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544 Publikationen

2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2087955
Next-generation sequencing of the Chinese hamster ovary microRNA transcriptome: Identification, annotation and profiling of microRNAs as targets for cellular engineering
Hackl M, Jakobi T, Blom J, Doppmeier D, Brinkrolf K, Szczepanowski R, Bernhart SH, Höner zu Siederdissen C, Bort JAH, Wieser M, Kunert R, et al. (2011)
Journal of Biotechnology 153(1-2): 62-75.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1968039
The Nodulation of Alfalfa by the Acid-Tolerant Rhizobium sp. Strain LPU83 Does Not Require Sulfated Forms of Lipochitooligosaccharide Nodulation Signals
Torres Tejerizo G, Florencia Del Papa M, Eugenia Soria-Diaz M, Draghi W, Lozano M, de los Angeles Giusti M, Manyani H, Megias M, Gil Serrano A, Pühler A, Niehaus K, et al. (2011)
Journal of Bacteriology 193(1): 30-39.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2486400
Advanced Genomics and Transcriptomics of Industrial Microorganisms
Kalinowski J, Rückert C, Szczepanowski R, Pühler A (2010)
Chemie Ingenieur Technik 82(9): 1518-1519.
PUB | DOI
 
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1903875
The role of sigma factor RpoH1 in the pH stress response of Sinorhizobium meliloti
de Lucena DK, Pühler A, Weidner S (2010)
BMC Microbiology 10(1): 256.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1785275
Complete genome sequence and lifestyle of black-pigmented Corynebacterium aurimucosum ATCC 700975 (formerly C. nigricans CN-1) isolated from a vaginal swab of a woman with spontaneous abortion
Trost E, Götker S, Schneider J, Schneiker-Bekel S, Szczepanowski R, Tilker A, Viehöver P, Arnold W, Bekel T, Blom J, Gartemann K-H, et al. (2010)
BMC Genomics 11(1): 91.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1588692
Complete Genome Sequence of Listeria seeligeri, a Nonpathogenic Member of the Genus Listeria
Steinweg C, Kuenne CT, Billion A, Mraheil MA, Domann E, Ghai R, Barbuddhe SB, Kaerst U, Goesmann A, Pühler A, Weisshaar B, et al. (2010)
Journal of Bacteriology 192(5): 1473-1474.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1929311
BioImaging: Contributions from biology, physics and informatics
Gölzhäuser A, Nattkemper TW, Niehaus K, Pühler A, Sauer M (2010)
Journal of Biotechnology 149(4): 227-228.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1635309 PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1783187
EDGAR: a software framework for the comparative analysis of prokaryotic genomes
Blom J, Albaum S, Doppmeier D, Pühler A, Vorhölter F-J, Zakrzewski M, Goesmann A (2009)
BMC Bioinformatics 10(1): 154.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1635951
Characterization of the Lacl-type transcriptional repressor RbsR controlling ribose transport in Corynebacterium glutamicum ATCC 13032
Nentwich SS, Brinkrolf K, Gaigalat L, Hueser AT, Rey DA, Mohrbach T, Marin K, Pühler A, Tauch A, Kalinowski J (2009)
MICROBIOLOGY 155(1): 150-164.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1634097
Genome sequence of Desulfobacterium autotrophicum HRM2, a marine sulfate reducer oxidizing organic carbon completely to carbon dioxide
Strittmatter AW, Liesegang H, Rabus R, Decker I, Amann J, Andres S, Henne A, Fricke WF, Martinez-Arias R, Bartels D, Goesmann A, et al. (2009)
ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY 11(5): 1038-1055.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1634443
Functional genome research on bacteria relevant for agriculture, environment and biotechnology
Pühler A, Selbitschka W (2009)
JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY 140(1-2): 1-2.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1634467
A portal for rhizobial genomes: RhizoGATE integrates a Sinorhizobium meliloti genome annotation update with postgenome data
Becker A, Barnett MJ, Capela D, Dondrup M, Kamp P-B, Krol E, Linke B, Rüberg S, Runte K, Schroeder BK, Weidner S, et al. (2009)
JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY 140(1-2): 45-50.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1635321
EMMA 2-A MAGE-compliant system for the collaborative analysis and integration of microarray data
Dondrup M, Albaum S, Griebel T, Henckel K, Jünemann S, Kahlke T, Kleindt CK, Kuester H, Linke B, Mertens D, Mittard-Runte V, et al. (2009)
BMC Bioinformatics 10(1): 50.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1591546
Detection of 140 clinically relevant antibiotic-resistance genes in the plasmid metagenome of wastewater treatment plant bacteria showing reduced susceptibility to selected antibiotics
Szczepanowski R, Linke B, Krahn I, Gartemann K-H, Guetzkow T, Eichler W, Pühler A, Schlueter A (2009)
MICROBIOLOGY 155(7): 2306-2319.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1591844
Phylogenetic characterization of a biogas plant microbial community integrating clone library 16S-rDNA sequences and metagenome sequence data obtained by 454-pyrosequencing
Kroeber M, Bekel T, Diaz NN, Goesmann A, Jaenicke S, Krause L, Miller D, Runte KJ, Viehoever P, Pühler A, Schlueter A (2009)
JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY 142(1): 38-49.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1633812
Genetic makeup of the Corynebacterium glutamicum LexA regulon deduced from comparative transcriptomics and in vitro DNA band shift assays
Jochmann N, Kurze A-K, Czaja LF, Brinkrolf K, Brune I, Hueser AT, Hansmeier N, Pühler A, Borovok I, Tauch A (2009)
MICROBIOLOGY 155(5): 1459-1477.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1634447
The Sequence Analysis and Management System - SAMS-2.0: Data management and sequence analysis adapted to changing requirements from traditional sanger sequencing to ultrafast sequencing technologies
Bekel T, Henckel K, Küster H, Meyer F, Mittard-Runte V, Neuweger H, Paarmann D, Rupp O, Zakrzewski M, Pühler A, Stoye J, et al. (2009)
Journal of Biotechnology 140(1-2): 3-12.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1783292
The missing link: Bordetella petrii is endowed with both the metabolic versatility of environmental bacteria and virulence traits of pathogenic Bordetellae
Gross R, Guzman CA, Sebaihia M, Martins dos Santos VAP, Pieper DH, Koebnik R, Lechner M, Bartels D, Buhrmester J, Choudhuri JV, Ebensen T, et al. (2008)
BMC Genomics 9(1): 449.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1592024
The genome of Xanthomonas campestris pv. campestris B 100 and its use for the reconstruction of metabolic pathways involved in xanthan biosynthesis
Vorhölter F-J, Schneiker-Bekel S, Goesmann A, Krause L, Bekel T, Kaiser O, Linke B, Patschkowski T, Rückert C, Schmid J, Sidhu VK, et al. (2008)
Journal of Biotechnology 134(1-2): 33-45.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585980
Genetic diversity and composition of a plasmid metagenome from a wastewater treatment plant
Schlueter A, Krause L, Szczepanowski R, Goesmann A, Pühler A (2008)
Journal of Biotechnology 136(1-2): 65-76.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1588078
The LacI/GalR family transcriptional regulator UriR negatively controls uridine utilization of Corynebacterium glutamicum by binding to catabolite-responsive element (cre)-like sequences
Brinkrolf K, Ploeger S, Solle S, Brune I, Nentwich SS, Hueser AT, Kalinowski J, Pühler A, Tauch A (2008)
MICROBIOLOGY 154(4): 1068-1081.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1592318
Host genes involved in nodulation preference in common bean (Phaseolus vulgaris)-Rhizobium etli symbiosis revealed - by suppressive subtractive hybridization
Meschini EP, Blanco FA, Zanetti ME, Beker MP, Küster H, Pühler A, Aguilar OM (2008)
MOLECULAR PLANT-MICROBE INTERACTIONS 21(4): 459-468.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585560 PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585914
Genome research in the light of ultrafast sequencing technologies
Pühler A, Selbitschka W (2008)
JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY 136(1-2): 1-2.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585969
Insight into the plasmid metagenome of wastewater treatment plant bacteria showing reduced susceptibility to antimicrobial drugs analysed by the 454-pyrosequencing technology
Szczepanowski R, Bekel T, Goesmann A, Krause L, Kroemeke H, Kaiser O, Eichler W, Pühler A, Schlueter A (2008)
JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY 136(1-2): 54-64.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1592210 PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1586009
Taxonomic composition and gene content of a methane-producing microbial community isolated from a biogas reactor
Krause L, Diaz NN, Edwards RA, Gartemann K-H, Krömeke H, Neuweger H, Pühler A, Runte KJ, Schlüter A, Stoye J, Szczepanowski R, et al. (2008)
JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY 136(1-2): 91-101.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1586869
Identification of Xanthomonas campestris pv. campestris galactose utilization genes from transcriptome data
Serrania J, Vorhölter F-J, Niehaus K, Pühler A, Becker A (2008)
Journal of Biotechnology 135(3): 309-317.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585956
Comparative genomic hybridisation and ultrafast pyrosequencing revealed remarkable differences between the Sinorhizobium meliloti genomes of the model strain Rm1021 and the field isolate SM11
Stiens M, Becker A, Bekel T, Gödde V, Goesmann A, Niehaus K, Schneiker-Bekel S, Selbitschka W, Weidner S, Schlüter A, Pühler A (2008)
Journal of Biotechnology 136(1-2): 31-37.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585987
The metagenome of a biogas-producing microbial community of a production-scale biogas plant fermenter analysed by the 454-pyrosequencing technology
Schlüter A, Bekel T, Diaz NN, Dondrup M, Eichenlaub R, Gartemann K-H, Krahn I, Krause L, Kroemeke H, Kruse O, Mussgnug JH, et al. (2008)
Journal of Biotechnology 136(1-2): 77-90.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1586719 PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585918
The lifestyle of Corynebacterium urealyticum derived from its complete genome sequence established by pyrosequencing
Tauch A, Trost E, Tilker A, Ludewig U, Schneiker-Bekel S, Goesmann A, Arnold W, Bekel T, Brinkrolf K, Brune I, Goetker S, et al. (2008)
Journal of Biotechnology 136(1-2): 11-21.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1592345
The genome sequence of the tomato-pathogenic actinomycete Clavibacter michiganensis subsp michiganensis NCPPB382 reveals a large island involved in pathogenicity
Gartemann K-H, Abt B, Bekel T, Burger A, Engemann J, Fluegel M, Gaigalat L, Goesmann A, Graefen I, Kalinowski J, Kaup O, et al. (2008)
JOURNAL OF BACTERIOLOGY 190(6): 2138-2149.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585939
Ultrafast pyrosequencing of Corynebacterium kroppenstedtii DSM44385 revealed insights into the physiology of a lipophilic corynebacterium that lacks mycolic acids
Tauch A, Schneider J, Szczepanowski R, Tilker A, Viehöver P, Gartemann K-H, Arnold W, Blom J, Brinkrolf K, Brune I, Goetker S, et al. (2008)
Journal of Biotechnology 136(1-2): 22-30.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1631126 PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1990198
Bacteriophage 2851 is a prototype phage for dissemination of the Shiga toxin variant gene 2c in Escherichia coli O157:H7
Strauch E, Hammerl JA, Konietzny A, Schneiker-Bekel S, Arnold W, Goesmann A, Pühler A, Beutin L (2008)
Infection and Immunity 76(12): 5466-5477.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2007 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2914794
Molecular Detection with Magnetic Labels and Magnetoresistive Sensors
Schotter J, Panhorst M, Brzeska M, Kamp P-B, Becker A, Pühler A, Reiss G, Brückl H (2007)
In: Nanoscale Devices - Fundamentals and Applications. Gross R, Sidorenko A, Tagirov L (Eds); NATO Science Series, 233. Dordrecht: Springer Netherlands: 35-46.
PUB | DOI
 
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1783754
CoryneCenter: an online resource for the integrated analysis of corynebacterial genome and transcriptome data
Neuweger H, Baumbach J, Albaum S, Bekel T, Dondrup M, Hüser AT, Kalinowski J, Oehm S, Pühler A, Rahmann S, Weile J, et al. (2007)
BMC Systems Biology 1(1): 55.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1631327
Complete genome sequence of the myxobacterium Sorangium cellulosum
Schneiker-Bekel S, Perlova O, Kaiser O, Gerth K, Alici A, Altmeyer MO, Bartels D, Bekel T, Beyer S, Bode E, Bode HB, et al. (2007)
Nature Biotechnology 25(11): 1281-1289.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1595908
Novel macrolide resistance module carried by the IncP-1 beta resistance plasmid pRSB111, isolated from a wastewater treatment plant
Szczepanowski R, Krahn I, Bohn N, Pühler A, Schlueter A (2007)
ANTIMICROBIAL AGENTS AND CHEMOTHERAPY 51(2): 673-678.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1595939
Molecular basics of mycorrhizal symbioses
Pühler A, Strack D (2007)
PHYTOCHEMISTRY 68(1): 6-7.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1594087
The Ic1R-type transcriptional repressor LtbR regulates the expression of leucine and tryptophan biosynthesis genes in the amino acid producer Corynebacterium glutamicum
Brune I, Jochmann N, Brinkrolf K, Hueser AT, Gerstmeir R, Eikmanns BJ, Kalinowski J, Pühler A, Tauch A (2007)
JOURNAL OF BACTERIOLOGY 189(7): 2720-2733.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1594426
A comprehensive proteome map of the lipid-requiring nosocomial pathogen Corynebacterium jeikeium K411
Hansmeier N, Chao T-C, Daschkey S, Muesken M, Kalinowski J, Pühler A, Tauch A (2007)
PROTEOMICS 7(7): 1076-1096.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1631103
In memoriam: Wolf-Dieter Deckwer - Merging process engineering and systems biology
Rinas U, Pühler A (2007)
JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY 132(4): 341.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1593538 PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1593371
The extracytoplasmic function-type sigma factor SigM of Corynebacterium glutamicum ATCC 13032 is involved in transcription of disulfide stress-related genes
Nakunst D, Larisch C, Hueser AT, Tauch A, Pühler A, Kalinowski J (2007)
JOURNAL OF BACTERIOLOGY 189(13): 4696-4707.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1593746 PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1595014 PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1596137
Identification and characterization of a nodH ortholog from the alfalfa-nodulating Or191-like rhizobia
Del Papa MF, Pistorio M, Draghi WO, Lozano MJ, Giusti MA, Medina C, van Dillewijn P, Martinez-Abarca F, Flores BM, Ruiz-Sainz JE, Megias M, et al. (2007)
Molecular Plant - Microbe Interactions 20(2): 138-145.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1783345
GISMO - gene identification using a support vector machine for ORF classification
Krause L, McHardy AC, Nattkemper TW, Pühler A, Stoye J, Meyer F (2007)
Nucleic Acids Research 35(2): 540-549.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1894739
Development of bioinformatic tools to support EST-sequencing, in silico- and microarray-based transcriptome profiling in mycorrhizal symbioses
Küster H, Becker A, Firnhaber C, Hohnjec N, Manthey K, Perlick AM, Bekel T, Dondrup M, Henckel K, Goesmann A, Meyer F, et al. (2007)
Phytochemistry 68(1): 19-32.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1783727
The DeoR-type transcriptional regulator SugR acts as a repressor for genes encoding the phosphoenolpyruvate: sugar phosphotransferase system (PTS) in Corynebacterium glutamicum
Gaigalat L, Schlüter J-P, Hartmann M, Mormann S, Tauch A, Pühler A, Kalinowski J (2007)
BMC Molecular Biology 8(1): 104.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1593996
Molecular systems biology
Sewald N, Pühler A (2007)
JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY 129(2): 171-172.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1946125
IncP-1-beta plasmid pGNB1 isolated from a bacterial community from a wastewater treatment plant mediates decolorization of triphenylmethane dyes
Schlüter A, Krahn I, Kollin F, Bonemann G, Stiens M, Szczepanowski R, Schneiker-Bekel S, Pühler A (2007)
Appl Environ Microbiol 73(20): 6345-6350.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | GenBank
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1946381 PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773628 PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1599402
Mapping and comprehensive analysis of the extracellular and cell surface proteome of the human pathogen Corynebacterium diphtheriae
Hansmeier N, Chao TC, Kalinowski J, Pühler A, Tauch A (2006)
PROTEOMICS 6(8): 2465-2476.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1596821
Long-term field release of bioluminescent Sinorhizobium meliloti strains to assess the influence of a recA mutation on the strains' survival
Selbitschka W, Keller M, Miethling-Graff R, Dresing U, Schwieger F, Krahn I, Homann I, Dammann-Kalinowski T, Pühler A, Tebbe CC (2006)
MICROBIAL ECOLOGY 52(3): 583-595.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1597413
Aspects of prokaryotic genome research
Gottschalk G, Goebel W, Pühler A (2006)
JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY 126(1): 1-2.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1598081
Mobilizable IncQ-related plasmid carrying a new quinolone resistance gene, qnrS2, isolated from the bacterial community of a wastewater treatment plant
Bönemann G, Stiens M, Pühler A, Schlüter A (2006)
ANTIMICROBIAL AGENTS AND CHEMOTHERAPY 50(9): 3075-3080.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1598182
Genome sequence of the ubiquitous hydrocarbon-degrading marine bacterium Alcanivorax borkumensis
Schneiker-Bekel S, dos Santos VAPM, Bartels D, Bekel T, Brecht M, Buhrmester J, Chernikova TN, Denaro R, Ferrer M, Gertler C, Goesmann A, et al. (2006)
Nature Biotechnology 24(8): 997-1004.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1598803
BioPerspectives - From basic research to industrial production
Grabley S, Pühler A (2006)
JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY 124(1): 1-3.
PUB | DOI | WoS
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1599618
The surface (S)-layer gene cspB of Corynebacterium glutamicum is transcriptionally activated by a LuxR-type regulator and located on a 6 kb genomic island absent from the type strain ATCC 13032
Hansmeier N, Albersmeier A, Tauch A, Damberg T, Ros R, Anselmetti D, Pühler A, Kalinowski J (2006)
Microbiology 152(4): 923-935.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1600852 PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1598296
Highlights from ECB12 - Bringing genomes to life
Nielsen J, Pühler A (2006)
JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY 124(4): 627-628.
PUB | DOI | WoS
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1599383
Sequence analysis of the 144-kilobase accessory plasmid pSmeSM11a, isolated from a dominant Sinorhizobium meliloti strain identified during a long-term field release experimerit
Stiens M, Schneiker-Bekel S, Keller M, Kuhn S, Pühler A, Schlüter A (2006)
Appl Environ Microbiol 72(5): 3662-3672.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1600185
The clc element of Pseudomonas sp strain B13, a genomic island with various catabolic properties
Gaillard M, Vallaeys T, Vorhölter F-J, Minoia M, Werlen C, Sentchilo V, Pühler A, van der Meer JR (2006)
JOURNAL OF BACTERIOLOGY 188(5): 1999-2013.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1868701
Ultrafast de novo sequencing of Corynebacterium urealyticum using the Genome Sequencer 20 System
Tauch A, Trost E, Bekel T, Goesmann A, Ludewig U, Pühler A (2006)
Biochemica 4: 4-6.
PUB
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773853 PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1599211 PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1596976
Complete genome of the mutualistic, N-2-fixing grass endophyte Azoarcus sp strain BH72
Krause A, Ramakumar A, Bartels D, Battistoni F, Bekel T, Boch J, Boehm M, Friedrich F, Hurek T, Krause L, Linke B, et al. (2006)
Nature Biotechnology 24(11): 1385-1391.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1597316
Whole-genome sequence of Listeria welshimeri reveals common steps in genome reduction with Listeria innocua as compared to Listeria monocytogenes
Hain T, Steinweg C, Kuenne CT, Billion A, Ghai R, Chatterjee SS, Domann E, Kaerst U, Goesmann A, Bekel T, Bartels D, et al. (2006)
Journal of Bacteriology 188(23): 8299-8302.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1631957
Finding novel genes in bacterial communities isolated from the environment
Krause L, Diaz NN, Bartels D, Edwards RA, Pühler A, Rohwer F, Meyer F, Stoye J (2006)
BIOINFORMATICS 22(14): e281-e289.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2447862
What can bacterial genome research teach us about iron uptake in Sinorhizobium meliloti?
Pühler A, Becker A, Buhrmester J, Chao T-C, Rüberg S, Weidner S (2005)
In: Biological Nitrogen Fixation, Sustainable Agriculture and the Environment: Proceedings of the 14th International Nitrogen Fixation Congress. Wang Y-P, Lin M, Tian Z-X, Elmerich C, Newton WE (Eds); Current Plant Science and Biotechnology in Agriculture, 41. Springer: 119-122.
PUB
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1603458
Rational design of a Corynebacterium glutamicum pantothenate production strain and its characterization by metabolic flux analysis and genorne-wide transcriptional profiling
Hüser AT, Chassagnole C, Lindley ND, Merkamm M, Guyonvarch A, Elisakova V, Patek M, Kalinowski J, Brune I, Pühler A, Tauch A (2005)
APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY 71(6): 3255-3268.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1603821 PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1603291
Characterization of the Xanthomonas campestris pv. campestris lipopolysaccharide substructures essential for elicitation of an oxidative burst in tobacco cells
Braun SG, Meyer A, Olst O, Pühler A, Niehaus K (2005)
Molecular Plant - Microbe Interactions 18(7): 674-681.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773302
BACCardI - a tool for the validation of genomic assemblies, assisting genome finishing and intergenome comparison
Bartels D, Kespohl S, Albaum S, Drüke T, Goesmann A, Herold J, Kaiser O, Pühler A, Pfeiffer F, Raddatz G, Stoye J, et al. (2005)
Bioinformatics 21(7): 853-859.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1604683 PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1604328 PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1864013
Genomics of resistance plasmids isolated from wastewater treatment plants
Tennstedt T, Heuer H, Top EM, Szczepanowski R, Pühler A, Schlüter A (2005)
Plasmid 53(1): 40-41.
PUB
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1602311 PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1601712
Insights into genome plasticity and pathogenicity of the plant pathogenic bacterium Xanthomonas campestris pv. vesicatoria revealed by the complete genome sequence
Thieme F, Koebnik R, Bekel T, Berger C, Boch J, Buttner D, Caldana C, Gaigalat L, Goesmann A, Kay S, Kirchner O, et al. (2005)
JOURNAL OF BACTERIOLOGY 187(21): 7254-7266.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1602933
Combined transcriptome profiling reveals a novel family of arbuscular mycorrhizal-specific Medicago truncatula lectin genes
Frenzel A, Manthey K, Perlick AM, Meyer F, Pühler A, Küster H, Krajinski F (2005)
Mol Plant-Microbe Interact 18(8): 771-782.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | GenBank
 
2005 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1601308
Magnetoresistive sensors and magnetic nanoparticles for biotechnology
Reiss G, Brückl H, Hütten A, Schotter J, Brzeska M, Panhorst M, Sudfeld D, Becker A, Kamp P-B, Pühler A, Wojczykowski K, et al. (2005)
Journal of Materials Research 20(12): 3294-3302.
PUB | DOI | WoS
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1601771
Functional genomics and expression analysis of the Corynebacterium glutamicum fpr2-cysIXHDNYZ gene cluster involved in assimilatory sulphate reduction
Rückert C, Koch DJ, Rey DA, Albersmeier A, Mormann S, Pühler A, Kalinowski J (2005)
BMC Genomics 6(1): 121.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | GenBank
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1602010
Role of the regulatory gene rirA in the transcriptional response of Sinorhizobium meliloti to iron limitation
Chao T-C, Buhrmester J, Hansmeier N, Pühler A, Weidner S (2005)
APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY 71(10): 5969-5982.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1602017
Role of the ssu and seu genes of Corynebacterium glutamicum ATCC 13032 in utilization of sulfonates and sulfonate esters as sulfur sources
Koch DJ, Rückert C, Rey DA, Mix A, Pühler A, Kalinowski J (2005)
APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY 71(10): 6104-6114.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | GenBank
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1602137
The transcriptional regulator SsuR activates expression of the Corynebacterium glutamicum sulphonate utilization genes in the absence of sulphate
Koch DJ, Rückert C, Albersmeier A, Hüser AT, Tauch A, Pühler A, Kalinowski J (2005)
Mol Microbiol 58(2): 480-494.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1604877
Production of N-acetyl-phosphinothricin: A substance used for inducing male sterility in transgenic plants
Risse JM, Pühler A, Flaschel E (2005)
ENGINEERING IN LIFE SCIENCES 5(1): 38-45.
PUB | DOI | WoS
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1603956 PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1604074 PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1603317
Complete genome sequence and analysis of the multiresistant nosocomial pathogen Corynebacterium jeikeium K411, a lipid-requiring bacterium of the human skin flora
Tauch A, Kaiser O, Hain T, Goesmann A, Weisshaar B, Albersmeier A, Bekel T, Bischoff N, Brune I, Chakraborty T, Kalinowski J, et al. (2005)
Journal of Bacteriology 187(13): 4671-4682.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | GenBank
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1601955
DNA microarray analysis of the nitrogen starvation response of Corynebacterium glutamicum
Silberbach M, Hüser AT, Kalinowski J, Pühler A, Walter B, Kramer R, Burkovski A (2005)
JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY 119(4): 357-367.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1603889
Adaptation of Corynebacterium glutamicum to ammonium limitation: A global analysis using transcriptome and proteome techniques
Silberbach M, Schafer M, Hüser AT, Kalinowski J, Pühler A, Kramer R, Burkovski A (2005)
APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY 71(5): 2391-2402.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1601922 PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | GenBank
 
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1608687
Construction and validation of cDNA-based Mt6k-RIT macro- and microarrays to explore root endosymbioses in the model legume Medicago truncatula
Küster H, Hohnjec N, Krajinski F, El Yahyaoui F, Manthey K, Gouzy J, Dondrup M, Meyer F, Kalinowski J, Brechenmacher L, van Tuinen D, et al. (2004)
JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY 108(2): 95-113.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1608839 PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 

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