Please note that PUB no longer supports Internet Explorer versions 8 or 9 (or earlier).

We recommend upgrading to the latest Internet Explorer, Google Chrome, or Firefox.

544 Publikationen

2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2936223
Belmann, P.; Fischer, B.; Krüger, J.; Procházka, M.; Rasche, H.; Prinz, M.; Hanussek, M.; Lang, M.; Bartusch, F.; Gläßle, B.; Krüger, J.; Pühler, A.; Sczyrba, A. (2019): de.NBI Cloud federation through ELIXIR AAI F1000Research,8:842
PUB | PDF | DOI | PubMed | Europe PMC
 
2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2936839
Nelkner, J.; Tejerizo, G. T.; Hassa, J.; Lin, T. W.; Witte, J.; Verwaaijen, B.; Winkler, A.; Bunk, B.; Spröer, C.; Overmann, J.; Grosch, R.; Pühler, A.; Schlüter, A. (2019): Genetic Potential of the Biocontrol Agent Pseudomonas brassicacearum (Formerly P. trivialis) 3Re2-7 Unraveled by Genome Sequencing and Mining, Comparative Genomics and Transcriptomics Genes,10:(8):601
PUB | PDF | DOI | PubMed | Europe PMC
 
2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2935923
Nelkner, J.; Henke, C.; Lin, T. W.; Pätzold, W.; Hassa, J.; Jaenicke, S.; Grosch, R.; Pühler, A.; Sczyrba, A.; Schlüter, A. (2019): Effect of Long-Term Farming Practices on Agricultural Soil Microbiome Members Represented by Metagenomically Assembled Genomes (MAGs) and Their Predicted Plant-Beneficial Genes Genes,10:(6):424
PUB | PDF | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2936439
Schaffert, L.; März, C.; Burkhardt, L.; Droste, J.; Brandt, D.; Busche, T.; Rosen, W.; Schneiker-Bekel, S.; Persicke, M.; Pühler, A.; Kalinowski, J. (2019): Evaluation of vector systems and promoters for overexpression of the acarbose biosynthesis gene acbC in Actinoplanes sp. SE50/110 Microbial Cell Factories,18:114
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2019 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2934570
Castellani, L. G.; Nilsson, J. F.; Wibberg, D.; Schlüter, A.; Pühler, A.; Brom, S.; Pistorio, M.; Tejerizo, G. T. (2019): Insight into the structure, function and conjugative transfer of pLPU83a, an accessory plasmid of Rhizobium favelukesii LPU83 Plasmid
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2935899
López, J. L.; Lozano, M. J.; Lagares, A.; Fabre, M. L.; Draghi, W. O.; Del Papa, M. F.; Pistorio, M.; Becker, A.; Wibberg, D.; Schlüter, A.; Pühler, A.; Blom, J.; Goesmann, A.; Lagares, A. (2019): Codon Usage Heterogeneity in the Multipartite Prokaryote Genome. Selection-Based Coding Bias Associated with Gene Location, Expression Level, and Ancestry mBio,10:(3):e00505-19
PUB | PDF | DOI
 
2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2935556
Verwaaijen, B.; Wibberg, D.; Winkler, A.; Zrenner, R.; Bednarz, H.; Niehaus, K.; Grosch, R.; Pühler, A.; Schlüter, A. (2019): A comprehensive analysis of the Lactuca sativa, L. transcriptome during different stages of the compatible interaction with Rhizoctonia solani Scientific Reports,9:7221
PUB | PDF | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2920160
Arnold, W.; Grotjohann, N.; Pühler, A.; Röllke, K.; Selbitschka, W. (2018): Die CeBiT ec Schülerakademie „Synthetische Biologie/Biotechnologie “– Begabtenförderung in einem zukunftsträchtigen Forschungsfeld ABB-Information. Jahresheft,2017
PUB
 
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2916929
Stolze, Y.; Bremges, A.; Maus, I.; Pühler, A.; Sczyrba, A.; Schlüter, A. (2018): Targeted in situ metatranscriptomics for selected taxa from mesophilic and thermophilic biogas plants Microbial Biotechnology,11:(4): 667-679.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2920169
Salto, I. P.; Torres Tejerizo, G.; Wibberg, D.; Pühler, A.; Schlüter, A.; Pistorio, M. (2018): Comparative genomic analysis of Acinetobacter spp. plasmids originating from clinical settings and environmental habitats Scientific Reports,8:(1):7783
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2920170
Hassa, J.; Maus, I.; Off, S.; Pühler, A.; Scherer, P.; Klocke, M.; Schlüter, A. (2018): Metagenome, metatranscriptome, and metaproteome approaches unraveled compositions and functional relationships of microbial communities residing in biogas plants Applied Microbiology and Biotechnology,102:(12): 5045-5063.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2920168
Tomazetto, G.; Hahnke, S.; Wibberg, D.; Pühler, A.; Klocke, M.; Schlüter, A. (2018): Proteiniphilum saccharofermentans str. M3/6 T isolated from a laboratory biogas reactor is versatile in polysaccharide and oligopeptide utilization as deduced from genome-based metabolic reconstructions Biotechnology Reports,18:e00254
PUB | DOI
 
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2930510
Alkhateeb, R.; Vorhölter, F. - J.; Steffens, T.; Rückert, C.; Ortseifen, V.; Hublik, G.; Niehaus, K.; Pühler, A. (2018): Comparative transcription profiling of two fermentation cultures of Xanthomonas campestris pv. campestris B100 sampled in the growth and in the stationary phase APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY,102:(15): 6613-6625.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2920750
Maus, I.; Rumming, M.; Bergmann, I.; Heeg, K.; Pohl, M.; Nettmann, E.; Jaenicke, S.; Blom, J.; Pühler, A.; Schlüter, A.; Sczyrba, A.; Klocke, M. (2018): Characterization of Bathyarchaeota genomes assembled from metagenomes of biofilms residing in mesophilic and thermophilic biogas reactors Biotechnology for Biofuels,11:167
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2920173
Wibberg, D.; Salto, I. P.; Eikmeyer, F. G.; Maus, I.; Winkler, A.; Nordmann, P.; Pühler, A.; Poirel, L.; Schlüter, A. (2018): Complete Genome Sequencing of Acinetobacter baumannii Strain K50 Discloses the Large Conjugative Plasmid pK50a Encoding Carbapenemase OXA-23 and Extended-Spectrum β-Lactamase GES-11 Antimicrobial Agents and Chemotherapy,62:(5):e00212-18
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2917037
Verwaaijen, B.; Wibberg, D.; Nelkner, J.; Gordin, M.; Rupp, O.; Winkler, A.; Bremges, A.; Blom, J.; Grosch, R.; Pühler, A.; Schlüter, A. (2018): Assembly of the Lactuca sativa, L. cv. Tizian draft genome sequence reveals differences within major resistance complex 1 as compared to the cv. Salinas reference genome JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY,267: 12-18.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2908419
Torres Tejerizo, G. A.; Wibberg, D.; Winkler, A.; Ormeño-Orrillo, E.; Martínez-Romero, E.; Niehaus, K.; Pühler, A.; Kalinowski, J.; Lagares, A.; Schlüter, A.; Pistorio, M. (2017): Genome Sequence of the Symbiotic Type Strain Rhizobium tibeticum CCBAU85039T Genome Announcements,5:(4): e01513-16.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2912114
Verwaaijen, B.; Wibberg, D.; Kröber, M.; Winkler, A.; Zrenner, R.; Bednarz, H.; Niehaus, K.; Grosch, R.; Pühler, A.; Schlüter, A. (2017): The Rhizoctonia solani AG1-IB (isolate 7/3/14) transcriptome during interaction with the host plant lettuce (Lactuca sativa L.) PLOS ONE,12:(5):e0177278
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2913116
Wolf, T.; Droste, J.; Gren, T.; Ortseifen, V.; Schneiker-Bekel, S.; Zemke, T.; Pühler, A.; Kalinowski, J. (2017): The MalR type regulator AcrC is a transcriptional repressor of acarbose biosynthetic genes in Actinoplanes sp. SE50/110 BMC Genomics,18:562
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2915516
Maus, I.; Bremges, A.; Stolze, Y.; Hahnke, S.; Cibis, K. G.; Koeck, D. E.; Kim, Y. S.; Kreubel, J.; Hassa, J.; Wibberg, D.; Weimann, A.; Off, S.; Stantscheff, R.; Zverlov, V. V.; Schwarz, W. H.; König, H.; Liebl, W.; Scherer, P.; McHardy, A. C.; Sczyrba, A.; Klocke, M.; Pühler, A.; Schlüter, A. (2017): Genomics and prevalence of bacterial and archaeal isolates from biogas-producing microbiomes Biotechnology for Biofuels,10:(1):264
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2910369
Maus, I.; Kim, Y. S.; Wibberg, D.; Stolze, Y.; Off, S.; Antonczyk, S.; Pühler, A.; Scherer, P.; Schlüter, A. (2017): Biphasic Study to Characterize Agricultural Biogas Plants by High-Throughput 16S rRNA Gene Amplicon Sequencing and Microscopic Analysis Journal of Microbiology and Biotechnology,27:(2): 321-334.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2916528
Wolf, T.; Schneiker-Bekel, S.; Neshat, A.; Ortseifen, V.; Wibberg, D.; Zemke, T.; Pühler, A.; Kalinowski, J. (2017): Genome improvement of the acarbose producer Actinoplanes sp SE50/110 and annotation refinement based on RNA-seq analysis JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY,251: 112-123.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2911997
Omar Draghi, W.; Florencia Del Papa, M.; Barsch, A.; Albicoro, F. J.; Lozano, M. J.; Pühler, A.; Niehaus, K.; Lagares, A. (2017): A metabolomic approach to characterize the acid-tolerance response in Sinorhizobium meliloti METABOLOMICS,13:(6):71
PUB | DOI | WoS
 
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2916470
Tomazetto, G.; Hahnke, S.; Langer, T.; Wibberg, D.; Blom, J.; Maus, I.; Pühler, A.; Klocke, M.; Schlüter, A. (2017): The completely annotated genome and comparative genomics of the Peptoniphilaceae bacterium str. ING2-D1G, a novel acidogenic bacterium isolated from a mesophilic biogas reactor Journal of Biotechnology,257: 178-186.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2910373
Bartholomäus, A.; Wibberg, D.; Winkler, A.; Pühler, A.; Schlüter, A.; Varrelmann, M. (2017): Identification of a novel mycovirus isolated from Rhizoctonia solani (AG 2-2 IV) provides further information about genome plasticity within the order Tymovirales Archives of Virology,162:(2): 555-559.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2916406
Lasek, R.; Dziewit, L.; Ciok, A.; Decewicz, P.; Romaniuk, K.; Jedrys, Z.; Wibberg, D.; Schlüter, A.; Pühler, A.; Bartosik, D. (2017): Genome content, metabolic pathways and biotechnological potential of the psychrophilic Arctic bacterium Psychrobacter sp DAB_AL43B, a source and a host of novel Psychrobacter-specific vectors Journal of Biotechnology,263: 64-74.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2916435
Czarnecki, J.; Dziewit, L.; Puzyna, M.; Prochwicz, E.; Tudek, A.; Wibberg, D.; Schlüter, A.; Pühler, A.; Bartosik, D. (2017): Lifestyle-determining extrachromosomal replicon pAMV1 and its contribution to the carbon metabolism of the methylotrophic bacterium Paracoccus aminovorans JCM 7685 Environmental Microbiology,19:(11): 4536-4550.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2914538
Ortseifen, V.; Kalinowski, J.; Pühler, A.; Rückert, C. (2017): The complete genome sequence of the actinobacterium Streptomyces glaucescens GLA.O (DSM 40922) carrying gene clusters for the biosynthesis of tetracenomycin C, 5`-hydroxy streptomycin, and acarbose. J Biotechnol,262: 84-88.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2916490
Wibberg, D.; Genzel, F.; Verwaaijen, B.; Blom, J.; Rupp, O.; Goesmann, A.; Zrenner, R.; Grosch, R.; Pühler, A.; Schlüter, A. (2017): Draft genome sequence of the potato pathogen Rhizoctonia solani AG3-PT isolate Ben3 Archives of Microbiology,199:(7): 1065-1068.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2911777
Torres Tejerizo, G. A.; Kim, Y. S.; Maus, I.; Wibberg, D.; Winkler, A.; Off, S.; Pühler, A.; Scherer, P.; Schlüter, A. (2017): Genome sequence of Methanobacterium congolense strain Buetzberg, a hydrogenotrophic, methanogenic archaeon, isolated from a mesophilic industrial-scale biogas plant utilizing bio-waste Journal of Biotechnology,247: 1-5.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2911462
Alkhateeb, R.; Rückert, C.; Rupp, O.; Pucker, B.; Hublik, G.; Wibberg, D.; Niehaus, K.; Pühler, A.; Vorhölter, F. - J. (2017): Refined annotation of the complete genome of the phytopathogenic and xanthan producing Xanthomonas campestris pv. campestris strain B100 based on RNA sequence data Journal of Biotechnology,253: 55-61.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2904970
Maus, I.; Wibberg, D.; Winkler, A.; Pühler, A.; Schnürer, A.; Schlüter, A. (2016): Complete Genome Sequence of the MethanogenMethanoculleus bourgensisBA1 Isolated from a Biogas Reactor Genome Announcements,4:(3):e00568-16
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2907676
Jaenicke, S.; Bunk, B.; Wibberg, D.; Spröer, C.; Hersemann, L.; Blom, J.; Winkler, A.; Schatschneider, S.; Albaum, S.; Kölliker, R.; Goesmann, A.; Pühler, A.; Overmann, J.; Vorhölter, F. - J. (2016): Complete Genome Sequence of the Barley Pathogen Xanthomonas translucens pv. translucens DSM 18974 T (ATCC 19319 T) Genome Announcements,4:(6):e01334-16
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2904978
Koeck, D. E.; Maus, I.; Wibberg, D.; Winkler, A.; Zverlov, V. V.; Liebl, W.; Pühler, A.; Schwarz, W. H.; Schlüter, A. (2016): Draft Genome Sequence of Propionisporasp. Strain 2/2-37, a New Xylan-Degrading Bacterium Isolated from a Mesophilic Biogas Reactor Genome Announcements,4:(3): e00609-16.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2904993
Koeck, D. E.; Maus, I.; Wibberg, D.; Winkler, A.; Zverlov, V. V.; Liebl, W.; Pühler, A.; Schwarz, W. H.; Schlüter, A. (2016): Complete Genome Sequence of Herbinix luporumSD1D, a New Cellulose-Degrading Bacterium Isolated from a Thermophilic Biogas Reactor Genome Announcements,4:(4): e00687-16.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2907431
Bartholomaeus, A.; Wibberg, D.; Winkler, A.; Pühler, A.; Schlüter, A.; Varrelmann, M. (2016): Deep Sequencing Analysis Reveals the Mycoviral Diversity of the Virome of an Avirulent Isolate of Rhizoctonia solani AG-2-2 IV PLOS ONE,11:(11):e0165965
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2904815
Stolze, Y.; Bremges, A.; Rumming, M.; Henke, C.; Maus, I.; Pühler, A.; Sczyrba, A.; Schlüter, A. (2016): Identification and genome reconstruction of abundant distinct taxa in microbiomes from one thermophilic and three mesophilic production-scale biogas plants Biotechnology for Biofuels,9:156
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2903660
Steffens, T.; Vorhölter, F. - J.; Giampa, M.; Hublik, G.; Pühler, A.; Niehaus, K. (2016): The influence of a modified lipopolysaccharide O-antigen on the biosynthesis of xanthan in Xanthomonas campestris pv. campestris B100 BMC Microbiology,16:93
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2917144
Wibberg, D.; Andersson, L.; Tzelepis, G.; Rupp, O.; Blom, J.; Jelonek, L.; Pühler, A.; Fogelqvist, J.; Varrelmann, M.; Schlüter, A.; Dixelius, C. (2016): Genome analysis of the sugar beet pathogen Rhizoctonia solani AG2-2IIIB revealed high numbers in secreted proteins and cell wall degrading enzymes BMC Genomics,17:245
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2906715
Koeck, D. E.; Wibberg, D.; Maus, I.; Winkler, A.; Albersmeier, A.; Zverlov, V. V.; Liebl, W.; Pühler, A.; Schwarz, W. H.; Schlüter, A. (2016): Corrigendum to "Complete genome sequence of the cellulolytic thermophile Ruminoclostridium cellulosi wild-type strain DG5 isolated from a thermophilic biogas plant (J. Biotechnol. 188 (2014) 136–137)")" Journal of Biotechnology,237: 35.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2905630
Gren, T.; Ortseifen, V.; Wibberg, D.; Schneiker-Bekel, S.; Bednarz, H.; Niehaus, K.; Zemke, T.; Persicke, M.; Pühler, A.; Kalinowski, J. (2016): Genetic engineering in Actinoplanes sp SE50/110-development of an intergeneric conjugation system for the introduction of actinophage-based integrative vectors Journal of Biotechnology,232: 79-88.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2908260
Torres Tejerizo, G. A.; Antonio Rogel, M.; Ormeno-Orrillo, E.; Julia Althabegoiti, M.; Fernanda Nilsson, J.; Niehaus, K.; Schlüter, A.; Pühler, A.; Florencia Del Papa, M.; Lagares, A.; Martinez-Romero, E.; Pistorio, M. (2016): Rhizobium favelukesii sp nov., isolated from the root nodules of alfalfa (Medicago sativa L) INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY,66: 4451-4457.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2905122
Draghi, W. O.; Del Papa, M. F.; Hellweg, C.; Watt, S. A.; Watt, T. F.; Barsch, A.; Lozano, M. J.; Lagares, A., J.; Salas, M. E.; Lopez, J. L.; Albicoro, F. J.; Nilsson, J. F.; Torres Tejerizo, G. A.; Luna, M. F.; Pistorio, M.; Boiardi, J. L.; Pühler, A.; Weidner, S.; Niehaus, K.; Lagares, A. (2016): A consolidated analysis of the physiologic and molecular responses induced under acid stress in the legume-symbiont model-soil bacterium Sinorhizobium meliloti SCIENTIFIC REPORTS,6:29278
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2917142
Wibberg, D.; Andersson, L.; Rupp, O.; Goesmann, A.; Pühler, A.; Varrelmann, M.; Dixelius, C.; Schlüter, A. (2016): Draft genome sequence of the sugar beet pathogen Rhizoctonia solani AG2-2IIIB strain BBA69670 Journal of Biotechnology,222: 11-12.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2904691
Martini, M. C.; Wibberg, D.; Lozano, M.; Torres Tejerizo, G.; Albicoro, F. J.; Jaenicke, S.; van Elsas, J. D.; Petroni, A.; Garcillan-Barcia, M. P.; de la Cruz, F.; Schlüter, A.; Pühler, A.; Pistorio, M.; Lagares, A.; Del Papa, M. F. (2016): Genomics of high molecular weight plasmids isolated from an on-farm biopurification system Scientific Reports,6:28284
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2903489
Maus, I.; Cibis, K. G.; Bremges, A.; Stolze, Y.; Wibberg, D.; Tomazetto, G.; Blom, J.; Sczyrba, A.; König, H.; Pühler, A.; Schlüter, A. (2016): Genomic characterization of Defluviitoga tunisiensis L3, a key hydrolytic bacterium in a thermophilic biogas plant and its abundance as determined by metagenome fragment recruitment Journal of Biotechnology,232: 50-60.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2903302
Wibberg, D.; Bremges, A.; Dammann-Kalinowski, T.; Maus, I.; Igeño, M. I.; Vogelsang, R.; König, C.; Luque-Almagro, V. M.; Roldán, M. D.; Sczyrba, A.; Moreno-Vivián, C.; Blasco, R.; Pühler, A.; Schlüter, A. (2016): Finished genome sequence and methylome of the cyanide-degrading Pseudomonas pseudoalcaligenes strain CECT5344 as resolved by single-molecule real-time sequencing Journal of Biotechnology,232: 61-68.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2902126
Liebe, S.; Wibberg, D.; Winkler, A.; Pühler, A.; Schlüter, A.; Varrelmann, M. (2016): Taxonomic analysis of the microbial community in stored sugar beets using high-throughput sequencing of different marker genes FEMS Microbiology Ecology,92:(2):fiw004
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2905505
Wolf, T.; Gren, T.; Thieme, E.; Wibberg, D.; Zemke, T.; Pühler, A.; Kalinowski, J. (2016): Targeted genome editing in the rare actinomycete Actinoplanes sp SE50/110 by using the CRISPR/Cas9 System Journal of Biotechnology,231: 122-128.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2900928
Nesme, J.; Achouak, W.; Agathos, S.; Bailey, M.; Baldrian, P.; Brunel, D.; Frostegard, A.; Heulin, T.; Jansson, J. K.; Jurkevitch, E.; Kowalchuk, G. A.; Kruus, K. L.; Lagares, A.; Lapin-Scott, H. M.; Le Paslier, D.; ic-Mulec, I.; Murrell, C.; Myrold, D. D.; Nalin, R.; Nannipieri, P.; Neufeld, J. D.; O'Gara, F.; Parnell, J. J.; Pühler, A.; Pylro, V.; Ramos, J. L.; Roesch, L.; Schleper, C.; Schloter, M.; Sczyrba, A.; Sessitsch, A.; Sjöling, S.; Sørensen, J.; Sørensen, S. J.; Tebbe, C. C.; Topp, E.; Tsiamis, G.; Van Elsas, J. D.; Van Keulen, G.; Wagner, M.; Widmer, F.; Zhang, T.; Zhang, X.; Zhao, L.; Zhu, Y. - G.; Vogel, T. M.; Simonet, P. (2016): Back to the future of soil metagenomics Frontiers in Microbiology,7:73
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901243
Wendler, S.; Otto, A.; Ortseifen, V.; Bonn, F.; Neshat, A.; Schneiker-Bekel, S.; Wolf, T.; Zemke, T.; Wehmeier, U. F.; Hecker, M.; Kalinowski, J.; Becher, D.; Pühler, A. (2016): Comparative proteome analysis of Actinoplanes sp SE50/110 grown with maltose or glucose shows Minor differences for acarbose biosynthesis proteins but major differences for saccharide transporters Journal of Proteomics,131: 140-148.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901675
Krahn, T.; Wibberg, D.; Maus, I.; Winkler, A.; Bontron, S.; Sczyrba, A.; Nordmann, P.; Pühler, A.; Poirel, L.; Schlüter, A. (2016): Intraspecies transfer of the chromosomally encoded Acinetobacter baumannii blaNDM-1 carbapenemase gene. Antimicrobial Agents and Chemotherapy,60:(5): 3032-3040.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901808
Alkhateeb, R.; Vorhölter, F. - J.; Rückert, C.; Mentz, A.; Wibberg, D.; Hublik, G.; Niehaus, K.; Pühler, A. (2016): Genome wide transcription start sites analysis of the Xanthomonas campestris pv. campestris B100 with insights into the gum gene cluster directing the biosynthesis of the exopolysaccharide xanthan. J Biotechnol,225: 18-28.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2905260
Maus, I.; Koeck, D. E.; Cibis, K. G.; Hahnke, S.; Kim, Y. S.; Langer, T.; Kreubel, J.; Erhard, M.; Bremges, A.; Off, S.; Stolze, Y.; Jaenicke, S.; Goesmann, A.; Sczyrba, A.; Scherer, P.; König, H.; Schwarz, W. H.; Zverlov, V. V.; Liebl, W.; Pühler, A.; Schlüter, A.; Klocke, M. (2016): Unraveling the microbiome of a thermophilic biogas plant by metagenome and metatranscriptome analysis complemented by characterization of bacterial and archaeal isolates Biotechnology for Biofuels,9:(1):171
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2905504
Kröber, M.; Verwaaijen, B.; Wibberg, D.; Winkler, A.; Pühler, A.; Schlüter, A. (2016): Comparative transcriptome analysis of the biocontrol strain Bacillus amyloliquefaciens FZB42 as response to biofilm formation analyzed by RNA sequencing Journal of Biotechnology,231: 212-223.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2905629
Tomazetto, G.; Hahnke, S.; Koeck, D. E.; Wibberg, D.; Maus, I.; Pühler, A.; Klocke, M.; Schlüter, A. (2016): Complete genome analysis of Clostridium bornimense strain M2/40(T). A new acidogenic Clostridium species isolated from a mesophilic two-phase laboratory-scale biogas reactor Journal of Biotechnology,232: 38-49.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2905631
Leßmeier, L.; Alkhateeb, R.; Schulte, F.; Steffens, T.; Loka, T. P.; Pühler, A.; Niehaus, K.; Vorhölter, F. - J. (2016): Applying DNA affinity chromatography to specifically screen for sucrose-related DNA-binding transcriptional regulators of Xanthomonas campestris Journal of Biotechnology,232: 89-98.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2904234
Ortseifen, V.; Stolze, Y.; Maus, I.; Sczyrba, A.; Bremges, A.; Albaum, S.; Jaenicke, S.; Fracowiak, J.; Pühler, A.; Schlüter, A. (2016): An integrated metagenome and -proteome analysis of the microbial community residing in a biogas production plant Journal of Biotechnology,231: 268-279.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2911748
Krahn, T.; Wibberg, D.; Maus, I.; Winkler, A.; Pühler, A.; Poirel, L.; Schlüter, A. (2015): Complete Genome Sequence ofAcinetobacter baumanniiCIP 70.10, a Susceptible Reference Strain for Comparative Genome Analyses Genome Announcements,3:(4): e00850-15.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2785064
Krahn, T.; Wibberg, D.; Maus, I.; Winkler, A.; Nordmann, P.; Pühler, A.; Poirel, L.; Schlüter, A. (2015): Complete Genome Sequence of the Clinical Strain Acinetobacter baumannii R2090 Carrying the Chromosomally Encoded Metallo-β-Lactamase GeneblaNDM-1 Genome Announcements,3:(5):e01008-15
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2761035
Arnold, M.; Wibberg, D.; Blom, J.; Schatschneider, S.; Winkler, A.; Kutter, Y.; Rückert, C.; Albersmeier, A.; Albaum, S.; Goesmann, A.; Zange, S.; Heesemann, J.; Pühler, A.; Hogardt, M.; Vorhölter, F. - J. (2015): Draft Genome Sequence of Pseudomonas aeruginosa Strain WS136, a Highly Cytotoxic ExoS-Positive Wound Isolate Recovered from Pyoderma Gangrenosum Genome announcements,3:(4)
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2782605
Rupp, O.; Brinkrolf, K.; Buerth, C.; Kunigo, M.; Schneider, J.; Jaenicke, S.; Goesmann, A.; Pühler, A.; Jaeger, K. - E.; Ernst, J. F. (2015): The structure of the Cyberlindnera jadinii genome and its relation to Candida utilis analyzed by the occurrence of single nucleotide polymorphisms Journal of Biotechnology,211: 20-30.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2758144
Wibberg, D.; Rupp, O.; Jelonek, L.; Kröber, M.; Verwaaijen, B.; Blom, J.; Winkler, A.; Goesmann, A.; Grosch, R.; Pühler, A.; Schlüter, A. (2015): Improved genome sequence of the phytopathogenic fungus Rhizoctonia solani AG1-IB 7/3/14 as established by deep mate-pair sequencing on the MiSeq (Illumina) system Journal of Biotechnology,203: 19-21.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901297
Wibberg, D.; Rupp, O.; Blom, J.; Jelonek, L.; Kröber, M.; Verwaaijen, B.; Goesmann, A.; Albaum, S.; Grosch, R.; Pühler, A.; Schlüter, A. (2015): Development of a Rhizoctonia solani AG1-IB Specific Gene Model Enables Comparative Genome Analyses between Phytopathogenic R-solani AG1-IA, AG1-IB, AG3 and AG8 Isolates Plos One,10:(12):e0144769
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2768627
Eikmeyer, F. G.; Heinl, S.; Marx, H.; Pühler, A.; Grabherr, R.; Schlüter, A. (2015): Identification of Oxygen-Responsive Transcripts in the Silage Inoculant Lactobacillus buchneri CD034 by RNA Sequencing PLoS ONE,10:(7):e0134149
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2764906
Bremges, A.; Maus, I.; Belmann, P.; Eikmeyer, F. G.; Winkler, A.; Albersmeier, A.; Pühler, A.; Schlüter, A.; Sczyrba, A. (2015): Deeply sequenced metagenome and metatranscriptome of a biogas-producing microbial community from an agricultural production-scale biogas plant GigaScience,4:(1):33
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2722382
Stolze, Y.; Zakrzewski, M.; Maus, I.; Eikmeyer, F. G.; Jaenicke, S.; Rottmann, N.; Siebner, C.; Pühler, A.; Schlüter, A. (2015): Comparative metagenomics of biogas-producing microbial communities from production-scale biogas plants operating under wet or dry fermentation conditions Biotechnology for Biofuels,8:14
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2733521
Stoeveken, J.; Singh, R.; Kolkenbrock, S.; Zakrzewski, M.; Wibberg, D.; Eikmeyer, F. G.; Pühler, A.; Schlüter, A.; Moerschbacher, B. M. (2015): Successful heterologous expression of a novel chitinase identified by sequence analyses of the metagenome from a chitin-enriched soil sample Journal of Biotechnology,201: 60-68.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2717648
Hahnke, S.; Maus, I.; Wibberg, D.; Geizecler, T.; Pühler, A.; Klocke, M.; Schlüter, A. (2015): Complete genome sequence of the novel Porphyromonadaceae bacterium strain ING2-E5B isolated from a mesophilic lab-scale biogas reactor Journal of Biotechnology,193: 34-36.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709783
Ortseifen, V.; Winkler, A.; Albersmeier, A.; Wendler, S.; Pühler, A.; Kalinowski, J.; Rückert, C. (2015): Complete Genome Sequence of the Actinobacterium Streptomyces glaucescens GLA.O (DSM 40922) consisting of a linear chromosome and one linear plasmid Journal of Biotechnology,194: 81-83.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2764307
Wendler, S.; Otto, A.; Ortseifen, V.; Bonn, F.; Neshat, A.; Schneiker-Bekel, S.; Walter, F.; Wolf, T.; Zemke, T.; Wehmeier, U. F.; Hecker, M.; Kalinowski, J.; Becher, D.; Pühler, A. (2015): Comprehensive proteome analysis of Actinoplanes sp SE50/110 highlighting the location of proteins encoded by the acarbose and the pyochelin biosynthesis gene cluster Journal of Proteomics,125: 1-16.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2758122
Wibberg, D.; Alkhateeb, R.; Winkler, A.; Albersmeier, A.; Schatschneider, S.; Albaum, S.; Niehaus, K.; Hublik, G.; Pühler, A.; Vorhölter, F. - J. (2015): Draft genome of the xanthan producer Xanthomonas campestris NRRL B-1459 (ATCC 13951) Journal of Biotechnology,204: 45-46.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2758134
Maus, I.; Cibis, K. G.; Wibberg, D.; Winkler, A.; Stolze, Y.; König, H.; Pühler, A.; Schlüter, A. (2015): Complete genome sequence of the strain Defluviitoga tunisiensis L3, isolated from a thermophilic, production-scale biogas plant Journal of Biotechnology,203: 17-18.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2015 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901302
Verwaaijen, B.; Pühler, A.; Niehaus, K.; Schlüter, A. (2015): Analysis of the pathogenic interaction of R. solani On L. sativa by means of transcriptomics Mycoses,58:(Suppl. 3): 49-50.
PUB | WoS
 
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2733509
Maus, I.; Wibberg, D.; Stantscheff, R.; Stolze, Y.; Blom, J.; Eikmeyer, F. G.; Fracowiak, J.; König, H.; Pühler, A.; Schlüter, A. (2015): Insights into the annotated genome sequence of Methanoculleus bourgensis MS2(T), related to dominant methanogens in biogas-producing plants Journal of Biotechnology,201: 43-53.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2719679
Vinardell, J. M.; Acosta-Jurado, S.; Göttfert, M.; Zehner, S.; Becker, A.; Baena-Ropero, I.; Blom, J.; Crespo-Rivas, J. C.; Goesmann, A.; Jaenicke, S.; Krol, E.; McIntosh, M.; Margaret, I.; Pérez-Montaño, F.; Schneiker-Bekel, S.; Serrania, J.; Szczepanowski, R.; Buendia-Claveria, A. M.; Lloret, J.; Bonilla, I.; Pühler, A.; Ruiz-Sainz, J. E.; Weidner, S. (2015): The Sinorhizobium fredii HH103 genome: a comparative analysis with S. fredii strains differing in their symbiotic behaviour with soybean Molecular Plant-Microbe Interactions,28:(7): 811-824.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901214
Koeck, D. E.; Maus, I.; Wibberg, D.; Winkler, A.; Zverlov, V. V.; Liebl, W.; Pühler, A.; Schwarz, W. H.; Schlüter, A. (2015): Draft genome sequence of Herbinix hemicellulosilytica T3/55(T), a new thermophilic cellulose degrading bacterium isolated from a thermophilic biogas reactor Journal of Biotechnology,214: 59-60.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2778477
Dziewit, L.; Czarnecki, J.; Prochwicz, E.; Wibberg, D.; Schlüter, A.; Pühler, A.; Bartosik, D. (2015): Genome-guided insight into the methylotrophy of Paracoccus aminophilus JCM 7686 Frontiers in Microbiology,6:852
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2731076
Dziewit, L.; Pyzik, A.; Szuplewska, M.; Matlakowska, R.; Mielnicki, S.; Wibberg, D.; Schlüter, A.; Pühler, A.; Bartosik, D. (2015): Diversity and role of plasmids in adaptation of bacteria inhabiting the Lubin copper mine in Poland, an environment rich in heavy metals Frontiers in Microbiology,6:152
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2694187
Brinkrolf, K.; Hoffrogge, R.; Hackl, M.; Tauch, A.; Baumann, M.; Noll, T.; Goesmann, A.; Pühler, A.; Borth, N. (2014): Functional -Omics for Cell Lines and Processes - The -Omics Technologies on the Example of CHO Cells. In: Hansjörg Hauser; Roland Wagner (Hrsg.): Animal Cell Biotechnology In Biologics Production. Berlin, Germany: Walter de Gruyter.
PUB
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2678800
Kröber, M.; Wibberg, D.; Grosch, R.; Eikmeyer, F. G.; Verwaaijen, B.; Chowdhury, S. P.; Hartmann, A.; Pühler, A.; Schlüter, A. (2014): Effect of the strain Bacillus amyloliquefaciens FZB42 on the microbial community in the rhizosphere of lettuce under field conditions analyzed by whole metagenome sequencing Frontiers in Microbiology,5:252
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2684336
Weitze, M. - D.; Pühler, A. (2014): Concept of Law in Biology Synthetic Biology - Towards an Engineering Science European Review,22: S102-S112.
PUB | DOI | WoS
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2717549
Geizecler, T.; Hahnke, S.; Maus, I.; Wibberg, D.; Pühler, A.; Schlüter, A.; Klocke, M. (2014): Complete genome sequence of Peptoniphilus sp strain ING2-D1G isolated from a mesophilic lab-scale completely stirred tank reactor utilizing maize silage in co-digestion with pig and cattle manure for biomethanation Journal of Biotechnology,192: 59-61.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2665038
Schwientek, P.; Neshat, A.; Kalinowski, J.; Klein, A.; Rückert, C.; Schneiker-Bekel, S.; Wendler, S.; Stoye, J.; Pühler, A. (2014): Improving the genome annotation of the acarbose producer Actinoplanes sp. SE50/110 by sequencing enriched 5'-ends of primary transcripts Journal of Biotechnology,190: 85-95.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2685988
Jakobi, T.; Brinkrolf, K.; Tauch, A.; Noll, T.; Stoye, J.; Pühler, A.; Goesmann, A. (2014): Discovery of transcription start sites in the Chinese hamster genome by next-generation RNA sequencing Journal of Biotechnology,190: 64-75.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2676552
Becker, J.; Timmermann, C.; Rupp, O.; Albaum, S.; Brinkrolf, K.; Goesmann, A.; Pühler, A.; Tauch, A.; Noll, T. (2014): Transcriptome analyses of CHO cells with the next-generation microarray CHO41K: Development and validation by analysing the influence of the growth stimulating substance IGF-1 substitute LongR(3.) Journal of biotechnology,178: 23-31.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2701280
Noll, T.; Pühler, A.; Weisshaar, B.; Wendisch, V. F. (2014): The Genomics Revolution and its Impact on Future Biotechnology Journal of Biotechnology,190: 1-1.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2658490
Dziewit, L.; Czarnecki, J.; Wibberg, D.; Radlinska, M.; Mrozek, P.; Szymczak, M.; Schlüter, A.; Pühler, A.; Bartosik, D. (2014): Architecture and functions of a multipartite genome of the methylotrophic bacterium Paracoccus aminophilus JCM 7686, containing primary and secondary chromids BMC Genomics,15:(1):124
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | GenBank
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2656773
Rupp, O.; Becker, J.; Brinkrolf, K.; Timmermann, C.; Borth, N.; Pühler, A.; Noll, T.; Goesmann, A. (2014): Construction of a Public CHO Cell Line Transcript Database Using Versatile Bioinformatics Analysis Pipelines PLoS ONE,9:(1): e85568.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2699819
Schatschneider, S.; Huber, C.; Neuweger, H.; Watt, T.; Pühler, A.; Eisenreich, W.; Wittmann, C.; Niehaus, K.; Vorhölter, F. - J. (2014): Metabolic flux pattern of glucose utilization by Xanthomonas campestris pv. campestris: prevalent role of the Entner-Doudoroff pathway and minor fluxes through the pentose phosphate pathway and glycolysis Molecular BioSystems,10:(10): 2663-2676.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2651944
Tielen, P.; Wibberg, D.; Blom, J.; Rosin, N.; Meyer, A. - K.; Bunk, B.; Schobert, M.; Tüpker, R.; Schatschneider, S.; Rückert, C.; Albersmeier, A.; Goesmann, A.; Vorhölter, F. - J.; Jahn, D.; Pühler, A. (2014): Genome Sequence of the Small-Colony Variant Pseudomonas aeruginosa MH27, Isolated from a Chronic Urethral Catheter Infection Genome announcements,2:(1)
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2694915
Hahnke, S.; Wibberg, D.; Geizecler, T.; Pühler, A.; Klocke, M.; Schlüter, A. (2014): Whole genome sequence of Clostridium bornimense strain M2/40 isolated from a lab-scale mesophilic two-phase biogas reactor digesting maize silage and wheat straw Journal of Biotechnology,184: 199-200.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2693310
Wibberg, D.; Jelonek, L.; Rupp, O.; Kröber, M.; Goesmann, A.; Grosch, R.; Pühler, A.; Schlüter, A. (2014): Transcriptome analysis of the phytopathogenic fungus Rhizoctonia solani AG1-IB 7/3/14 applying high-throughput sequencing of expressed sequence tags (ESTs) Fungal Biology,118:(9-10): 800-813.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2664976
Rückert, C.; Szczepanowski, R.; Albersmeier, A.; Goesmann, A.; Fischer, N.; Steinkämper, A.; Pühler, A.; Biener, R.; Schwartz, D.; Kalinowski, J. (2014): Complete Genome Sequence of the Actinobacterium Actinoplanes friuliensis HAG 010964, producer of the lipopeptide antibiotic friulimycin Journal of biotechnology,178: 41-42.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2685861
Torres Tejerizo, G.; Pistorio, M.; Althabegoiti, M. J.; Cervantes, L.; Wibberg, D.; Schlüter, A.; Pühler, A.; Lagares, A.; Romero, D.; Brom, S. (2014): Rhizobial plasmid pLPU83a is able to switch between different transfer machineries depending on its genomic background FEMS Microbiology Ecology,88:(3): 565-578.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2672926
Wibberg, D.; Tielen, P.; Blom, J.; Rosin, N.; Schobert, M.; Tüpker, R.; Schatschneider, S.; Spilker, D.; Albersmeier, A.; Goesmann, A.; Vorhölter, F. - J.; Pühler, A.; Jahn, D. (2014): Genome Sequence of the Acute Urethral Catheter Isolate Pseudomonas aeruginosa MH38 Genome announcements,2:(2):e00161-14
PUB | PDF | DOI | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2675608
Wibberg, D.; Torres Tejerizo, G.; Florencia Del Papa, M.; Martini, C.; Pühler, A.; Lagares, A.; Schlüter, A.; Pistorio, M. (2014): Genome sequence of the acid-tolerant strain Rhizobium sp LPU83 Journal of Biotechnology,176: 40-41.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2717539
Maus, I.; Stantscheff, R.; Wibberg, D.; Stolze, Y.; Winkler, A.; Pühler, A.; König, H.; Schlüter, A. (2014): Complete genome sequence of the methanogenic neotype strain Methanobacterium formicicum MFT Journal of Biotechnology,192: 40-41.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2717558
Koeck, D. E.; Wibberg, D.; Maus, I.; Winkler, A.; Albersmeier, A.; Zverlov, V. V.; Pühler, A.; Schwarz, W. H.; Liebl, W.; Schlüter, A. (2014): First draft genome sequence of the amylolytic Bacillus thermoamylovorans wild-type strain 1A1 isolated from a thermophilic biogas plant Journal of Biotechnology,192: 154-155.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2707731
Koeck, D. E.; Wibberg, D.; Maus, I.; Winkler, A.; Albersmeier, A.; Zverlov, V. V.; Liebl, W.; Pühler, A.; Schwarz, W. H.; Schlüter, A. (2014): Complete genome sequence of the cellulolytic thermophile Ruminoclostridium cellulosi wild-type strain DG5 isolated from a thermophilic biogas plant Journal of Biotechnology,188: 136-137.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 

Filter und Suchbegriffe

author=21937

Suche

Publikationen filtern

Darstellung / Sortierung

Zitationsstil: wels

Export / Einbettung