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548 Publikationen

2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1633812
Jochmann, N.; Kurze, A. - K.; Czaja, L. F.; Brinkrolf, K.; Brune, I.; Hueser, A. T.; Hansmeier, N.; Pühler, A.; Borovok, I.; Tauch, A. (2009): Genetic makeup of the Corynebacterium glutamicum LexA regulon deduced from comparative transcriptomics and in vitro DNA band shift assays MICROBIOLOGY,155:(5): 1459-1477.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1634447
Bekel, T.; Henckel, K.; Küster, H.; Meyer, F.; Mittard-Runte, V.; Neuweger, H.; Paarmann, D.; Rupp, O.; Zakrzewski, M.; Pühler, A.; Stoye, J.; Goesmann, A. (2009): The Sequence Analysis and Management System - SAMS-2.0: Data management and sequence analysis adapted to changing requirements from traditional sanger sequencing to ultrafast sequencing technologies Journal of Biotechnology,140:(1-2): 3-12.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1783292 OA
Gross, R.; Guzman, C. A.; Sebaihia, M.; Martins dos Santos, V. A. P.; Pieper, D. H.; Koebnik, R.; Lechner, M.; Bartels, D.; Buhrmester, J.; Choudhuri, J. V.; Ebensen, T.; Gaigalat, L.; Herrmann, S.; Khachane, A. N.; Larisch, C.; Link, S.; Linke, B.; Meyer, F.; Mormann, S.; Nakunst, D.; Rückert, C.; Schneiker-Bekel, S.; Schulze, K.; Vorhölter, F. - J.; Yevsa, T.; Engle, J. T.; Goldman, W. E. .; Pühler, A.; Göbel, U. B.; Goesmann, A.; Blöcker, H.; Kaiser, O.; Martinez-Arias, R. (2008): The missing link: Bordetella petrii is endowed with both the metabolic versatility of environmental bacteria and virulence traits of pathogenic Bordetellae BMC Genomics,9:(1): 449.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1592024
Vorhölter, F. - J.; Schneiker-Bekel, S.; Goesmann, A.; Krause, L.; Bekel, T.; Kaiser, O.; Linke, B.; Patschkowski, T.; Rückert, C.; Schmid, J.; Sidhu, V. K.; Sieber, V.; Tauch, A.; Watt, S. A.; Weisshaar, B.; Becker, A.; Niehaus, K.; Pühler, A. (2008): The genome of Xanthomonas campestris pv. campestris B 100 and its use for the reconstruction of metabolic pathways involved in xanthan biosynthesis Journal of Biotechnology,134:(1-2): 33-45.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585980
Schlueter, A.; Krause, L.; Szczepanowski, R.; Goesmann, A.; Pühler, A. (2008): Genetic diversity and composition of a plasmid metagenome from a wastewater treatment plant Journal of Biotechnology,136:(1-2): 65-76.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1588078
Brinkrolf, K.; Ploeger, S.; Solle, S.; Brune, I.; Nentwich, S. S.; Hueser, A. T.; Kalinowski, J.; Pühler, A.; Tauch, A. (2008): The LacI/GalR family transcriptional regulator UriR negatively controls uridine utilization of Corynebacterium glutamicum by binding to catabolite-responsive element (cre)-like sequences MICROBIOLOGY,154:(4): 1068-1081.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1592318
Meschini, E. P.; Blanco, F. A.; Zanetti, M. E.; Beker, M. P.; Küster, H.; Pühler, A.; Aguilar, O. M. (2008): Host genes involved in nodulation preference in common bean (Phaseolus vulgaris)-Rhizobium etli symbiosis revealed - by suppressive subtractive hybridization MOLECULAR PLANT-MICROBE INTERACTIONS,21:(4): 459-468.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585560 OA
Rückert, C.; Milse, J.; Albersmeier, A.; Koch, D. J.; Pühler, A.; Kalinowski, J. (2008): The dual transcriptional regulator CysR in Corynebacterium glutamicum ATCC 13032 controls a subset of genes of the McbR regulon in response to the availability of sulphide acceptor molecules BMC GENOMICS,9:(1): 483.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585914
Pühler, A.; Selbitschka, W. (2008): Genome research in the light of ultrafast sequencing technologies JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY,136:(1-2): 1-2.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585969
Szczepanowski, R.; Bekel, T.; Goesmann, A.; Krause, L.; Kroemeke, H.; Kaiser, O.; Eichler, W.; Pühler, A.; Schlueter, A. (2008): Insight into the plasmid metagenome of wastewater treatment plant bacteria showing reduced susceptibility to antimicrobial drugs analysed by the 454-pyrosequencing technology JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY,136:(1-2): 54-64.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1592210
Jungwirth, B.; Emer, D.; Brune, I.; Hansmeier, N.; Pühler, A.; Eikmanns, B. J.; Tauch, A. (2008): Triple transcriptional control of the resuscitation promoting factor 2 (rpf2) gene of Corynebacterium glutamicum by the regulators of acetate metabolism RamA and RamB and the cAMP-dependent regulator GlxR FEMS MICROBIOLOGY LETTERS,281:(2): 190-197.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1586009
Krause, L.; Diaz, N. N.; Edwards, R. A.; Gartemann, K. - H.; Krömeke, H.; Neuweger, H.; Pühler, A.; Runte, K. J.; Schlüter, A.; Stoye, J.; Szczepanowski, R.; Tauch, A.; Goesmann, A. (2008): Taxonomic composition and gene content of a methane-producing microbial community isolated from a biogas reactor JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY,136:(1-2): 91-101.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1586869
Serrania, J.; Vorhölter, F. - J.; Niehaus, K.; Pühler, A.; Becker, A. (2008): Identification of Xanthomonas campestris pv. campestris galactose utilization genes from transcriptome data Journal of Biotechnology,135:(3): 309-317.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585956
Stiens, M.; Becker, A.; Bekel, T.; Gödde, V.; Goesmann, A.; Niehaus, K.; Schneiker-Bekel, S.; Selbitschka, W.; Weidner, S.; Schlüter, A.; Pühler, A. (2008): Comparative genomic hybridisation and ultrafast pyrosequencing revealed remarkable differences between the Sinorhizobium meliloti genomes of the model strain Rm1021 and the field isolate SM11 Journal of Biotechnology,136:(1-2): 31-37.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585987
Schlüter, A.; Bekel, T.; Diaz, N. N.; Dondrup, M.; Eichenlaub, R.; Gartemann, K. - H.; Krahn, I.; Krause, L.; Kroemeke, H.; Kruse, O.; Mussgnug, J. H.; Neuweger, H.; Niehaus, K.; Pühler, A.; Runte, K. J.; Szczepanowski, R.; Tauch, A.; Tilker, A.; Viehöver, P.; Goesmann, A. (2008): The metagenome of a biogas-producing microbial community of a production-scale biogas plant fermenter analysed by the 454-pyrosequencing technology Journal of Biotechnology,136:(1-2): 77-90.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1586719
Kohl, T.; Baumbach, J.; Jungwirth, B.; Pühler, A.; Tauch, A. (2008): The GlxR regulon of the amino acid producer Corynebacterium glutamicum: In silico and in vitro detection of DNA binding sites of a global transcription regulator JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY,135:(4): 340-350.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585918
Tauch, A.; Trost, E.; Tilker, A.; Ludewig, U.; Schneiker-Bekel, S.; Goesmann, A.; Arnold, W.; Bekel, T.; Brinkrolf, K.; Brune, I.; Goetker, S.; Kalinowski, J.; Kamp, P. - B.; Lobo, F. P.; Viehöver, P.; Weisshaar, B.; Soriano, F.; Droege, M.; Pühler, A. (2008): The lifestyle of Corynebacterium urealyticum derived from its complete genome sequence established by pyrosequencing Journal of Biotechnology,136:(1-2): 11-21.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1592345
Gartemann, K. - H.; Abt, B.; Bekel, T.; Burger, A.; Engemann, J.; Fluegel, M.; Gaigalat, L.; Goesmann, A.; Graefen, I.; Kalinowski, J.; Kaup, O.; Kirchner, O.; Krause, L.; Linke, B.; McHardy, A.; Meyer, F.; Pohle, S.; Rückert, C.; Schneiker-Bekel, S.; Zellermann, E. - M.; Pühler, A.; Eichenlaub, R.; Kaiser, O.; Bartels, D. (2008): The genome sequence of the tomato-pathogenic actinomycete Clavibacter michiganensis subsp michiganensis NCPPB382 reveals a large island involved in pathogenicity JOURNAL OF BACTERIOLOGY,190:(6): 2138-2149.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585939
Tauch, A.; Schneider, J.; Szczepanowski, R.; Tilker, A.; Viehöver, P.; Gartemann, K. - H.; Arnold, W.; Blom, J.; Brinkrolf, K.; Brune, I.; Goetker, S.; Weisshaar, B.; Goesmann, A.; Droege, M.; Pühler, A. (2008): Ultrafast pyrosequencing of Corynebacterium kroppenstedtii DSM44385 revealed insights into the physiology of a lipophilic corynebacterium that lacks mycolic acids Journal of Biotechnology,136:(1-2): 22-30.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1631126
Kuhn, S.; Stiens, M.; Pühler, A.; Schlüter, A. (2008): Prevalence of pSmeSM11a-like plasmids in indigenous Sinorhizobium meliloti strains isolated in the course of a field release experiment with genetically modified S-meliloti strains FEMS MICROBIOLOGY ECOLOGY,63:(1): 118-131.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 

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