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545 Publikationen

2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2938413 OA
Schaffert, L., Schneiker-Bekel, S., Dymek, S., Droste, J., Persicke, M., Busche, T., Brandt, D., Pühler, A. & Kalinowski, J. (2019). Essentiality of the Maltase AmlE in Maltose Utilization and Its Transcriptional Regulation by the Repressor AmlR in the Acarbose-Producing Bacterium Actinoplanes sp. SE50/110. Frontiers in Microbiology, 10: 2448. Frontiers Media. doi:10.3389/fmicb.2019.02448.
PUB | Dateien verfügbar | DOI | Download (ext.) | EBI - ENA Project
 
2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2936439 OA
Schaffert, L., März, C., Burkhardt, L., Droste, J., Brandt, D., Busche, T., Rosen, W., Schneiker-Bekel, S., Persicke, M., Pühler, A. & Kalinowski, J. (2019). Evaluation of vector systems and promoters for overexpression of the acarbose biosynthesis gene acbC in Actinoplanes sp. SE50/110. Microbial Cell Factories, 18: 114. Springer Nature. doi:10.1186/s12934-019-1162-5.
PUB | Dateien verfügbar | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2935899 OA
López, J.L., Lozano, M.J., Lagares, A., Fabre, M.L., Draghi, W.O., Del Papa, M.F., Pistorio, M., Becker, A., Wibberg, D., Schlüter, A., Pühler, A., Blom, J., Goesmann, A. & Lagares, A. (2019). Codon Usage Heterogeneity in the Multipartite Prokaryote Genome. Selection-Based Coding Bias Associated with Gene Location, Expression Level, and Ancestry. mBio, 10(3): e00505-19. American Society for Microbiology. doi:10.1128/mbio.00505-19.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2936223 OA
Belmann, P., Fischer, B., Krüger, J., Procházka, M., Rasche, H., Prinz, M., Hanussek, M., Lang, M., Bartusch, F., Gläßle, B., Krüger, J., Pühler, A. & Sczyrba, A. (2019). de.NBI Cloud federation through ELIXIR AAI. F1000Research, 8: 842. F1000 Research Ltd. doi:10.12688/f1000research.19013.1.
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2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2936839 OA
Nelkner, J., Tejerizo, G.T., Hassa, J., Lin, T.W., Witte, J., Verwaaijen, B., Winkler, A., Bunk, B., Spröer, C., Overmann, J., Grosch, R., Pühler, A. & Schlüter, A. (2019). Genetic Potential of the Biocontrol Agent Pseudomonas brassicacearum (Formerly P. trivialis) 3Re2-7 Unraveled by Genome Sequencing and Mining, Comparative Genomics and Transcriptomics. Genes, 10(8): 601. MDPI. doi:10.3390/genes10080601.
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2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2935923 OA
Nelkner, J., Henke, C., Lin, T.W., Pätzold, W., Hassa, J., Jaenicke, S., Grosch, R., Pühler, A., Sczyrba, A. & Schlüter, A. (2019). Effect of Long-Term Farming Practices on Agricultural Soil Microbiome Members Represented by Metagenomically Assembled Genomes (MAGs) and Their Predicted Plant-Beneficial Genes. Genes, 10(6): 424. MDPI. doi:10.3390/genes10060424.
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2019 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2934570
Castellani, L.G., Nilsson, J.F., Wibberg, D., Schlüter, A., Pühler, A., Brom, S., Pistorio, M. & Tejerizo, G.T. (2019). Insight into the structure, function and conjugative transfer of pLPU83a, an accessory plasmid of Rhizobium favelukesii LPU83. Plasmid. Elsevier BV. doi:10.1016/j.plasmid.2019.03.004.
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2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2935556 OA
Verwaaijen, B., Wibberg, D., Winkler, A., Zrenner, R., Bednarz, H., Niehaus, K., Grosch, R., Pühler, A. & Schlüter, A. (2019). A comprehensive analysis of the Lactuca sativa, L. transcriptome during different stages of the compatible interaction with Rhizoctonia solani. Scientific Reports, 9: 7221. Springer Nature. doi:10.1038/s41598-019-43706-5.
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2920160
Arnold, W., Grotjohann, N., Pühler, A., Röllke, K. & Selbitschka, W. (2018). Die CeBiT ec Schülerakademie „Synthetische Biologie/Biotechnologie “– Begabtenförderung in einem zukunftsträchtigen Forschungsfeld. ABB-Information. Jahresheft, 2017. Arbeitskreis Begabungsforschung und Begabungsförderung.
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2916929
Stolze, Y., Bremges, A., Maus, I., Pühler, A., Sczyrba, A. & Schlüter, A. (2018). Targeted in situ metatranscriptomics for selected taxa from mesophilic and thermophilic biogas plants. Microbial Biotechnology, 11(4), 667-679. Wiley-Blackwell. doi:10.1111/1751-7915.12982.
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2920169
Salto, I.P., Torres Tejerizo, G., Wibberg, D., Pühler, A., Schlüter, A. & Pistorio, M. (2018). Comparative genomic analysis of Acinetobacter spp. plasmids originating from clinical settings and environmental habitats. Scientific Reports, 8(1): 7783. Springer Nature. doi:10.1038/s41598-018-26180-3.
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2920170
Hassa, J., Maus, I., Off, S., Pühler, A., Scherer, P., Klocke, M. & Schlüter, A. (2018). Metagenome, metatranscriptome, and metaproteome approaches unraveled compositions and functional relationships of microbial communities residing in biogas plants. Applied Microbiology and Biotechnology, 102(12), 5045-5063. Springer Nature. doi:10.1007/s00253-018-8976-7.
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2920168
Tomazetto, G., Hahnke, S., Wibberg, D., Pühler, A., Klocke, M. & Schlüter, A. (2018). Proteiniphilum saccharofermentans str. M3/6 T isolated from a laboratory biogas reactor is versatile in polysaccharide and oligopeptide utilization as deduced from genome-based metabolic reconstructions. Biotechnology Reports, 18: e00254. Elsevier BV. doi:10.1016/j.btre.2018.e00254.
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2930510
Alkhateeb, R., Vorhölter, F.-J., Steffens, T., Rückert, C., Ortseifen, V., Hublik, G., Niehaus, K. & Pühler, A. (2018). Comparative transcription profiling of two fermentation cultures of Xanthomonas campestris pv. campestris B100 sampled in the growth and in the stationary phase. APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY, 102(15), 6613-6625. Springer. doi:10.1007/s00253-018-9106-2.
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2920750
Maus, I., Rumming, M., Bergmann, I., Heeg, K., Pohl, M., Nettmann, E., Jaenicke, S., Blom, J., Pühler, A., Schlüter, A., Sczyrba, A. & Klocke, M. (2018). Characterization of Bathyarchaeota genomes assembled from metagenomes of biofilms residing in mesophilic and thermophilic biogas reactors. Biotechnology for Biofuels, 11: 167. Springer Nature. doi:10.1186/s13068-018-1162-4.
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2920173
Wibberg, D., Salto, I.P., Eikmeyer, F.G., Maus, I., Winkler, A., Nordmann, P., Pühler, A., Poirel, L. & Schlüter, A. (2018). Complete Genome Sequencing of Acinetobacter baumannii Strain K50 Discloses the Large Conjugative Plasmid pK50a Encoding Carbapenemase OXA-23 and Extended-Spectrum β-Lactamase GES-11. Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 62(5): e00212-18. American Society for Microbiology. doi:10.1128/aac.00212-18.
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2917037
Verwaaijen, B., Wibberg, D., Nelkner, J., Gordin, M., Rupp, O., Winkler, A., Bremges, A., Blom, J., Grosch, R., Pühler, A. & Schlüter, A. (2018). Assembly of the Lactuca sativa, L. cv. Tizian draft genome sequence reveals differences within major resistance complex 1 as compared to the cv. Salinas reference genome. JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY, 267, 12-18. Elsevier Science Bv. doi:10.1016/j.jbiotec.2017.12.021.
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2908419 OA
Torres Tejerizo, G.A., Wibberg, D., Winkler, A., Ormeño-Orrillo, E., Martínez-Romero, E., Niehaus, K., Pühler, A., Kalinowski, J., Lagares, A., Schlüter, A. & Pistorio, M. (2017). Genome Sequence of the Symbiotic Type Strain Rhizobium tibeticum CCBAU85039T. Genome Announcements, 5(4), e01513-16. American Society for Microbiology. doi:10.1128/genomea.01513-16.
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2912114 OA
Verwaaijen, B., Wibberg, D., Kröber, M., Winkler, A., Zrenner, R., Bednarz, H., Niehaus, K., Grosch, R., Pühler, A. & Schlüter, A. (2017). The Rhizoctonia solani AG1-IB (isolate 7/3/14) transcriptome during interaction with the host plant lettuce (Lactuca sativa L.). PLOS ONE, 12(5): e0177278. Public Library of Science (PLoS). doi:10.1371/journal.pone.0177278.
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2913116 OA
Wolf, T., Droste, J., Gren, T., Ortseifen, V., Schneiker-Bekel, S., Zemke, T., Pühler, A. & Kalinowski, J. (2017). The MalR type regulator AcrC is a transcriptional repressor of acarbose biosynthetic genes in Actinoplanes sp. SE50/110. BMC Genomics, 18: 562. Springer Nature. doi:10.1186/s12864-017-3941-x.
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