and pathogenicity of the plant pathogenic bacterium Xanthomonas campestris pv. vesicatoria revealed by the complete genome sequence
Thieme F, Koebnik R, Bekel T, Berger C, Boch J, Buttner D, Caldana C, Gaigalat L, Goesmann A, Kay S, Kirchner O, et al. (2005)
JOURNAL OF BACTERIOLOGY 187(21): 7254-7266.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1602933
Combined transcriptome profiling reveals a novel family of arbuscular mycorrhizal-specific Medicago truncatula lectin genes
Frenzel A, Manthey K, Perlick AM, Meyer F, Pühler A, Küster H, Krajinski F (2005)
Mol Plant-Microbe Interact 18(8): 771-782.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | GenBank
 
2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1601308
Magnetoresistive sensors and magnetic nanoparticles for biotechnology
Reiss G, Brückl H, Hütten A, Schotter J, Brzeska M, Panhorst M, Sudfeld D, Becker A, Kamp P-B, Pühler A, Wojczykowski K, et al. (2005)
Journal of Materials Research 20(12): 3294-3302.
PUB | DOI | WoS
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1601771 OA
Functional genomics and expression analysis of the Corynebacterium glutamicum fpr2-cysIXHDNYZ gene cluster involved in assimilatory sulphate reduction
Rückert C, Koch DJ, Rey DA, Albersmeier A, Mormann S, Pühler A, Kalinowski J (2005)
BMC Genomics 6(1): 121.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | GenBank
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1602010
Role of the regulatory gene rirA in the transcriptional response of Sinorhizobium meliloti to iron limitation
Chao T-C, Buhrmester J, Hansmeier N, Pühler A, Weidner S (2005)
APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY 71(10): 5969-5982.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1602017
Role of the ssu and seu genes of Corynebacterium glutamicum ATCC 13032 in utilization of sulfonates and sulfonate esters as sulfur sources
Koch DJ, Rückert C, Rey DA, Mix A, Pühler A, Kalinowski J (2005)
APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY 71(10): 6104-6114.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | GenBank
 

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